-
基于生物信息学分析双硫死亡相关基因PDLIM1 mRNA在多种肿瘤中的表达及临床应用价值
编辑人员丨2024/3/2
目的 分析双硫死亡(disulfidptosis)相关基因人PDZ和LIM域蛋白 1(PDZ and LIM domain protein 1,PDLIM1)mRNA在多种肿瘤中的表达及作用.方法 通过仙桃学术网站分析PDLIM1 mRNA的表达情况.利用仙桃学术网站和Sangerbox 3.0数据分析平台探究PDLIM1在33种肿瘤中的诊断和预后能力.利用TISIDB数据库分析PDLIM1与临床分级和分期的相关性.在Sangerbox 3.0数据分析平台和Kaplan-Meier Plotter数据库中分析PDLIM1与肿瘤免疫相关性.通过STRING数据库和Cytoscape构建蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks,PPI).利用Sangerbox 3.0数据分析平台进行富集分析.最后利用GSCA(Gene Set Cancer Analysis)网站分析获得PDLIM1 mRNA表达与药物的敏感性.结果 PDLIM1 mRNA在33种肿瘤中表达量存在异质性.PDLIM1在胆管癌(CHOL)、多形性胶质母细胞瘤(GBM)、肾透明细胞癌(KIRC)、肺腺癌(LUAD)、卵巢癌(OV)、胰腺癌(PAAD)、黑色素瘤(SKCM)和睾丸生殖细胞肿瘤(TGCT)中具有良好的诊断能力.PDLIM1在胶质瘤(GBMLGG)、脑低级别胶质瘤(LGG)、混合肾癌(KIPAN)、多形性胶质细胞瘤(GBM)、间皮瘤(MESO)、葡萄膜黑色素瘤(UVM)和肾上腺皮质癌(ACC)中高表达预后差,而在肉瘤中低表达预后差.PDLIM1 mRNA表达与头颈鳞状细胞癌(HIVSC)、肾乳头状细胞癌(KIRP)、子宫内膜癌(UCEC)、子宫癌肉瘤(UCS)和葡萄膜黑色素瘤(UVM)的分级,以及与宫颈癌、头颈鳞状细胞癌、子宫内膜癌和脑低级别胶质瘤肿瘤的分期有关.PDLIM1与以前列腺癌为首的36种肿瘤的免疫浸润显著相关,且发现在PDLIM1 mRNA高表达的患者中经免疫治疗后的预后相对较好.PDLIM1在生物体内主要通过参与肌动蛋白细胞骨架、细胞黏附、肿瘤相关途径的调节来发挥作用,对以Isoliquiritigenin为首的多种药物敏感.结论 PDLIM1与多种肿瘤的临床预后和免疫浸润等方面密切相关,有望成为一种肿瘤诊断和预后生物标志物或治疗靶点.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/3/2
-
细胞骨架蛋白PDLIM1在肿瘤中的研究进展
编辑人员丨2023/8/6
人PDZ和LIM域蛋白1(PDZ and LIM domain protein 1,PDLIM1)是PDZ-LIM蛋白家族的成员之一,参与多种生物学过程,包括细胞骨架组织和肿瘤发生.PDLIM1通过PDZ结构域结合相关蛋白质(如辅肌动蛋白α-actinin)以及通过LIM结构域与相关激酶(如clik1)结合,并定位到肌动蛋白应力纤维,进而参与细胞骨架调控.细胞骨架具有维持细胞形态的功能,在细胞运动中起着关键作用.肿瘤细胞的浸润与转移常表现为细胞运动能力的改变,这个改变过程往往涉及到细胞骨架在时空上的动态重组,而重组的时空调控由关键的细胞信号通路介导.因此,进一步研究PDLIM1在肿瘤浸润与转移过程中的信号调控机制,可能发现潜在的治疗靶点和预后因子,有助于在精准医疗时代进行更好的个性化肿瘤防治.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/6
-
多种血清肿瘤相关抗原自身抗体联合检测对骨肉瘤的诊断价值研究
编辑人员丨2023/8/5
目的:探讨多种血清肿瘤相关抗原(tumor associated antigen,TAA)自身抗体联合检测对骨肉瘤的诊断价值.方法:收集2013年12月至2016年6月收治的51例骨肉瘤患者(骨肉瘤组)和同时期在医院体检的51例健康志愿者(健康组)的外周血血清.使用间接ELISA法检测所有受试对象血清中抗烯醇化酶1(enolase 1,ENO1)自身抗体、抗甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceral-dehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)自身抗体、抗热休克蛋白(heat shock protein,HSP)27自身抗体、抗HSP60自身抗体、抗核仁磷酸蛋白1(nucleophosmin 1,NPM1)自身抗体、抗人PDZ和LIM域蛋白1(PDZ and LIM domain 1,PDLIM1)自身抗体、抗重组人微管解聚蛋白1(stathmin 1,STMN1)自身抗体、抗丙糖磷酸异构酶1(triosephosphate isomerase 1,TPI1)自身抗体共8种TAA自身抗体的血清含量.按单侧估计各TAA自身抗体含量的95%参考值范围,并以此计算和评价各TAA自身抗体血清含量检测诊断骨肉瘤的价值.按诊断的灵敏度由高到低排序,从诊断骨肉瘤灵敏度最高的自身抗体开始,每次增加1种灵敏度排名次一位的自身抗体,计算和评价对应的TAA自身抗体联合检测诊断骨肉瘤的价值.结果:①2组血清TAA自身抗体含量检测及对比结果.2组受试对象血清中抗ENO1自身抗体、抗GAPDH自身抗体、抗HSP27自身抗体、抗HSP60自身抗体、抗PDLIM1自身抗体、抗STMN1自身抗体和抗TPI1自身抗体含量比较,组间差异均有统计学意义(0.269±0.101,0.202±0.113,Z=-3.758,P=0.000;0.145±0.037,0.125±0.027,Z=-3.477,P=0.001;0.175±0.048,0.164±0.027,Z=-2.125,P=0.034;0.174±0.048,0.149±0.028,Z=-2.871,P=0.004;0.305±0.079,0.288±0.068,Z=-2.249,P=0.025;0.188±0.082,0.167±0.071,Z=-2.041,P=0.041;0.174±0.083,0.159±0.040,Z=-2.095,P=0.036);2组受试对象血清中抗NPM1自身抗体含量比较,差异无统计学意义(0.255±0.075,0.260±0.064,Z=-0.020,P=0.984).②血清TAA自身抗体含量检测诊断骨肉瘤的结果.除抗NPM1自身抗体之外的7种TAA自身抗体中,抗STMN1自身抗体诊断骨肉瘤的价值最大,其灵敏度为27.45%、特异度为96.08%、Youden指数为0.2353、Kappa值为0.24.随着联合检测的TAA自身抗体种类增加,诊断的灵敏度逐渐增大、特异度逐渐减小.当联合检测抗STMN1自身抗体、抗TPI1自身抗体、抗PDLIM1自身抗体、抗ENO1自身抗体和抗HSP27自身抗体5种血清TAA自身抗体时,诊断效果比较理想,对应的灵敏度为60.78%、特异度为80.39%、Youden指数为0.4118、符合率为70.59%、Kappa值为0.41.结论:联合检测抗STMN1自身抗体、抗TPI1自身抗体、抗PDLIM1自身抗体、抗ENO1自身抗体和抗HSP27自身抗体5种血清TAA自身抗体,对骨肉瘤具有较高的诊断价值.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/5
-
肝细胞肝癌组织中TFAM、PDLIM1表达及与患者临床病理特征和预后的关系
编辑人员丨2023/8/5
目的 探究肝细胞肝癌(HCC)组织中线粒体转录因子A(TFAM)和PDZ-Lim结构域蛋白1(PDLIM1)表达及与患者临床病理特征和预后的关系.方法 采用免疫组化法检测103例HCC患者癌和癌旁组织中TFAM和PDLIM1蛋白表达.Spearman秩相关分析TFAM和PDLIM1蛋白表达的相关性.比较不同临床病理特征HCC患者TFAM、PDLIM1蛋白表达差异.应用Kaplan-Meier法分析TFAM、PDLIM1蛋白表达与HCC患者预后的关系.利用单因素及多因素Cox比例回归模型分析影响HCC患者预后的因素.结果 HCC癌组织中TFAM和PDLIM1蛋白表达阳性率分别为21.36%(22/103)、29.13%(30/103),癌旁组织中TFAM和PDLIM1蛋白表达阳性率分别为76.70%(79/103)、78.64%(81/103),癌组织中TFAM和PDLIM1蛋白表达阳性率低于癌旁组织(χ2分别为63.111、50.811,P均<0.05).HCC癌组织中TFAM与PDLIM1表达呈正相关(r=0.801,P<0.05).不同肿瘤最大径、肿瘤TNM分期HCC癌组织中TFAM和PDLIM1蛋白表达阳性率差异有统计学意义(P均<0.05).TFAM阴性表达者3年累积生存率低于TFAM阳性表达者(P<0.05).PDLIM1阴性表达者3年累积生存率低于PDLIM1阳性表达者(P<0.05).肿瘤TNM分期Ⅲ期、肿瘤最大径>3 cm、TFAM阴性表达、PDLIM1阴性表达是影响HCC患者预后的独立危险因素(P均<0.05).结论 HCC癌组织中TFAM、PDLIM1表达降低,二者表达与肿瘤最大径及肿瘤分期有关;TFAM、PDLIM1可能成为新的HCC预后相关肿瘤标志物.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/5
