目的 探讨野西瓜多糖通过调控LINC00476对胰腺癌细胞增殖、迁移、侵袭的影响.方法 将胰腺癌SUIT-2细胞分为空白组和低、中、高剂量实验组,分别用0、200、400、600 μg·mL-1的野西瓜多糖处理SUIT-2细胞.用克隆形成实验检测细胞的增殖能力,用Transwell实验检测细胞的迁移、侵袭能力,用实时荧光定量聚合酶链反应法检测LINC00476和人抗原R(HuR)mRNA的表达水平,用蛋白质印迹法检测HuR蛋白的表达水平.结果 空白组和低、中、高剂量实验组的克隆形成数分别为(137.31±9.43)、(109.57±4.72)、(77.28±5.76)和(50.74±6.76)个,迁移细胞数分别为(229.21±27.67)、(188.69±9.29)、(150.98±20.25)和(109.37±8.04)个,侵袭细胞数分别为(125.96±9.20)、(100.52±7.60)、(81.65±8.62)和(66.01±5.79)个,LINC00476 mRNA 表达水平分别为 0.96±0.07、1.38±0.16、1.68±0.18 和2.18±0.30,HuR mRNA 表达水平分别为 1.05±0.07、0.81±0.06、0.58±0.10 和 0.32±0.04,HuR 蛋白相对表达水平分别为 1.00±0.09、0.74±0.05、0.55±0.03 和 0.32±0.02.与空白组比较,低、中、高剂量实验组的增殖、迁移和侵袭能力均显著降低,HuR表达水平均显著降低,LINC00476 mRNA表达水平均显著升高(均P＜0.05).结论 野西瓜多糖可能通过上调LINC00476抑制胰腺癌细胞的增殖、迁移、侵袭.

目的:对基因芯片表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的胰腺癌数据进行生物信息学分析,探讨长链非编码RNA(lncRNA)与mRNA在胰腺癌中的差异表达和预后价值.方法:首先对GEO数据库中的胰腺癌数据注释获得mRNA和lncRNA,并对芯片中的mRNA和lncRNA取交集获得差异mRNA和lncRNA.然后对差异mRNA和lncRNA进行基因分析,同时对TCGA数据库中胰腺癌的相关数据进行生存分析.结果:通过基因分析获得与胰腺癌相关可信度高的差异mRNA 1147个,lncRNA 336个,通过基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,构建lncRNA-mRNA共表达网络、lncRNA-mRNA-pathway网络、信号通路关系网络及蛋白质相互作用网络,结果证明mRNA和lncRNA对胰腺癌的发生发展有着重要影响;生存分析发现有12个lncRNA与胰腺癌的预后相关,分别是ATP1A1-AS1、CBR3-AS1、CTD-3080P12.3、FAM66D、FAM87A、FLJ38576、LINC00476、LINC00574、LINC01554、PYY2、LINC00857、OVOL1-AS1.结论:lncRNA对胰腺癌的发生发展及预后有显著影响,有望为胰腺癌的靶向治疗和预后评估提供新的治疗靶点和分子标志物.

背景:酒精性股骨头坏死与饮酒具有高度的相关性,然而其具体发病机制尚不明确且存在一定的个体差异.目的:构建酒精性股骨头坏死的基因网络图谱,进一步探索酒精性股骨头坏死的潜在发病机制.方法:从广西中医药大学第一附属医院骨二科招募3例酒精性股骨头坏死患者和3名健康志愿者,通过对其外周血进行基因测序筛选具有差异表达的mRNA和lncRNA,通过预测lncRNA-miRNA和miRNA-mRNA的相互作用靶点,使用cytoscape软件构建竞争性内源RNA调控网络.结果 与结论:①通过差异表达分析从酒精性股骨头坏死样本中鉴定出了差异lncRNA 127个、差异mRNA 921个,通过靶基因预测共预测出了205个miRNA及5184个mRNA靶点,最终构建了包含3个lncRNA(SNHG3、MUC19、LINC00476)、5个miRNA(hsa-miR-146b-5p、hsa-miR-139-5p、hsa-miR-126-3p、hsa-miR-193a-3p、hsa-miR-135a-5p)和11个mRNA(PEX5、ACTR3B、CHMP4B、CSMD1、MTRF1、ZNF3、HTR7、NR5A2、SYT14、CASK、ING5)的ceRNA网络,涉及干细胞分化、炎症反应、神经内分泌、基因多态性等多种生物学过程.②结果表明,通过构建竞争性内源网络筛选出了一系列酒精性股骨头坏死潜在的生物标志物,为进一步研究其分子机制及治疗靶点提供了新思路.