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黄栌枯萎病拮抗细菌CCBC3-3-1的全基因组测序及比较基因组分析
编辑人员丨1个月前
[目的]从黄栌枝干内部分离到的细菌CCBC3-3-1 菌株对黄栌枯萎病菌(Verticillium dahliae)表现出较强的拮抗作用,从基因组层面深入研究其拮抗机理,为进一步研发生防菌剂提供理论依据.[方法]利用PacBio RS测序平台完成CCBC3-3-1 的全基因组测序,根据 16S rDNA序列信息构建系统发育树,并与同属近缘种菌株进行比较基因组学分析;对其发酵液进行LC-MS非靶标代谢组检测.[结果]CCBC3-3-1 基因组总长度为 5.16 Mb,由 1 条环状双链染色体和 3 个环状质粒组成,GC含量 48.08%,含有 5 013 个编码基因.经过antiSMASH预测,CCBC3-3-1 基因组中有 8 个抗生素及次生代谢物合成相关的基因簇,其中 2 个与已知基因簇相似度较低,5 个基因簇功能未知,其发酵液中检测出 6 种已知抗生素类物质.比较基因组学分析结果表明CCBC3-3-1 基因组与泛菌属内 4 个近缘种均有显著差异,而且CCBC3-3-1 在 16S rDNA系统发育树上形成一个相对独立的分支.[结论]CCBC3-3-1 是泛菌属的一个新变异种Pantoea sp.,能够产生多种抗生素类物质,在黄栌枯萎病生物防治方面具有重要应用潜力.
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编辑人员丨1个月前
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龙翔山植物群落空间异质性及其影响因子
编辑人员丨2024/3/23
为探明焦作市龙翔山植物群落的空间分布及种间关系,对不同海拔、坡向群落进行样方调查,利用种间联结分析、回归分析及非度量多维度分析(NMDS)等方法,研究植物群落物种组成、多样性、生态位及种间关联特征.结果表明:共调查植物57科128属172种,其中乔木15科24属28种,灌木16科22属25种,草本33科86属111种;乔木层中柽柳的重要值最高(1.523),黄栌的生态位宽度(4.763)位居第一;灌草中野皂荚和羊胡子草的重要值最高(0.483和0.429),其生态位宽度位居第2和第5;阴坡植物总盖度(83%)、Simpson指数(0.605)和Shannon指数(1.875)高于阳坡,且显著高于平地(P<0.05);500~600 m海拔的Mar-galef多样性指数(1.315)及均匀度指数(1.084)最高;海拔与植物群落Margalef多样性指数、均匀度分别呈显著幂指数和二次多项式拟合趋势(P<0.05),而坡度与Margalef多样性指数、Shannon指数呈显著二次多项式拟合趋势(P<0.05);优势植物的生态位重叠指数与种间联结指数Dice系数、Jiaccard系数、Ochiai系数均呈显著正相关(P<0.05),表明龙翔山优势植物在时空上相伴生,且种对间呈正联结;NMDS分析表明,龙翔山不同海拔及坡向之间植物群落组成及多样性存在差异.本研究结果可为焦作山区植物资源利用、保护及管理提供参考.
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编辑人员丨2024/3/23
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复方黄栌口服液对异硫氰酸-萘酯致大鼠黄疸型肝炎的保护作用
编辑人员丨2023/8/6
目的 观察复方黄栌口服液对异硫氰酸-萘酯致大鼠黄疸型肝炎模型的肝脏保护作用.方法 将Wistar大鼠随机分为空白组,模型组,护肝宁片组,复方黄栌口服液低、中、高剂量组,连续灌胃给药10 d.除空白组外,各组于实验第8天,灌胃异硫氰酸-萘酯造模,48 h后处死大鼠,取少量肝组织制肝匀浆液和做病理切片,检测肝匀浆中MDA、SOD、TC、TG的活性以及肝脏病理组织学的改变为观察指标.结果 与模型组相比,复方黄栌口服液低、中、高剂量均可显著降低肝脏TC、TG、MDA水平(P<0.01),可显著升高肝脏SOD水平(P<0.01,P<0.05);复方黄栌口服液低、中、高剂量的肝脏指数均显著降低(P<0.01,P<0.05);结论 复方黄栌口服液对异硫氰酸-萘酯诱导的大鼠急性肝损伤具有很好的保护作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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岷江干旱河谷区典型灌木对干旱胁迫的生理生化响应
编辑人员丨2023/8/6
以岷江干旱河谷区6种典型山地灌木[沙棘(Hippophae rhamnoides)、羊蹄甲(Bauhinia faberi)、白刺花(Sorphora davidii)、锦鸡儿(Caragana arborescens)、三颗针(Berberis sargentiana)、黄栌(Cotinus szechuanensis)]为试材,采用盆栽试验研究了土壤自然干旱胁迫对苗木叶片抗氧化保护酶活性、膜伤害程度以及渗透调节物质的影响,探讨植物应对土壤干旱逐渐加剧的生理生态适应机理.结果表明,植物不同抗氧化保护酶对干旱胁迫及随之而来的氧化胁迫的响应存在一定差异.各灌木的超氧化物歧化酶随着干旱胁迫的增强呈先上升后下降,过氧化物酶在整个胁迫期间表现为逐渐升高,过氧化氢酶的升高则主要发生在胁迫的中后期,表明不同胁迫时期对植物体起主导作用的保护酶不同,三者表现为相互协调的作用方式.随着干旱胁迫的增强,各灌木的丙二醛呈缓慢增加趋势,细胞的膜脂过氧化作用逐渐加强,植物开始遭受一定程度的毒害.沙棘和羊蹄甲叶片的质膜相对透性随胁迫的增强呈现先升后降最终回到初始水平的特点,表明植物可以通过干旱锻炼获得一定的抗旱能力.白刺花和黄栌叶片的质膜相对透性在胁迫的0-4 d保持不变,从8d开始大幅上升并一直维持在较高水平,说明胁迫初期植物细胞膜的结构和功能还很完整,生理活动仍能正常进行,但从中期开始细胞膜遭受严重破坏.随着干旱胁迫的增强,各灌木叶片的脯氨酸总体均呈增加趋势,表明干旱胁迫下植物通过积累脯氨酸以提高细胞的渗透调节能力.主成分分析表明,6种灌木的抗旱能力由强到弱依次为:羊蹄甲、沙棘、锦鸡儿、黄栌、白刺花、三颗针.综合分析表明,干旱河谷区几种典型灌木可通过提高抗氧化酶活性并积累渗透调节物质对干旱胁迫进行积极的反馈,以减弱逆境胁迫下活性氧的危害,提高细胞的渗透调节能力,减轻细胞遭受的损伤.
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编辑人员丨2023/8/6
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复方黄栌口服液对小鼠肝匀浆TC、TG、MDA及SOD水平的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的:观察复方黄栌口服液对小鼠黄疸型肝炎模型肝匀浆总胆固醇(total cholesterol,TC)、三酰甘油(triacylglycerol,TG)、丙二醛(malondialdehyde,MDA)及超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)水平的影响.方法:72只小鼠随机分为空白组,模型组,护肝宁片组[1g·(kg·d)-1],大剂量、中剂量、小剂量复方黄栌口服液组[(30mL· (kg·d)-1、15mL·(kg· d)-1、7.5 mL·(kg·d)-1],给药方式为每天灌服1次,连续10 d.于第8天给药2h后,各给药组及模型组均灌服体积分数0.4%异硫氰酸萘酯橄榄油溶液(100 mg·kg-1),空白组给予同体积的橄榄油,48 h后取材,取材前12 h禁食不禁水.将小鼠脱颈椎处死,观察各组小鼠组织病理学变化.另取肝脏,用冷生理盐水制成匀浆,检测肝匀浆MDA、SOD、TC、TG.结果:复方黄栌口服液各剂量组和护肝宁片组TC、TG水平均低于模型组(P<0.01).复方黄栌口服液各剂量组和护肝宁片组MDA均低于模型组,SOD水平均高于模型组(P<0.01).组织形态学显示:模型组小鼠肝组织中肝小叶分界不清晰,肝细胞索排列紊乱,出现局灶性坏死、嗜酸性变和点状坏死,有胆栓的形成;护肝宁片组小鼠肝组织中肝小叶分界不清晰,肝细胞出现局灶性坏死及点状坏死,汇管区可见炎细胞侵润,有少量胆栓形成;大剂量复方黄栌口服液组小鼠肝组织中肝小叶分界较清晰,可见部分肝细胞索以中央静脉为中心呈放射状排列,部分排列紊乱;肝细胞出现局灶性坏死和点状坏死,同时可见部分再生的肝细胞,胆栓明显减少.结论:复方黄栌口服液可显著改善异硫氰酸-萘酯致小鼠黄疸型肝炎模型症状,显著降低肝匀浆TC、TG、MDA水平,显著升高SOD水平;可显著减轻肝脏的损伤.
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编辑人员丨2023/8/6
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复方黄栌口服液对大鼠肝匀浆及肝组织的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的:观察复方黄栌口服液对四氯化碳致大鼠慢性肝损伤模型肝匀浆中谷草转氨酶(AST)、谷丙转氨酶(ALT)、丙二醛(MDA)、羟脯氨酸(Hyp)、超氧化物歧化酶(SOD)水平及肝组织的影响.方法:取雌雄各半的SD大鼠72只,随机分为空白组,模型组,护肝宁片组(0.675g/kg),大、中、小剂量复方黄栌口服液组(15、10、5mL/kg).采用腹腔注射50%四氯化碳橄榄油溶液1 mL/kg制备大鼠慢性肝损伤模型,2次/周,连续8周,同时第5周开始灌胃相对应的药物.末次给药24 h后,大鼠经水合氯醛腹腔注射麻醉后,经下腔静脉采血,检测肝匀浆中AST、ALT、MDA、Hyp、SOD含量,同时取少量肝组织,观察组织病理学变化.结果:大鼠慢性肝损伤模型造模成功.与模型组相比,大、中、小剂量复方黄栌口服液组和护肝宁片组均可显著降低肝匀浆中ALT、AST、MDA水平(P<0.01),均可显著升高肝匀浆中SOD水平(P<0.01),均可显著降低肝匀浆中Hyp水平(P<0.01),均可显著改善模型大鼠肝脏区病理损伤(P<0.01).结论:复方黄栌口服液对四氯化碳所致的大鼠慢性肝损伤具有较好的保护作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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复方黄栌口服液治疗急性病毒性黄疸型肝炎湿热蕴结证临床研究
编辑人员丨2023/8/6
目的:观察复方黄栌口服液治疗急性病毒性黄疸型肝炎湿热蕴结证的临床疗效.方法:选取本院治疗的急性病毒性黄疸型肝炎湿热蕴结证患者200例,随机分为对照组和治疗组,每组100例.对照组给予保护肝功能、降低转氨酶等常规西药对症治疗,治疗组在对照组治疗的基础上加用复方黄栌口服液治疗.两组疗程均为4周,并于治疗后3个月进行随访.检测两组患者治疗前后总胆红素(total bilirubin,TBIL)、结合胆红素(Direct bilirubin,DBIL)、谷丙转氨酶(alanine transaminase,ALT)、谷草转氨酶(aspartateaminotransferase,AST)水平,并进行临床症状评分,观察治疗效果.结果:两组治疗后临床疗效比较,对照组有效率为76.00%,治疗组有效率为90.00%,治疗组优于对照组(P<0.05),差异具有统计学意义;两组患者治疗后3个月随访,对照组有效率为80.20%,治疗组有效率为94.80%,治疗组优于对照组(P<0.05),差异具有统计学意义;治疗后,治疗组与对照组TBIL、DBIL、ALT、AST水平比较,差异均具有统计学意义(P<0.05);治疗后3个月随访,治疗组与对照组TBIL、DBIL、ALT、AST水平及并发症发生情况比较,差异均具有统计学意义(P<0.05).结论:复方黄栌口服液治疗急性病毒性黄疸型肝炎湿热蕴结证疗效显著,能够改善患者的黄疸症状及肝功能,缩短病程,减少并发症,远期疗效好.
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编辑人员丨2023/8/6
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秦岭山地天然次生林群落MRT数量分类、CCA排序及多样性垂直格局
编辑人员丨2023/8/6
采用多元回归树(MRT)对秦岭山地天然次生林群落进行数量分类,采用典范对应分析(CCA)进行排序,分析了秦岭山地天然次生林群落物种多样性沿海拔梯度的变化规律.结果表明:(1)275个样方共有种子植物195种,隶属61科128属.乔、灌、草3个层次物种多样性变化沿海拔梯度的变化趋势基本一致,呈单峰模型;(2)经交叉验证认为秦岭山地天然次生林群落可分为2类,Ⅰ冬瓜杨(Populus purdomii+陇东海棠(Malus kansuensis)+蛇莓(Duchesnea indica)群落,Ⅱ锐齿槲栎(Quercus aliena var.acuteserrata)+黄栌(Cotinus coggygria)+茜草(Rubia cordifolia)群落;(3)CCA排序结果揭示了群落生境的分布范围,反映出生态轴的排序意义,较好地反映秦岭山地天然次生林群落与环境因子的关系,其结果表明,海拔、坡向、凋落层厚度和干扰情况4个变量对该地区次生林群落的分布有较大的影响.
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编辑人员丨2023/8/6
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珍稀濒危植物矮牡丹生存群落优势种种间联结性及群落稳定性
编辑人员丨2023/8/6
采用方差比率法(VR)、x2检验、联结系数(AC)、共同出现百分率(PC)、Pearson相关系数、Spearman秩相关系数以及M.Godron稳定性测定等数量分析方法,对山西稷山矮牡丹(Paeonia suffruticosa Andr.var.spontanea)生存群落中20个优势物种、190个种对间进行种间相关性及群落稳定性分析.结果显示:(1)稷山矮牡丹生存群落20个优势种种群整体表现为不显著负相关性,物种间相对独立,群落稳定性结果(40/60)远离20/80,整体群落不稳定.(2)x2检验中不显著关联的对数有168对,占到了88.78%;AC和PC结果都表明20个优势种群落有很大的独立性或随机性,对生境的需求不同,共同出现概率较低;x2检验结果、Pearson相关系数半矩阵图、Spearman秩相关系数半矩阵图分别表明检验呈正关联的种对占总对数的38.42%、38.42%、44.74%;检验呈负关联的种对分别占总对数的61.05%、61.05%,54.74%;其中黄刺玫(Rosa xanthina)、连翘(Forsythia suspensa)、辽东栎(Quercus wutaishanica Mayr)与矮牡丹的正相关性相对较显著;黄精(Polygonatum sibiricum、红柄白鹃梅(Exochorda giraldii)、西北栒子(Cotoneaster zabelii)和黄栌(Cotinus coggygria)与矮牡丹的负相关性相对较显著;(3)根据种群的聚类分析和种间联结测定分析,把矮牡丹生存群落的20个优势种划分为3个生态种组.以上研究表明该群落中种对间的关联性较弱,群落处于不稳定演替阶段,在对矮牡丹保护的同时应加强与其正相关性较强物种在其群落中的保护和建立,促进其群落趋于稳定,以求达到对其实效保护的目的.
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编辑人员丨2023/8/6
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基于Gash修正模型模拟侧柏及其混交林的林冠截留过程
编辑人员丨2023/8/6
为探究Gash修正模型对纯林及混交林林冠截留模拟的适用性和差异性,以北京市八达岭森林公园侧柏纯林和侧柏黄栌混交林为研究对象,以研究区2013年5-10月的实测资料为基础数据,运用Gash修正模型对其林冠截留过程进行模拟,并分析模型参数敏感性.结果 表明:(1)侧柏(Platycladus orientalis)纯林的穿透降雨量、树干茎流量和林冠截留量的实测值分别为395.2、22.3和129.5 mm,相对应的Gash修正模型模拟值分别为415.80、18.04和113.09 mm,相对误差分别为5.2%、19.0%和12.7%;侧柏黄栌(Cotinus coggygria)混交林的穿透降雨量、树干茎流量和林冠截留量的实测值分别为414.6、12.2和120.1 mm,相对应的Gash修正模型模拟值分别为454.26、10.27和82.40 mm,相对误差分别为9.6%、15.6%和31.4%;(2)选择Gash修正模型中的饱和林冠持水能力(S)、平均降雨强度(尺)、饱和林冠平均蒸发速率((E))、郁闭度(c)、树干持水能力(St)和树干茎流系数(Pt)共6项参数,进行敏感性分析.对于侧柏纯林,当各参数在-50%-20%范围内变化时,模拟林冠截留量对各项参数的变化敏感性排序为S>c>(E)>(R)>c>St>Pt,而当参数在-20%~50%范围内变化时,其排序为S>(E)>(R)>c>St>Pt;对于侧柏黄栌混交林,模拟林冠截留量对各项参数的变化敏感性排序为S>(E)>(R)>c>St>Pt.综上,Gash修正模型对于侧柏黄栌混交林的模拟精度较侧柏纯林小,但可满足应用需要;参数S是影响侧柏黄栌混交林和侧柏纯林中的Gash修正模型模拟精度的重要因素.
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编辑人员丨2023/8/6
