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ABRACL在恶性肿瘤发生发展中的作用
编辑人员丨2天前
ABRACL蛋白是肌动蛋白和细胞运动的调节因子，属于HSPC280家族，其保守的疏水槽可与其他蛋白相互作用，从而增强肌动蛋白动力和细胞活性。ABRACL在肿瘤组织中表达上调，与肿瘤细胞的增殖和迁移关系密切。深入了解ABRACL在肿瘤发生发展中的作用，可为ABRACL预防或逆转肿瘤进展提供新的思路和见解。
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编辑人员丨2天前
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膀胱癌circRNAs介导的ceRNA网络及预后评估模型的构建
编辑人员丨2023/8/5
目的 探究膀胱癌中差异性表达的环状RNAs(circRNAs),并构建circRNAs介导的ceRNA网络及预后评估模型.方法 下载并分析基因表达数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)中膀胱癌RNA测序数据,以|log2 fold change(log2FC)|>1、P-value<0.05为纳入标准,筛选RNA差异表达谱.整合TCGA膀胱癌RNA差异分析数据及CircInteractome等公共数据库数据,构建circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络,通过GEO与TCGA对网络中mRNAs进行功能富集分析.利用String数据库挖掘ceRNA网络分子的相互作用关系.采用Cox回归分析筛选预后相关mRNAs,并构建膀胱癌预后风险评估模型;利用"time ROC"软件包绘制ROC曲线,对模型效能进行评估.结果 通过2个GEO数据集的差异分析,共筛选到4个circRNAs,分别是hsa_circ_0102787、hsa_circ_0103114、hsa_circ_0102402与hsa_circ_0104387.通过公共数据库及TCGA差异分析,构建了由circRNAs介导的ceRNA网络,包含4个circRNAs、23个miRNAs和86个mRNAs;功能富集分析显示该网络mRNAs涉及多个与肿瘤调控相关的生物学过程;网络中mRNAs存在相互作用关系,生存分析显示6个mRNAs与膀胱癌预后相关.以"风险评分=(-0.3569)×ABRACL+(-0.2644)×MAP3K8"构建膀胱癌预后风险评估模型,Kaplan-Meier曲线提示高评分组预后差(P<0.001),模型5年总体生存率的AUC=0.744.结论 发掘4个膀胱癌中表达失调的circR-NAs,构建了膀胱癌相关circRNA-miRNA-mRNA网络及预后评估模型,为揭示膀胱癌发生发展的分子机制及寻找新的诊断、预后标志物奠定了理论基础.
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编辑人员丨2023/8/5
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ABRACL基因启动子不同片段重组质粒构建及转录活性研究
编辑人员丨2023/8/5
目的 构建肌动蛋白结合Rho激活C末端样(ABRACL)基因启动子不同截短片段重组质粒,并检测其转录活性.方法 以含ABRACL启动子全长质粒为模板,利用PCR方法分别扩增ABRACL启动子不同截短片段;将扩增片段分别插入pGL3.0-basic载体,构建ABRACL启动子不同截短片段重组质粒;经双酶切及序列鉴定正确后,将重组质粒转染ZR75-1和A549细胞,采用双荧光素酶报告基因检测系统测定ABRACL启动子不同截短片段的双荧光素酶活性;检测转录因子MYB原癌基因样2(B-MYB)对ABRACL启动子不同截短片段转录活性的影响.结果 成功构建含ABRACL基因启动子不同截短片段重组质粒,双荧光素酶活性测定发现ABRACL基因启动子-400 bp片段活性较高,转录因子B-MYB可以增强ABRACL启动子-600 bp和-1000 bp片段的活性.结论 发现ABRACL基因启动子转录活性较高区域,为进一步研究ABRACL基因上游调控机制奠定基础.
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编辑人员丨2023/8/5
