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2018年天津市儿童GⅡ型诺如病毒感染的分子流行病学分析
编辑人员丨6天前
目的:分析2018年天津市儿童医院患儿GⅡ型诺如病毒(NoV)感染的分子流行病学特征。方法:单中心研究。2018年1至12月就诊于天津市儿童医院疑似病毒感染引起急性胃肠炎患儿粪便标本2 185份,采用实时荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测NoV,对阳性标本的衣壳蛋白VP1(VP1)区进行基因扩增并测序,分析基因型并运用MEGA5.05作系统进化树分析。结果:2 185份粪便标本中检出NoV阳性标本610份,阳性率为27.9%(610/2 185),全部为GⅡ型,共发现7个基因型,以GⅡ.3型和GⅡ.4型为主,分别占46.2%(151/327)和40.1%(131/327),GⅡ.2型占4.6%(15/327),其他亚型占9.1%(30/327)。不同年龄组间NoV检出率差异有统计学意义(χ 2=17.050, P=0.002),其中阳性标本中以≤3岁年龄组检出率最高,占阳性标本总数的89.2%,不同月份NoV检出率差异有统计学意义(χ 2=225.153, P<0.001),其中11、12月为高发月份。GⅡ.3型和GⅡ.4型NoV感染的患儿在伴随粒细胞减少症方面,两种亚型差异有统计学意义(χ 2=11.270, P=0.001),在伴随呼吸道症状方面,两种亚型差异有统计学意义(χ 2=7.257, P=0.007)。 结论:2018年天津地区儿童NoV感染主要以GⅡ.3型和GⅡ.4型为主,基因型呈现多样性,提示本地区在今后应继续加强监测和预防儿童的NoV感染。
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编辑人员丨6天前
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云南省某中学一起诺如病毒暴发疫情的病原鉴定和基因特征分析
编辑人员丨6天前
目的:明确2022年云南省某中学一起急性肠胃炎暴发疫情的病原和基因特征。方法:采集这起暴发疫情中的学生和厨工病例的肛拭子,使用诺如病毒GⅠ/GⅡ双通道核酸检测试剂盒定性检测。GⅠ和GⅡ阳性的样本分别采用引物G1SKF/G1SKR和MON431/G2SKR进行病毒扩增和测序,通过在线分型工具及系统进化分析确定病毒基因型别。结果:共采集58份肛拭子,实验室检测阳性率为53.45%(31/58)。其中,GⅠ阳性样本22份,GⅡ阳性样本14份,GⅠ和GⅡ合并感染样本5份。31份阳性样本基因测序获得毒株序列22株,包括诺如病毒GⅠ型15株,其中GⅠ.6[P6]型9株、GⅠ6.[P11]型6株;诺如病毒GⅡ.4[P16]型7株。结论:本起疫情由诺如病毒GⅠ.6[P6]型、GⅠ.6[P11]型和GⅡ.4[P16]型混合感染引起,这是云南省首次在诺如病毒暴发疫情中检出GⅠ型。
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编辑人员丨6天前
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2020年北京地区儿童中急性胃肠炎相关诺如病毒的分子流行病学特征
编辑人员丨6天前
目的:探讨北京地区2020年疫情防控措施下急性胃肠炎患儿诺如病毒的分子流行病学特点。方法:采用回顾性重复横断面研究方法,2020年收集首都儿科研究所附属儿童医院就诊急性胃肠炎患儿的粪便标本或呕吐物标本1 213份。首先用实时荧光反转录PCR进行标本中诺如病毒筛查,然后用反转录PCR对诺如病毒阳性标本进行病毒VP1基因和RdRp基因扩增,据核苷酸序列进行基因分型。采用χ 2 检验对不同标本类型、患儿不同性别及不同年龄组间诺如病毒的检出阳性率进行比较。 结果:在1 213份急性胃肠炎患儿标本中,共筛查到诺如病毒阳性标本215份,全年的检出阳性率为17.7%,阳性病例集中在秋冬季节[1、10、11及12月阳性率分别为28.6%(18/63)、26.2%(16/61)、22.8%(77/338)以及17.1%(89/520)]。粪便标本的阳性率明显高于呕吐物标本(χ2=9.692, P<0.01),而男女性别差异无统计学意义(χ2=0.041, P>0.05),各年龄组间诺如病毒检出率差异有统计学意义(χ2=103.112, P<0.01),以6~48月龄诺如病毒的检出率较高。对G基因型分析显示共有3个基因群(GⅠ、GⅡ和GⅨ)诺如病毒流行,以GⅡ基因群为主,占总数的98.5%(196/199)。而GⅡ基因群中以GⅡ.4 Sydney为主要流行株,占GⅡ基因群的55.1%(108/196);其次为GⅡ.2型(29.6%,58/196),以往流行的GⅡ.3型(10.2%,20/196)诺如病毒在本次监测周期中较少。诺如病毒P基因型分析结果显示以GⅡ.P16为主,占61.5%(96/156);其次为GⅡ.P31(19.9%,31/156)。双基因测定结果显示以GⅡ.4 Sydney[P16]为主,占36.4%(56/154),其次为GⅡ.2[P16] 占24.7%(38/154)。 结论:2020年诺如病毒的总阳性率与以往没有大的区别,但流行的基因型别构成有了明显的改变,且呈现多种基因型别诺如病毒的同时流行。
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编辑人员丨6天前
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2019年北京市非流行季餐饮服务单位诺如病毒污染状况研究
编辑人员丨6天前
目的:调查北京市餐饮服务单位厨师的诺如病毒隐性感染状况及餐饮服务单位环境中诺如病毒污染情况。方法:采用横断面调查方法,按照方便抽样的原则抽取北京市16个行政区内的餐饮服务单位以及三个大型火车站内部的餐饮服务单位,采集环境标本和厨师的肛拭子或便标本,使用实时荧光定量PCR技术对标本进行诺如病毒核酸检测,并分析了餐饮服务单位环境中诺如病毒污染情况和人员隐性感染状况。结果:共调查650家餐饮服务单位,采集厨师肛拭子或便标本1 302件,环境标本2 600件。其中非火车站内部餐饮服务单位644家,厨师肛拭子或便标本1 290件,环境标本2 576件。非火车站餐饮服务单位厨师诺如病毒隐性感染率为0.85%(11/1 290),环境污染率为0.04%(1/2 576);火车站餐饮服务单位厨师和环境标本中均未检出诺如病毒。结论:在2019年诺如病毒非流行季期间,北京市餐饮服务单位中厨师诺如病毒感染率较低,环境中存在诺如病毒污染情况。
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编辑人员丨6天前
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三种水中诺如病毒富集方法的比较
编辑人员丨2023/8/6
诺如病毒是一种重要的食源性及水源性病毒,该病毒常通过污染水源引起急性胃肠炎的暴发[1].21世纪以来,在全球范围内,很多国家都报道了诺如病毒感染的暴发事件[2-3].由于水中诺如病毒含量较低,往往需要经过富集才能通过荧光定量PCR仪检测到.本研究对应用广泛的3种病毒富集方法,絮凝沉淀法、聚二乙醇(polyethylene glycol , PEG)沉淀法和阴离子膜法进行了比较评价,通过计算诺如病毒的回收率,以获得一种较好的方法[4-6],应用于实际检测工作中.
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编辑人员丨2023/8/6
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杭州市轮状病毒检测阴性的腹泻患儿病原体调查分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨杭州市轮状病毒检测阴性的腹泻患儿病原体分布情况.方法 收集2017年3月至2018年6月浙江大学附属杭州市第一人民医院,浙江大学附属儿童医院和杭州市儿童医院儿科门诊605例轮状病毒检测阴性的腹泻患儿粪便样本,回顾分析了常规检测结果并对粪便样本性状采用布里斯托评分.粪便样本采用DNA纯化试剂盒和RNA提取试剂盒提取病原体DNA和/或RNA.病原体DNA和RNA逆转录cDNA作为扩增模板,采用聚合酶链反应(PCR)对7种常见致婴幼儿腹泻病原体进行扩增,扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测.病原体检出阳性率采用卡方检验进行统计学分析.结果 605例患儿中,男性患儿375例(28±11)个月,女性患儿230例(29±10)个月.大便样本布里斯托评分主要集中在6型(496,82%),其次为7型(85,14%)和5型(24,4%).大便常规检测结果中,隐血阳性97例,占比16%,白细胞阳性170例,占比28%.605例患儿大便样本病原体目的基因检出阳性452例,阳性率74.7%.319例检出单一病原体基因片段,127例检出了两种病原体基因,6例检出3种病原体基因片段.检出最高的为艰难梭菌毒素B,阳性率48.9%(296/605),其次为沙门菌属(20.0%,121/605)和诺如病毒(10.9%,66/605).艰难梭菌毒素A阳性率为1.0%(6/605).男性患儿和女性患儿病原体检出阳性率分别为86.7%(325/375)和86.5%(199/230),(χ2=0.002,P=0.959).结论 杭州地区轮状病毒检测阴性的腹泻患儿以沙门菌属和诺如病毒感染为主.艰难梭菌毒素B阳性率高,但艰难梭菌毒素A阳性率低,可能与婴幼儿胃肠道内艰难梭菌定植相关而非腹泻的病原菌.腹泻病原体检出率无性别差异.
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编辑人员丨2023/8/6
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安徽省马鞍山市哨点医院食源性疾病患者诺如病毒感染的分子流行病学特征分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 了解马鞍山哨点医院食源性疾病病例诺如病毒的感染状况及基因特征.方法收集2015年1月至2018年6月马鞍山3家医院食源性疾病病例流行病学资料和粪便标本,共911例;采用实时荧光定量逆转录PCR法检测GⅠ/GⅡ组诺如病毒,阳性标本使用普通逆转录PCR方法进行扩增,扩增产物测序后采用生物学软件对病毒序列进行序列比对和系统进化分析.结果 男女病例分别为504例(55.3%)和402例(44.1%),5例性别不详.诺如病毒阳性率为14.7%(134例),其中GⅠ组7例,GⅡ组124例,GⅠ和GⅡ组混合感染3例;全年均可检出诺如病毒,每年11月至次年4月阳性率较高[24.4%(20/82)~45.3%(24/53)];男性诺如病毒阳性78例(15.5%),女性阳性55例(13.7%)(χ2=0.58,P=0.448);各年龄组诺如病毒阳性率差异无统计学意义(χ2=9.55,P=0.089);成功测序79份,GⅠ组4份(5.1%),GⅡ组75份(94.9%),GⅡ.17和GⅡ.4型较多,分别为35和15份;不同年份流行优势株有所不同,2015年以GⅡ.17(30份,68.2%)为主,2016年以GⅡ.4(5/9)为主,2017年以GⅡ.4(8/16)为主,2018年以GⅡ.3(3/6)为主.结论 马鞍山的诺如病毒腹泻全年流行,冬春高发;以GⅡ型为主,优势流行株为GⅡ.17和GⅡ.4型,不同年份的流行优势毒株有所不同.
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编辑人员丨2023/8/6
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广东省某牡蛎养殖区人群血清抗体阻断诺如病毒GII.4与HBGA受体结合
编辑人员丨2023/8/5
目的 研究广东省某牡蛎养殖区人群血清抗体阻断诺如病毒GII.4与HBGA受体结合的作用.方法 分别于2015年1月和2016年12月,采用随机数字表法,以广东省长沙湾牡蛎养殖区为调查点,抽取18岁及以上常住人口为实验组对象,排除具有任何已知的免疫抑制状态或免疫缺陷疾病或正在接受免疫抑制治疗者,以及调查时处于妊娠状态者,2015年1月共抽取调查对象195名, 2016年12月共抽取调查对象164名,两次问卷有效回收率均为100%.于2015年11—12月,在匹配年龄、性别条件下,从广东省4个不同内陆地区抽取普通人群为对照组,共169名,问卷有效回收率为100%.采集实验组和对照组对象唾液标本,运用ELISA法对实验组和对照组对象HBGA受体型别进行鉴定,检测调查对象血清抗体水平及其吸光度值,利用诺如病毒体外中和替代模型测定血清抗体阻断诺如病毒GII.4与HBGA受体结合的效率.结果2015年实验组、2016年实验组和对照组对象的年龄分别为(50.68±15.17)、(52.52±15.90)和(51.37±13.32)岁(F=0.21,P=0.650);男性分别占35.9% (70名)、36.6%(60名)、40.8%(69名)(χ2=0.93,P=0.334).2015年实验组、2016年实验组以及对照组对象血清抗体吸光度值分别为4.202±0.083、4.305±0.075和3.748±0.083(F=13.28,P<0.001);3组血清抗体阳性率均为100%.2015年实验组对象血清抗体阻断率为50%时,抗体几何平均滴度(GMT)为423.1±40.11,对照组对象血清抗体阻断率为50%时,抗体GMT为248.2±25.63(t=3.73,P<0.001).结论 牡蛎养殖区人群较普通人群有更多的诺如病毒暴露与感染机会,血清抗体阻断能力强,该人群较普通人群对GII.4感染具有更高抵抗能力.
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编辑人员丨2023/8/5
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诺如病毒病毒样颗粒疫苗研究进展
编辑人员丨2021/1/16
诺如病毒(norovirus,NoV)是引起急性胃肠炎的常见病原体.据WHO统计,全球每年有超过1亿人感染NoV,严重者会发生死亡,因此对该病毒疫苗的研究刻不容缓.目前NoV疫苗的研发主要集中于病毒样颗粒疫苗.此文在NoV生物学特征和流行病学特征的基础上,介绍NoV疫苗开发所面临的主要挑战以及病毒样颗粒疫苗研发的现状.
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编辑人员丨2021/1/16
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人诺如病毒疫苗及治疗药物的研究进展
编辑人员丨2021/1/16
诺如病毒(norovirus,NoV)是引起急性胃肠炎的主要病原体之一,可以感染所有年龄段的人群.目前针对NoV引发的疾病尚无有效的治疗和预防手段,因此对于易感人群以及群发性感染,制定预防策略(包括疫苗)是必要的.利用NoV衣壳蛋白VP1以及VP1 P结构域自我组装形成的病毒样颗粒是NoV疫苗的主要研究方向,通过基因工程技术设计的多种相关疫苗已在不同系统中表达,临床试验证明其中部分疫苗具有良好的免疫原性.此外,NoV与其他肠道病原体(如轮状病毒)的联合疫苗也具有良好的前景.此文重点介绍目前处于临床前以及临床研究的NoV疫苗以及NoV相关疾病的治疗药物.
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编辑人员丨2021/1/16
