目的:利用生物信息学技术筛选并分析影响结直肠腺癌患者预后的铁死亡相关基因（FRG）。方法:使用癌症基因组图谱（TCGA）数据库下载RNA测序数据，共545例结直肠腺癌患者临床信息，602例数据集。从FerrDb数据库下载FRG基因集。取FRG基因集与TCGA数据库基因集交集，得到FRG表达数据集。使用R软件筛选结直肠腺癌组织与癌旁组织间差异表达FRG和预后相关基因，获得影响结直肠腺癌预后的FRG。通过在线蛋白互作网络工具分析蛋白之间的互作关系及蛋白质表达的相关性。使用LASSO回归分析构建患者5年总生存率的预后风险模型，计算TCGA数据库509例结直肠腺癌样本的风险值，以中位风险值为临界值，将患者分为高风险组（≥中位风险值）、低风险组（<中位风险值），并绘制生存曲线。绘制依据FRG预后模型的风险值预测TCGA数据库中结直肠腺癌患者5年总生存率时间依赖的受试者工作特征（ROC）曲线，使用Cox比例风险模型进行单因素和多因素生存分析，筛选影响预后的因素。基于基因本体（GO）数据库和京都基因与基因组百科全书（KEGG）数据库对与结直肠腺癌预后相关的FRG进行通路富集分析。结果:数据库中545例患者临床信息，602个数据集中，通过比较发现199个在结直肠腺癌中差异表达的FRG，28个预后相关的FRG，取交集后发现21个影响结直肠腺癌患者预后的FRG。DUOX2、NOX4、NOX1、DDIT3、JDP2、ATP6V1G2、ULK1、ATG3与WIPI1基因间可能有相关性；NOX4、NOX5、PLIN4和ATP6V1G2基因表达呈正相关，ULK1与MAPK1、MYB、FANCD2、ATG3、ATP5MC3基因表达呈负相关。使用LASSO回归分析，最终筛选出15个FRG（ATP5MC3、NOX4、NOX5、ALOX12B、ATG3、WIPI1、MAPK1、MYB、AKR1C1、DDIT3、JDP2、ATP6V1G2、DRD4、SLC2A3、PLIN4），构建风险模型，风险值=NOX4×0.139-ATP5M3×0.108+NOX5×1.486+ALOX12B×0.475-ATG3×0.030-WIPI1×0.170-MAPK1×0.271-MYB×0.063+AKR1C1×0.021+DDIT3×0.186+JDP2×0.292+ATP6V1G2×0.777+ DRD4×0.294+SLC2A3×0.059+PLIN4×0.113。高风险组患者总生存较低风险组差（ P<0.001），低风险组5年总生存率为76.8%，高风险组5年总生存率为48.2%。多因素生存分析显示年龄和风险值是预后的独立影响因素。使用预后相关FRG构建的风险模型能够较好地预测患者5年总生存率（曲线下面积0.728）。高、低风险组患者中的差异表达基因可能与细胞外基质组成和细胞外结构构成、局部黏附等基因通路有关。 结论:依据筛选的FRG构建的预后风险模型可较好评估结直肠腺癌患者预后，这些FRG有望成为结直肠腺癌预后相关新的候选生物标志物。

目的:应用超声以及多种遗传学检测技术对3例产前筛查提示染色体可能异常的胎儿进行分析，为遗传咨询提供依据。方法:对3例孕妇进行胎儿超声检查、核型分析、单核苷酸多态性微阵列芯片(single nucleotide polymorphism-based microarray，SNP-Array)检测，并通过荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization，FISH)对结果进行验证。 结果:三例胎儿均发现22号染色体存在异常。例1在22q13.2q13.33区存在7.1 Mb的杂合缺失，涉及SHANK3、FBLN1等54个OMIM基因；例2为嵌合体核型，约12%的细胞22q13.31q13.33区存在6.6 Mb的杂合缺失，覆盖SHANK3、PPARA等48个OMIM基因，另有5%的细胞22q11.1q13.2区存在26.1 Mb的拷贝重复，覆盖285个OMIM基因；例3在22q11.1q11.21区存在1.7 Mb的二次重复，涉及CECR1、CECR2、ATP6V1E1等10个OMIM基因。三例胎儿父母的核型及SNP-Array检测结果均未见异常，提示胎儿为新发变异。结论:22号染色体微缺失/微重复所致疾病的严重性不仅与其范围有关，还与染色体结构、基因剂量及环境等密切相关。在产前诊断中综合运用超声和多种遗传学检测技术可以显著提高表型变异较大的遗传学异常的检出率。

The uterus is transiently receptive for embryo implantation. It remains to be understood why the uterus does not reject a semi-allogeneic embryo (to the biological mother) or an allogeneic embryo (to a surrogate) for implantation. To gain insights, we examined uterine early response genes approaching embryo attachment on day 3 post coitum (D3) at 22 hours when blue dye reaction, an indication of embryo attachment, had not manifested in mice. C57BL/6 pseudo-pregnant (control) and pregnant mouse uteri were collected on D3 at 22 hours for microarray analysis. The self-assembling-manifold ( SAM) algorithm identified 21,858 unique probesets. Principal component analysis indicated a clear separation between the pseudo-pregnant and pregnant groups. There were 106 upregulated and five downregulated protein-coding genes in the pregnant uterus with fold change (fc) >1.5 and q value <5%. Gene ontology (GO) analysis of the 106 upregulated genes revealed 38 significant GO biological process (GOBP) terms ( P <0.05), and 32 (84%) of them were associated with immune responses, with a dominant natural killer (NK) cell activation signature. Among the top eight upregulated protein-coding genes, Cyp26a1 inactivates retinoic acid (RA) while Lrat promotes vitamin A storage, both of which are expected to attenuate RA bioavailability; Atp6v0d2 and Gjb2 play roles in ion transport and transmembrane transport; Gzmb, Gzmc, and Il2rb are involved in immune responses; and Tdo2 is important for kynurenine pathway. Most of these genes or their related pathways have functions in immune regulations. RA signaling has been implicated in immune tolerance and immune homeostasis, and uterine NK cells have been implicated in immunotolerance at the maternal-fetal interface in the placenta. The mechanisms of immune responses approaching embryo attachment remain to be elucidated. The coordinated effects of the early response genes may hold the keys to the question of why the uterus does not reject an implanting embryo.

目的:对原发性远端肾小管酸中毒（distal renal tubular acidosis，dRTA）患者进行基因突变分析和基因型-表型相关性研究，以提高对该病的认识和理解。方法:通过Sanger测序或全外显子组测序的方法对2010年4月至2020年9月青岛大学附属医院和青岛大学附属市立医院确诊的来自37个家系的44例原发性dRTA患者进行致病基因突变分析，根据2015年美国医学遗传学和基因组学学会（American College of Medical Genetics and Genomics，ACMG）的分类标准和指南评估变异致病性。总结患者的临床特点，并进行基因型和表型的关联研究。结果:44例dRTA患者共确定 SLC4A1基因7个变异， ATP6V0A4基因17个变异， ATP6V1B1基因15个变异，其中新增11个新变异；根据ACMG指南，39个变异中致病性、可能致病性和良性变异分别为22、16和1个。9例患者是 SLC4A1基因突变导致的常染色体显性遗传dRTA，4例患者为 SLC4A1基因突变导致的常染色体隐性遗传dRTA合并东南亚卵圆形红细胞增多症并伴有贫血，14例和8例患者分别为 ATP6V0A4基因和 ATP6V1B1基因突变导致的常染色体隐性遗传dRTA，2例患者不符合常染色体隐性遗传模式仅携带1个 ATP6V1B1杂合突变，7例患者检测结果为阴性。43例患者均为完全性dRTA，1例患者为不完全性dRTA。 ATP6V0A4基因和 ATP6V1B1基因突变导致患者感音神经性耳聋的患病率分别为2/14和6/10。成人、儿童和婴幼儿慢性肾脏病的发生频率分别为4/4、2/4、1/36。经以枸橼酸钾钠合剂为基础的药物治疗后，大部分患儿的生长发育（28/40）和电解质紊乱（41/44）得到明显改善。 结论:本研究44例原发性dRTA共发现3个致病基因 SLC4A1、 ATP6V0A4、 ATP6V1B1的39个变异位点，其中11个为新变异。dRTA人群基因型和表型密切相关。经恰当的治疗后，大部分患者的病情获得改善。本研究丰富了人类基因突变数据库，将为dRTA人群的遗传咨询和诊治提供有益的借鉴。

目的:探讨一例 ATP6V0A2基因相关常染色体隐性皮肤松弛症(autosomal recessive cutis laxa, ARCL)患儿的临床表现及遗传学特点。 方法:收集1例 ATP6V0A2基因相关ARCL患儿的临床资料，对患儿进行全外显子组测序分析(trio-whole exome sequencing, trio-WES)，Sanger测序对可能的变异位点进行验证，并复习文献总结该类疾病的临床表现和遗传学特征。 结果:患儿5岁2月龄，身高109.5 cm(40%)，体重14.2 kg(<3%)，眼裂下斜、眼距宽、宽鼻梁、前额突、长人中，腹部、双侧腹股沟皮肤松弛、皱纹明显，双侧隐睾，既往有"脐疝"病史， ATP6V0A2基因存在复合杂合变异，包含1个移码变异c.1421_1424delAGTC(p.Val476Thrfs*71)和1个剪接位点变异c.2293+1G>A，2个变异位点文献均未见报道。本研究对既往文献报道的75例 ATP6V0A2基因相关ARCL患者的临床表型进行分析，结果显示皮肤松弛(100%，75/75)、特殊面容(78.7%，59/75)和前囟大或闭合延迟(65.3%，49/75)是最常见临床特征，眼裂下斜(57.3%，43/75)、宽鼻梁(40.0%，30/75)和长脸(34.7%，26/75)是最常见的面部特征。 结论:当患者出现皮肤松弛，合并特殊面容、前囟大或闭合延迟、生长发育迟缓、智力发育迟缓和癫痫等应考虑 ATP6V0A2基因相关ARCL。全外显子组测序是一种快速鉴定致病变异的精确方法，有助于早期确诊。

目的:本研究旨在探究微伏级T波电交替（MTWA）对心脏再同步治疗（CRT）患者远期快速性室性心律失常（VTA）发生的预测价值。方法:本研究为诊断性试验研究。选取自2010年5月至2015年1月于南京医科大学第一附属医院心血管内科成功植入心脏再同步治疗起搏器（CRT-P）或心脏再同步治疗除颤器（CRT-D）的慢性心力衰竭（CHF）患者45例，年龄（59.5±12.3）岁，男33例（73.3%，33/45）。所有患者均于术前和术后6个月接受超声心动图和心电图检查，采用活动平板时域法于术后1周内和6个月时在双心室（BiV）110次/min起搏频率下测定MTWA。VTA事件均采自程控仪调取的CRT-P或CRT-D记录的持续性室性心动过速（室速）、心室颤动（室颤），包括抗心动过速起搏（ATP）、电复律（CV）或电除颤治疗的事件，随访（55.3±34.2）个月。按照有无发生VTA事件将患者分为VTA组（A组）和无VTA组（B组）。结果:①CRT对CHF患者左心室射血分数（LVEF）及MTWA的影响：a.两组患者术后6个月LVEF较基线均明显增高[A组：（36.8%±9.8%）对（30.0%±7.1%）， P=0.004；B组：（44.1%±12.7%）对（31.5%±7.6%）， P<0.001]；b.两组患者术后6个月MTWA（MTWA2）较基线MTWA（MTWA1）均有下降，但差异无统计学意义。②MTWA对CRT术后远期VTA发生的预测价值：a.基线和术后6个月A组患者的MTWA值明显大于B组[MTWA1：（26.6±21.0）μV对（11.4±6.8）μV， P=0.002；MTWA2：（19.0±15.4）μV对（9.8±10.0）μV， P=0.02]。b.以22 μV和13 μV分别作为MTWA1和MTWA2的分界点，将患者分为MTWA阳性组与阴性组，基线与术后6个月MTWA阳性组患者VTA的发生率均明显大于MTWA阴性组（基线， P=0.002；术后6个月， P=0.012）。MTWA1以22 μV为最佳分界点，预测VTA事件的敏感性为47.6%，特异性为95.8%；MTWA2以13 μV为最佳分界点，预测VTA事件的敏感性为61.9%，特异性75.0%。c.用Log rank法对VTA发生时间分布的差异进行检验：MTWA1阳性组、MTWA2阳性组发生VTA的时间比同组阴性组发生时间明显缩短。d.采用二分类Logistic回归分析评估MTWA1、MTWA2与LVEF对VTA的影响，结果显示相对于LVEF，MTWA值对VTA的发生具有更好的预测作用。 结论:MTWA对CRT患者远期VTA的发生有良好的预测价值。

目的:胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma，PAAD)是消化系统中恶性程度较高的肿瘤之一，预后较差。本研究旨在通过生物信息学方法和乳酸代谢基因构建PAAD预后模型来研究其临床意义以及分析乳酸代谢基因与肿瘤微环境之间的关系。方法:分别从TCGA和GTEx数据库下载胰腺癌和非病变胰腺组织数据，乳酸代谢基因从GeneCards数据库下载，识别PAAD差异表达乳酸代谢基因后通过单变量和LASSO-Cox方法构建PAAD乳酸代谢基因预后模型。ssGSEA和ESTIMATE算法评估乳酸风险基因与肿瘤微环境之间的关系。结果:预后模型由7个关键乳酸基因构成( UCA1、 ARNT2、 PNPLA6、 ATP6V0A1、 MET、 PRPF8、 KRT7)，对于独立预测PAAD患者的预后具有重要的临床价值。在肿瘤微环境中，乳酸代谢高风险组多种免疫细胞浸润呈现抑制状态，包括NK细胞、调节性T细胞、嗜酸细胞等。 结论:通过乳酸代谢基因构建的PAAD预后模型和肿瘤微环境的分析结果对PAAD患者的预后改善和临床治疗提供新的证据。

目的:分析原发性远端肾小管酸中毒（dRTA）患儿的临床特点及基因型和临床表型的关系。方法:回顾性分析重庆医科大学附属儿童医院2010年1月至2020年12月诊断的27例dRTA患儿的一般情况、临床表现、实验室检查、基因检测及随访（截至2021年3月）等临床资料。根据致病基因不同分为SLC4A1基因组和ATP6V0A4+ATP6V1B1基因组，比较不同基因型组患儿起病年龄、临床表现和实验室检查结果。同时比较患儿治疗前后身高标准差积分、体重标准差积分和血pH值、血钾浓度等。组间比较采用 t检验、Fisher确切概率法、秩和检验。 结果:27例dRTA患儿中男16例、女11例，起病年龄33.4（10.0，36.0）月龄。22例（81%）SLC4A1基因变异，3例（11%）ATP6V1B1基因变异，2例（8%）ATP6V0A4基因变异。22例（81%）患儿有肾脏钙质沉积，19例（70%）有低钾表现，18例（67%）有身材矮小，16例（59%）有营养不良，16例（59%）有佝偻病，15例（56%）有多饮、多尿等临床表现。SLC4A1基因组患儿起病年龄大于ATP6V0A4+ATP6V1B1基因组［27.3（12.0，36.0）比8.2（2.5，15.0）月龄， H=6.33， P=0.012］，临床表现、实验室检查结果差异均无统计学意义（均 P>0.05）。27例患儿病程3.9（1.3，6.0）年、随访3.1（1.0，4.5）年。SLC4A1基因组和ATP6V0A4+ATP6V1B1基因组临床表现恢复率及末次实验室检查结果差异均无统计学意义（均 P>0.05）。治疗后患儿身高标准差积分、体重标准差积分均较治疗前升高（-3.2±1.9比-2.1±1.1、-2.5±1.5比0±1.9， t=-2.94、-5.44，均 P<0.01）。血钾及pH值均较治疗前上升［（3.2±0.5）比（4.0±0.5）mmol/L、7.27±0.07比7.37±0.07， t=-4.92、-5.25，均 P<0.01］。14例患儿血钾恢复正常，12例血pH值恢复正常，仅4例血清碳酸氢根浓度、实际碱剩余恢复正常。 结论:SLC4A1基因变异的dRTA患儿起病年龄晚于ATP6V0A4和（或）ATP6V1B1基因变异患儿，病情及预后与致病基因无相关性。早诊断、早治疗、规律随访、及时调整用药可改善患儿预后，提高患儿生存质量。血清碳酸氢根浓度、实际碱剩余可能不是评估临床恢复的必备指标。

目的:分析1例原发性远端肾小管酸中毒(dRTA)患儿的临床及遗传学特征。方法:选取2021年4月因"食纳差10 d，哭闹2 d"就诊于西安市儿童医院的1例原发性dRTA患儿作为研究对象，收集患儿的临床资料。应用全外显子组测序及Sanger测序进行变异分析及家系验证。结果:患儿为1月18日龄男性，临床主要表现为食纳差、烦躁哭闹、体重不增及脱水。患儿实验室检查提示代谢性酸中毒、电解质紊乱(高氯、低钾)、反常性碱性尿及贫血；泌尿系彩色多普勒超声提示双肾髓质钙盐沉积。基因检测发现患儿 ATP6V0A4基因存在父源性c.1363dupA(p.M455NfsX14)和母源性c.2257C>T(p.Q753X)复合杂合变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会相关变异标准与指南，c.1363dupA(p.M455NfsX14)评级为致病性变异(PVS1＋PM3＋PM2_Supporting)，c.2257C>T(p.Q753X)评级为致病性变异(PVS1＋PM3＋PM2_Supporting)。 结论:ATP6V0A4基因c.1363dupA(p.M455NfsX14)和c.2257C>T(p.Q753X)变异考虑是患儿致病的原因。c.2257C>T(p.Q753X)变异的发现拓展了 ATP6V0A4基因的变异谱。

目的:探讨1例癫痫性脑病(DEE)患儿的临床表型及遗传学病因。方法:收集2021年2月就诊于广东医科大学附属医院儿童医学中心的1例患儿的临床资料进行回顾性分析。采集患儿及其父母的外周血样，对其进行全外显子组测序，对候选变异进行Sanger测序验证。以" ATP6V0A1基因""发育性及癫痫性脑病104型"" ATP6V0A1 variant""developmental and epileptic encephalopathy 104""DEE 104""epileptic encephalopathy"为关键词检索中国知网、万方数据平台以及PubMed数据库中的相关文献，检索时间为建库至2022年12月。 结果:患儿为5月龄男性，婴儿期起病，表现为频繁的局灶性发作，伴严重发育落后，体型消瘦、小头畸形、外眦上斜，精灵耳，四肢肌张力低下。患儿脑电图提示多灶性尖波、慢波、棘慢波发放，头颅MRI发现双侧侧脑室、第三脑室扩大，脑沟、脑裂、脑池增宽。测序结果提示患儿 ATP6V0A1基因存在c.2401C>T(p.His801Tyr)新发错义变异，判读为可能致病性(PS2＋PM2_Supporting＋PP3)。结合患儿的临床表型和基因检测结果，确诊其为DEE104型。共检索到 ATP6V0A1基因变异所致DEE104型文献2篇，共14例。DEE104型患者变异以杂合变异为主，热点变异为c.2219G>A(10/14, 71.4%)，最常见的临床特征为难治性癫痫发作及发育迟缓(14/14, 100.0%)。 结论:患儿考虑为 ATP6V0A1基因c.2401C>T的杂合变异所致的癫痫型脑病104型。