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北京市2010-2020年多重耐药肯塔基沙门菌流行特征分析
编辑人员丨5天前
目的:了解北京市肯塔基沙门菌临床分离株的流行情况、耐药水平及分子特征。方法:对2010-2020年分离的22株肯塔基沙门菌采用微量肉汤稀释法进行抗生素药物敏感性检测;全基因组测序进行多位点序列分型、基因组岛和耐药基因识别。采用PFGE分析菌株的分子流行病学特征。结果:22株菌对8~22种抗生素耐药,尤其是对环丙沙星、阿奇霉素和头孢菌素类等都表现为超高水平的多重耐药。21株菌超广谱β-内酰胺酶表型阳性。全基因组序列分析显示,22株肯塔基沙门菌均为ST198,携带SGI1-K基因组岛。所有菌株均有耐药基因 tetA、 sul1、 qacE,喹诺酮耐药决定区 gyrA基因存在2个突变位点(S83F、D87 N)、 parC基因存在3个突变位点(T57S、S80I、T255S)。β-内酰胺类相关耐药基因( blaCTX-M-55、 blaCTX-M-14b、 blaTEM-141、 blaTEM-206、 blaTEM-209、 blaTEM-214、 blaTEM-1B)、氨基糖甙类耐药相关基因[ aac(3) -Id、 aac(3) -IId、 aac(6') -Iaa、 aadA7、 aadA17、 aph(3')- Ia、 aph(3'')- Ib、 aph(6)-Id、 rmtB]以及 floR、 dfrA14、 mphA和 qnrS1等基因在不同年代菌株间存在明显差异。PFGE图谱分析显示,22株菌株之间相似性>85%,与全球广泛传播的ST198-X1流行株高度同源,在传播扩散过程中,耐药谱和PFGE图谱都发生了变化,分为两大聚类簇。 结论:北京市流行的肯塔基沙门菌为多重耐药的ST198-X1-SGI-1K国际流行株,自2016年以来保持低水平流行,引起散发感染病例和聚集性腹泻事件。对氟喹诺酮类、ESBL和阿奇霉素等耐药严重,应加强多重耐药肯塔基沙门菌的监测。
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编辑人员丨5天前
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2022年上海市生禽肉和调理肉制品中主要食源性致病菌监测
编辑人员丨2024/6/1
目的 分析上海市市售生禽肉和调理肉制品中沙门菌、单核细胞增生李斯特菌及小肠结肠炎耶尔森氏菌等食源性致病菌的污染情况.方法 2022年1~8月,从上海市农贸市场、超市、餐饮店等环节采集样品348份,其中生禽肉240份,调理肉制品108份.按照食品安全国家标准分别对样品中的沙门菌、单核细胞增生李斯特菌和小肠结肠炎耶尔森氏菌的检测.采用VITEK2全自动微生物鉴定仪对可疑菌株进行生化鉴定,并对沙门菌分离株进行血清学分型.结果 生禽肉中沙门菌、单核细胞增生李斯特菌和小肠结肠炎耶尔森氏菌的检出率分别为28.33%(68/240)、5.00%(12/240)和0.83%(2/240);调理肉制品中沙门菌、单核细胞增生李斯特菌和小肠结肠炎耶尔森氏菌的检出率分别为5.56%(6/108)、28.70%(31/108)和1.85%(2/108);血清学分型结果显示,生禽肉中68株沙门菌分布于14种不同血清型,其中科瓦利斯沙门菌(35.29%)、鼠伤寒沙门菌(16.18%)和肠炎沙门菌(13.24%)占比较高,调理肉制品中6株沙门菌分布于3种不同血清型,分别为肠炎沙门菌(66.67%)、肯塔基沙门菌(16.67%)和鼠伤寒沙门菌(16.67%).结论 上海市市售生禽肉和调理肉制品中沙门菌和单核细胞增生李斯特菌污染率较高,存在引发食源性疾病的风险,在后续的监管中应予以重点关注.
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编辑人员丨2024/6/1
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遵义市食源性沙门菌分子分型及耐药研究
编辑人员丨2024/4/27
目的 了解遵义市食源性沙门菌分型及耐药特征.方法 收集遵义市2020-2022年食源性沙门菌,采用玻片凝集法对沙门菌进行血清分型,利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对沙门菌进行分子分型,采用肉汤稀释法对沙门菌进行耐药监测,应用BioNumerics软件进行数据分析.结果 收集的21株沙门菌分为16种血清型,其中肯塔基沙门菌3株、德尔卑沙门菌2株、肠炎沙门菌2株、希林登沙门菌2株,其余均为1株.PFGE结果显示带型呈现多态性,同源性最高为62.96%.药敏试验结果显示食源性沙门菌对氨苄西林耐药率最高,为71.43%,其次对四环素耐药率达61.90%,多重耐药率为76.19%.结论 遵义市食源性沙门菌血清型和遗传性多样,对抗菌药物的耐药率高,多重耐药严重.
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编辑人员丨2024/4/27
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2010-2021年深圳市ST314肯塔基沙门菌遗传特征和耐药分析
编辑人员丨2024/4/27
目的 了解深圳市ST314肯塔基沙门菌流行情况、遗传特性及耐药特征.方法 对2010-2021年深圳市疾病预防控制中心食源性疾病监测网络收集的14株ST314肯塔基沙门菌全基因组测序进行系统发育进化分析、耐药基因及质粒检测;采用微量肉汤法稀释法进行药物敏感性实验.结果 共收集57株肯塔基沙门菌,14株为ST314.ST314肯塔基沙门菌全球系统发育树显示,深圳分离株与越南和泰国等东南亚国家的分离株聚集分布在clade 314.2上,且深圳本地菌株间单核苷酸多态性距离较大,说明为散发.在ST314肯塔基沙门菌基因组检测到9类共17个耐药基因/突变,携带3种产超广谱β-内酰胺酶基因,包括blblaCTX.M-24(14.3%,2/14)、blaCTX-M-55(7.1%,1/14)、blacTX-M-130(14.3%,2/14),均位于质粒上.关于喹诺酮类的耐药因子,在基因组中鉴定出2种质粒介导的喹诺酮耐药基因:qnrB6(71.4%,10/14)和 aac(6')Ib-cr(78.6%,11/14),一 种喹诺酮耐药决定区突变 T57 S(100%,14/14).深圳市ST314肯塔基沙门菌的多重耐药率为92.86%(13/14),对四环素和复方新诺明的耐药率最高(100%,14/14),其次是氯霉素(92.86%,13/14)、头孢噻肟和氨苄西林(78.57%,11/14)、环丙沙星和萘啶酸(71.43%,10/14),对氨苄西林-舒巴坦的耐药率最低(21.43%,3/14).结论 ST314是深圳市肯塔基沙门菌中的第二大流行的ST型,主要从食品中分离,尤其是禽类;ST314为散发感染,基因组呈现高度的遗传保守型.ST314肯塔基沙门菌耐药十分严重,尤其是喹诺酮耐药决定区突变、喹诺酮耐药基因共同介导的喹诺酮类耐药和质粒介导的头孢类耐药问题突出.
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编辑人员丨2024/4/27
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济宁市城区生活污水中沙门菌分布、耐药特征及全基因组测序分析
编辑人员丨2024/4/13
目的 了解济宁市城区生活污水中沙门菌分布、血清型、耐药特征,并进行全基因组测序分析,为沙门菌的防控提供科学依据.方法 2023年2-3月,每周采集城区3个污水厂进水口污水各2份,每份500 ml,连续采集7周,合计42份污水样本,对污水样本进行沙门菌的培养、分离、鉴定,分离出的沙门菌进行血清凝集试验和荧光定量PCR血清分型,利用微量肉汤稀释法对41株沙门菌进行9类17种药物的最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)检测,进行全基因组测序及系统进化分析.结果 济宁市城区生活污水沙门菌分离率较高,42份样本中阳性样本24份,共分离出41株沙门菌,属9种血清型,以阿贡纳和肯塔基为主,李营和济东污水厂有其独有的血清型.只有1株吉韦沙门菌不耐药,其余40株沙门菌均为多重耐药菌,对复方新诺明、四环素、氨苄西林、链霉素耐药率达90%以上,对氨苄西林/舒巴坦耐药率达80%以上,共19种耐药谱,SXT-TET-STR-AMP-AMS占首位,不同血清型沙门菌的耐药谱不同,肯塔基沙门菌、黄金海岸沙门菌、婴儿沙门菌的多重耐药非常严重,同种血清型在不同污水厂中的耐药谱也不一致,李营污水厂的沙门菌耐药现象最严重.利用CARD数据库进行耐药基因预测,主要预测出8类耐药家族的18个耐药基因,耐药表型与耐药基因几乎全部一致.不同血清型沙门菌的ST分型不同,以ST13的阿贡纳沙门菌为主,进化树分为6个簇,不同污水厂的沙门菌在不同分支,提示基因组有差异,不同源.结论 济宁市城区生活污水中沙门菌血清型多样,提示可能已在人群中存在并传播,耐药严重,携带耐药基因广泛,有些型别菌株持续存在且跨区域分布,有致病风险,需持续监测,并制定对科学的防控措施以控制沙门菌的流行及耐药的加重.
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编辑人员丨2024/4/13
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2016年河南省市售生禽肉中沙门菌血清分型和分子分型研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 了解河南省市售生禽内中沙门菌污染状况,并对分离株进行血清型和分子分型研究,为河南省食源性疾病溯源数据库提供基础数据.方法 沙门菌检测及血清分型、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型分析参照国家食品及食源性疾病监测网工作手册.结果 165份生禽肉样品中检出41株沙门菌,分属13个血清型,优势血清型是科瓦利斯沙门菌、肯塔基沙门菌、鼠伤寒沙门菌及达布沙门菌.经XbaⅠ酶切,获得30种带型,每种带型包括1~5株菌株,相似度为47.5%~100%.部分不同血清型沙门菌PFGE型相似.结论 河南省市售生禽肉沙门菌污染严重,沙门菌血清型和基因型呈现多样化,基因型有一定的地区聚集性.
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编辑人员丨2023/8/6
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2005-2016年宁波市3种来源的非伤寒沙门菌对β-内酰胺类抗生素耐药性
编辑人员丨2023/8/6
目的 采用氨苄青霉素和第三代头孢菌素耐药水平、产超广谱β-内酰胺酶水平和可能耐药分子机制等指标,评价非伤寒沙门菌对β-内酰胺类抗生素的耐药水平,为相关疾病控制和治疗提供数据支撑.方法 采用美国临床和实验室标准化研究所(CLSI)纸片法检测2005-2016年宁波市在临床患者、食品和河水中分离的非伤寒沙门菌菌株对氨苄青霉素、头孢曲松和头孢曲松/克拉维酸的耐药水平,并通过聚合酶链式反应(PCR)技术检测菌株中是否携带有blaTEM、blaCTX-M和blaOXA3种编码β-内酰胺酶的耐药基因以及1类(IntI1)和2类整合子基因(IntI2).结果 从临床患者、食品和河水中共分离893株非伤寒沙门菌,其对氨苄青霉素的耐药率为37.8%(338/893),对头孢曲松耐药和产超广谱β-内酰胺酶的菌株占比分别为7.7%(69/893)和7.3%(65/893).检测菌株中耐氨苄青霉素最高的3种血清型为印第安纳沙门菌(100.0%,11/11)、德尔卑沙门菌(69.7%,23/33)和鼠伤寒沙门菌(57.4%,148/258).其他检出对头孢曲松耐药和产超广谱β-内酰胺酶的非伤寒沙门菌血清型有阿贡那沙门菌(4株)、肯塔基沙门菌(2株)和明斯特沙门菌(2株).blaTEM基因主要存在于只对氨苄青霉素有耐药性的菌株中,blaCTX-M和blaOXA基因主要存在于对头孢曲松有耐药性的菌株中.检出的IntI1基因均为完整的整合子结构,包含1类整合子3'端Sul1和qacE△1基因,未检出IntI2基因.结论 分离自临床患者、食品和河水中的非伤寒沙门菌对氨苄青霉素具有较高的耐药水平,对第三代头孢菌素表现一定程度的耐药性.在印第安纳沙门菌、德尔卑沙门菌和鼠伤寒沙门菌等血清型中存在高水平的β-内酰胺类抗生素耐药现象.对β-内酰胺类抗生素耐药的非伤寒沙门菌具有较复杂的的分子机制,增加了耐药扩散的风险,应加强对非伤寒沙门菌耐药水平的监测和耐药机制的分析.
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编辑人员丨2023/8/6
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浙江省宁波市多重耐药肯塔基沙门菌的检出及病原学分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究浙江省宁波市市售鸡肉与腹泻患者粪便中分离到的多重耐药肯塔基沙门菌的分子分型及耐药谱特征.方法 采用经典血清学方法鉴定肯塔基沙门菌的血清学分型.微量肉汤稀释法检测肯塔基沙门菌对12种抗生素的敏感性.脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析不同来源的2株肯塔基沙门菌的分子分型特征.聚合酶链式反应(PCR)检测菌株的耐药基因gyrA、blaCTX-M14-like、blaCTX-M15-like、blaTEM与blaOXA.结果 2株不同来源的肯塔基沙门菌耐药谱完全相同,均对9种抗生素耐药,为多重耐药沙门菌,且均为ESBLs表型阳性.2株肯塔基沙门菌双酶切(XbaⅠ与BlnⅠ)PFGE分型指纹图完全相同,具有相同PFGE分型.喹诺酮耐药基因gyrA发生83、87位氨基酸密码子点突变;ESBLs决定基因blaCTX-M14-like、blaCTX-M15-like、blaTEM均阳性,blaOXA阴性.结论 在宁波市售鸡肉样品和临床腹泻患者粪便样品中检出含环丙沙星高水平耐药在内的多重耐药肯塔基沙门菌,PFGE分子型别一致,说明该型多重耐药肯塔基沙门菌已造成散发病例感染.应该加强多重耐药肯塔基沙门菌在禽类养殖业与健康人群中传播的监测.必须规范禽类养殖业对于禽用抗生素的合理使用,防止出现更多的多重耐药沙门菌.
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编辑人员丨2023/8/6
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食源性沙门菌的分离鉴定及血清分型能力验证
编辑人员丨2023/8/6
目的 验证本实验室在国家食品安全风险监测中检测沙门菌的能力及实验室的质量控制水平.方法 按照考核方作业指导书对实验样品进行前处理,参照GB 4789.4-2016《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》进行沙门菌的检验,将全自动微生物生化鉴定仪鉴定为沙门菌的阳性菌株进行血清学鉴定和分型.结果 1号和3号样品在沙门氏+菌显色平板等3种选择性分离平板上均长出典型沙门菌特征的菌落,2号样品在3种分离平板上均无菌落生长;1号和3号样品中的可疑菌落经生化鉴定后结果与阳性对照菌株的一致,均符合沙门菌典型的生化反应特征;通过对可疑沙门菌进行血清分型,1号样品血清鉴定结果为肯塔基沙门菌,3号样品血清鉴定结果为鼠伤寒沙门菌,2号样品中未检出沙门菌.3个样品的能力验证结果 与考核方一致,本实验室取得满意结果 .结论 参加能力验证是提高检验检测机构实验室质量控制最有效的手段之一,通过参加本次能力验证,能有效提高本实验室出具检测数据的准确性和可靠性,同时也能有效提升本实验室从事食品检验的能力和质控水平.
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编辑人员丨2023/8/6
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2020年福建省生禽肉中沙门菌污染状况及病原学特征分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 了解2020年福建省生禽肉中沙门菌污染状况、血清分型和耐药情况.方法 采集2020年福建省生禽肉样品178份,按照GB 4789.4-2016的方法分离出沙门菌后进行血清分型,并对分离出来的沙门菌进行药敏实验.结果 共检出沙门菌40株,检出率为22.5% (40/178),通过血清分型,鼠伤寒沙门菌占比最高,检出率为22.5%(9/40),其次分别是肯塔基沙门菌和肠炎沙门菌,检出率分别为17.5%(7/40)、15.0% (6/40).药敏实验结果表明,40株沙门菌对四环素耐药程度最高,耐药率为77.5% (31/40),其次是萘啶酸和氨苄西林,耐药率分别为62.5%(25/40)、52.5%(21/40).多重耐药率(MDR>3)为52.5%(21/40).结论 2020年福建省生禽肉中存在一定程度沙门菌污染,以鼠伤寒沙门菌为主.菌株耐药状况严重,且存在较高的多重耐药率,应加强食品安全风险监测,预防食源性疾病暴发.
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编辑人员丨2023/8/5
