目的:探讨气肿性尿路感染（emphysematous urinary tract infection，EUTI）的影响因素及预后。方法:回顾性分析2013年12月至2020年6月在山东大学齐鲁医院青岛院区诊断为EUTI的患者临床资料，选取同一时间段非气肿性尿路感染患者作为对照组。比较两组患者基线资料的差异。采用二元Logistic回归分析法分析EUTI的影响因素。结果:（1）24例EUTI及53例非气肿性尿路感染被纳入本研究。与非气肿性尿路感染相比，EUTI组患者血红蛋白水平较低（ t=-5.245， P<0.001），血尿素氮（ Z=-4.361， P<0.001）、血清肌酐（ Z=-4.543， P<0.001）、血糖（ Z=-2.608， P=0.009）及三酰甘油（ Z=-2.408， P=0.016）水平均较高，而糖尿病（ χ2=13.453， P<0.001）和慢性肾脏病（ χ2=17.936， P<0.001）者均较多。血清肌酐升高是尿路感染者发生EUTI的影响因素（ OR=1.011，95% CI 1.001~1.020， P=0.025）。（2）大肠埃希菌是24例EUTI患者中最常见的致病菌（14例，58.3%），其他致病菌包括肺炎克雷伯菌（2例，8.3%）、屎肠球菌（1例，4.2%）、泛菌属（1例，4.2%）和混合菌（1例，4.2%）。大肠埃希菌感染的EUTI患者中有10例为超广谱β-内酰胺酶阳性菌。（3）预后不良组（ n=4）和预后良好组（ n=20）住院天数（ Z=-2.457， P=0.014）、休克（ P=0.002）、自身免疫疾病（ P=0.022）、血白细胞（ Z=-2.091， P=0.036）、血尿素氮（ t=2.432， P=0.024）的差异均有统计学意义，进一步Logistic回归分析未得出EUTI预后的影响因素。 结论:血清肌酐升高是尿路感染者发生EUTI的独立影响因素，大肠埃希菌是最常见的致病菌且超广谱β-内酰胺酶阳性菌比例高。

目的:分析急性呼吸窘迫综合征（ARDS）患者治疗前后肺部微生态的异同，根据不同预后，寻找ARDS患者肺部微生态在疾病转归中的变化规律。方法:采用回顾性研究方法，选择2019年2月至2020年1月江门市中心医院重症监护病房（ICU）收治的重症肺炎导致ARDS患者作为研究对象。将患者分为治疗前组（24例）、治疗后存活组（17例）、治疗后死亡组（7例）；以同期本院ICU收治的存在轻度肺部感染的非ARDS患者为对照组（25例）。分析并比较4组患者肺部微生态的异同，筛选与ARDS死亡相关的可能致病菌（潜在的死亡危险因素）及ARDS生存相关的益生菌（潜在的生存保护因素）。结果:病原微生物方面，治疗后死亡组大肠埃希菌和白色念珠菌的阳性检出率较治疗后存活组明显升高〔57.1%（4/7）比5.9%（1/17），57.1%（4/7）比0% （0/7），均 P<0.05〕。而在背景菌筛选中，治疗前组较治疗后存活组、治疗后死亡组较治疗后存活组、治疗后死亡组较对照组同时减少的菌属可能是肺部益生菌（潜在的ARDS生存保护因素），结果筛选出共同的菌属为氢化杆菌属〔治疗前组比治疗后存活组：62.5% （15/24）比94.1%（16/17），治疗后死亡组比治疗后存活组：14.3%（1/7）比94.1%（16/17），治疗后死亡组比对照组：14.3%（1/7）比96.0%（24/25），均 P<0.05〕。治疗后死亡组较治疗前组、治疗后死亡组较治疗后存活组、治疗后死亡组较对照组同时增加的菌属为可能的肺部致病菌（潜在的ARDS死亡危险因素），结果筛选出共同的菌群有爱德华菌属、肠杆菌属、埃希杆菌属、克雷伯菌属、克吕沃尔菌属、莱略特菌、泛菌属、拉乌尔菌属等肠杆目菌群。 结论:肺部病原微生物中大肠埃希菌或白色念珠菌增加，或背景菌出现肠杆目菌群增多可能是ARDS患者死亡的危险因素。氢化杆菌属可能是ARDS患者存活的保护因素，能否作为ARDS的新治疗手段值得继续探讨。

[目的]从黄栌枝干内部分离到的细菌CCBC3-3-1 菌株对黄栌枯萎病菌(Verticillium dahliae)表现出较强的拮抗作用,从基因组层面深入研究其拮抗机理,为进一步研发生防菌剂提供理论依据.[方法]利用PacBio RS测序平台完成CCBC3-3-1 的全基因组测序,根据 16S rDNA序列信息构建系统发育树,并与同属近缘种菌株进行比较基因组学分析;对其发酵液进行LC-MS非靶标代谢组检测.[结果]CCBC3-3-1 基因组总长度为 5.16 Mb,由 1 条环状双链染色体和 3 个环状质粒组成,GC含量 48.08%,含有 5 013 个编码基因.经过antiSMASH预测,CCBC3-3-1 基因组中有 8 个抗生素及次生代谢物合成相关的基因簇,其中 2 个与已知基因簇相似度较低,5 个基因簇功能未知,其发酵液中检测出 6 种已知抗生素类物质.比较基因组学分析结果表明CCBC3-3-1 基因组与泛菌属内 4 个近缘种均有显著差异,而且CCBC3-3-1 在 16S rDNA系统发育树上形成一个相对独立的分支.[结论]CCBC3-3-1 是泛菌属的一个新变异种Pantoea sp.,能够产生多种抗生素类物质,在黄栌枯萎病生物防治方面具有重要应用潜力.

为获得能够把难溶性磷转化为可溶性磷的解磷微生物,从茅台酒厂种植地的土壤中分离筛选出两株具有解磷能力的菌株,并对这两株菌株进行分子生物学鉴定及解磷性能分析,测定其发酵液中的有机酸,初步探究解磷机理和在酒糟中的生长能力.结果表明,筛选的P1 和P2 菌株分别为路氏肠杆菌(Enterobacter ludwi-gii)和分散泛菌(Pantoea dispersa).P1 和 P2 单菌培养的难溶磷降解率分别在第 10 天和第 1 天达到最高9.62%和7.56%,P1 和P2 混菌(P3)培养难溶磷的降解率在第2 天达到最大为18.83%.不同条件下菌株对难溶磷的降解率有一定影响,其中 40℃混菌培养在第 6 天高达 33.82%.P1 主要产乙酸,高达 4 103.65 mg/L,P2 主要产乙酸和琥珀酸,混菌培养主要产乙酸,其次是草酸.两株菌在酒糟中具有较强的生长能力,为解磷功能菌株制备酒糟生物有机肥提供一定的参考.

目的 通过RiboPrinter全自动微生物基因指纹鉴定系统对中药片剂待压片粉污染的耐胆盐阴性菌进行溯源分析,找到污染源.方法 用VITEK2 Compact全自动微生物鉴定系统、RiboPrinter全自动微生物基因指纹鉴定系统、16SrRNA(16S核糖体RNA)序列分析、MALDI-TOF MS(基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱)对待压片粉中和环境中分离的16株耐胆盐革兰氏阴性菌进行鉴定并比较结果差异,再采用RiboPrinter方法对鉴定结果一致的菌株进行基因指纹图谱比对、溯源,并利用BioNumerics软件进行聚类分析.结果 待压片粉中分离的6株菌株与沸腾干燥机布袋上分离的1株菌株鉴定结果一致,为热生泛菌(Pantoea calida),通过比较,MALDI-TOF MS鉴定速度更快,分辨率更高.RiboPrinter溯源分析表明7株热生泛菌同源性极高,相似度为0.94±0.03.结论 通过RiboPrinter溯源结果和BioNumerics构建树状图分析,推断待压片粉污染来自沸腾干燥机布袋,分析污染风险高低,并提出污染解决措施和方案.

Objective The purpose of this study was to investigate the bacterial communities of biting midges and ticks collected from three sites in the Poyang Lake area,namely,Qunlu Practice Base,Peach Blossom Garden,and Huangtong Animal Husbandry,and whether vectors carry any bacterial pathogens that may cause diseases to humans,to provide scientific basis for prospective pathogen discovery and disease prevention and control.Methods Using a metataxonomics approach in concert with full-length 16S rRNA gene sequencing and operational phylogenetic unit(OPU)analysis,we characterized the species-level microbial community structure of two important vector species,biting midges and ticks,including 33 arthropod samples comprising 3,885 individuals,collected around Poyang Lake.Results A total of 662 OPUs were classified in biting midges,including 195 known species and 373 potentially new species,and 618 OPUs were classified in ticks,including 217 known species and 326 potentially new species.Surprisingly,OPUs with potentially pathogenicity were detected in both arthropod vectors,with 66 known species of biting midges reported to carry potential pathogens,including Asaia lannensis and Rickettsia bellii,compared to 50 in ticks,such as Acinetobacter lwoffii and Staphylococcus sciuri.We found that Proteobacteria was the most dominant group in both midges and ticks.Furthermore,the outcomes demonstrated that the microbiota of midges and ticks tend to be governed by a few highly abundant bacteria.Pantoea sp7 was predominant in biting midges,while Coxiella sp1 was enriched in ticks.Meanwhile,Coxiella spp.,which may be essential for the survival of Haemaphysalis longicornis Neumann,were detected in all tick samples.The identification of dominant species and pathogens of biting midges and ticks in this study serves to broaden our knowledge associated to microbes of arthropod vectors.Conclusion Biting midges and ticks carry large numbers of known and potentially novel bacteria,and carry a wide range of potentially pathogenic bacteria,which may pose a risk of infection to humans and animals.The microbial communities of midges and ticks tend to be dominated by a few highly abundant bacteria.

[目的]探究产胞外多糖(exopolysaccharides,EPS)菌株在促进盐碱土中植物生长,改善土壤性能等方面的影响,为研制适用于盐碱土壤修复的微生物菌剂奠定基础.[方法]从新疆喀什地区盐碱草地根际土壤中筛选产胞外多糖菌株,基于 16S rRNA基因序列比对及系统发育分析对产胞外多糖菌株进行种属鉴定,采用单因素和响应面法优化最高产菌株的培养基组分,通过接种试验评估其对盐碱土栽培植物的促生效果及土壤团聚体的影响.[结果]共筛选出 19 株具有产胞外多糖能力的菌株,隶属于7 个菌属,以假单胞菌属(Pseudomonas)占绝对优势.菌株产糖量介于 236-1 544 mg/L,尤以泛菌属Pantoea MQ A0 产糖量最高,且兼具固氮、产吲哚乙酸(IAA)和铁载体、解磷等功能.MQ A0 的最适产糖发酵培养基为甘油 12.5 mL/L,蛋白胨 9.0 g/L,酵母粉 5.5 g/L,CaCO3 5.1 g/L,在此条件下菌株产糖量达 2 436 mg/L,较优化前增加 57.8%.接种MQ A0 发酵液使盐碱土栽培的玉米株高、鲜重、茎粗、须根数和总根长分别提高 41.2%、203.0%、42.7%、30.4%和 99.7%;粗多糖提取液对土壤团聚体的形成也有显著促进作用(P<0.05).[结论]高产胞外多糖菌株MQ A0 兼具多种促生特性,在促进盐碱土中植物生长和土壤改良方面效果显著.

成团泛菌(Pantoea agglomerans)YS19 和菠萝泛菌(Pantoea ananatis)YJ76 是从水稻(Oryza sativa)"越富"品种中分离得到的2株优势内生固氮细菌.利用YS19和YJ76共培养方式模拟菌体栖息微环境,探索潜在的种间生物效应,发现适量的YJ76能够促进YS19共质体的形成并且YJ76细胞可以参与到YS19的共质体结构中,YS19∶YJ76接种量比例为10∶3时促进效果最为显著.相比之下,当使用吲哚产量显著下降的YJ76突变株Δzwf与YS19共培养时,上述促进效应均显著减弱.与单独培养相比,共培养显著提高了两个菌株对重金属Zn2+、四环素、紫外线以及干燥的耐受能力,YS19分别提高了 63.9％、56.0％、57.4％、72.0％,YJ76分别提高了 147.9％、172.7％、266.3％、348.6％.结果表明水稻的两种主要内生菌YS19和YJ76在共栖息时表现为强烈的协同作用,而YJ76产生的吲哚信号分子在这个过程中起到重要调节作用.

[目的]昆虫肠道共生细菌是栖息在昆虫肠道中的微生物,是肠道微生物群落中最主要的成员.它们对昆虫的生长发育、营养吸收以及免疫系统均具有重要影响.本研究通过对小菜蛾Plutella xylostella肠道共生细菌进行分离培养和功能鉴定,以探究肠道共生细菌对小菜蛾适应性的影响及其对真菌的广谱抑制作用.[方法]利用体外平板培养分离纯化小菜蛾3龄幼虫肠道细菌PxG45菌株,结合形态学、16S rDNA基因测序和生理生化测定进行菌种鉴定.利用生物测定探究PxG45对小菜蛾3龄幼虫存活率及球孢白僵菌Beauveria bassiana侵染小菜蛾3龄幼虫对存活率的影响.通过平板对峙法检测PxG45对球孢白僵菌的抑制作用,进一步检测PxG45对植物病原真菌希金斯炭疽菌Colletotrichum higginsianum、刺盘孢炭疽菌C.camelliae、尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种 Fusarium oxysporum f.sp.cubense race 4、茄链格孢菌 Alternaria solani、稻瘟病菌 Magnaporthe oryzae和丁香假单胞菌杨梅致病变种Pseudomonas syringae pv.myricae的广谱抗性.[结果]小菜蛾3龄幼虫肠道菌PxG45为成团泛菌Pantoea agglomerans.与未饲喂PxG45的对照组相比,饲喂PxG45不仅显著提高了健康小菜蛾3龄幼虫的存活率,还提高了球孢白僵菌侵染后3龄幼虫的存活率.与PxG45拮抗培养的球孢白僵菌和6种植物病原真菌的菌落直径均显著小于单独培养球孢白僵菌和6种植物病原真菌时的直径,与PxG45拮抗培养后真菌的生长均被抑制.[结论]成团泛菌PxG45通过直接的抑菌作用影响小菜蛾对外界的适应性,且这种抑菌作用具备广谱性,可显著抑制植物病原真菌的生长.本研究表明PxG45具备生防菌潜力,并为利用害虫肠道共生菌提供新思路.

为了探明柞蚕(Antheraea pernyi)卵与赤眼蜂(Trichogramma)之间内共生菌的相互联系,通过 16S rRNA高通量测序技术对赤眼蜂和柞蚕卵的内共生菌多样性及相对丰度进行了测定,并通过KEGG和COG分析了内共生菌生物群落代谢途径差异,预测了生物群落蛋白功能.结果表明,柞蚕卵内共生菌物种丰度在各级分类单元上均高于赤眼蜂,二者共有内共生菌为肠杆菌属(Enterobacter)、假单胞菌(Pseudomonas)、泛菌属(Pantoea)、埃希氏杆菌-志贺氏菌属(Escherichia-Shigella)、芽胞杆菌属(Bacillus)和鞘氨醇单胞菌属(Sphin-gomonas),除芽胞杆菌属隶属于厚壁菌门(Firmicute)外,其他均隶属于变形菌门γ-变形菌纲(γ-proteobacte-ria).就相对丰度而言,赤眼蜂体内葡萄球菌属(Staphylococcus)分布量最高,而柞蚕卵内不动杆菌属(Acineto-bacter)分布量最高.KEGG代谢途径差异分析表明,微生物群落功能主要为氨基酸和碳水化合物代谢,但不同代谢功能的强弱有差异.COG生物群落蛋白功能预测表明,赤眼蜂内共生菌群落蛋白质的氨基酸转运代谢功能显著强于柞蚕卵,但是柞蚕卵内共生菌群落蛋白的脂质转运代谢功能和信号传导功能显著强于赤眼蜂.尽管赤眼蜂和柞蚕卵内共生菌的丰度和多样性有差异,但二者存在多种共有共生菌,这些共有共生菌为次生共生菌,参与了赤眼蜂和柞蚕卵的氨基酸代谢功能、碳水化合物代谢功能以及胞膜转运功能等,因此可能在柞蚕卵和赤眼蜂之间进行平行传递.