目的:检测三阴乳腺癌(TNBC)中长链非编码RNA-HOX转录反义RNA(HOTAIR)表达，并探讨HOTAIR对TNBC发生发展的分子调控机制。方法:收集64例2016年1月至2019年7月东莞市人民医院乳腺科手术治疗TNBC癌及癌旁腺体组织，以实时定量荧光聚合酶链反应(qPCR)检测HOTAIR表达，比较其在癌及癌旁中表达差异，并分析其与病理分期的相关性。在TNBC MDA-MB231细胞株中以小干扰RNA下调HOTAIR表达，以siControl为对照组检测对细胞增殖能力和凋亡的影响。进一步研究下调HOTAIR表达对于多梳蛋白复合体2(PRC2)核心亚基Zeste基因增强子同源物2(EZH2)表达的影响，应用SPSS 19.0统计软件分析，组间差异采用 t检验。 结果:与癌旁组织比较，HOTAIR在TNBC中表达明显上调(0.71±0.10比0.50±0.06， t＝ 20.286， P<0.01)，差异有统计学意义。且HOTAIR在晚期TNBC组织中的表达明显高于早中期(0.78±0.05比0.64±0.07， t＝8.625， P<0.01)，差异有统计学意义。MDA-MB231细胞中以小干扰RNA(siRNA)沉默HOTAIR或EZH2的表达均引起细胞增殖能力下降、细胞凋亡增加。HOTAIR沉默表达后，EZH2表达明显下调，而下调EZH2 RNA对HOTAIR表达无影响。 结论:TNBC中HOTAIR表达明显上调，与不良预后相关。TNBC中HOTAIR可能通过调节PRC2复合物核心蛋白EZH2表达发挥生物效应。

目的:探讨恶性外周神经鞘膜瘤（malignant peripheral nerve sheath tumor，MPNST）的临床病理学特征、免疫表型及分子遗传学特征。方法:收集江苏省人民医院（南京医科大学第一附属医院）2012年1月至2022年12月诊治的23例MPNST，观察其临床及组织病理学、免疫组织化学及分子病理特点，并复习相关文献。结果:患者中男性10例，女性13例，年龄11~79岁（中位年龄36岁），其中Ⅰ型神经纤维瘤病（neurofibromatosis type 1，NF-1）相关MPNST患者14例，散发性MPNST患者9例。发生于四肢7例、躯干4例、颈肩部3例、胸腔3例、脊柱旁2例、腹腔2例、腹膜后1例、盆腔1例。组织学上肿瘤主要由条束状增生、紧密排列的梭形细胞组成，17例（17/23，73.9%）肿瘤边缘可见神经纤维瘤样区域。低倍镜下可见肿瘤细胞丰富区与稀疏区交替镶嵌分布，形成大理石样外观。高倍镜下肿瘤细胞核形不规则，呈卵圆形或锥形、子弹头样或细长波浪样，7例肿瘤细胞明显多形性，可见瘤巨细胞；核分裂象活跃（≥3个/10 HPF），常可见地图样坏死。免疫组织化学：肿瘤细胞阳性表达S-100蛋白（14/23，60.9%）、SOX10（11/23，47.8%）；CD34纤维网格缺失（14/17），H3K27me3表达缺失（19/23，82.6%），1例出现SDHA及SDHB表达缺失。5例行二代测序患者中均发生NF1基因胚系或体系功能缺失性变异；4例有SUZ12基因体系突变，其中2例伴有TP53突变；1例伴有SDHA基因胚系突变及FAT1、BRAF、KRAS基因体系突变。随访19例，随访时间1~67个月；4例死亡，且均有NF-1病史。结论:MPNST的形态学谱系广泛，基因改变复杂，需与多种梭形细胞肿瘤鉴别。H3K27me3完全缺失是诊断MPNST的重要免疫标记，CD34纤维网格不完整常提示神经纤维瘤恶性转化，NF1基因功能缺失性变异及PRC2基因复合物功能失活是较常见的分子诊断辅助依据，可能还伴有其他基因改变。

表观遗传学是肿瘤发展中的关键事件，可以改变肿瘤驱动基因的表达而导致基因组不稳定，而无需涉及基因本身的序列变化。组蛋白修饰属于表观遗传学的重要部分，在肿瘤的发病机制中起着重要作用。果蝇zeste基因增强子人类同源物2(enhancer of Zeste homolog2，EZH2)是多梳抑制性复合物2(polycomb repressive complex 2，PRC2)的酶催化亚单位，通过诱导组蛋白H3赖氨酸27甲基化(H3K27me3)来改变下游靶基因的表达。除直接作用于H3K27me3外，EZH2还可以通过多种途径调节基因表达。在多种肿瘤中均发现了EZH2的表达上调，而且肿瘤的不良预后也与EZH2表达的异常增高有关。本文综述了EZH2的结构和功能，重点介绍了EZH2在肿瘤发生、发展、转移中的作用，并分析其作为靶点对肿瘤诊断和治疗的指导性意义。

多梳抑制性去泛素化酶(polycomb repressive deubiquitinase,PR-DUB)复合物是多梳蛋白家族的成员之一,通过调节组蛋白修饰参与染色体的表观遗传修饰.多梳抑制性复合物1(polycomb repressive complex 1,PRC1)和PR-DUB复合物通过对H2AK119Ub泛素化与去泛素化修饰调控平衡,保护活性基因免受异常沉默,去泛素化功能与促进基因活化和建立转录允许的染色质状态有关,除此之外还激活增强子并促进双链断裂处DNA损伤修复.附加性梳样1(additional sex comb-like1,ASXL1)作为表观遗传支架组装染色质修饰复合物和转录因子参与表观遗传调控.BRCA1相关蛋白1(BRCA1-associated protein 1,BAP1)作为去泛素化酶去除底物的泛素化修饰.PR-DUB复合物由核心二聚体和其他辅助因子组成,BAP1与ASXL1形成核心二聚体,其他亚基相互作用调节PR-DUB复合物靶向和功能.ASXL1和BAP1是与PR-DUB复合物去泛素化功能最相关的2个亚基,ASXL1的DEUBAD结构域激活BAP1发挥去泛素化作用水解H2AK119Ub1.了解ASXL1和BAP1的结构以及相互作用机制对研究PR-DUB复合物特异性去泛素化作用的机制至关重要.在人类中,PR-DUB复合物成分的突变经常引起多种血液肿瘤.ASXL1基因突变常导致蛋白质翻译提前结束,大部分是由于C末端PHD结构域缺失导致.目前认为,PR-DUB复合物中突变的ASXL1或BAP1、表观遗传因子以及Akt/mTOR等靶点或信号通路相互作用是促进血液肿瘤发生发展的可能机制.这对于针对潜在的治疗靶点研究开发新的特异性靶向治疗药物至关重要.本文将介绍PR-DUB复合物的结构与功能、作用机制及其在血液肿瘤疾病中的发生,重点就ASXL1和BAP1进行综述,并系统总结了潜在的靶向治疗药物,以期为PR-DUB复合物在血液疾病防治中的研究提供科学参考.

目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)Hotair在慢性肾脏病(CKD)小鼠模型肾脏纤维化中的作用及其机制.方法 采用随机数字表法将36只小鼠分为对照组、CKD组、CKD+短发夹RNA-对照(sh-Ctrl)组、CKD+短发夹RNA-Hotair(sh-Hotair)组,每组9只.对照组喂食正常饲料,其余3组均予0.2％腺嘌呤饲料喂养造模.造模6周后,CKD+sh-Ctrl组和CKD+sh-Hotair组分别予尾静脉注射100μL(1011基因拷贝)包装了对照shRNA和Hotair-shRNA的腺相关病毒,对照组和CKD组予尾静脉注射100 μL 0.9％氯化钠注射液.观察8周后处死,检测血清肌酐、尿素氮水平,取肾组织行HE染色和Masson染色观察肾脏纤维化情况.采用qRT-PCR法检测肾皮质Hotair、多梳抑制复合体2(PRC2)复合物[Zeste增强子同源物2(EZH2)、Zeste12同源物抑制因子(SUZ12)、胚胎外胚层发育蛋白(EED)]和赖氨酸特异性去甲基化酶1(LSD1)mRNA表达水平,Western blot法检测肾皮质纤维化相关蛋白胶原蛋白1A1(COL1A1)、胶原蛋白4A1(COL4A1)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)和E-钙黏蛋白(E-cad-herin)的表达水平,并检测PRC2复合物和LSD1的蛋白表达水平.结果 与对照组比较,CKD组小鼠体重下降、肾功能恶化,出现肾脏纤维化,肾皮质Hotair表达升高;与CKD+sh-Ctrl组比较,CKD+sh-Hotair组小鼠血清肌酐、尿素氮水平均降低(均P＜0.01),病理检查显示肾脏纤维化程度减轻,肾皮质Hotair表达下降(P＜0.01).与对照组比较,CKD组小鼠COL1A1、COL4A1和α-SMA蛋白表达水平均增加,E-cadherin表达水平减少,PRC2复合物中EZH2、EED和LSD1 mRNA和蛋白表达水平均升高(均P＜0.01).与CKD+sh-Ctrl组比较,CKD+sh-Hotair组小鼠COL1A1、COL4A1 和α-SMA蛋白表达水平均降低,E-cadherin蛋白表达水平恢复,PRC2复合物中EZH2、EED和LSD1 mRNA和蛋白表达水平均下降(均P＜0.01).结论 lncRNA Hotair在CKD小鼠模型中表达升高,敲低Hotair可缓解肾脏纤维化,可能与Hotair作为PRC2和LSD1的分子支架介导的表观遗传修饰相关.

目的 探讨与乙型肝炎病毒(HBV)相关肝细胞癌(HCC)发生发展相关的异常甲基化修饰的差异表达基因及分子机制,以期望用于肝癌的早期诊断.方法 从公共基因表达数据库(GEO)中下载表达谱芯片GSE121248、GSE107170 和DNA甲基化芯片GSE136319,采用R语言筛选HBV相关HCC中癌组织和癌旁组织间差异表达基因(DEGs)和差异甲基化基因(DMGs),并绘制可视化火山图.对甲基化差异表达基因(MDEGs)进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,构建蛋白质相互作用(PPI)网络,并使用Cytoscape软件进行分子复合物检测(MCODE)分析和利用cytoHubba插件筛选关键基因.通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库验证关键基因的mRNA表达水平,并采用皮尔逊相关系数来评估关键基因在HCC中甲基化和基因表达之间的关系.使用HPA数据库、Cox比例风险回归模型、Kaplan Meier-plotter数据库和ROC分析对关键基因进行蛋白表达、生存分析验证以及预测准确率效能;并分析关键基因的表达与临床指标(肿瘤大小、病理分期)之间的相关性.结果 从GSE121248 和GSE107170 数据集中分别筛选出 921 个和 1 172 个DEGs,其中下调表达基因分别为 570个和714 个,上调表达基因分别为351 个和458 个;DNA甲基化芯片GSE136319 数据进行差异分析后,有7 952 个高甲基化基因,2 630 个低甲基化基因.综合分析DEGs和DMGs,共得到 33 个低甲基化修饰下表达上调的基因,和158 个高甲基化修饰下表达下调的基因.GO富集分析表明,异常甲基化修饰的差异表达基因主要参与羧酸分解代谢、有机酸分解代谢和血红素结合等过程;KEGG通路主要为化学致癌 DNA 加合物、补体和凝血系统和PPAR信号通路等.STRING和 Cytoscape软件筛选出 12 个与甲基化表达相关的关键基因,包括 FTCD、HRG、C8A、FOXM1、FGA、KLKB1、MBL2、FETUB、TTK、AURKA、PRC1 和 MAD2L1;经临床样本数据验证,FTCD、HRG、C8A、FOXM1、AURKA、PRC1、TTK和MAD2L1 这8 个基因在HBV相关HCC患者中差异表达,且与患者预后不良有关;FTCD、HRG、FOXM1、TTK、AURKA、PRC1 和 MAD2L1 的表达水平与肿瘤大小和病理分期相关.结论 FTCD、HRG、C8A、FOXM1、TTK、AURKA、PRC1 和MAD2L1 在HBV相关HCC的发病过程中可能起着重要的作用,有可能作为HBV相关HCC的潜在诊断标志物及治疗靶点.

多梳抑制复合物2(PRC2)是一种作用于组蛋白H3赖氨酸位点K27的高度保守的组蛋白甲基转移酶,是PcG蛋白家族的一员.而PRC2的催化亚基是果蝇Zeste基因增强子同源物2(EZH2).大量研究证明,EZH2在多种肿瘤组织中高表达,例如乳腺癌、非小细胞肺癌、胃癌等.本文总结了EZH2基因的起源、结构、生物学功能及其在消化系统肿瘤中的研究进展,并对EZH2的靶向治疗进行展望.

肺癌是世界范围内发生率和死亡率最高的恶性肿瘤,根据其病理类型可分为小细胞肺癌(SCLC)和非小细胞肺癌(NSCLC),非小细胞肺癌约占肺癌总数的80%左右,因缺乏高敏感性和特异性的早期诊断生物指标,其诊断之后的5年生存率不超过20% [1].在过去的10年当中,lncRNA逐渐进入研究者们的视线,随着生物信息学的不断发展和新一代全基因组与转录组测序技术的应用,我们不难发现在人类基因组中有2/3的基因是被转录成为RNA,然而其中只有1% -2%的部分被进一步编码为蛋白质[2].因此我们将RNA分为:具有编码潜力的RNA和无编码潜力的RNA,后者又被称为非编码RNA(ncRNA).虽然mRNA已经得到广泛及深入的研究,但是作为RNA中绝大部分的ncRNA却曾经被认为是"转录垃圾",近几年才有越来越多的证据表明其对分子机制的影响巨大.非编码RNA被分为小于200bp的小ncRNA和大于200bp的长链ncRNA(lncRNA)[3-4],有研究表明lncRNA与多种细胞生物过程有关,包括染色体剂量补偿、基因印记、表观遗传调节、细胞周期控制、核质运输、转录、翻译、剪接和细胞分化等[4-5],因此lncRNA被错误的激活或失活将会导致疾病的发生,其中包括肿瘤.lncRNA涉及通过多种机制调节癌细胞生长,转移和化疗药物耐药性,包括与RNA结合蛋白如多梳抑制复合物2(PRC2)相互作用,作为诱饵与其他蛋白质竞争靶基因或特异性微小RNA的结合位置,并且可以修饰mRNA结构并影响mRNA的稳定性.而且已经发现许多众所周知的转录因子(例如 E2F1, P53,SP1等)和表观遗传调节因子(例如EZH2,DN-MT1)介导的 DNA 甲基化或组蛋白修饰促进 ln-cRNA在癌症中的异常转录激活或失活[4].

帕金森病(Parkinson's disease,PD)是一种常见的神经退行性疾病,影响群体广泛.该文分析了帕金森病多巴胺细胞的表达和DNA甲基化信息,识别出了新的表达或者DNA甲基化异常的基因,并分析了这些基因与帕金森病的关联.结果表明:相比于正常细胞,帕金森病细胞中与微管形成相关的基因表达上调,这些基因包括SLAIN1、TAGLN3和TUBB2B;天然免疫关联的基因(如LY96)下调.另一个上调基因SCG5推测与免疫应激响应相关.DNA甲基化变化在启动子区显著,除了调节基因转录,这些变化可能通过PRC1和PcG复合物改变染色质的活性水平.此外,表达水平和DNA甲基化同时调整的基因与轴突定向、胞内运输、神经元分化及迁移等功能有关.以上结果提供了对帕金森病机理特征的新的认识.

目的 分析原发性胆汁性肝硬化(PBC)患者外周血单个核细胞(PBMC)中长链非编码RNA(lncRNA)表达谱,为PBC的发病机制、临床诊断和治疗提供新的方向.方法 收集PBC及健康对照组外周抗凝血各30份,分离PBMC,从中各选取4份进行lncRNA表达谱芯片测定,并用逆转录PCR(RT-PCR)验证芯片结果.对芯片结果进行生物信息学分析,如 Cis/Trans 靶基因分析、Gene ontology(GO)分析、Pathway分析和共表达网络预测,并设计小干扰RNA(siRNA)干扰lncRNA的表达,进行靶点验证.结果 相对于健康对照组,PBC患者PBMC中共发现749个异常表达的lncRNA, 230个异常表达的信使RNA(mRNA).PBC组核受体(NR4A3)基因表达水平下调78%,而在NR4A3基因下游20000 bp左右的lncRNA linc-pbc的表达上调2.56倍.转染针对linc-pbc 的siRNA后, PBMC中linc-pbc的水平下降,而NR4A3的mRNA表达水平及蛋白质水平均上调,叉头状转录因子(FOXP3)的表达也上调.结论 linc-pbc或许通过招募多梳蛋白抑制性复合物(PRC2),使NR4A3基因启动子区甲基化,下调NR4A3基因的表达水平,使其调控靶基因转录的活性降低,导致下游的靶基因FOXP3的表达下降,进而引起外周血及肝组织局部具有免疫抑制功能的调节性T细胞(Treg)细胞数量减少,打破机体免疫耐受平衡,促进PBC的发生和发展.