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丹酚酸C通过上调转录因子-E2相关因子信号通路抑制类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞炎症及促进凋亡
编辑人员丨6天前
目的:探讨丹酚酸C(SalC)对RA成纤维样滑膜细胞(FLSs)的作用,及转录因子-E2相关因子(Nrf2)信号通路在其中所扮演的角色。方法:用丹酚酸C 0.1、1、5、10、20 μmol/L分别处理RA-FLSs 24~72 h,之后用CCK8检测细胞活性。根据半抑制浓度(IC 50)值,选取实验所需的时间和剂量处理RA-FLSs。用伤口划痕实验和Transwell小室技术检测细胞迁移及侵袭能力。ELISA检测TNF-α,IL-1β及IL-6水平,蛋白质印迹实验检测MMP-9和MMP-13的表达及细胞凋亡相关蛋白及Nrf2及介导的相关基因的表达。用ML385干扰Nrf2,实验分成3组RA-FLSs、RA-FLSs+丹酚酸C(10 μmol/L)、RA-FLSs+丹酚酸C(10 μmol/L)+ ML385(2 μmol/L),测量迁移及侵袭能力,并检测凋亡、炎性及Nrf2信号通路相关蛋白的表达。统计学分析采用方差分析,两两比较采用Turkey检验。 结果:与对照组相比,丹酚酸C处理后RA-FLS的细胞迁移水平(丹酚酸C 0.1 μmol/L,0.75±0.05;丹酚酸C 5 μmol/L,0.50±0.05;丹酚酸C 10 μmol/L,0.26±0.05)显著性减少( t=7.65, P<0.001; t=14.25, P<0.001; t=20.67, P<0.001)和侵袭能力(丹酚酸C 0.1 μmol/L,0.75±0.11;丹酚酸C 5 μmol/L,0.49±0.06;丹酚酸C 10 μmol/L,0.26±0.07)显著性降低( t=4.93, P<0.001; t=10.32, P<0.001; t=14.96, P<0.001),MMP-9(丹酚酸C 0.1 μmol/L,0.72±0.10;丹酚酸C 5 μmol/L,0.48±0.08;丹酚酸C 10 μmol/L,0.27±0.06)水平显著性降低( t=5.60, P<0.001; t=11.03, P<0.001; t=5.94, P<0.001)及MMP-13(丹酚酸C 0.1 μmol/L,0.77±0.06;丹酚酸C 5 mol/L,0.58±0.06;丹酚酸C 10 μmol/L,0.32±0.13)水平显著性减少( t=8.66, P<0.001; t=11.03, P<0.001; t=14.22, P<0.001),促进细胞凋亡。丹酚酸C显著性降低促炎性细胞因子的水平( P<0.001),激活Nrf2信号通路蛋白Nrf2,过氧化氢酶(CAT),醌NADH脱氢酶1(NQO1)、超氧化物歧化酶1(SOD1)及谷胱甘肽合成酶(GSS)的表达( P<0.001)。用ML385干扰Nrf2后,显著性逆转丹酚酸C对Nrf2通路蛋白Nrf2(0.68±0.06; t=5.08, P<0.001),CAT(1.44±0.12; t=4.77, P<0.001),NQO1(0.65±0.12; t=5.04, P<0.001),SOD1(1.43±0.10; t=6.36, P<0.001)及GSS(1.42±0.10; t=7.60, P<0.001)的水平,及TNF-α[(260±22)pg/ml; t=13.75, P<0.001],IL-1β[(701±30)pg/ml; t=12.98, P<0.001],IL-6[(180.3±10.2)pg/ml; t=16.38, P<0.001]炎症因子的水平。除此之外ML385阻碍丹酚酸C对细胞迁移和侵袭的抑制作用(0.70±0.09; t=11.24, P<0.001;0.64±0.04; t=8.03, P<0.001)及对凋亡的诱导作用(24.4±1.8; t=23.02, P<0.001)。 结论:丹酚酸C可能通过上调Nrf2信号通路,抑制细胞活力及炎症反应,促进凋亡。丹酚酸C是治疗RA的有效潜在药物,但有待进一步动物及临床深入研究。
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编辑人员丨6天前
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血浆Dickkopf-1预测急性缺血性卒中患者的早期神经功能恶化和转归
编辑人员丨6天前
目的:探讨血浆Dickkopf-1与急性缺血性卒中患者早期神经功能恶化(early neurological deterioration, END)和转归的关系。方法:连续纳入2020年1月至2020年12月在南京江北医院神经内科住院的首发急性缺血性卒中患者。所有患者均在发病后24 h内入院。END定义为入院后7 d内任意一次美国国立卫生研究院卒中量表(National Institutes of Health Stroke Scale, NIHSS)评分较基线增加≥2分或运动项评分增加≥1分。转归不良定义为发病后90 d时改良Rankin量表评分>2分。应用多变量 logistic回归分析确定Dickkopf-1与END和转归的独立相关性。应用受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲线评估血浆Dickkopf-1对END和转归不良的预测价值。 结果:共纳入176例患者,男性92例(52.3%),年龄(66.7±9.6)岁。中位Dickkopf-1为4.30 μg/L,52例(29.5%)发生END,81例(46.0%)转归不良。多变量 logistic回归分析表明,Dickkopf-1较高是END[优势比(odds ratio, OR)1.696,95%置信区间(confidence interval, CI)1.223~2.351; P=0.002]和转归不良( OR 1.566,95% CI 1.156~2.121; P=0.004)的独立预测因素。ROC曲线分析显示,血浆Dickkopf-1对END具有良好的预测价值,其曲线下面积为0.717(95% CI 0.634~0.801);最佳截断值为4.40 μg/L,对应的预测敏感性和特异性分别为71.2%和60.5%。Dickkopf-1对转归不良也具有较好的预测价值,其曲线下面积为0.701(95% CI 0.624~0.778);最佳截断值为4.25 μg/L,对应的预测敏感性和特异性分别为65.4%和61.1%。 结论:血浆Dickkopf-1对急性缺血性卒中患者的END和转归不良均具有较好的预测价值。
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编辑人员丨6天前
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环状RNA调控卵巢癌及其化疗耐药的研究进展
编辑人员丨2024/4/27
卵巢癌是病死率最高的妇科恶性肿瘤,易产生化疗耐药而复发死亡,5年生存率仅为40%左右.环状RNA(circRNA)是一类单链共价闭合的非编码 RNA,稳定丰富存在于生物体细胞核、细胞质和体液中,成为近年来卵巢癌调控研究的热点.该文从细胞凋亡、上皮间充质转化、细胞周期、自噬和生物标志物方面系统综述了与卵巢癌调控相关的62个circRNAs,其中包括与卵巢癌顺铂和紫杉烷类化疗耐药显著相关的15个circRNAs;并从竞争性内源RNA、功能蛋白互作、翻译成多肽和蛋白质,以及信号通路方面对circRNA调控卵巢癌及其化疗耐药的分子机制进行了梳理,以期为后续circRNA调控卵巢癌及其化疗耐药的相关研究提供参考.
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编辑人员丨2024/4/27
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胃癌组织中磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B相关基因CXC基序受体4的表达及功能分析
编辑人员丨2024/4/27
目的 分析胃癌组织中磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-AKT)相关基因的表达及功能,寻找胃癌相关的潜在生物标志物.方法 在癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载胃癌数据,在分子特征数据库(MSigDB)下载PI3K-AKT相关基因集合,使用Wilcoxon检验和倍性变化筛选差异表达基因.通过R包"survival"进行生存分析.使用STRING数据库分析相关蛋白质交互作用(PPI)网络信息.基于Metascape对差异表达基因进行富集分析.应用CIBERSORT算法计算胃癌免疫细胞浸润水平.选取2023年3—5月在河北医科大学第四医院外三科行根治性手术的20例进展期胃癌患者标本,使用Western法检测肿瘤组织和癌旁组织中CXC基序受体4(CXCR4)的表达.结果 基于TCGA数据库,胃癌组织中上调基因10个,分别为溶质载体家族2成员1(SLC2A1)、周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、E2F转录因子1(E2F1)、肿瘤坏死因子受体相关因子2(TRAF2)、tribbles假激酶3(TRIB3)、G蛋白亚基γ转导蛋白1(GNGT1)、成纤维细胞生长因子17(FGF17)、白细胞介素4(IL-4)和CXCR4.下调基因12个,分别为蛋白激酶Cβ型异构体(PRKCB)、双特异性蛋白磷酸酶3(DUSP3)、类钙结合蛋白39(CAB39L)、蛋白激酶AMP激活催化亚基α2(PRKAA2)、腺苷酸环化酶2(ADCY2)、丝裂原活化蛋白激酶10(MAPK10)、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子1A(CDKN1A)、Toll通路中进化保守的信号传导中间体(ECSIT)、肽基脯氨酰顺/反异构酶-NIMA相互作用1(PIN1)、丙酮酸脱氢酶激酶1(PDK1)、MAPK相互作用的丝氨酸/苏氨酸激酶2(MKNK2)和T细胞淋巴瘤侵袭转移诱导蛋白1(TIAM1).CXCR4基因的表达与患者的预后相关,103例高表达CXCR4患者的3和5年总生存率分别为33.8%和18.8%,303例低表达CXCR4患者的3和5年总生存率分别为51.3%和42.5%,差异有统计学意义(x2=16.60,P<0.001).对CXCR4进行PPI网络显示,其与其他蛋白具有广泛的相互作用.通路富集分析结果显示,在基因本体论(GO)数据库收录的通路中,CXCR4主要与细胞因子介导的信号通路、调节白细胞胞间黏附、正向调节细胞因子产生、调节肽基酪氨酸磷酸化、调节造血功能和调节防御反应密切相关.在京都基因和基因组百科全书(KEGG)数据库收录的通路中,CXCR4主要与趋化因子信号通路、Th17细胞分化、破骨细胞分化、人巨细胞病毒感染、细胞因子-细胞因子受体相互作用密切相关.免疫细胞浸润结果显示,胃癌组织中,CXCR4的表达与初始B细胞浸润呈正相关(r=0.24,P<0.001),与CD8+T细胞浸润也呈正相关(r=0.25,P<0.001).Western blot法检测显示,CXCR4蛋白在胃癌组织中的相对表达水平为1.52±0.27,明显高于其在癌旁组织中的相对表达水平(0.42±0.12;t=17.05,P<0.001).结论 PI3K-AKT相关基因CXCR4在胃癌组织中高表达,且与胃癌患者预后、多种信号通路及初始B细胞和CD8+T细胞浸润相关,是胃癌潜在的生物标志物.
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编辑人员丨2024/4/27
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二肽激肽酶4抑制剂对帕金森病模型细胞形态和增殖的干预作用及其机制
编辑人员丨2024/1/13
目的 基于体外实验及网络药理学,初步探讨二肽激肽酶4(DPP-4)抑制剂对鱼藤酮(ROT)诱导神经细胞帕金森病(PD)的干预作用及其相关机制.方法 神经细胞株PC-12分为对照组、模型组、模型+西格列汀组、模型+利格列汀组、模型+维格列汀组,除对照组外各组均使用ROT建立PD体外模型,模型+西格列汀组、模型+利格列汀组、模型+维格列汀组在使用ROT建模的同时在培养基中分别加入DPP-4抑制剂西格列汀、利格列汀、维格列汀.倒置显微镜观察各组细胞形态学变化,CCK-8法观察各组细胞增殖能力.从Swiss Target Prediction、SEA等数据库分别获取DPP-4抑制剂西格列汀、利格列汀、维格列汀、沙格列汀及阿格列汀的药物靶点,通过DisGeNet、OMIM及GeneCards等数据库获取PD相关的疾病靶点,利用韦恩图将药物与疾病靶点取交集得到DPP-4抑制剂作用于PD的相关靶点.通过String数据库构建蛋白—蛋白相互作用(PPI)网络,选取基因满足度(Degree)值>平均值的基因作为DPP-4抑制剂对PD产生作用的关键靶点,将DPP-4抑制剂作用于PD的关键靶点基因输入到DAVID数据库进行GO基因功能和KEGG作用通路分析.将DPP-4抑制剂治疗PD的关键靶点以及KEGG信号通路导入到Cytoscape 3.7.2软件构建药物—疾病—靶点—通路网络,筛选与PD相关信号通路关系最为密切的靶点作为DPP-4抑制剂治疗PD的核心靶点,采用CB-Dock 2对接平台进行核心靶点的分子对接验证.结果 对照组细胞形态完整,增长状态良好,细胞呈多角形,细胞之间类似突触样连接,且突触较长;模型组细胞密度减少,细胞皱缩,细胞与细胞间的突触样连接断裂,且观察到较多圆形的损伤细胞;模型+西格列汀组、模型+利格列汀组、模型+维格列汀组较模型组细胞形态得到改善,恢复到正常状态下的细长、多角形态.模型组细胞存活率低于对照组、模型+西格列汀组、模型+利格列汀组、模型+维格列汀组(P均<0.05).共收集西格列汀药物靶点486个、利格列汀药物靶点665个、维格列汀药物靶点524个、沙格列汀药物靶点507个、阿格列汀药物靶点408个,PD疾病相关靶点1121个;将DPP-4抑制剂靶点与PD疾病相关靶点取交集共得到DPP-4抑制剂作用于PD的36个相关靶点.PPI网络显示,DPP-4抑制剂作用于PD相关靶点中Degree值>平均值的关键靶点共有16个,分别为ALB、IGF1、STAT3、CASP3、EGFR、ESR1、MAPK14、PPARG、MAPK1、HMOX1、NOS3、REN、MMP3、IL2、AR、IGF1R.GO分析结果显示,DPP-4抑制剂作用于PD的关键靶点共同涉及的生物过程主要包括信号转导、细胞迁移的正向调控和细胞凋亡的负向调控等,细胞组分主要包括细胞质、细胞质膜、细胞核等,分子功能主要包括酶结合、蛋白质结合、蛋白丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸激酶活性等.KEGG通路富集分析共得到20条信号通路,与PD较为相关的信号通路为PI3K-AKT信号通路、FoxO信号通路、MAPK信号通路.药物—疾病—靶点—通路网络图显示,在PI3K-AKT、FoxO及MAPK信号通路中均有富集的靶点为IGF1、EGFR、IGF1R及MAPK1.分子对接结果显示,5种DPP-4抑制剂均与PD相关核心靶点蛋白有较好的结合,其结合能均小于-5.0 kcal/mol.结论 DPP-4抑制剂对PD体外模型细胞具有积极地干预作用,其可能通过IGF1、EGFR、IGF1R及MAPK1等核心靶点作用于PI3K-AKT、FoxO、MAPK等信号通路来发挥作用.
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编辑人员丨2024/1/13
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浓缩生长因子凝胶、Bio-Oss骨粉联合引导骨再生术在单牙缺失伴颊侧骨质缺损患者中的应用效果及安全性分析
编辑人员丨2023/9/16
[目的]探讨浓缩生长因子(CGF)凝胶、Bio-Oss骨粉联合引导骨再生术在单牙缺失伴颊侧骨质缺损患者中的应用效果及安全性.[方法]选择2016年2月至2021年1月西安市第九医院收治的106例单牙缺失伴颊侧骨质缺损患者,按照随机数字表法分为观察组和对照组,每组53例.对照组采用Bio-Oss骨粉联合引导骨再生术,观察组采用CGF凝胶、Bio-Oss骨粉联合引导骨再生术.比较两组创伤愈合情况及术前、术后6个月颊侧软组织厚度、颊侧软组织剖面、牙槽骨宽度、种植牙的牙龈指数(GI)评分、沟龈探诊深度(PD),比较两组术后6个月并发症发生情况.[结果]观察组一期愈合率(96.23%)显著高于对照组(79.25%),差异有统计学意义(P<0.05).两组术前颊侧软组织厚度、颊侧软组织剖面、牙槽骨宽度比较,差异无统计学意义(P>0.05);术后6个月,两组颊侧软组织厚度、颊侧软组织剖面、牙槽骨宽度均增加(P<0.05),且观察组增加更明显.两组术前GI、PD比较,差异无统计学意义(P>0.05);术后6个月,两组GI、PD均降低(P<0.05),且观察组降低更明显(P<0.05).观察组术后6个月并发症总发生率(5.66%)显著低于对照组(18.87%),差异有统计学意义(P<0.05).[结论]CGF凝胶、Bio-Oss骨粉联合引导骨再生术治疗单牙缺失伴颊侧骨质缺损患者的愈合率,可提高颊侧软组织厚度、颊侧软组织剖面与牙槽骨宽度,改善牙龈组织状态,且安全可靠,值得临床推广应用.
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编辑人员丨2023/9/16
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全基因组预测糙皮侧耳经典胞外分泌蛋白
编辑人员丨2023/8/6
糙皮侧耳(平菇)作为目前木质纤维素降解模式真菌,其产生的胞外分泌蛋白在植物纤维素、半纤维素及木质素降解过程中发挥着重要作用 为了给蛋白质组学鉴定糙皮侧耳胞外分泌蛋白实验提供参考,利用常见的生物信息学工具SignalP、ProtComp、TMHMM、big-PI Fungal Predictor和TargetP对糙皮侧耳全基因组中的12 186条蛋白质序列进行经典分泌蛋白预测,同时,对上述分泌蛋白的氨基酸分布、信号肽长度和切割位点以及其理化性质等进行分析结果表明,糙皮侧耳全基因组中含有359个经典分泌蛋白,其氨基酸长度主要集中于101~600之间;信号肽长度集中在18~21之间;信号肽切割位点属于A-X-A类型,除此之外还含有5条具有RR-motif的信号肽对这些分泌蛋白进行功能注释,结果表明225个蛋白质为未知功能蛋白质;114个为已知功能蛋白质,主要功能注释集中于木质纤维素降解酶类,包括纤维素酶、半纤维素酶、木质素降解相关酶等.以上结果表明通过上述生物信息学分析实现了对糙皮侧耳全基因组经典分泌蛋白的有效预测.
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编辑人员丨2023/8/6
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富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白与原发性肝癌发生发展的关系
编辑人员丨2023/8/6
原发性肝癌是临床常见的恶性肿瘤,富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白在肝癌的发展与转移过程中发挥着非常重要的作用.介绍了富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白的结构与生物学功能,分析了其在恶性肿瘤中的作用机制及其与肝癌发展、转移的关系,并对其在肝癌诊治中的应用价值进行了分析与展望.
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编辑人员丨2023/8/6
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痛风性关节炎患者关节超声不同表现下骨破坏指标的比较
编辑人员丨2023/8/6
目的 观察痛风性关节炎患者关节超声不同表现与骨破坏指标(Dickkopf-1、RANKL)的相关性,从而进一步探讨肌肉骨骼超声对痛风性关节炎的诊断和监测的作用.方法 选择2016年7月至2017年6月就诊于北京大学人民医院风湿免疫科门诊的160例痛风性关节炎患者为研究对象,进行关节超声检查(双足第一跖趾关节、双踝关节及双膝关节).根据超声检查结果分为以下3组,A组为无聚集体组,B组为聚集体及“双轨征”组,C组为痛风石及骨侵蚀组.检测患者血清中Dickkopf-1、RANKL浓度,分析Dickkopf-1、RANKL及其他临床和实验室指标的关系.结果 (1)Dickkopf-1浓度在3组之间差异有统计学意义(P<0.001).并且C组[(1 722.2±482.7)ng/L]高于B组[(1 309.3 ±496.4) ng/L](t=4.418,P<0.001),B组高于A组[(807.9±373.8)ng/L](t=6.137,P<0.001).(2)RANKL浓度在3组之间差异有统计学意义(P <0.001).并且C组[(0.78±0.47) ng/L]高于B组[(0.35±0.29) ng/L](t=5.456,P<0.001),B组高于A组[(0.10±0.09)ng/L](t=6.923,P<0.001).(3)病程越长,血清Dickkpof-1浓度越高(r=0.430,P<0.001),血清RANKL浓度也越高(r=0.359,P<0.001).结论 痛风性关节炎患者关节超声检查可以观察到聚集体、双轨征、痛风石及骨侵蚀等表现.并且病程越长,骨破坏的程度有可能越严重.骨骼肌肉超声检查可以成为痛风性关节炎患者关节受累程度的首选影像学检查方法.
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编辑人员丨2023/8/6
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中性内肽酶相互作用蛋白质的功能
编辑人员丨2023/8/6
目的 分析与中性内肽酶(NEP)相互作用的蛋白质的功能.方法 利用在线蛋白质间相互作用的数据库PINA2获得与NEP相互作用的蛋白质,并利用基因本体(GO)和KEGG分析这些蛋白质的功能.结果 PINA2数据库显示与NEP相互作用的蛋白质有176个;GO分析显示这些蛋白质分布于细胞内的各个区域,一部分可以分泌出细胞发挥作用,可以与蛋白、核酸及酶类结合,参与细胞内蛋白质定位、多肽和RNA降解、大分子代谢及血管紧张素成熟.KEGG信号通路结果显示NEP相结合蛋白参与帕金森病、阿尔茨海默病等疾病过程,还参与蛋白降解及吞噬过程.结论 NEP及其相互作用蛋白可以通过调节蛋白定位和大分子降解参与帕金森病及阿尔茨海默病的疾病过程,并且一部分可以分泌到细胞外,为帕金森病和阿尔茨海默病的诊断和治疗提供潜在靶点.
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编辑人员丨2023/8/6
