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YY1转录因子诱导低氧乳腺癌外泌体中的circ_000543促进乳腺癌细胞增殖、侵袭
编辑人员丨1周前
目的:探讨低氧外泌体circ_000543对乳腺癌(breast cancer,BC)细胞增殖与侵袭的作用。方法:借助生物信息学网站预测circ_000543在BC组织中的异常表达及可能对其进行调控的转录因子。使用双荧光素酶报告实验与ChIP实验验证YY1转录因子与circ_000543的调控关系。对BC细胞进行缺氧诱导,分离常氧BC细胞及缺氧BC细胞的外泌体,qRT-PCR检测circ_000543在外泌体中的表达。干预外泌体中circ_000543与YY1的表达,并与常氧条件下的BC细胞进行共培养。CCK8与Transwell分别检测细胞的增殖与侵袭能力。结果:qRT-PCR实验发现,与MCF-10A细胞(1±0.11)和常氧细胞分离的外泌体(1±0.10)比较,circ_000543在BC细胞(1.59±0.13)及低氧细胞分泌的外泌体(1.63±0.12)中均表达上调( t=6.001, P=0.004; t=6.986, P=0.002)。缺氧细胞外泌体能促进常氧BC细胞的增殖与侵袭,敲减circ_000543后部分抵消外泌体的作用。YY1能作为转录因子促进circ_000543在BC细胞中的表达。敲减YY1后circ_000543的表达被抑制,同时也能抑制外泌体对BC细胞增殖与侵袭的作用。 结论:转录因子YY1诱导低氧细胞外泌体中的circ_000543进而促进BC细胞的增殖与侵袭。
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编辑人员丨1周前
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阴阳蛋白1转录调控乙酰辅酶A羧化酶1对卵巢癌细胞迁移和脂质合成的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨卵巢癌组织和细胞中乙酰辅酶A羧化酶1(ACC1)的表达情况,及其对卵巢癌细胞迁移和脂质合成影响的相关机制。方法:收集2019年1月至2021年12月于临沂市肿瘤医院手术切除并经病理诊断的1例正常卵巢组织、1例卵巢癌原发灶组织及1例卵巢癌网膜转移灶组织,采用免疫组织化学法检测各组织中ACC1和阴阳蛋白1(YY1)的水平。通过PROMO数据库预测YY1可能具有与ACC1启动子区域的结合位点。通过组装的病毒载体,使人卵巢癌HEY细胞过表达ACC1或YY1[阴性对照(NC)为未经处理的细胞],或者敲低ACC1或YY1(转入目的基因的干扰序列sh1、sh2、sh3,对照为转入干扰序列的阴性对照序列shNC)。采用双荧光素酶报告基因实验验证YY1与ACC1启动子的结合位点及转录调控活性。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)和蛋白质印迹法分别检测经相应处理的HEY细胞ACC1、YY1 mRNA和蛋白表达水平;采用Transwell实验检测HEY细胞迁移能力;采用油红O染色和尼罗红染色检测HEY细胞中脂滴形成情况。结果:正常卵巢组织、卵巢癌原发灶和网膜转移灶中ACC1的免疫组织化学评分分别为0、2、8分,YY1评分分别为0、4、6分。Transwell实验显示,ACC1过表达组侵袭的HEY细胞数较NC组多[(87.7±7.4)个比(52.2±4.2)个, t=5.19, P=0.003];ACC1敲低的ACC1-sh1组和ACC1-sh2组侵袭的HEY细胞数均少于shNC组[(21.2±1.5)个、(29.7±2.3)个比(56.2±5.3)个, t值分别为6.41、3.77, P值分别为<0.001、0.005]。ACC1过表达组HEY细胞中脂滴数较NC组多[油红O染色:(301±25)个比(215±21)个,尼罗红染色:(287±15)个比(207±10)个;均 P<0.05],ACC1敲低的ACC1-sh1、ACC1-sh2组HEY细胞脂滴数均较ACC1-shNC组少[油红O染色:(113±8)个、(119±12)个比(195±18)个,尼罗红染色:(82±8)个、(117±11)个比(165±17)个;均 P<0.05]。双荧光素酶报告基因实验显示,YY1过表达促进野生型ACC1启动子区域报告基因的荧光素酶活性( P=0.003),而ACC1启动子区域YY1结合位点突变后,报告基因的荧光素酶活性较野生型低( P=0.008)。蛋白质印迹法检测显示,YY1过表达HEY细胞YY1、ACC1蛋白表达水平均高于NC组,二者有协同增高趋势;YY1敲低的YY1-sh1组、YY1-sh2组、YY1-sh3组细胞YY1、ACC1蛋白表达水平均低于对照YY1-shNC组,二者亦有协同降低趋势。 结论:ACC1和YY1在卵巢癌转移灶中高表达且呈现正相关趋势。体外ACC1表达水平对卵巢癌细胞迁移和脂质合成有影响,其可能是通过YY1对ACC1转录调控而实现的。
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编辑人员丨1周前
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YY1蛋白通过转录抑制转化生长因子β1减缓糖尿病肾病进程
编辑人员丨1周前
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编辑人员丨1周前
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放疗联合免疫治疗复发性食管癌的疗效及对T淋巴细胞、肿瘤标志物的影响
编辑人员丨1个月前
目的 探讨放疗联合免疫治疗复发性食管癌的疗效及对T淋巴细胞、肿瘤标志物的影响.方法 选取2020年9月-2023年9月新疆医科大学附属肿瘤医院胸腹放疗科采用三维适形调强放疗(IMRT)联合卡瑞利珠单抗治疗的复发性食管癌患者33例纳入观察组,另选取同期医院行单纯性IMRT的复发性食管癌患者33例纳入对照组.2组均治疗6周后评估患者临床疗效;于治疗前、治疗6周后比较2组T淋巴细胞亚群[CD3细胞(CD3+)、CD4细胞(CD4+)、CD8细胞(CD8+)]、肿瘤增殖相关因子[血管内皮生长因子(VEGF)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)、转录因子阴阳1(YY1)]、肿瘤标志物[糖类抗原125(CA125)、癌胚抗原(CEA)、鳞状细胞癌抗原(SCC)];记录并比较2组治疗期间不良反应发生情况.结果 观察组总有效率高于对照组(96.97%vs.75.76%,x2/P=4.632/0.031);治疗6周后,2组CD3+、CD4+高于治疗前,CD8+低于治疗前,且观察组高于/低于对照组(t/P=4.598/<0.001,3.317/<0.001,4.664/<0.001);治疗 6 周后,2 组血清 VEGF、MMP-9、YY1、CA125、CEA、SCC 低于治疗前,且观察组低于对照组(t/P=7.229/<0.001,6.388/<0.001,6.157/<0.001,5.322/<0.001,5.116/<0.001,2.479/0.016);治疗期间,2组不良反应发生率比较,差异无统计学意义(P>0.05).结论 放疗联合免疫治疗能更有效地降低血清肿瘤增殖相关因子及肿瘤标志物水平,提高临床疗效,改善患者免疫功能,且不会显著增加不良反应发生风险.
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编辑人员丨1个月前
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脓毒症患儿血清sTREM2和YY1水平及与心肌损伤的相关性研究
编辑人员丨1个月前
目的 探讨脓毒症患儿血清可溶性髓样细胞触发受体2(sTREM2)和转录因子阴阳-1(YY1)水平及其与心肌损伤的相关性.方法 选取2020年10月至2023年10月期间于本院就诊的134例脓毒症患儿作为研究对象,根据患儿是否存在心肌损伤将其分为心肌损伤组(n=48)和无心肌损伤组(n=86);另选取同期健康儿童72例作为对照组.采用ELISA法检测各组血清sTREM2水平,采用qRT-PCR法检测各组血清YY1表达水平;Pearson法分析患儿血清sTREM2与YY1水平的相关性及二者血清水平与心肌损伤指标的相关性;多因素Logistic回归分析脓毒症患儿发生心肌损伤的影响因素.结果 脓毒症患儿血清sTREM2和YY1水平均明显升高(P<0.05);无心肌损伤组和心肌损伤组患儿脓毒性休克占比、CRP、PCT、LD、CK-MB、cTnI、Mb水平比较,差异具有统计学意义(P<0.05);与无心肌损伤组相比,心肌损伤组患儿血清sTREM2和YY1水平明显降低(P<0.05),且血清sTREM2和YY1水平呈正相关(r=0.472,P=0.001),两者与心肌损伤指标LD、CK-MB、cTnI、Mb水平均呈负相关(均P<0.05);Logistic回归分析结果显示,脓毒症休克、CRP、PCT水平升高为脓毒症患儿发生心肌损伤的危险因素,sTREM2和YY1水平升高为保护因素(P<0.05).结论 脓毒症患儿血清sTREM2和YY1水平均明显升高,二者血清水平变化水平与脓毒症患儿心肌损伤密切相关,且sTREM2水平升高和YY1高表达为脓毒症患儿发生心肌损伤的保护因素.
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编辑人员丨1个月前
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人SLC15A3基因及蛋白质的生物信息学分析
编辑人员丨2024/4/27
目的:研究SLC15A3调控和功能的完整机制.方法:通过生物信息学软件对人SLC15A3基因启动子元件和蛋白结构、理化和定位特性及其进化关系进行表征.结果:人SLC15A3基因受多种转录因子(YY1、AP-1、c-Fos、c-Jun、Sp1、NF-κB)调控.SLC15A3蛋白是由581个氨基酸残基组成的疏水不稳定蛋白,在哺乳动物中氨基酸序列有高保守性,与CD6、TYROBP、CD5、NOD2等蛋白相互作用.结论:本研究生物信息学分析结果有助于深入研究SLC15A3在炎症反应发生发展中的作用机制.
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编辑人员丨2024/4/27
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外周血单个核细胞YY1、miR-181a-5p表达水平对妊娠期糖尿病不良妊娠结局的预测价值
编辑人员丨2024/2/3
目的 探究外周血单个核细胞YY1转录因子(YY1)、微小RNA(miR)-181a-5p表达水平对妊娠期糖尿病(GDM)不良妊娠结局的预测价值.方法 纳入2020年6月至2022年6月该院收治的GDM患者200例作为GDM组,选取同期产检健康孕妇100例作为对照组.采用荧光定量PCR检测外周血单个核细胞YY1、miR-181a-5p表达水平.绘制受试者工作特征(ROC)曲线,分析YY1、miR-181a-5p表达水平对GDM患者不良妊娠结局的预测价值.结果 与对照组比较,GDM组外周血单个核细胞中YY1、miR-181a-5p表达水平均下降(P<0.05),GDM组产后出血、巨大儿、新生儿低血糖的发生率均上升(P<0.05).多因素Logistic回归分析显示,年龄、血糖控制不良是GDM患者妊娠不良结局的独立危险因素(P<0.05),外周血单个核细胞YY1、miR-181a-5p表达水平均是GDM患者妊娠不良结局的独立保护因素(P<0.05).ROC曲线分析结果显示,外周血单个核细胞YY1、miR-181a-5p表达水平单独及二者联合预测GDM患者不良妊娠结局的曲线下面积(AUC)分别为0.717、0.751、0.832,其中联合预测的AUC明显高于二者单独预测(P<0.05).结论 GDM患者外周血单个核细胞YY1、miR-181a-5p表达水平降低可增加不良妊娠结局的风险,YY1、miR-181a-5p与GDM患者不良妊娠结局的关系密切,二者均可作为GDM患者不良妊娠结局的预测因子.
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编辑人员丨2024/2/3
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基于全基因表达谱的骨关节炎软骨下骨转录因子预测及分析
编辑人员丨2023/8/6
目的:利用生物信息分析方法对骨关节炎软骨下骨全基因表达谱进行转录因子预测及分析.方法:下载基因芯片实验数据(GSE30322),使用软件包limma packagein R(版本:3.3.1)筛选差异表达基因,筛选差异基因的标准以基因表达上调或下调的倍数≥2为标准(P<0.05),进一步使用Cytoscape软件(版本:3.4.0)的iRegulon插件预测分析调控这些差异表达基因的转录因子,并分析预测的转录因子所调控的差异表达基因.结果:发现上调的差异表达基因可能相关15个转录因子及其相对应的靶基因:FOXN4,NANOS1,E2F6,RAD21,MECOM,ETS1,MEF2A,POU2F3, BRCA1,GATA3,ZNF706,ZBTB33,SUZ12,DBP,SETDB1等.发现下调的差异表达基因可能相关12个转录因子及其相对应的靶基因:ARID3A,YY1,RDBP,ATF1,CRX,TAF1,XBP1,SOX3,E2F4,PGR,TIMM8A,HOXA2等.结论:预测分析的转录因子可能在骨关节炎软骨下骨致病机制调控中起了重要作用,其有可能成为新的防治骨关节炎的靶点.
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编辑人员丨2023/8/6
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神经肽Y Y1受体拮抗剂促进大鼠BMSCs成骨分化和股骨缺损修复
编辑人员丨2023/8/6
目的 探索神经肽Y Y1受体拮抗剂(PD160170)对大鼠骨髓间充质干细胞(BMSCs)成骨分化以及骨缺损修复的影响.方法 第三代大鼠BMSCs成骨分化诱导培养,随机分为4组,对照组(等体积PBS),终浓度分别为10-6、10-7、10-8 mol/L Y1受体拮抗剂三浓度梯度组,在干预7、14 d时,分别进行碱性磷酸酶(ALP)和茜素红染色;在干预7、21 d时,采用q-PCR和Westen blot检测Ⅰ型胶原(COLI)、骨钙素(OCN)和Runt相关转录因子2(Runx2)基因和蛋白的表达.采用300±20g雄性SD大鼠构建股骨髁上骨缺损模型,直径为2.5 mm,随机分为3组,每组6只,分别每日局部注射0.2 mL溶液等体积PBS(对照组)、10-6mol/L和10-8 mol/LY1受体拮抗剂溶液,28 d后处死,Micro-CT检测观察骨缺损修复情况.结果 ALP和茜素红染色发现,Y1受体拮抗剂组细胞胞浆内棕色颗粒、细胞外周基质矿化结节均高于对照组,且具有浓度特异性,以10-8 mol/L最为明显;q-PCR及Westemblot检测发现,在成骨分化诱导第7天,10-8 mol/L Y1受体拮抗剂组COLI mRNA和蛋白表达水平均显著高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05);在第21天,10-8 mol/LY1受体拮抗剂组OCN、Runx2 mRNA和蛋白表达明显高于对照组(P<0.05).通过micro-CT分析发现,在局部注射10-6 Y1受体拮抗剂28 d后,骨缺损BWTV、骨密度、骨小梁数量高于对照组,差异均具有统计学意义(P<0.05);而骨小梁厚度(P=0.07)、骨体积(P=0.35)在各组之间差异无统计学意义.结论 神经肽YY1受体拮抗剂可促进BMSCs成骨分化以及骨缺损的修复,提示阻断Y1受体信号传导具有预防或治疗骨折、骨质疏松症等潜力,为临床药物研究提供一定的实验依据.
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编辑人员丨2023/8/6
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基于转录组学分析预测潜在的γ-和β-珠蛋白基因表达调控因子
编辑人员丨2023/8/6
目的 预测潜在的γ-和β-珠蛋白表达调控因子,为珠蛋白基因表达调控研究提供新的思路.方法 从GEO数据库中下载γ-和β-珠蛋白基因差异表达相关的两组RNA-seq数据,利用分化各时期共同存在的不同组织来源细胞间的差异表达基因及其预测出的上游调控因子,通过STRING数据库、Centiscape软件进行潜在调控因子的预测.结果 除预测到BCL11A、NF-E2、YY1和GATA1等已知的γ-和β-珠蛋白基因表达调控因子外,从两组数据共同预测出14个潜在调控因子.结论 分析预测出的包括MAPK1、TNF和IFNG等潜在的调控因子可能调控γ-和β-珠蛋白基因表达,需要近一步的分子生物学实验证实.
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编辑人员丨2023/8/6
