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Rett综合征一个家系的胚胎植入前遗传学检测
编辑人员丨1周前
目的:对1个Rett综合征(RTT)家系进行胚胎植入前遗传学检测(PGT)。方法:选取2021年6月4日于吉林大学第一医院生殖产前中心就诊的1个RTT家系为研究对象。用二代测序和Sanger测序对家系成员 MECP2基因的变异情况进行分析。用直接测序检测囊胚 MECP2基因c.925C>T位点的携带状态,采用Sanger测序对结果进行验证。选择 MECP2基因及上下游2 Mb范围内168个有效SNP位点构建家系单体型,用于对携带该变异的胚胎进行筛选,选取未检测到变异的胚胎分析染色体非整倍体的情况。 结果:PGT检测显示7个囊胚中有5个未携带变异,2个携带致病性变异。结合非整倍体检测的结果,提示在5个未携带变异的囊胚中有2个为整倍体。经遗传咨询后,该夫妇选择移植最优囊胚后临床妊娠,羊水产前诊断提示胎儿染色体核型正常且未携带致病性变异,足月剖宫产术娩出一健康女婴。结论:二代测序技术可实现高效的PGT检测,减少RTT在患病家系中的再发风险。
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编辑人员丨1周前
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MeCP2诱导的视网膜色素上皮细胞转录组和m6A的改变
编辑人员丨1周前
目的:探讨重组人甲基CpG结合蛋白2(MeCP2)处理的视网膜色素上皮(RPE)细胞中mRNA和N6-甲基腺嘌呤(m6A)改变及其机制。方法:将传代ARPE-19细胞贴壁培养后分为正常对照组和MeCP2组,正常对照组细胞采用正常培养液培养,MeCP2组细胞于含终质量浓度20 ng/ml重组人MeCP2蛋白培养液中,连续培养72 h。提取细胞内总RNA进行转录组测序(RNA-seq)和甲基化免疫共沉淀测序(MeRIP-seq)分析。采用edgeR软件包根据 P<0.05筛选差异表达基因(DEGs)和差异甲基化基因(DMGs)。采用基因本体论(GO)富集分析对差异基因进行生物学功能描述,采用京都基因和基因组百科全书(KEGG)进行通路富集分析。筛选出DEGs与DMGs交集的基因,采用实时荧光定量PCR技术检测各组差异基因mRNA表达水平。 结果:共筛选出DEGs 100个,DMGs 7 441个,富集分析发现DEGs与细胞外基质(ECM)-受体相互作用、细胞分裂、细胞周期和磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)信号通路等相关,DMGs与微管细胞骨架、血管生成、表皮生长因子受体(ErbB)信号通路、晚期糖基化终末产物(AGEs)-糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)信号通路、Notch信号通路和转化生长因子β(TGF-β)信号通路等相关。DEGs中24个基因表达增加,76个基因表达减少;DMGs中5个基因含有高甲基化峰,7 439个基因含有低甲基化峰,注释峰后,正常对照组有7 626个基因发生m6A甲基化,MeCP2组有8 006个基因发生m6A甲基化,2个组间有7 360个交集基因。正常对照组和MeCP2组的m6A甲基化富集于转录本的CDS、内含子和3'-非翻译区(3'UTR)区域,其甲基化比例分别为23.62%/22.27%、48.53%/48.35%和23.66%/25.28%。联合分析发现2个上皮-间充质转化(EMT)相关基因 CSPG5和 RBP1的mRNA和m6A水平均降低。荧光定量PCR结果显示,MeCP2组 GSPG5、 RBP1、 ZNF484 mRNA相对表达量均明显低于正常对照组,差异均有统计学意义( t=7.885、7.613、7.345,均 P<0.01)。 结论:RPE细胞中MeCP2对EMT的调控机制与m6A甲基化修饰相关。 CSPG5和 RBP1基因可能是m6A甲基化的靶基因,参与MeCP2调控的EMT过程。
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编辑人员丨1周前
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产前诊断Xq28重复一例
编辑人员丨1周前
27岁,G 2P 0,孕16周血清学筛查提示21三体高风险(1/228)。在签署知情同意书后,于孕18周接受羊膜腔穿刺,常规进行核型分析和染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)。孕妇既往体健,夫妻双方否认近亲结婚和有毒有害物质接触史。羊水细胞G显带核型为46,XY;CMA检测结果为arr[GRCh37] Xq28 (153 224 080-153 430 415)×2,即胎儿染色体Xq28区存在0.206 Mb的重复( 图1),遗传自母亲,涉及 HCFC1、MECP2、OPN1LW等6个OMIM基因。ClinGen数据库提示 MECP2基因三倍剂量敏感性证据充足;DGV数据库收录有覆盖该区域的个案报道;DECIPHER数据库收录有相似变异的不确定案例;ISCA数据库收录有相似变异的致病性案例。综合分析认为其致病的可能性大。夫妻经遗传咨询后于孕24周选择终止妊娠。
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编辑人员丨1周前
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罕见鸟氨酸氨基甲酰转移酶缺乏症合并MECP2重复综合征一个家系的基因变异分析及产前诊断
编辑人员丨1周前
目的:分析1例鸟氨酸氨基甲酰转移酶缺乏症(OTCD)合并MECP2重复综合征家系的基因变异特征,并为该家系提供产前诊断。方法:回顾性分析2017年12月19日就诊于甘肃省妇幼保健院新生儿重症监护中心的1例患儿(先证者)及其家系成员的临床资料。高通量测序结合多重连接探针扩增(MLPA)技术对患儿进行致病性变异分析。短串联重复序列(STR)连锁分析、MLPA以及拷贝数变异测序(CNV-seq)对胎儿进行产前诊断。结果:先证者为出生3 d的女婴,测序发现其携带 OTC基因第7 ~ 9外显子杂合缺失。根据美国医学遗传学与基因组学会变异相关指南,该变异被评级为可能致病性变异(PVS1+PM2_Supporting+PP4),与其急性脑病发作合并代谢异常(血氨显著升高、血瓜氨酸降低、尿乳清酸增高)的临床表现相符,确诊其为OTCD。产前诊断未发现胎儿携带与先证者相同的 OTC基因缺失变异,但存在Xq28区重复,涵盖MECP2重复综合征的全部区域,且 SRY(+),母亲及先证者均证实携带该重复。结合先证者存在X染色体失活的可能性,考虑先证者同时罹患OTCD与MECP2重复综合征,而胎儿为MECP2重复综合征男性患者。 结论:基因检测明确了OTCD合并MECP2重复综合征家系的致病变异,可为患者家庭的精准治疗、遗传咨询及再次生育提供依据。
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编辑人员丨1周前
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NRXN1基因和MECP2基因SNP检测及其与儿童自闭症异常心理的关联研究
编辑人员丨1周前
本研究通过分析NRXN1基因和MECP2基因SNP检测情况,及其与儿童自闭症异常心理的关联,旨在为临床更加精准地诊治自闭症患儿提供数据支持,现将结果报道如下。
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编辑人员丨1周前
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新生儿MECP2重复综合征1例
编辑人员丨1周前
本文报道1例新生儿期起病的MECP2重复综合征,临床特征为肌张力低下、反复感染、唾液分泌过多、流涎、吸气性三凹征,伴呼吸及吞咽困难、胃食管反流、隐睾、双髋关节畸形、脑室增宽、脑电图中重度异常、精神运动发育迟滞,全外显子组测序提示Xq28区域存在0.126 Mb重复,该区域包含MECP2全基因,多重连接依赖性探针扩增分析确认MECP2重复。
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编辑人员丨1周前
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一个 MECP2重复综合征家系的遗传学病因分析
编辑人员丨1周前
目的:对1个以智力发育落后、肌张力低下为主要表现的家系进行遗传学分析,明确其遗传学病因。方法:抽取该家系两例男性患者及其家系成员的外周血,提取基因组DNA;先对1例患儿行拷贝数变异测序(copy number variation sequencing, CNV-seq),然后用荧光定量PCR验证重复片段;随后对另1例患者及其家系成员行CNV-seq或单核苷酸多态性徽阵列(single nucleotide polymorphism array, SNP array)检测。结果:2例男性患者均表现为严重肌张力低下,运动、智力发育落后,特别是语言发育障碍。CNV seq及SNP array分析结果提示2例男性患者存在染色体Xq28重复,片段大小分别为0.26 Mb及0.42 Mb,重复区间内包含 MECP2基因,确诊为 MECP2重复综合征,CNV seq验证显示先证者母亲及一姐均存在Xq28区域重复,为 MECP2重复女性携带者,1名正常男性家系成员不携带Xq28区域重复。 结论:染色体Xq28区域重复可能为该家系智力发育落后、肌张力低下患者的遗传学病因,确诊为 MECP2重复综合征。
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编辑人员丨1周前
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三例Rett综合征患者的 MECP2基因变异分析
编辑人员丨1周前
目的:对3例Rett综合征患者进行 MECP2基因变异分析,明确其致病原因。 方法:采集3例患者及其父母外周血提取DNA,设计特异性引物覆盖基因全外显子及其侧翼序列,通过PCR及Sanger测序法和多重连接探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)检出患者 MECP2基因的变异。 结果:3个家系的先证者 MECP2基因的Sanger测序及MLPA结果分别为,家系1发生c.965C>G杂合变异,家系2发生c.1157_1197del41杂合缺失变异;家系3发生第4外显子部分缺失杂合变异。3个家系先证者的父母均未携带相应的变异,均为新发变异。其中 MECP2基因c.965C>G和c.1157_1197del41变异为未报道的新变异。 结论:根据美国医学遗传学与基因组学学会指南并结合临床表现对上述变异进行分析后推测3个变异均为可能致病性变异,是这3个Rett综合征家系的致病原因。本研究结果丰富了 MECP2基因的变异谱,为家系遗传咨询和产前诊断提供了依据。
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编辑人员丨1周前
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MECP2重复综合征的临床表型及遗传学分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨 MECP2重复综合征患者的临床症状及遗传学来源,为家系的遗传咨询及产前诊断提供依据。 方法:对2018年1月至2019年9月在郑州大学第一附属医院遗传与产前诊断中心接受基因组拷贝数变异测序技术(copy number variation sequencing,CNV-seq)检测且确诊为 MECP2重复综合征的4例患者进行临床症状分析,并对其进行母源溯源。 结果:4例患者均为男性,其CNV-seq结果显示Xq28区域存在0.32~0.86 Mb微重复,且均来自无症状的母亲。其中3例两倍拷贝数重复的患者存在语言能力缺失、智力低下、肌张力减退等症状;1例三倍拷贝数重复的患者在出生后6个月夭折,生前临床症状为反复感染、癫痫、痉挛等。结论:4例 MECP2重复综合征均为完全显性的男性患者,且遗传自无症状的母亲。CNV-Seq检测技术稳定、可靠,可准确地检测出 MECP2重复综合征。
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编辑人员丨1周前
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全外显子组测序对于智力障碍或全面发育迟缓患者的诊断价值
编辑人员丨1周前
目的:探讨全外显子组测序(WES)对于智力障碍(ID)或全面发育迟缓(GDD)患者的诊断价值。方法:选取2018年5月至2021年12月于郴州市第一人民医院就诊的134例ID或GDD患者为研究对象。采集患者及其父母的外周血样进行WES检测,对候选变异进行Sanger测序/拷贝数变异测序(CNV-seq)验证和家系来源分析,对候选变异根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)变异分类标准进行致病性评估。结果:在134例患者中,共检出致病性单核苷酸变异(SNV)及小片段插入/缺失(InDel)46例,致病性基因组拷贝数变异(CNV)11例,单亲二倍体(UPD)1例,总体阳性检出率为43.28%(58/134)。46例致病性SNV/InDel共涉及40个基因62个位点,其中最多的是 MECP2基因( n=4)。11例致病性CNV中,10例为缺失变异,1例为重复变异,片段范围为0.76 ~ 15.02 Mb。1例患者在15q11.2q12区存在约15.62 Mb的杂合性丢失(LOH),结合家系WES数据提示为父源性UPD,结合其临床表型诊断为Angelman综合征。 结论:WES不仅能够高效检出SNV/InDel,对CNV、LOH也有较高的检出率,结合家系数据分析能够准确判断变异的来源,这些优势表明WES对ID或GDD患者的遗传学病因诊断具有重要的价值。
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编辑人员丨1周前
