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基于蛋白激酶NEK9/MTA2信号通路泛素化修饰探讨胃癌的转移机制
编辑人员丨5天前
目的:基于永离有丝分裂基因A相关激酶9(NEK9)/转移相关肿瘤基因家族2(MTA2)信号通路泛素化修饰探讨胃癌(GC)的转移机制.方法:使用癌症基因组图谱(TCGA)和Kaplan-Meier Plotter数据库分析NEK9表达与GC分期、预后之间的关联.体外实验中,将GC细胞分为:对照组、shNC 组、shNEK9 组、shNC+NC-OE 组、shNEK9+NC-OE 组和 shNEK9+MTA2-OE 组.分别采用 MTT 和Transwell法测定细胞的增殖、迁移和侵袭,并通过 Western blot检测 NEK9、MTA2、上皮间充质转化(EMT)标记和PI3K/AKT信号通路蛋白表达.结果:TCGA数据库分析显示,NEK9 mRNA在肿瘤组织中的表达明显上调,并且与TNM分期较晚和NEK9高表达者的预后较差密切相关.此外,NEK9在7个GC细胞系中的表达明显高于正常胃上皮GES-1细胞(P<0.05).与对照组相比,shNEK9组细胞活力、相对集落形成、EdU阳性细胞数、侵袭和迁移细胞数均显著降低(P<0.05).此外,在shNEK9组细胞中,E-钙粘蛋白水平上调(P<0.05),波形蛋白水平下调(P<0.05).通过免疫共沉淀试验证明NEK9与MTA2有相互作用.NEK9敲低加速了 HGC-27细胞中MTA2的降解,并且 MTA2泛素化在NEK9沉默的细胞中增加.与shNEK9+NC-OE组组相比,shNEK9+MTA2-OE组相对集落形成、EdU阳性细胞数和迁移和侵袭数均显著增加(P<0.05).结论:NEK9在GC中明显上调,其敲低在体外抑制GC细胞的生长和转移.NEK9可能通过去泛素化途径稳定 MTA2进而激活PI3K-AKT信号通路来对GC细胞产生促癌影响.
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编辑人员丨5天前
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胃癌上皮-间充质转化过程中微小RNA-579-3p/含锌指和BTB域4通路的作用及其机制
编辑人员丨5天前
目的:探讨微小RNA-579-3p(miR-579-3p)/含锌指和BTB域4(ZBTB4)通路在胃癌上皮-间充质转化(EMT)中的作用机制。方法:生物信息学筛选胃癌与癌旁组织差异表达的微小RNA(miRNA);实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)法检测50例患者胃癌和癌旁癌旁组织中miR-579-3p、ZBTB4表达;检测胃上皮细胞株GES-1和胃癌细胞株HGC27、AGS、MKN45中miR-579-3p的表达,分析miR-579-3p与临床病理特征的关系。生物信息学分析miR-579-3p靶基因。双荧光素酶报告基因验证miR-579-3p与ZBTB4的调控关系。应用miR-579-3p抑制物(inhibitor)干扰HGC27细胞株miR-579-3p表达,细胞计数试剂盒(CCK-8)法、划痕实验、Transwell小室实验检测细胞增殖、迁移和侵袭能力;RT-qPCR和蛋白质印迹法(Western blot)检测mRNA和蛋白表达水平。采用 t检验、 χ2检验分析数据。 结果:生物信息学筛选后RT-qPCR检测结果发现miR-579-3p在胃癌组织中表达显著高于癌旁组织(3.259±1.307比1.326±0.419, t=9.959, P<0.01),miR-579-3p表达与胃癌分化和淋巴结转移明显相关( χ2=4.500、7.714, P<0.05);miR-579-3p在胃癌细胞株表达均高于GES-1( P<0.01)。转染miR-579-3p抑制剂的HGC-27细胞活性(0.500±0.068比1.223±0.089, t=15.780, P<0.01)、迁移率(0.228±0.039比0.533±0.056, t=7.707, P<0.01)和侵袭细胞数[(89.000±7.550)个比(206.700±8.505)个, t=17.92, P<0.01]显著低于对照组。RT-qPCR结果显示miR-579-3p inhibitors组波形蛋白(Vimentin)(0.248±0.030比1.061±0.150, t=9.258, P<0.01)、基质金属蛋白酶-2(MMP-2)(0.178±0.030比1.013±0.195, t=3.320, P<0.01)和连接蛋白细胞黏附分子(Nectin-4)(0.465±0.065比1.042±0.154, t=5.990, P<0.01)的mRNA表达明显低于对照组,而E-钙黏蛋白(E-cadherin)mRNA(3.249±0.460比1.000±0.175, t=7.990, P<0.01)的表达明显高于对照组,Western blot检测显示抑制miR-579-3p表达后Vimentin(0.420±0.271比1.004±0.095, t=3.528, P<0.05)、MMP-2(0.663±0.119比0.922±0.068, t=3.283, P<0.05)、Nectin-4表达(0.660±0.130比0.919±0.080, t=2.982, P<0.05)低于对照组,而E-cadherin蛋白表达(1.352±0.113比0.994±0.005, t=5.483, P<0.01)高于对照组。生信分析结果显示ZBTB4是miR-579-3p靶基因;双荧光素酶报告基因分析表明过表达miR-579-3p后野生组中ZBTB4基因活性明显低于对照组(0.323±0.020比1.095±0.131, t=11.690, P<0.01)。RT-qPCR显示ZBTB4在胃癌组织中表达低于癌旁组织( t=7.713, P<0.01);皮尔逊相关分析结果显示ZBTB4与miR-579-3p呈负相关( r=-0.470, P<0.01)。RT-qPCR和Western blot显示抑制miR-579-3p后ZBTB4表达明显增强( P<0.01)。 结论:miR-579-3p/ZBTB4通路激活促进胃癌的EMT。
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编辑人员丨5天前
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miR-146a基因rs2910164 G/C多态性与miR-146a异常表达与胃癌风险相关性的研究
编辑人员丨5天前
目的:探讨miR-146a基因单核苷酸多态位点rs2910164 G/C是否影响miR-146a的表达并改变其对胃癌的易感性。方法:选取53例胃癌患者和6株胃癌细胞株(AGS、BGC-823、HGC27、MKN-28、MKN-45和SGC-7901),采用Taqman定量PCR检测miR-146a的表达,构建miR-146a过表达细胞模型,探究miR-146a过表达对胃癌细胞AGS生长的影响,然后对417例胃癌患者和420名无癌对照者进行病例对照研究,检测miR-146a基因rs2910164位点的等位基因和基因型频率,基因分型采用Taqman等位基因判别法;用Taqman对65例已知基因型胃癌患者的成熟和pri-miR-146a转录本进行定量分析。结果:miR-146a在53例胃癌和6种胃癌细胞系中表达下调,miR-146a的过表达通过抑制AGS细胞G1/S期转变抑制胃癌细胞生长;病例对照研究结果显示,与GG基因型受试者相比,携带GC/CC基因型的受试者患胃癌的风险显著降低;与GG基因型相比,GC/CC基因型miR-146a G/C SNP显著提高成熟miR-146a水平。结论:miR-146a的下调在胃癌发生中发挥重要作用,miR-146a基因rs2910164多态位点可通过影响成熟miR-146a的加工过程而降低胃癌风险。
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编辑人员丨5天前
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hsa_circ_0000670通过miR-515-5p/SIX1分子轴促进胃癌进展
编辑人员丨5天前
目的:探讨hsa_circ_0000670通过调控miR-515-5p/SIX1分子轴促进胃癌进展的分子机制。方法:收集2014—2015年南通大学附属如皋医院收治的35例胃癌患者的胃癌及癌旁正常组织,采用实时荧光定量聚合酶链反应法和Western blot法分别检测胃癌组织、癌旁正常组织、人胃上皮细胞GES-1、胃癌细胞AGS、HGC-27中circ_0000670、miR-515-5p、SIX1的表达水平;采用Pearson相关分析分析circ_0000670与miR-515-5p、miR-515-5p与SIX1、circ_0000670与SIX1的相关性。采用Kaplan-Meier法和Log rank检验分析circ_0000670低表达组(17例)和circ_0000670高表达组(18例)患者的生存情况。采用平板克隆形成实验检测细胞增殖能力,流式细胞术检测细胞周期及凋亡率,采用划痕实验、Transwell实验检测细胞迁移及侵袭能力,双荧光素酶报告实验检测circ_0000670与miR-515-5p、miR-515-5p与SIX1的靶向关系。分别将sh-NC、sh-circ_0000670转染至HGC-27细胞,将细胞注射入裸鼠体内,检测移植瘤体积及重量,并检测移植瘤组织中circ_0000670、miR-515-5p及SIX1蛋白的表达水平,Western blot法检测E-cadherin、Vimentin蛋白表达水平。结果:胃癌组织及细胞系中circ_0000670、SIX1的表达水平高于癌旁正常组织及胃上皮细胞GES-1,miR-515-5p的表达水平低于癌旁正常组织及胃上皮细胞GES-1(均 P<0.05)。circ_0000670低表达组患者5年生存率(82.4%)高于circ_0000670高表达组(28.7%, P=0.034)。circ_0000670与miR-515-5p、miR-515-5p与SIX1呈负相关( r分别为-0.846、-0.615,均 P<0.001),circ_0000670与SIX1呈正相关( r=0.814, P<0.001)。转染si-circ_0000670或转染miR-515-5p mimic可减弱胃癌细胞AGS、HGC-27增殖、迁移及侵袭能力(均 P<0.05),阻滞细胞于G 0/G 1期,增加细胞凋亡能力,提高E-cadherin蛋白表达水平,降低S期细胞比例及Vimentin蛋白表达水平(均 P<0.05)。双荧光素酶报告实验证实,circ_0000670可靶向调控miR-515-5p,miR-515-5p可靶向调控SIX1。共转染si-circ_0000670与miR-515-5p inhibitor可逆转转染si-circ_0000670对细胞增殖、迁移、侵袭、细胞周期及凋亡的作用(均 P<0.05);共转染miR-515-5p mimic与pcDNA-SIX1可逆转转染miR-515-5p mimic对细胞增殖、迁移、侵袭、细胞周期及凋亡的作用(均 P<0.05)。sh-circ_0000670组小鼠移植瘤体积及重量[分别为(299.20±47.58)mm 3和(289.80±48.73)g]低于sh-NC组[分别为(596.20±125.46)mm 3和(538.00±114.39)g,均 P<0.05],sh-circ_0000670组小鼠移植瘤组织中circ_0000670和SIX1表达水平降低,miR-515-5p的表达水平升高(均 P<0.05)。 结论:敲降circ_0000670的表达可通过调控miR-515-5p/SIX1分子轴从而减弱胃癌细胞增殖、迁移及侵袭能力,诱导细胞周期阻滞于G 0/G 1期及促进细胞凋亡。
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编辑人员丨5天前
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微小RNA-140-5p调控组蛋白去乙酰化酶4表达在胃癌转移中的作用及其机制
编辑人员丨5天前
目的:探究微小RNA-140-5p(miR-140-5p)通过靶向调控组蛋白去乙酰化酶4(HDAC4)基因表达在胃癌转移中的作用及机制。方法:收集2020年4月至2020年10月齐齐哈尔医学院附属第三医院院胃癌患者手术切除癌组织以及癌旁组织(52例);细胞实验对象为购买人胃正常上皮黏膜细胞系GES-1和胃癌细胞系MGC-803、SGC-7901和HGC-27。采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)以及蛋白质印迹法(Western blot)检测胃癌患者肿瘤组织中HDAC4的表达。在线网站Targetscan预测HDAC4上游调控miRNA。双荧光素酶报告实验验证miR-140-5p和HDAC4的靶向关系。胃癌细胞依据不同转染处理分组为si-NC组、si-HDAC4组、mimic-NC组、miR-140-5p mimic组、inhibitor-NC组和miR-140-5p inhibitor组。采用RT-qPCR检测胃癌细胞miR-140-5p的表达,Western blot检测HDAC4蛋白表达。Transwell实验检测细胞迁移和侵袭;流式细胞术检测细胞凋亡,组间比较采用 t检验。 结果:胃癌组织中的HDAC4的mRNA和蛋白表达高于癌旁组织(1.024±0.099比1.512±0.065;0.916±0.160比1.734±0.289, t=29.71、17.86,均 P<0.05)。在胃癌细胞中miR-140-5p与HDAC4存在结合位点,双荧光素酶报告实验验证miR-140-5p结合在HDAC4的3’端非编码区(3’UTR)(0.986±0.050比0.436±0.039, t=15.02, P<0.05)。胃癌细胞中miR-140-5p表达显著低于正常细胞(1.021±0.054比0.362±0.029, t=18.62, P<0.05)。miR-140-5p mimic组细胞迁移(180.000±5.890比54.000±3.230, t=32.49, P<0.05)和侵袭(94.000±5.430比43.000±3.420, t=13.77, P<0.05)能力显著低于mimic-NC组,而凋亡能力显著高于mimic-NC组(11.250±1.560比30.240±3.550, t=8.48, P<0.05);miR-140-5p inhibitor组细胞迁移(192.000±6.000比284.000±8.430, t=15.37, P<0.05)和侵袭(89.000±5.110比153.000±6.990, t=12.80, P<0.05)能力显著高于inhibitor-NC组,而凋亡能力显著低于inhibitor-NC组(13.200±1.620比5.350±1.000, t=7.14, P<0.05)。miR-140-5p mimic+Jagged1/FC组细胞迁移(60.000±3.430比196.000±7.230, t=29.44, P<0.05)和侵袭(48.000±3.750比97.000±4.890, t=13.77, P<0.05)能力显著高于miR-140-5p mimic+DMSO组,而细胞凋亡能力显著低于miR-140-5p mimic+DMSO组(28.950±3.240比12.050±1.430, t=8.27, P<0.05)。 结论:胃癌细胞的miR-140-5p上调表达可通过抑制HDAC4/Notch信号轴进而抑制胃癌转移进程。
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编辑人员丨5天前
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黏蛋白16对皮革胃恶性表型的影响
编辑人员丨5天前
目的:观察黏蛋白16(MUC16)基因在皮革胃中的表达和MUC16对胃癌细胞的增殖、侵袭等生物学行为的影响。方法:收集2009年1月至2017年12月在浙江省肿瘤医院首次经病理诊断的13例皮革胃组织标本,用免疫组织化学染色法检测MUC16的表达。采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)和蛋白质印迹法(Western blot)分析MUC16的表达。选取MUC16高表达的细胞系,利用慢病毒构建MUC16敲低的稳转细胞株。将实验分为MUC16敲低组(MUC16-KO组)和阴性对照(NC组),采用细胞计数试剂盒(CCK-8)和克隆形成实验检测不同细胞的增殖能力,用划痕愈合实验和Transwell实验检测不同细胞的迁移和侵袭能力。定性资料用 χ2检验,定量资料采用独立样本 t检验或单因素方差分析结果。 结果:皮革胃组织样本中MUC16的蛋白表达水平明显高于常见胃癌组织(2.99±0.30比1.07±0.48), t=5.942, P<0.05)。人胃癌细胞系KATO Ⅲ、NUGC4、HGC27和AGS中MUC16的信使RNA(messenger RNA,mRNA)的表达水平均高于人正常胃上皮细胞系GES1(9.93±0.79、8.69±0.54、6.37±0.61、3.58±3.30比1.00±0.10, t=19.368、24.373、15.045、13.848,均 P<0.05)。人弥漫型胃癌细胞系KATO Ⅲ、NUGC4、HGC27中MUC16的mRNA表达水平均高于人胃腺癌细胞系AGS(9.93±0.79、8.69±0.54、6.37±0.61比3.58±0.30, t=12.959、14.331、7.082,均 P<0.05)。人胃癌细胞系KATO Ⅲ、NUGC4、HGC27和AGS中MUC16的蛋白表达水平均高于人正常胃上皮细胞系GES1(0.79±0.01、0.62±0.02、0.53±0.00、0.38±0.01比0.08±0.00, t=122.969、46.765、202.339、36.109,均 P<0.05)。且人弥漫型胃癌细胞系KATO Ⅲ、NUGC4、HGC27中的MUC16蛋白表达水平高于胃腺癌细胞AGS(0.79±0.01、0.62±0.02、0.53±0.00比0.38±0.01, t=50.215、18.590、23.986,均 P<0.05)。两种细胞株中的MUC16-KO组在96 h时间点吸光度值均低于NC组[AGS细胞株(0.86±0.02比1.21±0.42), t=12.973, P<0.05;HGC27细胞株(0.45±0.30比1.04±0.11), t=8.936, P<0.05]。两种细胞株MUC16-KO组的克隆形成能力明显低于对照组[AGS(191.67±2.08)个比(243.67±3.51)个, t=22.062, P<0.05;HGC27(66.67±2.52)个比(140.33±20.50)个, t=6.177, P<0.05]。两种细胞株MUC16-KO组的划痕愈合率明显低于对照组[AGS(6.49±0.56)%比(31.19±3.90)%, t=10.856, P<0.05;HGC27(0.32±2.00)%比(4.32±2.00)%, t=3.441, P<0.05]。两种细胞株MUC16-KO组的侵袭能力明显低于对照组[AGS(2 049.00±268.53)个比(3 670.33±290.24)个, t=7.102, P<0.05;HGC27(2 498.33±1 175.35)个比(6 869.67±548.88)个, t=5.837, P<0.05]。 结论:MUC16在皮革胃中高表达,且表达水平比普通胃癌更高。MUC16在胃癌细胞系中的高表达可以促进胃癌细胞的增殖、迁移和侵袭等恶性细胞生物学行为。
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编辑人员丨5天前
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CXC趋化因子受体2受体拮抗剂SCH527123对胃癌细胞增殖迁移抑制作用及机制
编辑人员丨5天前
目的:探究CXC趋化因子受体2(CXCR2)的特征以及SCH527123对胃癌细胞增殖迁移的抑制作用及其机制。方法:对中山大学附属第一医院156例临床标本进行免疫组织化学实验,并培养胃癌细胞株HGC27,检测其增殖、侵袭和血管生成变化。同时通过移植皮下肿瘤进一步研究SCH527123在胃癌中的作用。计量资料组间比较采用 t检验。 结果:CXCR2在胃癌中的表达上调(73.21%比35.71%, χ2=21.656, P<0.01),并且与预后不良相关(Log-rank 3.652, P<0.05)。体外实验结果显示,CXCR2拮抗剂SCH527123通过调节蛋白激酶B(Akt)、细胞外信号调节激酶(ERK)1/2和核因子-κB(NF-κB)通路抑制胃癌细胞的增殖、侵袭和血管形成( P<0.01)。体内实验结果显示,SCH527123抑制皮下移植瘤进展[(186.29±61.36) mm 3比(351.13±195.75) mm 3, t=3.936, P<0.01],减少肿瘤微血管密度和肺转移的发生(15.33±5.51比65.00±7.94, t=8.904, P<0.01)。 结论:CXCR2在胃癌的发展中起重要作用,其拮抗剂SCH527123是一种有效的肿瘤抑制因子,而Akt、ERK1/2和NF-κB通路可能是其作用机制。
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编辑人员丨5天前
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LncRNA ANCR在胃癌患者肿瘤组织中表达的临床意义及其生物学效应研究
编辑人员丨5天前
目的:探究LncRNA抗分化非编码RNA(anti-differetiation non-coding RNA, ANCR)在胃癌患者肿瘤组织中表达的临床意义及其对细胞的生物学效应。方法:收集宁波医疗中心李惠利医院东部院区2016年9月至2018年6月胃癌组织及相应癌旁组织标本各72例,同时培养胃癌细胞HGC-27,慢病毒转染ANCR cDNA全长载体于HGC-27细胞中作为实验组,并转染空白载体作为对照组;实时荧光定量PCR(qPCR)技术检测组织或细胞中ANCR、转录因子Oct4及Sox2 mRNA的表达水平,免疫印迹实验(western blot)检测细胞中Oct4及Sox2蛋白表达水平,CCK-8实验检测两组细胞增殖能力,Transwell侵袭及迁移实验检测两组细胞转移能力。结果:胃癌组织及癌旁组织中ANCR表达分别为0.013(0.006,0.025)及0.041(0.011,0.136),胃癌组织中ANCR表达显著高于癌旁组织( P<0.01),且高表达ANCR的患者TNM分期更高及细胞分化程度更低( χ2=7.414、8.236, P<0.05)。对照组及实验组细胞ANCR mRNA表达分别为(1.000±0.064)、(6.250±0.889),Oct4 mRNA表达分别为(1.000±0.208)、(2.815±0.349),Sox2 mRNA表达分别为(1.000±0.173)、(2.526±0.390),Oct4蛋白表达分别为(1.000±0.148)、(3.396±0.105),Sox2蛋白表达分别为(1.000±0.119)、(2.916±0.130),实验组细胞ANCR、Oct4、Sox2 mRNA表达显著高于对照组( P<0.01),实验组细胞Oct4、Sox2蛋白表达水平明显高于对照组( P<0.01)。对照组及实验组细胞72h的相对增殖能力分别为(7.164±0.426)、(9.627±0.605);96h的相对增殖能力分别为(13.750±1.089)、(19.166±1.649),实验组细胞72 h、96 h的增殖能力显著高于对照组( P<0.01)。对照组及实验组每视野平均侵袭细胞数分别为(17.26±5.48)个、(39.43±5.21)个;迁移细胞数分别为(30.49±7.74)、(62.20±7.51)个,实验组迁移及侵袭细胞数显著多于对照组( P<0.01)。 结论:LncRNA ANCR在胃癌患者肿瘤组织中表达显著增高,且与患者病情进展及细胞恶性程度密切相关,体外可促进胃癌干细胞标志物的表达,并增强细胞增殖及转移能力。
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编辑人员丨5天前
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Dynamin 3在胃癌中的作用机制及预后价值
编辑人员丨5天前
目的:探讨Dynamin 3(DNM3)在胃癌中的作用机制及预后价值。方法:采用生物信息分析、实验研究方法和回顾性队列研究方法。收集2013年1月至2018年7月福建医科大学附属协和医院收治的153例行根治性胃切除术胃癌患者的临床病理资料、新鲜胃癌及配对正常组织样本和石蜡切片,行实时荧光定量聚合酶链式反应检测、免疫印迹实验、流式细胞周期实验、免疫组织化学染色检测和预后分析。收集癌症基因组图谱(TCGA)数据库的胃腺癌(STAD)数据集进行生物信息分析。观察指标:(1)胃癌中DNM3基因在TCGA-STAD中的表达情况。(2)胃癌中DNM3的突变和拷贝数改变。(3)胃癌中DNM3的启动子甲基化水平。(4)胃癌中DNM3、p53的蛋白相对表达量。(5)胃癌中DNM3相关性和富集性分析。(6)流式细胞周期G0/G1期、S期、G2/M期的比例。(7)胃癌中免疫细胞浸润和DNM3之间的相关性。(8)免疫组织化学染色检测与临床特征之间的相关性。(9)影响胃癌患者5年总生存率的独立因素分析。正态分布的计量资料以 x± s表示,多组间比较采用方差分析,进一步两两比较采用LSD法;两组间比较采用 t检验;偏态分布的计量资料以 M( Q1, Q3)表示,组间比较采用Mann-Whitney U检验。计数资料以绝对数或百分比表示,组间比较采用 χ2检验或Fisher确切概率法。配对样本采用威尔科克森符号秩检验。等级资料采用秩和检验。运用Pearson相关系数或Spearman相关系数检验两组的相关性。单因素和多因素分析采用COX比例风险回归模型。采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线并计算生存率,采用Log-Rank检验进行生存情况分析。使用Benjamini-Hochberg错误发生率校正对 P值进行调整。 结果:(1)胃癌中DNM3基因在TCGA-STAD中的表达情况。TCGA-STAD数据库中DNM3基因在27个肿瘤组织和配对正常组织中的表达水平分别为0.775(0.605,1.161)和1.216(0.772,1.681),两者比较,差异有统计学意义( Z=-2.64, P<0.05)。DNM3基因在笔者中心48对胃癌组织和配对正常组织中mRNA表达水平分别为4.370(2.870,6.040)和2.520(0.850,4.170),两者比较,差异有统计学意义( Z=-4.39, P<0.05)。(2)胃癌中DNM3的突变和拷贝数改变。TCGA-STAD数据库中16例胃癌患者发生DNM3突变或体细胞拷贝数改变,其中6个错义突变,1个截断突变,8个拷贝数增加,1个拷贝数减少。TCGA-STAD数据库370例胃癌患者中DNM3突变前后的mRNA表达水平分别为6.13(5.40,7.08)和5.02(3.98,5.46),两者比较,差异有统计学意义(Log 2FC=-1.11, Z=-2.59, P<0.05)。(3)胃癌中DNM3的启动子甲基化水平。TCGA-STAD数据库中372例胃癌患者DNM3甲基化水平与DNM3 mRNA的检测结果显示:DNM3甲基化水平为0.198(-0.458,0.301),DNM3 mRNA表达水平为6.014(5.141,6.628),DNM3甲基化水平与DNM3 mRNA表达水平呈负相关( r=-0.38, P<0.05)。32例患者随访结果显示:16例DNM3高甲基化组和16例DNM3低甲基化组患者3年总生存率分别为18.8%和41.3%,两者比较,差异有统计学意义(风险比=1.40, P<0.05)。免疫印迹实验结果显示:AGS细胞用0、0.5、1.0 μmol/L 5-azacytidin处理后的DNM3相对表达量分别为0.270±0.020、0.357±0.051、0.599±0.039,3组比较,差异有统计学意义( F=57.84, P<0.05)。HGC-27细胞用0、0.5、1.0 μmol/L 5-azacytidin处理后的DNM3相对表达量分别为0.316±0.038、0.770±0.031、0.877±0.052,3组比较,差异有统计学意义( F=156.30, P<0.05)。(4)胃癌中DNM3、p53的蛋白相对表达量。免疫印迹实验结果显示:转染DNM3质粒和对照质粒的AGS细胞中DNM3、p53的蛋白相对表达量分别为0.688±0.047、0.872±0.041和0.249±0.029、0.352±0.020;转染DNM3质粒和对照质粒的AGS细胞比较,上述蛋白相对表达量差异均有统计学意义( t=13.77,19.74, P<0.05)。转染DNM3质粒和对照质粒的HGC-27细胞中上述蛋白相对表达量分别为0.969±0.069、1.464±0.081和0.456±0.048、0.794±0.052,差异均有统计学意义( t=10.57,12.06, P<0.05)。(5)胃癌中DNM3相关性和富集性分析。相关性分析结果显示:DNM3与胃癌中RBMS3、CNTN4、PDE1A基因呈正相关( r=0.52,0.52,0.50, P<0.05),与SLC25A39、PAICS、GAPDH基因呈负相关( r=-0.41,-0.40,-0.40, P<0.05)。基因集富集分析结果显示:与核糖体和氧化磷酸化有关的基因集在DNM3低表达组中上调[富集分数(NES)=-3.30,-2.16, P<0.05],而淋巴细胞和非淋巴细胞之间的免疫调节相互作用在DNM3高表达组中上调(NES=1.67, P<0.05)。基因本体论分析结果显示:DNM3低表达与有丝分裂姐妹染色体分离(编号:0000070)、无义介导衰变的核转录mRNA分解过程、姐妹染色体分离(编号:0000819)、核转录mRNA分解代谢过程、氧化磷酸化的调控有关(NES=-2.29,-3.10,-2.33,-2.56,-2.68, P<0.05)。京都基因与基因组百科全书分析结果显示:DNM3低表达在核糖体和氧化磷酸化中存在上调和串联(NES=-3.34,-2.21, P<0.05)。(6)流式细胞周期G0/G1期、S期、G2/M期的比例。流式细胞周期实验结果显示:转染pCMV-DNM3质粒的AGS细胞G0/G1期、S期、G2/M期的比例分别为65.1%±3.0%、17.3%±3.0%、17.6%±1.0%,转染对照质粒的AGS细胞上述指标分别为53.4%±4.0%、26.3%±2.0%、20.3%±3.0%。转染DNM3质粒与转染对照质粒的AGS细胞比较,G0/G1期、S期差异均有统计学意义( t=4.05,4.32, P<0.05)。(7)胃癌中免疫细胞浸润和DNM3之间的相关性。免疫细胞浸润实验结果显示:DNM3 mRNA表达水平与肥大细胞,NK细胞,pDCs,B细胞,滤泡辅助T细胞,有效记忆T细胞,T细胞,中央记忆T细胞,CD8 T细胞,DC细胞,巨噬细胞,γ-δT细胞(Tgd),iDCs,嗜酸性粒细胞浸润水平呈正相关(Spearman相关系数分别为0.41,0.29,0.26,0.20,0.22,0.22,0.13,0.16,0.15,0.14,0.14,0.17,0.18,0.22, P<0.001,<0.001,<0.001,<0.001,<0.001,<0.001, P=0.015,0.002,0.004,0.005,0.005, P<0.001,<0.001,<0.001);与Th17细胞,Th2细胞,NK CD56dim细胞浸润水平呈负相关( r=-0.18,-0.23,-0.10, P<0.001, P=0.001和 P=0.046)。(8)免疫组织化学染色检测与临床特征之间的相关性。免疫组织化学分析结果显示:DNM3在105例胃癌组织和105例配对正常组织中的免疫组织化学染色评分分别为3(2,4)分和6(4,9)分,差异有统计学意义( Z=-7.35, P<0.05)。70例DNM3低表达与35例DNM3高表达胃癌患者性别、肿瘤部位、N分期比较,差异均有统计学意义( χ2 =4.29,7.67,6.86, P<0.05)。(9)影响胃癌患者5年总生存率的独立因素分析。多因素分析结果显示:病理学T分期为T3~4期和DNM3染色评分低是胃癌患者5年总生存率的独立危险因素(风险比=1.91,0.51,95%可信区间为1.06~3.43,0.26~0.98, P<0.05)。DNM3低表达组胃癌患者和高表达组胃癌患者的5年总生存率分别为44.3%和65.7%,两者比较,差异有统计学意义( χ2=5.02, P<0.05)。 结论:DNM3是一种肿瘤抑制因子,也是胃癌预后不良的独立预测因子,它可能通过甲基化调控胃癌的细胞周期和肿瘤微环境中的免疫抑制。
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编辑人员丨5天前
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肝细胞核因子4γ在胃癌组织中的表达及其对胃癌细胞增殖和干性的影响
编辑人员丨5天前
目的:探讨肝细胞核因子4γ(HNF4γ)在胃癌细胞增殖和干性维持中的作用及机制。方法:收集2012—2015年在郑州大学第一附属医院行胃癌根治术患者的胃癌及相应癌旁正常组织蜡块102例,新鲜组织42例。分别采用实时荧光定量聚合酶链反应、逆转录聚合酶链反应和免疫组化法检测HNF4γ的表达情况。建立HNF4γ过表达胃癌细胞株AGS-HNF4γ和HNF4γ沉默细胞株HGC27-shHNF4γ,分别采用XTT细胞增殖、平板克隆实验、干细胞成球实验测定HNF4γ过表达和沉默对胃癌细胞增殖和干性的影响,Western blot检测CD44的表达。结果:42例新鲜胃癌组织中,HNF4γ mRNA的表达水平为12.43±2.702,高于相应癌旁正常组织3.639±1.109( P<0.010)。102例石蜡包埋胃癌组织中,41.2%(42/102)HNF4γ蛋白表达阳性,高于癌旁正常组织的8.8%(9/102, P<0.001)。HNF4γ蛋白表达与胃癌患者的分化程度、浸润深度、临床分期和淋巴结转有关(均 P<0.05)。HNF4γ蛋白高表达组患者的中位生存时间为25个月,3年生存率为4.8%(2/42),HNF4γ蛋白正常表达组患者的中位生存时间为38个月,3年生存率为51.7%(31/60),差异均有统计学意义(均 P<0.001)。AGS-HNF4γ细胞增殖快于对照AGS-Vector细胞,细胞克隆数高于AGS-Vector细胞[分别为(243.5±24.5)个和(81.0±16.0)个, P=0.030],细胞成球率高于AGS-Vector细胞[分别为(83.5±3.9)%和(21.8±5.6)%, P=0.010],CD44的表达量高于AGS-Vector细胞。HGC27-shHNF4细胞增殖慢于对照HGC27-Vector细胞,细胞克隆数低于HGC27-Vector细胞[分别为(26.0±1.0)个和(83.5±4.5)个, P=0.006],细胞成球率低于HGC27-Vector细胞[分别为(20.8±8.4)%和(72.5±4.8)%, P=0.030],CD44的表达量低于HGC27-Vector细胞。 结论:HNF4γ在胃癌组织中异常高表达,与胃癌患者的不良预后有关。HNF4γ可促进胃癌细胞的增殖,并通过促进CD44的表达维持胃癌细胞的干性。
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编辑人员丨5天前
