目的 基于网络药理学与体外实验探讨淫羊藿素抗非小细胞肺癌(NSCLC)表皮生长因子受体-酪氨酸酶抑制剂(EGFR-TKIs)耐药的分子机制.方法 利用PubChem和化合物靶点预测(Swiss Target Prediction)数据库下载淫羊藿素的简化分子线性输入规范(SMILES)号及作用靶点,通过人类基因(GeneCards)和在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库收集NSCLC耐药疾病靶点,将药物与疾病交集靶点导入STRING数据库分析蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)情况,运用Cytoscape 3.9.1软件内置插件计算节点拓扑参数值并筛选核心靶点,采用生物信息学分析平台(DAVID)数据库进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体(GO)富集分析,构建"淫羊藿素-关键靶点-疾病-通路"图.使用Pymol和Autodock Tools 1.5.7软件进行分子对接.体外实验选用NSCLC耐药株PC9OR研究淫羊藿素对细胞增殖、集落形成、迁移、侵袭和凋亡能力的影响,并对富集得到的核心靶点及关键通路进行验证.结果 共筛选到淫羊藿素治疗NSCLC耐药的潜在作用靶点1 952个.通过PPI网络节点拓扑参数值筛选得到13个核心靶点,涉及蛋白激酶B(AKT1)、雌激素受体α(ESR1)、B淋巴细胞瘤2(BCL2)、表皮生长因子受体(EGFR)等基因.KEGG通路富集分析显示,癌症相关通路、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶 B(PI3K-AKT)信号通路、EGFR-TKIs耐药通路等可能在淫羊藿素治疗NSCLC EGFR-TKIs耐药的过程中起关键作用.GO富集分析显示,细胞功能涉及信号传导、凋亡过程的负调控、DNA转录的正调控等.分子对接显示淫羊藿素与各核心靶点均具有较强的结合能力.细胞实验表明,淫羊藿素抑制耐药细胞的增殖、集落形成、迁移、侵袭及促进细胞凋亡,并下调ESR1、AKT1、EGFR等mRNA表达水平以及PI3K-AKT通路磷酸化磷脂酰肌醇-3-激酶(p-PI3K)、磷酸化蛋白激酶B(p-AKT)的关键蛋白水平.结论 淫羊藿素可能通过多靶点调控PI3K-AKT通路抑制EGFR-TKIs耐药细胞的增殖、集落形成、迁移、侵袭及促进细胞凋亡,从而发挥抗NSCLC EGFR-TKIs耐药的作用.

目的:评价Z-DNA结合蛋白1(ZBP1)/受体相互作用蛋白激酶1(RIPK1)信号通路在脂多糖(LPS)-三磷酸腺苷(ATP)致小鼠巨噬细胞焦亡中的作用。方法:常规培养小鼠RAW264.7巨噬细胞，采用随机数字表法分为6组( n＝9)：空白对照组(C组)、LPS-ATP组、LPS-ATP＋转染阴性对照scRNA组(LPS-ATP＋scRNA组)、LPS-ATP＋ZBP1小干扰RNA组(LPS-ATP＋siRNA组)、LPS-ATP＋二甲基亚砜组(LPS-ATP＋DMSO组)和LPS-ATP＋RIPK1抑制剂nec-1组(LPS-ATP＋nec-1组)。LPS-ATP＋siRNA组使用siRNA技术抑制ZBP1的表达，LPS-ATP＋nec-1组给予nec-1抑制RIPK1的表达；C组常规培养，余5组给予10 μg/ml LPS孵育24 h，然后加入5 mmol/L ATP孵育30 min构建细胞焦亡模型。采用CCK-8法检测细胞存活情况；ELISA法检测细胞上清液IL-1β、IL-6、IL-18和TNF-α浓度；碘化丙啶荧光染色法测定细胞焦亡情况；Western blot法检测ZBP1、RIPK1、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶1(caspase-1)和消皮素D(GSDMD)表达。 结果:与C组比较，LPS-ATP组细胞存活率降低，细胞焦亡率升高，上清液IL-1β、IL-6、IL-18及TNF-α浓度升高，细胞ZBP1、RIPK1、caspase-1和GSDMD表达上调( P<0.05)；与LPS-ATP组比较，LPS-ATP＋scRNA组和LPS-ATP＋DSMO组上述各指标差异无统计学意义( P>0.05)；与LPS-ATP＋scRNA组比较，LPS-ATP＋siRNA组细胞存活率升高，细胞焦亡率降低，上清液IL-1β、IL-6、IL-18及TNF-α浓度降低，细胞ZBP1、RIPK1、caspase-1和GSDMD表达下调( P<0.05)；与LPS-ATP＋DSMO组比较，LPS-ATP＋nec-1组细胞存活率升高，细胞焦亡率降低，上清液IL-1β、IL-6、IL-18及TNF-α浓度降低，RIPK1、caspase-1和GSDMD表达下调( P<0.05)，ZBP1表达差异无统计学意义( P>0.05)。 结论:ZBP1/RIPK1信号通路激活参与了LPS-ATP致小鼠巨噬细胞焦亡的过程。

目的:利用生物信息学探索细胞分化周期蛋白45(cell differentiation cycle protein 45，CDC45)在甲状腺癌中的表达模式，并分析其潜在功能及涉及的信号通路，探索CDC45在甲状腺癌中的临床应用价值。方法:利用癌症基因组图谱计划(the cancer genome atlas，TCGA)数据库下载甲状腺癌的基因表达和临床生存数据；通过Timer，人类蛋白质图谱(the human protein atlas，HPA)和SPSS分析CDC45在甲状腺癌中的基因及蛋白表达模式；利用Kaplan-Meier曲线分析CDC45表达与预后之间的相关性；使用Cox回归对甲状腺癌预后影响因素进行分析，并利用R软件对结果进行可视化；使用String预测CDC45的蛋白互作网络，并利用基因本体数据库(gene ontology，GO)，东京基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes，KEGG)和GSEA软件进行功能和通路富集分析；分别通过R软件和Timer分析CDC45与免疫浸润以及各个免疫细胞之间的相关性。结果:与癌旁组织相比，甲状腺癌组织中CDC45基因水平显著上调，差异具有统计学意义[(－4.10±1.95)比(－2.04±1.24)， t＝11.28， P<0.001]。免疫组化染色结果显示，与癌旁组织相比，甲状腺癌中CDC45蛋白表达明显上升。TCGA数据库分析结果显示，CDC45的表达量与甲状腺癌患者年龄、性别以及M分期无关( P>0.05)；但N1分期甲状腺癌患者CDC45表达量显著高于N0分期患者，差异具有统计学意义[(－2.19±1.31)比(－1.82±1.09)， t＝－3.40， P<0.05]；甲状腺癌Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ期患者CDC45表达水平显著高于Ⅱ期患者，差异具有统计学意义[(－1.99±1.20)或(－1.94±1.20)或(－1.82±1.22)比(－2.56±1.28)， t＝3.09、3.02、3.05， P值均<0.001]。CDC45对甲状腺癌患者总体生存期(overall survival，OS)和疾病特异性生存期(disease free survival，DSS)无显著影响( P>0.05)，但高表达的CDC45显著减少了甲状腺癌患者无疾病间隔期(disease free interval，DFI)和无进展间隔期(progression free interval，PFI)，差异具有统计学意义( P＝6.2e －9、2.5e －5)。多因素Cox回归分析发现，CDC45、M分期和T分期都可以作为甲状腺癌患者DFI时间的独立影响因子；而CDC45、年龄和M分期可以作为PFI时间的独立影响因子。通过蛋白互作网络挑选相关性最高的40个基因进行富集分析，GO富集分析结果表明CDC45相关蛋白主要在核浆和染色体中参与DNA的复制、代谢与结合；KEGG富集分析结果表明CDC45相关蛋白主要参与DNA复制、细胞周期、核苷酸切除修复等；GSEA富集分析发现CDC45还富集在免疫相关的通路上。免疫浸润结果表明，CDC45与B细胞，CDC8 ＋T细胞，CD4 ＋T细胞，巨噬细胞，中性粒细胞以及髓样树突细胞之间呈显著正相关，差异有统计学意义( r＝0.35、0.25、0.14、0.16、0.27、0.39， P值均<0.05)。 结论:CDC45在甲状腺癌中显著高表达，可以独立预测甲状腺癌患者的DFI和PFI时间。

目的:探讨子痫前期患者胎盘组织中转录因子二聚化配体2（transcription factor dimerization partner 2，TFDP2）的表达及其对滋养细胞凋亡的影响。方法:回顾性选取2018年1月至2022年12月期间在南京大学医学院附属鼓楼医院剖宫产分娩的子痫前期产妇30例（子痫前期组），及同期在本院剖宫产分娩的健康正常产妇30例（对照组）的胎盘组织。利用免疫组织化学染色检测TFDP2在胎盘组织中的定位，实时荧光定量-聚合酶链反应和蛋白质印迹技术检测2组胎盘组织中TFDP2 mRNA和蛋白水平的差异。取合体滋养细胞BeWo细胞，转染小干扰RNA敲降TFDP2，利用蛋白质印迹和实时荧光定量-聚合酶链反应技术检测凋亡相关指标——B细胞淋巴瘤2蛋白（B cell lymphoma 2，Bcl2）和Bcl2相关X蛋白（Bcl2 associated X，Bax）及其mRNA的改变，利用末端脱氧核苷酸转移酶介导的dUTP原位切口末端标记染色和流式细胞技术观察凋亡细胞数量的改变，并探索相关下游信号通路的变化。采用两独立样本 t检验、秩和检验和 χ2检验进行统计学分析。 结果:TFDP2主要表达于对照组胎盘合体滋养细胞和绒毛外滋养细胞中。子痫前期胎盘组织合体滋养细胞中TFDP2的表达量在mRNA水平（0.722±0.239与1.000±0.348， t=3.61， P=0.001）和蛋白水平（0.728±0.185与1.000±0.206， t=2.41， P=0.037）均低于对照组。与未敲降TFDP2比较，在BeWo细胞中敲降TFDP2，凋亡指标Bax/Bcl2比值升高（mRNA：1.755±0.452与1.000±0.279， t=3.48， P=0.006；蛋白：3.206±0.922与1.000±0.290， t=3.95， P=0.017），每个视野中凋亡细胞数量升高［（4.556±1.740）与（2.444±1.130）个， t=3.05， P=0.008］，总凋亡细胞比例升高［（21.37±1.66）%与（12.61±0.38）%， t=8.92， P=0.001］，BeWo细胞质中蛋白激酶A催化亚基的Thr197位点磷酸化活性降低（0.466±0.035与1.000±0.075， t=11.19， P<0.001），细胞核中β-连环蛋白的表达降低（0.250±0.093与1.000±0.269， t=4.57， P=0.010）。 结论:子痫前期患者胎盘组织合体滋养细胞中TFDP2的表达降低，可能通过抑制蛋白激酶A催化亚基/β-连环蛋白信号通路，促进合体滋养细胞的凋亡。

目的:分析 VPS13B基因复合杂合变异导致的Cohen综合征患者的致病性以及临床特征。 方法:采用家系调查研究，收集2021年9月于河南省立眼科医院就诊的中国汉族Cohen综合征一家系共2代3人，其中患者1例。收集先证者及其父母的临床资料，完善相关眼科及全身检查以评估临床表型；采集该家系成员外周静脉血样本，提取全基因组DNA，进行全外显子组测序。对家系成员中进行Sanger测序和家系共分离分析。根据ACMG指南对筛选出来的变异位点进行致病性评分；应用在线工具对变异位点进行致病性预测。以"Cohen综合征"、"Cohen syndrome"和" VPS13B基因"为关键词，检索在线人类孟德尔遗传数据库、PubMed数据库、中国知网、万方数据知识服务平台以及维普中文科技期刊数据库中Cohen综合征相关文献。总结文献中不同患者的临床表现以及致病位点，分析基因型和临床表型的关系。 结果:该家系符合常染色体隐性遗传。先证者，男，5岁，双眼夜盲伴畏光、上睑下垂、下睑内翻、倒睫，双眼高度近视，周边视网膜骨细胞样色素沉积，周边部视网膜外层萎缩变薄，闪光视网膜电图未检测出波形；全身发育迟缓，典型面部特征，手指脚趾细长，扁平足，足内翻，肌张力减退，未发现心脏异常；性格过度开朗。先证者临床表现符合Cohen综合征。先证者父母临床表型及辅助检查结果均未见明显异常。全外显子测序显示，先证者携带 VPS13B基因1个无义变异c.11713C>T(p.Gln3905*)和1个剪接变异c.6940+1G>T。经Sanger测序验证，上述变异在该家系中呈共分离。其中c.11713C>T(p.Gln3905*)为未报道的新变异位点，该变异位点使其编码的蛋白质提前终止，影响蛋白质的正常功能。ACMG指南显示2种变异均为致病变异。共检索到12篇中国Cohen综合征的变异位点及临床特征相关文献，结合本研究结果共发现中国患者人群中 VPS13B变异位点共24个，其中移码变异位点发生率较高，占41.7%(10/24)，错义变异、剪接变异和无义变异分别占20.8%(5/24)、20.8%(5/24)和16.7%(4/24)。Cohen综合征患者发病年龄为28天~12岁，神经系统、眼、脑、骨骼等全身症状呈散发状态，临床表现具有高度异质性。 结论:该Cohen综合征家系 VPS13B基因发现1个新的致病变异c.11713C>T，扩大了 VPS13B基因致病变异谱。Cohen综合征患者临床表型具有高度异质性。

目的:通过蛋白重组技术低成本、快速制备高浓度人视黄醇结合蛋白4（hRBP4）参考物质，解决临床hRBP4高值参考物质难以获取的需求。方法:在美国国立生物技术信息中心NCB查找hRBP4的互补DNA序列，经大肠埃希菌密码子优化后人工合成，然后将DNA片段克隆至原核表达质粒pET-28a（+）中，以构建重组hRBP4表达载体。将重组质粒转化至 E. coli BL21感受肽中，优化诱导表达条件（如温度、转速和异丙基硫代半乳糖苷IPTG浓度等）、诱导质粒表达并对重组蛋白进行His融合标签纯化，获取纯化后的hRBP4重组蛋白。 结果:DNAMAN软件对比显示编码hRBP4蛋白的碱基序列完全正确，成功构建重组hRBP4原核表达质粒；SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳结果显示亲和纯化产物中可清晰可见约相对分子质量26 000电泳条带；临床尿液和血清hRBP4常规检测系统均可检测到纯化的hRBP4蛋白，且稀释倍数与检测浓度间呈现良好线性关系。结论:成功构建重组hRBP4高水平表达系统，重组hRBP4蛋白纯度大、浓度高、生产周期短，有望在室间质量评价质控品和有证参考物质研制中发挥重要作用。

目的:通过网络药理学研究三七治疗血小板聚集的作用机制。方法:查询中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库筛选三七的药物成分，使用Swiss Target Prediction预测药物成分的作用靶点；运用GeneCards获取血小板聚集的疾病靶点，利用venny 2.1获取交集靶点。使用String进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析并使用Cytoscape构建网络图，使用Cytoscape软件构建"药物-靶点-通路"网络图。利用Metascape进行基因本体（GO）富集分析及京都基因和基因组百科全书（KEGG）信号通路分析。结果:三七中的7个有效成分通过多条通路直接作用于142个疾病靶点治疗血小板聚集，其中β-谷甾醇、豆甾醇、槲皮素和人参皂苷Rh 2等是核心成分，肿瘤蛋白p53（TP53）、丝裂原活化蛋白激酶1（MAPK1）、JUN、肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素-6（IL-6）、蛋白激酶B1（AKT1）是重要靶点。GO富集分析显示，生物过程（BP）主要涉及细胞对脂质的反应、对激素的反应、细胞对氮化合物的反应等；细胞组分（CC）主要涉及膜筏、膜微区、小窝和质膜筏等；分子功能（MF）主要涉及DNA结合转录因子结合、转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ特异度DNA结合转录因子结合等。KEGG通路富集分析表明，三七治疗血小板聚集的信号通路主要有晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体（AGE-RAGE）、磷脂酰肌醇-3-激酶（PI3K）/Akt、缺氧诱导因子-1（HIF-1）、TNF、MAPK等。 结论:三七主要通过调节AGE-RAGE、PI3K/Akt、HIF-1、TNF、MAPK等信号通路的TP53、MAPK1、JUN、TNF、IL-6、AKT1等疾病靶点，调节酶类活性治疗血小板聚集。

目的:探讨泛素结合酶2T（UBE2T）对肺腺癌放射敏感性的影响及其可能的机制。方法:收集2019年3月至2021年12月在遵义医科大学第二附属医院经病理证实，且经单纯放射治疗的各期肺腺癌患者45例，按实体肿瘤疗效评价（RECIST）1.1标准进行疗效评价，分为放疗敏感组（25例）、放疗抵抗组（20例），前者为完全缓解+部分缓解，后者为疾病稳定+疾病进展。免疫组化（IHC）检测通过染色强度和阳性细胞数计分，结合卡方检验分析患者石蜡标本UBE2T表达水平与放射敏感性间的相关性。利用人肺腺癌细胞，构建慢病毒UBE2T干扰（UBE2Tsh）的A549细胞和UBE2T过表达的SPC-A-1细胞，行放射及克隆形成实验检测细胞的存活分数，多靶单击模型拟合生存曲线。免疫荧光技术检测DNA双链损伤（DSB）标记物γH2AX聚焦点水平（γH2AX聚焦点数/单个细胞）。蛋白质印迹法检测UBE2T、γH2AX、Rad51蛋白表达。流式细胞术检测细胞周期变化和凋亡率。二分类变量资料统计采用Fisher's精确概率法，计量资料采用 t检验。 结果:UBE2T高表达同肺腺癌患者放疗抵抗相关（ P<0.05）。慢病毒UBE2T干扰提高A549细胞的放射敏感性，放射增敏比（SER）为1.795，UBE2T过表达降低SPC-A-1细胞的放射敏感性，SER为0.293。UBE2Tsh A549细胞照射后细胞核内γH2AX聚焦点数显著增加（ P<0.01），γH2AX蛋白表达量增加（ P<0.01），Rad51蛋白表达量降低（ P<0.001），UBE2T过表达SPC-A-1细胞γH2AX蛋白表达量降低（ P<0.05），Rad51蛋白表达量增加（ P<0.001）。UBE2Tsh A549细胞照射后G 2期细胞占比减少（ P<0.01），细胞凋亡增加（ P<0.001）。 结论:UBE2T可能通过增强肺腺癌细胞放疗所致DNA双链损伤修复，诱导细胞周期G 2期阻滞，减少细胞凋亡介导放疗抵抗。

目的:探讨先天性虹膜缺损合并先天性白内障一家系的致病基因及遗传方式。方法:采用家系调查研究方法，2020年2月于云南省残疾人康复中心和昆明医科大学第二附属医院眼科收集云南汉族先天性虹膜缺损合并先天性白内障一家系，对先证者及其父母、子女和丈夫进行眼科临床检查及诊断。收集该家系成员全血，提取基因组DNA。对先证者及其丈夫进行全外显子组测序，采用生物信息学分析方法定位可疑致病基因，采用UGENE进行氨基酸保守性分析；采用MutationTaster预测变异对蛋白翻译的影响；参照美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)遗传变异分类标准与指南对变异位点进行致病性评估。对所有收集样本进行Sanger测序验证，确定致病基因及变异位点。结果:先证者临床表现为双眼虹膜大部缺损，仅周边部见少量虹膜组织，晶状体皮质及后囊混浊，伴有眼球震颤，眼部检查无其他异常。先证者全外显子组测序结果显示， PAX6基因第8外显子有1个新的杂合移码变异 PAX6：c.415dupA(p.R139fs)，发生移码突变的位点在各物种间保守。MutationTaster预测结果显示，该变异位点位于PAX6蛋白高度保守区，变异使蛋白质丧失功能。ACMG遗传变异分类标准与指南评分为PVS1+PM2+PP1，为致病性变异。结合该家系疾病临床表型及Sanger测序分析，显示变异与疾病共分离，表明该变异致病。先证者及子女均患该病，先证者父母表型正常，该变异为新发变异，符合常染色体显性遗传。 结论:PAX6基因杂合移码突变c.415dupA(p.R139fs)是导致该家系出现先天性虹膜缺损合并先天性白内障的原因，该变异位点为首次报道。

SOX家族基因由于与SRY基因结构域相似而得名。在SOX家族基因中，SRY基因是哺乳动物性腺分化决定基因，直接决定了性腺向睾丸分化的方向；SOX9基因是性别分化过程中启动睾丸发育程序的重要基因；与SOX9结构域相似的SOX8、SOX2基因则在男性性发育与维持男性生殖功能中起到一定的作用。这些SOX家族基因的序列中都包含一段高度保守的结构域HMG序列。HMG的编码产物中都包含一组由79个氨基酸组成的蛋白质，起到结合和弯曲DNA的作用。因此，这些SOX家族基因的功能类似。该文综述了SRY、SOX9、SOX8、SOX2等SOX家族基因在男性性别决定及男性生殖功能中的作用研究进展。