目的:对新型冠状病毒（SARS-CoV-2）抗原检测试剂盒（胶体金免疫层析法）进行国际多中心临床评价。方法:1 855份具有有效检测结果的临床平行样本（分别用于核酸和抗原检测）来自德国、英国、乌克兰、法国、印度、泰国、马来西亚、美国和巴西9个国家，采样时间为2021年1月3日至9月22日。对这些样本分别采用SARS-CoV-2抗原检测试剂盒（胶体金免疫层析法）和核酸检测试剂盒（RT-PCR）进行检测，计算阳性符合率［（抗原阳性例数/核酸阳性例数）×100%］、阴性符合率［（抗原阴性例数/核酸阴性例数）×100%］、总符合率［（抗原和核酸检测一致的例数/总例数）×100%］和Kappa 值。采用变异系数评价以上指标在不同国家间的差异。分析不同核酸检测循环阈值（Ct值）样本、不同特征样本和不同突变株样本的抗原检出率。结果:所有样本SARS-CoV-2抗原检测与核酸检测阳性符合率为90.8%（569/627），阴性符合率为99.7%（1 224/1 228），总符合率为96.7%（1 793/1 855），一致性系数Kappa值为0.924；各国间的阳性符合率（除含Ct值>30样本较多的马来西亚外）、阴性符合率（除不含阴性样本的法国外）和总符合率（除法国外）的变异系数分别为6%、<1%和6%。当Ct值<25时抗原检出率可达83.3%~100%（变异系数为6%），无症状感染者和症状出现7 d内样本总体检出率和变异系数分别为93.4%（428/458）和5%，对SARS-CoV-2突变株的总检出率为97.5%（119/122），对20份其他病毒感染样本（包括甲型流感病毒H1N1、乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒A型和B型、肠道萨奇病毒A组16、人类偏肺病毒、副流感病毒1型和4型、EB病毒和腺病毒）的抗原检测结果均为阴性。结论:SARS-CoV-2抗原检测试剂盒检测真实性好，且其各指标在9个国家间差异较小，可满足大规模早期筛查SARS-CoV-2感染的需要。

目的:分析全球新型冠状病毒感染（新冠感染）疫情数据及防控措施，了解新冠感染疫情流行特征、发展趋势及影响防控效果的主要因素，为科学防控新冠感染提供参考依据。方法:新冠感染疫情数据主要来源于世界卫生组织（WHO）及美国、欧洲疾病预防控制中心等网站报告数据。梳理全球新冠感染疫情流行特征、发展态势，探讨影响疫情防控的主要因素。统计时间为疫情开始至2022年3月31日，采用SPSS 19.0软件整理数据及统计分析。结果:全球范围内新冠感染累计确诊病例，2020年4月2日达100万例，2020年6月28日达1 000万例，2021年1月25日达1.00亿例，2021年8月3日达2.00亿例，2022年1月6日达3.00亿例，2022年2月8日达4.00亿例，2022年3月31日达4.89亿例。2020年1月至2022年3月31日，每增加1亿病例的间隔时间逐渐缩短（疫情开始到全球病例增至1亿约360 d，从1亿增长到2亿、2亿增至3亿的时间平均为170 d，确诊病例从3亿增至4亿仅为33 d），疫情发展速度加快。全球范围内累计死亡病例，2020年4月9日为10万例，2020年9月19日达100万例，2021年10月31日达500万例，2022年3月31日达614万例。2021年1-10月，死亡病例每增加100万例的时间间隔平均为97 d，10月份之后增速下降，平均为121 d。2021年末，受奥密克戎（Omicron）变异株的影响，全球范围内感染者剧增。截至2022年3月31日，各大洲累计确诊病例数从高到低依次为欧洲（1.81亿）、亚洲（1.41亿）、北美洲（9 467万）、南美洲（5 609万）、非洲（1 155万）和大洋洲（558万）。累计死亡病例数从高到低依次为欧洲（177万）、北美洲（142万）、亚洲（141万）、南美洲（128万）、非洲（25万）和大洋洲（0.89万）。新冠感染疫情累计确诊病例排名前5位的国家依次是美国（8 014万）、印度（4 303万）、巴西（2 998万）、法国（2 582万）和英国（2 128万）。累计死亡病例排名前5位的国家依次是美国（98万）、巴西（66万）、印度（52万）、英国（16万）和法国（14万）。结论:新冠感染疫情是一次全球范围内的公共卫生紧急事件，疫情在全球蔓延，传染性强，传播速度快，危害性大，建议加强重点环节防控，完善预警机制，继续疫苗接种等科学公共卫生防控措施，减少重症和死亡，应对持续挑战。

目的:评估三种商用试剂盒对新型冠状病毒英国B.1.1.7变异株的检测效果。方法:收集2021年1月北京市某区新冠肺炎聚集性疫情期间的10份鉴定为B.1.1.7变异株的咽拭子、鼻咽拭子样本，同时收集2020年6—12月北京市监测发现的10份鉴定为非变异株的咽拭子、鼻咽拭子样本做为对照。用三种可检测该变异株的商业化试剂盒分别进行检测，分析比较检测结果。结果:三种试剂盒中，以B试剂盒的检测效果最差，C试剂盒的综合效果最好，其检测灵敏度可达1 000 copy/mL。结论:部分检测试剂盒在灵敏度、稳定性等方面还有待进一步提高。为保证检测结果的质量，需要及时评估检测试剂对变异株的有效性，以使新冠病毒的检测更迅速，检测结果更可靠。

目的:探讨红细胞分布宽度（RDW）在评估德尔塔变异株新型冠状病毒（新冠病毒）感染患者病情严重程度中的价值。方法:纳入2021年12月至2022年1月西安交通大学第一附属医院医疗队在新冠肺炎定点医院收治的28例德尔塔变异株新冠病毒感染患者（普通型23例、重型4例、危重型1例），收集患者临床资料，并通过相关性分析筛选出影响动脉血氧分压（PaO 2）和动脉血二氧化碳分压（PaCO 2）的血液检查关键指标；按照红细胞分布宽度标准差（RDW-SD）中位值42.5 fL，将28例患者分为低RDW-SD组（≤42.5 fL，16例）和高RDW-SD组（>42.5 fL，12例），比较两组免疫相关指标；绘制受试者工作特征曲线（ROC曲线），评价RDW-SD对新冠肺炎患者严重程度的预测价值。 结果:相关性分析显示，在患者入院第1天实验室检查指标中，RDW-SD是唯一与PaO 2和PaCO 2均相关的指标，并且与PaO 2呈负相关（ r＝-0.379， P＝0.047），与PaCO 2呈正相关（ r＝0.509， P＝0.006）。进一步分析不同临床特征对RDW-SD水平的影响，结果显示，不同临床特征组之间RDW-SD数值（包括男性/女性、年龄≥65岁/<65岁、有/无高血压史、有/无糖尿病史、有/无吸烟史、有/无高热、有/无发热时间持续3 d、有/无呼吸系统症状、有/无消化系统症状）差异均无统计学意义，提示RDW-SD指标相对稳定，不受患者基线水平影响。低RDW-SD组CD19 B细胞比例明显高于高RDW-SD组（23.01±3.01比15.34±5.34， P<0.05），免疫球蛋白G（IgG）水平明显低于高RDW-SD组（g/L：11.43±3.20比15.42±1.54， P<0.05）。ROC曲线分析显示，RDW-SD评估新冠肺炎患者病情严重程度的ROC曲线下面积（AUC）为0.83〔95%可信区间（95% CI）为0.59~1.06〕，接近社区获得性肺炎常用评分标准预测病毒性肺炎死亡风险预测模型评分（MuL BSTA；AUC＝0.82，95% CI为0.51~1.12），并优于英国胸科协会改良肺炎评分（CURB-65；AUC＝0.70，95% CI为0.50~0.91）。 结论:RDW-SD对于评估德尔塔变异株新冠病毒感染患者的病情严重程度有一定价值。

目的:分析北京市境外输入性新型冠状病毒（新冠病毒）感染者的流行病学特征及疫苗接种对感染者病毒载量和疾病严重程度的影响。方法:数据来源于中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统和现场流行病学调查，应用Excel 2010和SPSS 22.0软件进行数据整理和统计学分析。结果:2021年6月1日至9月30日，北京市累计报告171例境外输入性新冠病毒感染者，无症状感染者占66.67%（114/171）。输入国以菲律宾、阿联酋、英国和俄罗斯为主，占67.84%（116/171）。感染者男女性别比为2∶1（114∶57）；年龄 M（ Q1， Q3）为28（23，36）岁；中国籍占80.12%（137/171）。对其中47例进行病毒全基因组测序，76.60%（36/47）属于Delta变异株。疫苗接种率为60.82%（104/171），其中疫苗全程接种率为53.80%（92/171）。13.53%（23/170）的感染者入境当天筛查出核酸阳性，所有感染者均在28 d内检测出核酸阳性。未接种组疾病严重程度高于未全程接种组和全程接种组（ P<0.001），出现了1例重型和1例危重型病例。未接种组N基因 Ct值 M（ Q1， Q3）为32.51（23.23，36.06），开放读码框lab（ORFlab）基因 Ct值为32.78（24.00，36.38），未全程接种组和全程接种组双基因 Ct值中位数较未接种组差异无统计学意义（ P>0.05）。 结论:研究期间，北京市境外输入性新冠病毒感染者以无症状感染者为主。新冠病毒感染者无论是否接种新冠病毒疫苗，其体内均有相似的病毒载量，但疫苗接种可降低疾病严重程度。

通过测序获得的新型冠状病毒目标基因序列与参考序列进行比对，分析内蒙古自治区的两例新型冠状病毒的基因变异情况并探索其感染来源。结果显示，两条序列分别属于不同的进化分支，Delta（AY.122）和Omicron（BA.1.1），hCoV-19/Inner Mongolia/IVDC-591/2022基因组序列上共有48个单核苷酸多态性，与一株蒙古国毒株共享40个核苷酸突变位点；hCoV-19/Inner Mongolia/IVDC-592/2022基因组与一株英国毒株共享57个核苷酸突变位点，核苷酸突变位点一致性为 100%（57/57）。系统发育分析表明，目标基因序列与同期国内新型冠状病毒序列间并无直接关联，而与欧洲、蒙古国的分离株存在关联。

目的:分析2021年1月北京市某区一起新冠肺炎聚集性疫情中新型冠状病毒（SARS-CoV-2）基因组特征及变异情况，为疫情防控和风险评估提供参考。方法:收集此次疫情相关呼吸道样本和外环境样本26份，使用高通量测序对病毒全基因组进行测定分析，对基因组数据拼接整理后进行一致性分析、变异位点分析及系统发生分析。结果:共测定获得SARS-CoV-2病毒全基因组序列26条。26条病毒基因组之间高度一致，与参考株基因组（NC_045512）相比，核苷酸序列一致性中位数为99.896%，氨基酸序列一致性中位数为99.733%。26例病毒属于GR分支，共存在33个核苷酸突变位点，分布在ORF1ab、S、ORF8和N基因上，对应27个氨基酸突变位点，包括S蛋白69-70位缺失、N501Y、D614G等。病毒具有近期英国变异株（VOC 202012/01）的关键特征，属于英国变异株的类似株。结论:此次聚集性疫情为同一传播链，疫情病毒为境外输入的英国变异株的类似株。

目的 回顾性分析福建省2021年3月—2022年2月新冠病毒Delta变异株感染与复阳者的流行病学特征.方法 通过中国疾病预防控制信息系统中的传染病报告卡收集福建省2020年10月1日—2022年9月30日的新冠病毒感染者信息,通过突发公共卫生事件管理信息系统中的流行病学调查报告获取本土暴发疫情中的个案传播关系.运用描述流行病学的方法分析Delta变异株感染者的三间分布特征和潜伏期,运用R软件的"R0"、"EpiEstim"包拟合暴发疫情中感染者的代间隔(SI)并估算实时再生数(Rt);分析复阳的发生率及其核酸检测情况,运用logistic回归分析复阳发生的影响因素.结果 新冠病毒Delta变异株在福建省的流行时间大致为2021年3月—2022年2月,呈持续散在输入和本土局部暴发态势.输入性感染者以海员及长途驾驶员(28.99％)、学生(15.94％)以及商业服务人员(14.49％)为主,由厦门入境的感染者最多,主要来自东南亚和日本、美国、英国等地;本土疫情主要发生在莆田和厦门的学校和工厂,传播速度快,实时再生数(Rt)的最大值达7.35,代间隔(SI)服从Gamma分布,均值和标准差分别为2.28和2.06,中位潜伏期为6.50d.复阳发生率为37.98％,本土感染者发生复阳的风险是输入性感染者的2.68倍(95％CI=1.45～4.95),病程为15～30d的感染者发生复阳的风险是病程为45d以上感染者的4.12倍(95％CI:1.18～14.34).结论 新冠病毒Delta变异株在福建省的流行时间大致为2021年3月—2022年2月,呈持续散在输入和本土局部暴发态势,输入性疫情防控压力较大,但暴发疫情得到迅速而有效的控制;Delta变异株感染者复阳发生率为37.98％,病程可能是复阳的影响因素.

1988年世界卫生组织(WHO)发起了全球消灭脊髓灰质炎(脊灰)的倡议(Global Polio Eradication Initiative,GPEI).自2012年以来,脊灰野病毒(Wild poliovirus,WPV)三个血清型中只有1型(WPVl)被检测到.自2014年以来检测到WPV1的国家仅限于三个国家,2016年37例,2017年1-9月11例.自实施GPEI以来,全球脊灰病例数下降了99.99％,这主要归功于在大规模免疫接种活动和全面的国家常规免疫接种规划中广泛使用口服脊灰减毒活疫苗(OPV).尽管OPV安全有效,它的使用偶尔会出现基因变异的疫苗衍生脊灰病毒(VDPVs),这种病毒与父代OPV株的遗传漂移表明病毒可以长期复制或长期循环.VDPVs也可以出现于原发性免疫缺陷(PIDs)人群中.在PIDs的某些人群中免疫缺陷相关VDPVs(iVDPVs)可以复制多年.另外,在极罕见情况下,在OPV接种率低的地区,具有传播性的疫苗衍生脊灰病毒(cVDPVs)可能在免疫功能正常的疫苗接受者和他们的接触者中发生,并出现麻痹型脊灰的暴发.2016年1月-2017年6月发现了新的cVDPV暴发,包括刚果民主共和国(DRC)(8例)、叙利亚(35例),而尼日利亚cVDPV 2型的传播与先前发生的病毒相关.2015-2016年老挝发生了cVDPV 1型(cVDPVl)的暴发,最后一例确诊病例发生于2016年1月.调查发现,10个国家中14个新发病人排出iVDPVs;另外,在3个先前英国和伊朗报告的病人中,在报告期间仍排出2型iVDPVs.在10个国家有免疫能力的人群和环境样品中还发现了不明确的VDPVs(aVDPVs),这类VDPVs目前不能明确地对它们进行分类.全球消灭脊灰被证实后,停止使用所有的OPV就能消除新的VDPV感染的危险.

目的 了解2017年广东省1株百日咳鲍特菌(简称百日咳杆菌)分离株的基因特征.方法 对2017年广东省百日咳杆菌分离株(BP_GD2017)进行全基因组测序,分析这株菌的ptxS1、prn、fim2 、fim3等主要抗原基因,并与我国的百日咳杆菌疫苗生产株CS株的抗原基因序列以及GenBank中收录的百日咳基因序列进行比较分析,同时应用wg-SNPs方法与NCBI上获取的31株国内外百日咳杆菌的基因组进行遗传进化分析.结果 广东分离株BP_GD2017的基因组大小为3.64 MB,G+C含量67.74％,rRNA操纵子3个,分别是5S、16S和23S,46个tRNA,基因组结构和特征与我国疫苗生产株CS株以及其他地区和时间分离的百日咳杆菌基因组相似.分离株的ptxS1基因为A型、prn基因为2型,均与我国疫苗生产株CS株不同,fim2和fim3基因的氨基酸序列与我国疫苗生产株CS株同源性为100％.wg-SNPs基因进化显示与我国疫苗生产株CS株在不同的进化分支,而与近年来流行的其他地区(美国、英国、荷兰和挪威等地)分离株处于同一进化分支.结论 广东省这株百日咳分离株与我国疫苗生产株CS株的主要抗原基因序列存在一定变异,遗传进化分支选择也出现了改变,通过比较分析不同国家或地区的分离株,可以从基因组水平上更加准确地分析基因重组、突变和进化,可以为制定百日咳疫苗免疫策略以及新型无细胞百日咳疫苗的研发提供支撑.