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胃癌上皮-间充质转化过程中微小RNA-579-3p/含锌指和BTB域4通路的作用及其机制
编辑人员丨1周前
目的:探讨微小RNA-579-3p(miR-579-3p)/含锌指和BTB域4(ZBTB4)通路在胃癌上皮-间充质转化(EMT)中的作用机制。方法:生物信息学筛选胃癌与癌旁组织差异表达的微小RNA(miRNA);实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)法检测50例患者胃癌和癌旁癌旁组织中miR-579-3p、ZBTB4表达;检测胃上皮细胞株GES-1和胃癌细胞株HGC27、AGS、MKN45中miR-579-3p的表达,分析miR-579-3p与临床病理特征的关系。生物信息学分析miR-579-3p靶基因。双荧光素酶报告基因验证miR-579-3p与ZBTB4的调控关系。应用miR-579-3p抑制物(inhibitor)干扰HGC27细胞株miR-579-3p表达,细胞计数试剂盒(CCK-8)法、划痕实验、Transwell小室实验检测细胞增殖、迁移和侵袭能力;RT-qPCR和蛋白质印迹法(Western blot)检测mRNA和蛋白表达水平。采用 t检验、 χ2检验分析数据。 结果:生物信息学筛选后RT-qPCR检测结果发现miR-579-3p在胃癌组织中表达显著高于癌旁组织(3.259±1.307比1.326±0.419, t=9.959, P<0.01),miR-579-3p表达与胃癌分化和淋巴结转移明显相关( χ2=4.500、7.714, P<0.05);miR-579-3p在胃癌细胞株表达均高于GES-1( P<0.01)。转染miR-579-3p抑制剂的HGC-27细胞活性(0.500±0.068比1.223±0.089, t=15.780, P<0.01)、迁移率(0.228±0.039比0.533±0.056, t=7.707, P<0.01)和侵袭细胞数[(89.000±7.550)个比(206.700±8.505)个, t=17.92, P<0.01]显著低于对照组。RT-qPCR结果显示miR-579-3p inhibitors组波形蛋白(Vimentin)(0.248±0.030比1.061±0.150, t=9.258, P<0.01)、基质金属蛋白酶-2(MMP-2)(0.178±0.030比1.013±0.195, t=3.320, P<0.01)和连接蛋白细胞黏附分子(Nectin-4)(0.465±0.065比1.042±0.154, t=5.990, P<0.01)的mRNA表达明显低于对照组,而E-钙黏蛋白(E-cadherin)mRNA(3.249±0.460比1.000±0.175, t=7.990, P<0.01)的表达明显高于对照组,Western blot检测显示抑制miR-579-3p表达后Vimentin(0.420±0.271比1.004±0.095, t=3.528, P<0.05)、MMP-2(0.663±0.119比0.922±0.068, t=3.283, P<0.05)、Nectin-4表达(0.660±0.130比0.919±0.080, t=2.982, P<0.05)低于对照组,而E-cadherin蛋白表达(1.352±0.113比0.994±0.005, t=5.483, P<0.01)高于对照组。生信分析结果显示ZBTB4是miR-579-3p靶基因;双荧光素酶报告基因分析表明过表达miR-579-3p后野生组中ZBTB4基因活性明显低于对照组(0.323±0.020比1.095±0.131, t=11.690, P<0.01)。RT-qPCR显示ZBTB4在胃癌组织中表达低于癌旁组织( t=7.713, P<0.01);皮尔逊相关分析结果显示ZBTB4与miR-579-3p呈负相关( r=-0.470, P<0.01)。RT-qPCR和Western blot显示抑制miR-579-3p后ZBTB4表达明显增强( P<0.01)。 结论:miR-579-3p/ZBTB4通路激活促进胃癌的EMT。
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编辑人员丨1周前
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CRIM1对非小细胞肺癌辐射敏感性和转移的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨富含半胱氨酸型运动神经元蛋白1(CRIM1)对非小细胞肺癌(NSCLC)辐射敏感性和转移的影响及可能的机制。方法:采用短发夹RNA(shRNA)敲降NSCLC H460、H358细胞中CRIM1的表达,并将H460、H358细胞分别分为3组:H460细胞、H460-shCRIM1细胞、H460-shNC细胞和H358细胞、H358-shCRIM1细胞、H358-shNC细胞,其中shCRIM1表示用shRNA敲降CRIM1的表达,shNC表示阴性对照。采用小干扰RNA(siRNA)敲降H358细胞中CRIM1的表达,并将细胞分为2组:H358-siNC细胞和H358-siCRIM1细胞。采用细胞克隆形成实验(照射剂量为0、1、2、4 Gy)、慧星实验(照射剂量为8 Gy)和细胞免疫荧光实验(照射剂量为6、8、12 Gy)观察CRIM1对H460细胞辐射敏感性的影响。采用Transwell实验、细胞黏附实验观察CRIM1对H460、H358细胞转移的影响。构建小鼠H460原位肿瘤模型,采用组织病理学检查评估裸鼠肺内原位接种肿瘤转移情况。采用转录组学分析法探讨CRIM1影响NSCLC细胞转移的可能机制。组间比较采用两独立样本 t检验。 结果:克隆形成实验结果显示,与H460-shNC细胞相比,1、2 Gy照射后H460-shCRIM1细胞的克隆形成率明显降低[1 Gy:(87.04±8.04)%对(58.01±4.39)%;2 Gy:(48.23±1.22)%对(31.43± 0.08)%],且差异均有统计学意义( t=4.48、19.50,均 P<0.05)。慧星实验结果显示,8 Gy照射后H460-shCRIM1细胞的olive尾距长于H460-shNC细胞,且差异有统计学意义(1.27±0.54对1.05±0.42, t=2.14, P<0.05)。细胞免疫荧光实验结果显示,H460-shCRIM1细胞受照后磷酸化组蛋白H2AX foci数多于H460-shNC细胞(6 Gy:14.33±2.81对11.00±3.92;8 Gy:34.00±11.14对21.17±6.15;12 Gy:25.80±3.96对20.17±3.31),且差异均有统计学意义( t=2.45、5.52、2.47,均 P<0.05)。Transwell实验结果显示,H460-shCRIM1、H358-shCRIM1细胞的迁移率分别较H460-shNC、H358-shNC细胞明显升高,且差异均有统计学意义( t=4.73、10.19,均 P<0.05)。细胞黏附实验结果显示,H460-shCRIM1、H358-shCRIM1细胞的黏附能力分别较H460-shNC、H358-shNC细胞下降,且差异均有统计学意义( t=2.86、3.66,均 P<0.05)。组织病理学检查结果显示,原位接种H460-shCRIM1细胞的裸鼠肺内转移灶明显多于H460-shNC细胞。转录组学分析结果显示,筛选出的细胞黏附相关基因连接黏附分子2(JAM2)、连接蛋白3(NECTIN3)和紧密连接蛋白4(CLDN4)在H460-shCRIM1、H358-siCRIM1细胞中的表达均下降;并在体外实验中得到验证,其中,H460-shCRIM1细胞相较于H460-shNC细胞分别下降了86.66%、49.35%、30.27%( t=47.52、7.47、18.98,均 P<0.05),H358-siCRIM1细胞相较于H358-siNC细胞分别下降了36.60%、31.70%、50.00%( t=7.40、7.10、16.56,均 P<0.05)。 结论:抑制CRIM1可增强NSCLC细胞H460的辐射敏感性,CRIM1可能通过影响肿瘤细胞连接的方式影响NSCLC的转移。
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编辑人员丨1周前
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Nectin-4靶向探针 68Ga-N188在胰腺癌诊断中的应用价值
编辑人员丨1周前
目的:探讨Nectin-4靶向探针 68Ga-N188在胰腺癌诊断中的应用价值。 方法:采用前瞻性研究方法。选取2022年8—12月北京大学第一医院收治的16例经增强CT检查诊断为胰腺癌患者的临床病理资料;男9例,女7例;年龄为(62±8)岁。患者均行 18氟-脱氧葡萄糖( 18F-FDG)和 68Ga-N188正电子发射断层显像(PET)/CT检查。观察指标:(1) 68Ga-N188在患者不同组织和肿瘤原发灶中的分布。(2)胰腺肿瘤中Nectin-4的表达和 68Ga-N188的摄取。(3) 68Ga-N188与 18F-FDG的PET/CT检查结果比较。正态分布的计量资料以 x±s表示,组间比较采用独立样本 t检验。计数资料以绝对数或百分率表示。 结果:(1) 68Ga-N188在患者不同组织和肿瘤原发灶中的分布。PET/CT检查结果显示:注射后1 h, 68Ga-N188在16例患者脂肪、肌肉、皮肤、脑组织中的最大标准摄取值(SUVmax)和平均标准摄取值(SUVmean)分别为0.40±0.16和0.25±0.09、0.68±0.20和0.44±0.12、0.39±0.14和0.28±0.11、0.09±0.04和0.05±0.02;在食管、肝脏、脾脏、胰腺组织中,上述指标分别为1.53±0.48和1.16±0.31、1.49±0.45和0.91±0.30、1.40±0.30和1.02±0.24、1.24±0.31和0.96±0.25;在肿瘤原发灶中,上述指标分别为3.28±1.02和2.14±0.62,与胰腺组织比较,差异均有统计学意义( t=8.03,6.75, P<0.05)。肿瘤原发灶中,基于SUVmax的肿瘤背景比为1.82±0.58。(2)胰腺肿瘤中Nectin-4的表达和 68Ga-N188的摄取。免疫组织化学染色结果显示:16例患者中,Nectin-4高表达7例,低表达9例。PET/CT检查结果显示:7例Nectin-4高表达和9例低表达患者肿瘤原发灶中, 68Ga-N188的SUVmax分别为3.77±1.10和2.64±0.68,两者比较,差异有统计学意义( t=2.64, P<0.05)。 18F-FDG在7例Nectin-4高表达和9例低表达患者肿瘤原发灶中的SUVmax分别为6.73±3.24和6.43±3.45,两者比较,差异无统计学意义( t=0.17, P>0.05)。(3) 68Ga-N188与 18F-FDG的PET/CT检查结果比较。16例患者中,14例经术后组织病理学检查诊断为胰腺癌患者肿瘤原发灶 68Ga-N188和 18F-FDG PET/CT检查阳性分别为14例和11例;其中3例经化疗后评估疗效胰腺癌患者肿瘤原发灶 68Ga-N188和 18F-FDG PET/CT检查阳性分别为3例和1例。3例接受化疗和11例未接受化疗胰腺癌患者肿瘤原发灶 18F-FDG的SUVmax分别为2.80±0.69和6.97±2.11,两者比较,差异有统计学意义( t=3.29, P<0.05), 68Ga-N188的SUVmax分别为3.38±1.12和2.93±0.50,两者比较,差异无统计学意义( t=0.66, P>0.05)。6例经术后组织病理学检查诊断有淋巴结转移胰腺癌患者淋巴结转移灶 68Ga-N188和 18F-FDG PET/CT检查阳性分别为6例和4例,转移灶中 68Ga-N188和 18F-FDG的SUVmax分别为2.25±1.12和4.02±1.27。 结论:68Ga-N188 PET/CT检查可用于胰腺癌原发灶和淋巴结转移灶影像学诊断。
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编辑人员丨1周前
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Nectin-4靶向探针68Ga-N188在胰腺癌诊断中的应用价值
编辑人员丨2024/6/22
目的 探讨Nectin-4靶向探针68Ga-N188在胰腺癌诊断中的应用价值.方法 采用前瞻性研究方法.选取2022年8-12月北京大学第一医院收治的16例经增强CT检查诊断为胰腺癌患者的临床病理资料;男9例,女7例;年龄为(62±8)岁.患者均行18氟.脱氧葡萄糖(18F-FDG)和68Ga-N188正电子发射断层显像(PET)/CT检查.观察指标:(1)68Ga-N188在患者不同组织和肿瘤原发灶中的分布.(2)胰腺肿瘤中Nectin-4的表达和68Ga-N188的摄取.(3)68Ga-N188与18F-FDG的PET/CT检查结果比较.正态分布的计量资料以(x)±s表示,组间比较采用独立样本t检验.计数资料以绝对数或百分率表示.结果 (1)68Ga-N188在患者不同组织和肿瘤原发灶中的分布.PET/CT检查结果显示:注射后 1h,68Ga-N188在16例患者脂肪、肌肉、皮肤、脑组织中的最大标准摄取值(SUVmax)和平均标准摄取值(SUVmean)分别为 0.40±0.16 和 0.25±0.09、0.68±0.20 和 0.44±0.12、0.39±0.14 和 0.28±0.11、0.09±0.04和0.05±0.02;在食管、肝脏、脾脏、胰腺组织中,上述指标分别为1.53±0.48和1.16±0.31、1.49±0.45和 0.91±0.30、1.40±0.30 和 1.02±0.24、1.24±0.31 和 0.96±0.25;在肿瘤原发灶中,上述指标分别为 3.28±1.02和2.14±0.62,与胰腺组织比较,差异均有统计学意义(t=8.03,6.75,P<0.05).肿瘤原发灶中,基于SUVmax的肿瘤背景比为1.82±0.58.(2)胰腺肿瘤中Nectin-4的表达和68Ga-N188的摄取.免疫组织化学染色结果显示:16例患者中,Nectin-4高表达7例,低表达9例.PET/CT检查结果显示:7例Nectin-4高表达和9例低表达患者肿瘤原发灶中,68Ga-N188的SUVmax分别为3.77±1.10和2.64±0.68,两者比较,差异有统计学意义(t=2.64,P<0.05).18F-FDG在7例Nectin-4高表达和9例低表达患者肿瘤原发灶中的SUVmax分别为6.73±3.24和6.43±3.45,两者比较,差异无统计学意义(t=0.17,P>0.05).(3)68Ga-N188与18F-FDG的PET/CT检查结果比较.16例患者中,14例经术后组织病理学检查诊断为胰腺癌患者肿瘤原发灶68Ga-N188和18F-FDG PET/CT检查阳性分别为14例和11例;其中3例经化疗后评估疗效胰腺癌患者肿瘤原发灶68Ga-N188和18F-FDG PET/CT检查阳性分别为3例和1例.3例接受化疗和11例未接受化疗胰腺癌患者肿瘤原发灶18F-FDG的SUVmax分别为2.80±0.69和6.97±2.11,两者比较,差异有统计学意义(t=3.29,P<0.05),68Ga-N 188的SUVmax分别为3.38±1.12和2.93±0.50,两者比较,差异无统计学意义(t=0.66,P>0.05).6例经术后组织病理学检查诊断有淋巴结转移胰腺癌患者淋巴结转移灶68Ga-N 188和18F-FDG PET/CT检查阳性分别为6例和4例,转移灶中68Ga-N 188和18F-FDG的SUVmax分别为2.25±1.12和4.02±1.27.结论 68Ga-N 188 PET/CT检查可用于胰腺癌原发灶和淋巴结转移灶影像学诊断.
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编辑人员丨2024/6/22
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基于加权基因共表达网络筛选糖尿病肾病的关键基因
编辑人员丨2023/8/5
目的 使用加权基因共表达网络分析探究糖尿病肾病基因的协同共表达,寻找糖尿病肾病发病的潜在关键基因.方法 从GEO数据库下载GSE30122表达谱数据,根据基因的相关性,构建基因共表达模块,并计算模块基因与疾病的相关性,选取与疾病显著相关的关键模块,使用R包clusterprofiler数据库进行GO与KEGG富集分析,并根据基因log FC值与富集最显著的通路关联并分析.结果 MEturquoise模块与疾病呈显著相关性(P=0.02);利用limma包筛选出的差异表达基因与关键模块中基因取交集,共得到201个共有关键基因,主要富集于细胞黏附分子、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路,细胞黏附分子中的CDH3、F11R、VTCN1表达下调,ITGA8、NECTIN2、NTNG1表达上调;AGE-RAGE信号通路中MAPK13表达上调,而COL4A3、PLCE1、PLCG2、VEGFA表达下调.结论 细胞黏附分子中的CDH3、F11R、VTCN1、ITGA8、NECTIN2、NTNG1等基因与AGE-RAGE信号通路中的MAPK13、COL4A3、PLCE1、PLCG2、VEGFA等基因可能在DN的发生发展中起到关键作用.
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编辑人员丨2023/8/5
