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lncRNA LINC00689靶向调控miRNA-634促进胶质瘤U251细胞增殖、侵袭和迁移
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨长链基因间非蛋白编码RNA689(LINC00689)对胶质瘤细胞增殖、侵袭和迁移的影响.方法 RT-PCR实验检测正常胶质细胞HEB、胶质瘤细胞系A172、U251、U87、SHG-4中LINC00689和miRNA-634的表达.将si-NC、si-LINC00689、miRNA-634 mimics、miRNA-NC、si-LINC00689+anti-miRNA-NC、si-LINC00689+anti-miRNA-634质粒转染至U251细胞中;CCK-8实验检测细胞增殖、Transwell实验检测细胞侵袭和迁移.结果 与正常胶质细胞HEB比较,胶质瘤细胞系A172、U251、U87和SHG-4的LINC00689表达水平较高,而miRNA-634表达水平较低(P<0.05).与si-NC组比较,si-LINC00689组LINC00689表达水平、细胞增殖活力、侵袭和迁移细胞数明显较低(P<0.05).与miRNA-NC组比较,miRNA-634 mimics组miRNA-634表达水平明显增高(P<0.05),细胞增殖活力、侵袭和迁移细胞数明显降低(P<0.05).与si-LINC00689+anti-miR-NA-NC组比较,si-LINC00689+anti-miRNA-634组细胞增殖活力、侵袭和迁移细胞数明显增高(P<0.05).结论 LINC00689可以促进胶质瘤细胞的增殖、侵袭和迁移,其机制可能与靶向调控miRNA-634有关.
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编辑人员丨2023/8/5
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长基因间非编码RNA 00689靶向miR-876-5p调控膀胱癌T24细胞增殖和凋亡的机制
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨长基因间非编码RNA 00689(LINC00689)对膀胱癌细胞T24增殖、凋亡的影响和可能机制.方法 实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析膀胱癌组织、癌旁组织、T24细胞以及正常膀胱上皮细胞SV-HUC-1中LINC00689和miR-876-5p表达.双荧光素酶报告基因和RT-qPCR验证LINC00689对miR-876-5p的调控作用.将T24细胞分为si-NC组、si-LINC00689组、miR-NC组、miR-876-5p组、si-LINC00689+anti-miR-NC组和si-LINC00689+anti-miR-876-5p组.运用细胞计数试剂盒(CCK-8)、流式细胞术分析细胞活力和凋亡,蛋白质免疫印记(Western blot)分析细胞周期素D1(CyclinD1)、p21、B细胞淋巴瘤2(Bcl-2)和Bcl相关X蛋白(Bax)表达.结果 膀胱癌组织、T24细胞中LINC00689表达升高,miR-876-5p表达降低(P<0.05).LINC00689负调控miR-876-5p表达.与si-NC组比较,si-LINC00689组细胞活力、CyclinD1和Bcl-2蛋白表达降低,凋亡率、p21和Bax蛋白升高(P<0.05).与miR-NC组比较,miR-876-5p组细胞活力、CyclinD1和Bcl-2蛋白表达降低,凋亡率、p21和Bax蛋白升高(P<0.05).与si-LINC00689+anti-miR-NC组比较,si-LINC00689+anti-miR-876-5p组细胞活力、CyclinD1和Bcl-2蛋白表达升高,凋亡率、p21和Bax蛋白降低(P<0.05).结论 抑制LINC00689通过负调控miR-876-5p能够降低膀胱癌T24细胞的增殖能力,并促进细胞凋亡.
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编辑人员丨2023/8/5
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喉鳞状细胞癌的转录组数据分析及生物标志物筛选
编辑人员丨2023/8/5
目的 通过数据挖掘分析长链非编码RNA(lncRNA)、微小RNA(miRNA)和信使RNA(mRNA)在喉鳞状细胞癌中的相互作用机制.方法 从肿瘤基因图谱(TCGA)中获取喉鳞状细胞癌的lncRNA、miRNA、mRNA表达谱数据及相关临床数据,从TCGA和GEO数据库中获取喉鳞状细胞癌的DNA甲基化数据.进行蛋白相互作用(PPI)、基因文本(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路分析和Kaplan-Meier生存分析,构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络和转录因子调控网络.结果 LINC00278、LINC00689、MYHAS、miRNA-99a和miRNA-301a属于低风险基因(HR<1);MNX1-AS1、LINC02575、HOXB-AS4、LSAMP-AS1、LINC02086、IG-FL2-AS1、LINC02253、CASC20、miRNA-383、miRNA-196a-2、miRNA-196a-1、miRNA-100和miRNA-4652属于高风险基因(HR>1).ceRNA网络中有11个lncRNA(LINC02576、LINC02086、AC020659.1、LINC00528、LINC00689、HOXB-AS4、MNX1-AS1、LINC00278、AC010624.1、AC016773.1、MYHAS)、5个miRNA(has-miRNA-206、has-miR-NA-573、has-miRNA-3662、has-miRNA-133b、has-miRNA-449a)和12个mRNA(STC2、PAX3、NETO2、EIF5A2、AD-PRHL1、SYNM、ACTA1、GPR156、CLIC5、BMP3、HNF4A、FOXL2).MYHAS的共表达mRNA(cor-mRNA)主要富集在钙信号通路、环磷酸鸟苷(cGMP)-cGMP依赖性蛋白激酶(PKG)信号通路和催产素信号通路等.转录因子网络中有9个转录因子(MYOD、RSRFC4、TAL1BETAITF2、YY1、P300、PAX3、PAX5、ZID和OLF1).喉鳞状细胞癌DNA甲基化分析得到75个甲基化位点,对应高甲基化基因56个,低甲基化基因15个.结论 ceRNA网络并不能完全阐释lncRNA、miRNA和mRNA在喉鳞状细胞癌发生中的作用机制,lncRNA、miRNA和mRNA在喉鳞状细胞癌发生过程中既相互联系又相互独立.筛选出的lncRNA、miRNA和mRNA为试验验证缩小了范围并提供了理论基础.MYHAS在喉鳞状细胞癌中发挥重要作用,是一个潜在的生物学靶点.
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编辑人员丨2023/8/5
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lncRNA AP000487.1在食管癌中的作用及机制研究
编辑人员丨2023/8/5
目的 探究与生存相关的lncRNA AP000487.1 在食管癌发生发展中的作用及机制.方法 qRT-PCR验证与食管癌患者总生存期显著相关的lncRNA AP000696.1、LINC00689、LINC00900 和AP000487.1 在食管癌组织和细胞株中的表达情况;在食管癌细胞株ECA109 和TE-1 中过表达和沉默AP000487.1 后,采用CCK-8 实验检测细胞增殖、Transwell侵袭实验评估细胞侵袭、划痕实验检测细胞迁移;采用Western blot测定TLR/NF-κB信号通路相关蛋白的表达;qRT-PCR检测NF-κB活化后炎症因子的表达.结果 qRT-PCR结果显示AP000487.1 在食管癌细胞株ECA109(P<0.001)、TE-1(P<0.001)和食管癌组织(P<0.001)中表达显著上调;CCK-8、Transwell侵袭实验及划痕实验结果显示,在ECA109 和TE-1 细胞中沉默AP000487.1 后降低了食管癌细胞的增殖、侵袭以及迁移能力;过表达AP000487.1 后,增强癌细胞的增殖、侵袭及迁移能力;Western blot测定通路相关蛋白,结果显示沉默AP000487.1 后,可抑制TLR/NF-κB信号通路,并下调p-p65 和p-IκB在TE-1 细胞中的表达;qRT-PCR检测NF-κB信号通路活化后炎症因子的表达,与Smart silencer-NC相比,Smart silencer-AP000487.1 组 TNF-α(P<0.001)、IL-1β(P<0.01)、IL-6(P<0.01)表达明显下调.结论 AP000487.1 在食管癌细胞株及癌组织中显著高表达,其异常表达通过调控TLR/NF-κB信号通路促进食管癌的增殖、侵袭和迁移.AP000487.1 可能是食管癌的潜在治疗靶点.
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编辑人员丨2023/8/5
