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乳腺癌circ0008234和miR-1205表达与CT征象的相关性分析
编辑人员丨6天前
目的:探讨乳腺癌circ0008234和miR-1205表达与多层螺旋CT显像的肿瘤学特点。方法:选取2018年1月至2018年12月浙江台州市第一人民医院的40例乳腺癌患者作为观察组,将同期收治的40例非乳腺癌患者作为对照组,荧光定量PCR法检测所有患者circ0008234和miR-1205表达水平。通过生物信息学方法预测circ0008234的下游靶miRNA,双荧光素酶报告分析法证实circ0008234和miR-1205的相互作用。采用多层螺旋CT对患者进行检查,观察肿块大小、形态、钙化区域、淋巴结转移及边缘,分析circ0008234和miR-1205表达水平与CT征象之间的相关性。结果:观察组circ0008234表达水平高于对照组(2.23±0.86 vs 1.07±0.37)( P=0.00),但miR-1205表达水平则低于对照组(0.76±0.29 vs 1.04±0.29)( P=0.00)。观察组患者circ0008234和miR-1205表达水平在不同边缘形态及微小钙化点患者体内无显著差异,但肿块形态规则的患者circ0008234表达水平显著高于不规则患者(2.52±0.88 vs 1.91±0.74)( P=0.025),miR-1205表达水平则低于不规则患者(0.66±0.30 vs 0.86±0.25)( P=0.025)。观察组肿块直径≥2 cm患者circ0008234表达水平显著高于肿块直径<2 cm患者(2.59±0.95 vs 1.69±0.17)( P=0.001),但miR-1205表达水平则低于肿块直径<2 cm患者(0.65±0.21 vs 0.92±0.33)( P=0.003)。观察组淋巴结转移患者circ0008234表达水平显著高于无淋巴结转移患者(2.55±1.09 vs 1.94±0.44)( P=0.022),但淋巴结转移患者miR-1205表达水平低于无淋巴结转移患者(0.65±0.26 vs 0.85±0.30)( P=0.027)。荧光素酶检测证实miR-1205是circ0008234的直接靶点。circ0008234可负调控miR-1205的表达。 结论:乳腺癌CT显像与circ0008234和miR-1205表达间存在相关性,这可为乳腺癌恶变程度和预后的判断提供依据。
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编辑人员丨6天前
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外周血环状RNA circ_0141633与circ_0008234对胰腺癌诊断和预后预测的价值
编辑人员丨6天前
目的:明确环状RNA circ_0141633与circ_0008234在胰腺癌外周血中的临床意义以及诊断和预后预测的价值,并分析对胰腺癌细胞生物学功能的影响。方法:收集97例胰腺癌患者与71例体检健康对照者的外周血标本,采用实时荧光定量PCR检测circ_0141633与circ_0008234表达。采用χ 2检验、K-M生存曲线以及Cox比例风险回归模型分析二者表达与胰腺癌临床病理特征以及预后的关系。采用受试者工作特征(ROC)曲线分析二者诊断胰腺癌的曲线下面积(AUC)、灵敏度以及特异度。采用MTT法、细胞划痕试验、Transwell侵袭试验以及蛋白质印迹分析二者对胰腺癌Bxpc-3细胞增殖、迁移、侵袭以及上皮间充质转化(EMT)的影响。 结果:胰腺癌患者外周血中circ_0141633与circ_0008234表达高于健康对照者外周血(均 P<0.05)。高表达circ_0141633、circ_0008234与较高临床分期、淋巴转移和血管浸润相关,也是胰腺癌预后不良的独立危险因素(均 P<0.05)。高表达circ_0141633与circ_0008234组患者总体生存率明显低于低表达circ_0141633与circ_0008234组患者。circ_0141633、circ_0008234、二者联合以及CA19-9诊断胰腺癌的AUC分别为0.70、0.67、0.88及0.82,灵敏度分别为64.32%、60.79%、78.22%及73.97%,特异度分别为68.54%、65.46%、81.65%及97.41%,二者联合诊断胰腺癌的效能优于CA19-9及单独诊断(均 P<0.05)。单独干扰circ_0141633与circ_0008234均可抑制Bxpc-3细胞增殖、迁移、侵袭以及EMT,联合干扰二者后上述抑制效果更加显著(均 P<0.05)。 结论:外周血高表达circ_0141633与circ_0008234可作为胰腺癌潜在的诊断和预后预测生物标志物,并具有促进胰腺癌进展的功能。
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编辑人员丨6天前
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结核性胸膜炎患者胸膜组织中环状RNA表达谱初步分析
编辑人员丨6天前
目的:分析结核性胸膜炎患者胸膜组织中环状RNA(circRNA)的表达谱,并预测其靶基因,初步探讨circRNA与结核性胸膜炎的关系。方法:本研究纳入了结核性胸膜炎患者和对照组各13例,所有患者均通过胸腔镜进行胸膜活检。应用高通量测序技术对结核性胸膜炎组织与正常胸膜组织各3例进行circRNA检测,用edgeR对基因进行了差异表达分析,剩余标本进行实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)验证,用miRanda软件预测差异表达circRNA相关的微小RNA(miRNA)。结果:高通量测序结果显示,结核性胸膜炎组织中存在差异表达的circRNA有134个,其中53个表达上调,81个表达下调。挑选6个有显著差异的circRNA进行qRT-PCR验证,结果显示hsa_circ_0008433在结核性胸膜炎组织中的表达上调( P<0.05),hsa_circ_0008234、hsa_circ_0001368在结核性胸膜炎组织中的表达下调( P<0.05),结果与高通量测序结果一致。其余3个circRNA的表达水平差异无统计学意义。miRanda软件预测hsa-miR-17、hsa-miR-20b-3p等是hsa_circ_0008234的靶基因,其可能在结核性胸膜炎的发生发展中起调控作用。 结论:结核性胸膜炎患者胸膜组织中circRNA表达谱发生了变化,这些差异表达的circRNA可能与结核性胸膜炎的发生发展密切相关。
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编辑人员丨6天前
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基于第二代DNA测序技术的肺腺癌相关环状RNA生物信息学分析
编辑人员丨2023/8/6
目的:应用第二代DNA测序技术及生物信息学法分析肺腺癌组织中环状RNA (circular RNA,circRNA)差异表达的情况及可能的作用,以期为肺腺癌患者的精确诊断和治疗提供有价值的分子标志物.方法:收集3例经病理及免疫组织化学检测确诊为肺腺癌患者的肺腺癌及癌旁肺组织,采用第二代DNA测序法检测腺癌及癌旁肺组织中circRNA的表达情况.利用生物信息学的方法,对差异表达的circRNA进行筛选及分层聚类分析,并通过软件预测结合人工搜索公共数据库的方式,构建相应的circRNA-miRNA-mRNA互作关系网.最后随机选取5种差异表达的circRNA(hsa_circ_0072309、hsa_circ_0008234、hsa_circ_0000199、hsa_ circ_ 0008870和hsa_circ_0000097),采用实时荧光定量PCR法检测它们在30对肺腺癌及癌旁肺组织中的表达水平,以验证测序结果的准确性.结果:3对肺腺癌及癌旁肺组织经第二代DNA测序,共检测到38 018种circRNA;通过火山图和聚类分析共得到482种具有显著差异的circRNA,其中70种表达水平显著上调,412种表达水平显著下调.通过绘制circRNA-miRNA-mRNA互作图后发现,差异最明显的4种circRNA对应的miRNA或靶基因(如miR-211和RAB22A)已被证实在肺癌等多种癌症的发生和发展中发挥重要作用.实时荧光定量PCR检测结果显示,hsa_circ_0072309、hsa_circ_0008234、hsa_circ_0000199、hsa_ circ_0008870和hsa_circ_0000097在30例肺腺癌组织中的表达水平均明显下调(P值均< 0.05),与测序结果一致,说明测序数据是准确可信的.结论:通过二代测序结合生物信息学分析的方法,从肺腺癌组织中筛选出了大量差异表达的circRNA,这为进一步研究circRNA对肺腺癌发生和发展的作用机制奠定了基础.
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编辑人员丨2023/8/6
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环状RNA hsa_circ_0008234对肺腺癌细胞增殖和迁移的作用
编辑人员丨2023/8/5
目的 环状RNA(circRNA)对肺腺癌的作用机制有待进一步研究.文中旨在探讨hsa_circ_0008234对肺腺癌细胞增殖和迁移的影响.方法 选取2018年11月至2019年12月江苏大学附属人民医院胸外科就诊的75例肺腺癌患者的肺腺癌组织及癌旁组织标本.其中5例组织标本用于高通量测序,另外70例组织标本用于进一步明确hsa_circ_0008234在肺腺癌组织中的表达情况.通过高通量测序技术筛选出在肺腺癌组织中表达最具差异性的低表达环状RNA hsa_circ_0008234.利用qRT-PCR检测circ_0008234在肺腺癌组织、血浆及细胞中的表达情况.PC9板设置过表达组(转染过表达circ_0008234的质粒)及对照组(转染阴性对照的质粒),A549板设置小干扰组(转染敲减circ_0008234的小干扰RNA)及阴性对照组(转染阴性对照的小干扰RNA).采用CCK-8及平板克隆形成实验检测circ_0008234对肺腺癌细胞增殖的作用;采用细胞划痕实验和Transwell迁移实验检测circ_0008234对肺腺癌细胞迁移的影响;采用蛋白质印迹法检测circ_0008234对BTG3蛋白的影响.结果 hsa_circ_0008234在肺腺癌组织中的表达量明显低于癌旁组织(P<0.05).hsa_circ_0008234在4株肺腺癌细胞PC9、A549、H1299、H1975的表达水平明显低于正常支气管黏膜上皮细胞BEAS-2B(P<0.01).过表达组circ_0008234的表达水平(119.67±2.03)明显高于对照组(1.00±0.03),A549细胞的小干扰组circ_0008234的表达水平(0.38±0.18)明显低于阴性对照组(1.00±0.02),差异有统计学意义(P<0.05).过表达组的迁移率[(20.90±3.42)%]明显低于对照组[(41.98±2.21)%];小干扰组的迁移率[(41.92±3.27)%]明显高于阴性对照组[(31.98±4.06)%],差异具有统计学意义(P<0.05).Transwell实验表明,肺腺癌细胞PC9中过表达组的迁移细胞数(31.33±2.61)明显低于阴性对照组(90.67±2.06);A549中小干扰组的迁移细胞数(121.50±2.97)明显高于阴性对照组(78.00±3.08),差异具有统计学意义(P<0.01).结论 circ RNA hsa_circ_0008234在肺腺癌组织、血浆及细胞中呈低表达;过表达circ_0008234后可抑制肺腺癌的增殖和迁移.
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编辑人员丨2023/8/5
