目的 探讨术前边缘区影像组学分析在三阴性乳腺癌(TNBC)术后复发的鉴别诊断价值.方法 回顾性收集2016年1月至2022年6月在海安市人民医院进行TNBC手术切除的139例患者资料,并依据随访结果分为复发组和未复发组.所有患者均接受乳腺二维超声(2DUS)检查.使用Image J基于高频灰阶声像图勾勒病灶边缘区,并提取感兴趣区(ROI).基于Pyradiomics提取影像组学特征,并运用组内相关系数(ICC)、单因素分析及最小绝对值收缩和选择算子(LASSO)和自相关矩阵进行特征降维.采用Pearson相关分析影像组学特征与Ki-67指数及复发时间的关系.采用多元logistic回归构建影像组学模型,采用ROC曲线、校准曲线及决策曲线评价影像组学模型预测效能.结果 排除11例失访者,最终纳入128例患者.按照7:3比例分为训练集90例和测试集38例.训练集边缘区影像组学特征降维后最终得到5个关键特征(X1:original_glszm_Gray-LevelNonUniformity,X2:original_glcm_Contrast,X3:wavelet-HLL_gldm_LowGrayLevelEmphasis,X4:wavelet-HHH_gl-szm_GrayLevelNonUniformity,X5:wavelet-HHH_glrlm_GrayLevelNonUniformityNormalized).相关性分析证实 X1、X2、X4 与Ki-67指数均呈正相关,与复发时间均呈负相关(均P＜0.05);X3和X5与Ki-67指数均呈负相关,与复发时间均呈正相关(均P＜0.05).多元 logistic 回归模型显示X2(OR=1.126,95％CI:1.086～1.165)、X3(OR=1.100,95％CI:1.056～1.143)和 X5(OR=1.142,95％CI:1.109～1.172)是TNBC是否复发的独立影响因素.影像组学模型在训练集AUC为0.892(95％CI:0.828～0.962),验证集AUC为0.873(95％CI:0.809～0.943).校准曲线及决策曲线显示影像组学模型具有良好的校准度和临床实用性.结论 病灶边缘区影像组学特征分析具有良好的鉴别诊断效能,可有效预测TNBC术后复发风险.

基于农业行业标准《植物新品种特异性、一致性和稳定性测试指南 辣椒》(辣椒DUS测试指南),利用47个基本性状作为形态学标记对457份近十年新育成辣椒品种进行数量性状分析、性状间相关性分析、品种聚类分析及多年栽培的稳定性分析等,综合分析目前我国新育成辣椒栽培品种特性及遗传多样性.利用11个数量性状进行分析发现供试品种呈现较好的多态性分布,品种间变异系数在23％～93％之间,而品种内平均变异系数均小于20％,说明供试品种内表达较为一致且品种间表达状态丰富,性状相关性分析发现数量性状中有4组之间显著相关;品种聚类分析在遗传相似系数0.52处可将457份种质资源划分成10大类,大部分品种集中在3个大类;通过两年栽培试验分析品种年度间稳定性和性状年度间稳定性,结果显示品种年度间表现较为稳定,平均相关系数为88.0％,年度间相关性中个体测量性状稳定于群体目测性状,群体测量性状年度间稳定性最低.本研究通过对457份新育成辣椒品种的形态学数据进行多层次综合分析,以此研究辣椒种质资源的遗传多样性,同时通过稳定性分析,进一步分析目前我国新育成辣椒栽培品种特性,为辣椒品种资源做出客观、严谨的评价,为辣椒品种选育提供基础.

特异性、一致性和稳定性是植物品种权授权、品种审定、登记的基本条件.近似品种选择是特异性测试的技术关键.本研究依据玉米DUS测试指南,对黄淮海地区3696份玉米品种进行了多年同一测试地点的性状观测,构建了黄淮海地区玉米品种测试性状数据库.通过对不同测试性状表达状态代码波动范围的研究,将玉米测试性状根据表达稳定性分为4级,确定了玉米品种27个测试性状表达状态代码的波动范围.在上述工作基础上,建立了基于测试性状表型数据库的近似品种筛选方法,提高了近似品种筛选的严谨性和效率.

为了评价SSR分子标记在辣椒(Capsicum annuum L.)品种特异性、一致性、稳定性(DUS)测试中的应用潜力,采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术和毛细管电泳技术,对辣椒SSR引物进行筛选,采用入选的30对核心引物,构建130份不同来源品种的指纹图谱.30对引物共检测到等位基因163个,每对引物等位基因变幅为2～15,平均等位基因数为5.43,多态信息量(PIC)的变异范围为0.17～0.76,平均为0.43.聚类分析表明,该套引物可以将所有参试品种区分开来,遗传基础相近的品种优先聚在一起.130个品种的遗传距离为0.01～0.91.有20对品种遗传距离小于0.10,其中3对品种有1个位点的差异,采用差异位点数判断品种特异性更适合目前辣椒品种现状.采用10对引物对品种0313963-4进行了一致性检测,综合一致性比率R值为96.5％,低于DUS测试中对表型性状一致性的要求.因此SSR标记直接用于辣椒DUS判定还需进一步研究,但是可用于近似品种筛选.

金针菇是著名的食、药两用真菌.以45份金针菇品种为试验材料,对21个性状进行分级与评价,对12个数量性状进行分级,并对其中10个数量性状的相关性和2个数量性状的不同测量部位的影响进行了研究.结果 表明:所有性状均适合作为DUS(特异性、一致性和稳定性)测试性状,12个数量性状可分别划分为3-5级;10个数量性状至少与1个其他数量性状显著相关;菌柄由上往下逐渐变粗,不同品种变粗程度略有差异,测量菌柄直径时要求测量菌柄上部1/3处;子实体数量由下往上逐渐减少,不同品种减少程度略有差异,测量子实体数量时要求测量单瓶中长度在基部1/3以上的子实体个数;形态性状的聚类分析结果支持将“菌落:表面色素”、“菌盖:纵切面形状”和“菌盖:表面颜色”作为分组性状.

为解决DUS测试中特异性测试近似品种筛选难的问题,本研究基于2256份DUS测试小麦已知品种构建DNA指纹数据库.首先利用81对SSR引物对96份小麦品种进行遗传相似度分析.结果 表明,81对SSR引物扩增出84个位点,共检测到731个等位变异,每个位点的等位变异数在3～18之间,多态性信息指数(PIC)变化范围为0.29～0.89.选取42个SSR标记构建了2256份小麦品种DNA指纹数据库,共获得148493个数据,除引物barc14、xgwm341之外,其他引物数据缺失率在5％以内.对176份小麦品种进行DNA指纹数据采集和特异性测试,结果表明不具有特异性的申请品种与其最近似品种的遗传相似度都在90％以上;本研究基于42对SSR荧光标记引物构建了我国小麦DUS测试已知品种的DNA指纹数据库,确定近似品种筛选的遗传相似度阈值为80％,建议将与申请品种遗传相似度高于80％的已知品种作为近似品种进行田间种植和特异性评价.

为了保护育种家合法权益、规范种业市场、提高种子市场监管效率等,本研究拟建立一套普通菜豆品种SSR分子标记鉴定体系.首先,遴选12个产地不同、植物学形态差异较大的普通菜豆品种,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选出120对多态性高、条带清晰的SSR引物;然后,利用荧光毛细管电泳技术对筛选出的引物多态性在96个普通菜豆品种中进一步检测,最终获得在菜豆基因组上均匀分布、多态性高、峰型稳定的33对SSR核心引物.在此基础上,依据扩增片段长度和荧光标记颜色对核心引物进行分组,并设置参照品种以校正不同实验批次和平台之间的误差,建立了基于SSR标记的品种鉴定体系.同时,构建了包含申请品种、保护品种、主栽品种和地方品系在内的161个普通菜豆品种的指纹数据库.这套核心引物能够将其中的140个品种区分开,遗传相似系数平均值为0.33,表明这些品种遗传多样性较丰富;未区分开的21个品种在产地、父母本、植物学性状等方面极其相似,但能通过部分性状加以区分,表明该套核心引物在辅助近似品种筛选方面非常有效.本研究建立的基于SSR分子标记的普通菜豆品种鉴定体系将为其真实性鉴定及DUS测试近似品种辅助筛选提供有力支撑.

小麦近缘种属来源的抗白粉病基因是培育小麦抗病品种,防治白粉病危害的最重要基因来源.Pm57是位于西尔斯山羊草2Ss#1染色体长臂上的一个外源基因,对小麦白粉病具有苗期和成株期广谱抗性.为了创制Pm57白粉病抗性丧失突变体,利用基于基因突变体的植物抗病基因克隆新兴技术分离Pm57基因,选用0.625％的甲基磺酸乙酯(EMS)对1万粒小麦-西尔斯山羊草Pm57易位系89(5)69种子进行了诱变处理,M1大田密播种植,收获了1598个M2可育株系.初步对其中300个M2株系进行苗期白粉病抗性接种鉴定,并利用2个Pm57基因特异分子标记X2L4g9P4/HaeⅢ和X284274及小麦全国区试品系DUS测试所用的42对SSR核心引物对Pm57抗性丧失突变体进行鉴定,筛选出来自27个M2株系的真实抗性丧失突变体70个,Pm57基因抗性丧失突变体频率达到9.0％.本研究所获得的白粉病抗性丧失突变体为Pm57基因的后续克隆与抗白粉病分子机理研究提供了重要的材料基础.

利用74份玉簪品种对19个数量性状进行筛选和分级研究,并对不同性状的测量时期和部位进行了探讨.结果 表明:叶柄宽度的测试方式采取自然状态下直接测量,花序梗长度测量从基部到第1花苞片着生处的长度,苞片性状全部观测第1花苞片,花相关性状以1～3花中的完全开放花为观测对象;所有候选性状均符合DUS测试指南性状选用的条件,可分为3～9个连续的分级;植株、叶片的观测可改在开花期观测,花序相关性状则在末花期观测.

本文以人外周血淋巴细胞非程序DNA合成（UDS)为观察指标，对职业接触铅的21名男工进行了测试。结果表明接触组与对照组之间没有显著差异。因此，铅不诱导人淋巴细胞的UDS。