目的:探讨靶向捕获高深度测序（Panel-seq）及转录组测序（RNA-seq）与传统检测方法在儿童初发急性B淋巴细胞白血病（B-ALL）细胞及分子遗传学分型中的差异及意义。方法:回顾性分析2020年9月至2021年12月在广州市妇女儿童医疗中心新诊断为B-ALL的152例患儿临床资料。患儿除接受包括核型分析、荧光原位杂交以及43种融合基因定量筛查的传统细胞及分子遗传学方法检测外，还进行Panel-seq及RNA-seq检测。Panel-seq覆盖血液系统肿瘤常见变异的600多个基因，同时分析融合基因及基因突变；RNA-seq分析融合基因、基因突变及基因表达情况，推测染色体水平的拷贝数变异，并结合基因表达谱聚类和拷贝数变异预测高二倍体亚型。分析比较各检测方法遗传学分型结果。结果:152例患儿中，男性93例，女性59例，中位年龄4.0岁（0.8~13.0岁），中位原始细胞比例0.855（0.215~0.965）。152例患儿中，传统检测方法鉴定出4例（2.6%）BCR-ABL1、2例（1.3%）CRLF2基因相关融合、27例（17.8%）ETV6-RUNX1、1例（0.7%）iAMP21、5例（3.3%）MLL重排、8例（5.3%）TCF3-PBX1以及22例（14.5%）高二倍体核型；Panel-seq鉴定出4例（2.6%）BCR-ABL1、2例（1.3%）CRLF2基因相关融合、27例（17.8%）ETV6-RUNX1、3例（2.0%）MEF2D基因相关融合、1例（0.7%）MEIS1-FOXO1、5例（3.3%）MLL重排、5例（3.3%）PAX5基因相关融合、8例（5.3%）TCF3-PBX1、4例（2.6%）ZNF384基因相关融合和2例（1.3%）IKZF1 N159Y突变。1例MLL重排患儿因样本质量问题未进行RNA-seq检测，其余151例患儿中，共检出1例（0.7%）ACIN1-NUTM1、4例（2.6%）BCR-ABL1、3例（2.0%）CRLF2基因相关融合、8例（5.3%）DUX4基因相关融合、27例（17.9%）ETV6-RUNX1、3例（2.0%）MEF2D基因相关融合、1例（0.7%）MEIS1-FOXO1、4例（2.6%）MLL重排、5例（3.3%）PAX5基因相关融合、1例（0.7%）ZMIZ1-ABL1、8例（5.3%）TCF3-PBX1、4例（2.6%）ZNF384基因相关融合及61例（40.4%）高二倍体亚型和2例（1.3%）IKZF1 N159Y突变；RNA-seq对融合基因及高二倍体核型检出有明显优势。传统方法、Panel-seq和RNA-seq检测的细胞及分子遗传学分型率分别为45.4%（69/152）、40.1%（61/152）和87.4%（132/151），三者结合可对89.5%（136/152）患儿进行分型。结论:联合应用Panel-seq、RNA-seq技术可提高B-ALL患儿遗传学异常的检出率，从而进行更精确的细胞及分子遗传学分型，为指导治疗及判断预后提供依据。

目的:探讨以喂养困难为首发表现的染色体1q21.1微缺失合并ZMIZ1基因变异新生儿的临床表现及遗传学特点。方法:回顾性分析苏州大学附属儿童医院收治的1例染色体1q21.1微缺失合并ZMIZ1基因变异相关喂养困难新生儿的临床资料及基因检测结果，并复习相关文献。结果:患儿，男，27 d，因“吐沫2 d”就诊，临床表现包括喂养困难、小头畸形、特殊面容、肌张力低、生长发育落后、心脏异常。全外显子组测序提示患儿1号染色体q21.1q21.2区域存在约776kb的缺失变异chr1:g.146633270-147408820del，同时ZMIZ1基因存在c.2504-2516del杂合移码变异，前者为新发变异，后者来源于表型正常的母亲。文献复习共检索到10篇1q21.1微缺失综合征文献（1篇中文，9篇英文），共报道55例；同时检索到ZMIZ1基因变异所致神经发育障碍伴畸形面容和远端骨骼异常英文文献4篇，共23例。以智力障碍、精神行为异常、肌张力低、发育迟缓、小头畸形合并特殊面容为主要临床表现。结论:1q21.1微缺失合并ZMIZ1基因变异临床罕见，新生儿期症状不典型，对于不明原因喂养困难、发育迟缓合并颅面异常的患儿，进行针对性基因检测有助于明确诊断。

目的:探讨ZMIZ1-AS1编码区拷贝数变异与中国深圳地区人群2型糖尿病易感性的关系。方法:选取深圳市二级以上综合医院诊断的2型糖尿病患者807例，以同期无糖尿病的社区健康人群711例为对照，采用TaqMan CNV分型技术检测两组外周血ZMIZ1-AS1基因拷贝数，分析ZMIZ1-AS1基因拷贝数基因型频率及其分布。结果:病例组和对照组的ZMIZ1-AS1基因拷贝数基因型频率分布差异无统计学意义（ χ2=0.328， P>0.05）。在调整年龄、性别、吸烟、饮酒、体质量指数等混杂因素后，ZMIZ1-AS1编码区拷贝数缺失、拷贝数增加与2型糖尿病均无关联（ χ2=0.015、0.199，均 P>0.05）。 结论:ZMIZ1-AS1编码区拷贝数缺失、拷贝数增加与2型糖尿病发病无关联。

锌指蛋白结构域MIZ-1型包含蛋白基因是激活的STAT蛋白抑制剂基因家族中的一员,主要表达于原始T淋巴细胞和性腺等,对免疫系统及性腺的发育具有非常重要的作用.随着全基因组关联技术的应用,多项研究发现该基因与多种自身免疫性皮肤病、皮肤肿瘤及某些自身免疫性疾病的发病显著相关.本文针对MIZ-1型包含蛋白基因的结构、功能及与疾病的关系予以综述.

目的 探讨新疆维、汉、哈族妊娠期糖尿病相关遗传基因分析及与临床资料的相关性分析.方法 选择2015年6月-2017年9月新疆地区孕妇526例(汉族207例,维吾尔族169例,哈萨克族150例),根据妊娠期是否伴有妊娠期糖尿病分为病例组(n=214例)和对照组(n=312例).入选既往全基因组关联研究报道且在汉族人群中验证40个2型糖尿病易感基因及11个糖代谢指标相关的遗传位点,应用MassARRAY平台进行基因分型,采用SPSS Pearson相关性分析软件对候选多态性位点与汉族、维族、哈族GDM及临床资料的相关性进行分析.结果 病例组年龄、BMI、空腹血糖、1h血糖、2h血糖、糖化血红蛋白水平、甘油三酯、高密度水平,均高于对照组(P＜0.05);病例组低密度水平,低于对照组(P＜0.05);相关性分析结果表明:汉族人GDM发生率与候选位点基因型和等位基因频率rs12571751关系密切(P＜0.05);维吾尔族GDM发生与rs2796441和rs1359790关系密切(P＜0.05);哈萨克族GDM发生与rs2010963、rs3025039基因无统计学意义(P＞0.05).结论 汉族和维族人群GDM发生的遗传背景存在差异性,ZMIZ1可能是影响汉族人群GDM发生的易感基因,PPARG和CDKN2A/B可能是影响维族人GDM发生的易感基因,其相关性仍有待更大样本研究验证.

目的:探究LNPEP、ZMIZ1基因单核苷酸多态性与湖北人群银屑病易感性的关系.方法:PCR扩增59例实验组及63例对照组的目的基因片段,用SNaPshot法测定位点rs2303138、rs4869317、rs1250560、rs1250544的基因型及等位基因.结果:rs2303138的AA、GG、GA基因型频率在银屑病实验组和对照组分别是18.60％、22.0％、59.30％和20.60％、30.20％、49.20％;rs4869317的AT、TT基因型频率在实验组和对照组分别是3.40％、96.60和1.60％、98.40％;rs1250560的AA、GG、GA基因型频率在实验组和对照组分别是57.60％、5.1％、37.3％和57.1％、11.1％、31.7％;rs1250544的AA、GG、GA基因型频率在实验组和对照组分别是23.7％、66.1％、10.2％和20.6％、73.0％、6.3％,均无统计学差异(P＞0.05).结论:LNPEP、ZMIZ1单核苷酸多态性可能与湖北人群银屑病患者的发病无关.

目的 探讨肾阳虚体质大鼠肝细胞DNA甲基化特征.方法 选取本课题组前期研发的自发性肾阳虚体质模型大鼠子一代、子四代雄性各3只分别组成子一代组和子四代组,3只正常SD大鼠设为空白组.取各组大鼠肝脏组织,进行DNA抽取与质检,构建DNA文库,进行甲基化测序,与参考基因组进行唯一比对,定位富集区域.将子一代组、子四代组富集区域分别与空白组比较,取差异富集区域.子一代组、子四代组差异富集区域取交集,将富集区域关联到基因,并根据组间富集区域富集样本个数差异筛选组间差异的甲基化富集区域.针对差异关联基因集进行GO、KEGG功能分析.结果 子一代组共获得276 091个富集区域,子四代组共获得309 430个富集区域,空白组共获得275413个富集区域.与空白组大鼠相比,子一代组肾阳虚体质大鼠差异富集区域共372个,其中甲基化水平增高89个,甲基化水平降低283个;子四代组肾阳虚体质大鼠差异富集区域共51条,其中甲基化水平增高30个,甲基化水平降低21个.取子一代组与子四代组差异富集区域的交集,初步筛出差异富集区域12个.对差异富集区域进行GO、KEGG功能分析,密切关联到基因11个,其中甲基化水平增高有Gdap1、Cdkal1、Cd3001b,甲基化水平降低有Zmiz1、Fam111a、Sh3bp4、As3mt、Col16a1、LOC103690271、Wdpcp、LOC102553861,基因功能涉及线粒体膜生成、代谢过程、细胞增殖、细胞吞噬、信号转导、生物调节、蛋白定位等.结论 肾阳虚体质大鼠存在肝细胞DNA甲基化的差异表达,差异甲基化位点其关联基因集中于肿瘤发生和线粒体能量代谢、糖脂代谢等生物学功能紊乱.

目的:探究circZMIZ1对前列腺癌(PCa)细胞铁死亡的影响及分子机制.方法:比较人正常前列腺上皮细胞(RWPE-1)和PCa细胞系(22Rv1、VCaP、PC3和DU145)中circZMIZ1、miR-214-3p以及谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)的mRNA和蛋白表达;通过双荧光素酶报告基因、RNA pull-down和RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP)实验验证PC3细胞中circZMIZ1、miR-214-3p和GPX4的调控关系.PC3细胞转染si-NC、si-circZMIZ1、inhibitor-NC、miR-214-3p inhibitor后,检测细胞中circZMIZ1、miR-214-3p和GPX4的表达、细胞增殖、LDH活性、细胞凋亡以及细胞内亚铁离子(Fe2+)含量和丙二醛(MDA)、谷胱甘肽(GSH)水平,细胞内活性氧(ROS)水平.构建PCa裸鼠皮下移植瘤模型,观察肿瘤生长情况,检测肿瘤组织中Ki-67、GPX4、circ?ZMIZ1、miR-214-3p表达情况.结果:与RWPE-1细胞相比,PCa细胞系(22Rv1、VCaP、PC3和DU145)中circZMIZ1、GPX4 mRNA和GPX4蛋白水平升高,miR-214-3p水平降低(P<0.05).circZMIZ1可以靶向结合PCa细胞中的miR-214-3p,GPX4是miR-214-3p的靶标.敲低circZMIZ1可上调miR-214-3p表达,降低GPX4表达,抑制PC3细胞增殖,促进LDH释放,诱导细胞凋亡,且敲低circZMIZ1可增加细胞内Fe2+含量和提高MDA、ROS水平,降低GSH水平(均P<0.05);下调miR-214-3p可减弱敲低circZMIZ1对PC3细胞铁死亡的影响(均P<0.05).裸鼠移植瘤结果显示,敲低circZMIZ1可抑制裸鼠体内肿瘤生长,并上调miR-214-3p、降低肿瘤组织Ki-67和GPX4表达(均P<0.05),该作用被miR-214-3p下调减弱.结论:敲低circZMIZ1可能通过miR-214-3p/GPX4轴诱导PCa细胞铁死亡.