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miR-454-3p调控肺癌细胞活性及对CBX7蛋白表达的影响
编辑人员丨4天前
目的:探究miR-454-3p对肺癌细胞活性的调控及对CBX7蛋白表达的影响。方法:体外培养正常肺上皮细胞293T细胞和人肺癌细胞A549细胞,把肺癌A549细胞分为三组,空白组、miR-NC组(转染miR-NC)和miR-454-3p组(转染miR-454-3p mimics),用CCK-8法检测三组细胞增殖情况;用Transwell检测三组细胞的侵袭数目,用流式细胞仪检测细胞的凋亡率;用蛋白质印迹对肺癌细胞中CBX7蛋白的表达进行检测并比较。结果:和正常肺上皮293T细胞相比较,肺癌A549细胞中miR-454-3p mRNA表达明显减少,差异有统计学意义( P<0.05)。空白组和miR-NC组细胞中CBX7蛋白表达比较差异无统计学意义( P>0.05);miR-454-3p组细胞中CBX7蛋白表达明显高于空白组及miR-NC组,差异有统计学意义(均 P<0.05)。CCK-8结果发现,miR-454-3p组的A值明显低于空白组及miR-NC组(均 P<0.05);空白组和miR-NC组肺癌细胞A值比较差异无统计学意义( P>0.05)。Transwell小室实验结果表明,和空白组及miR-NC组相比较,miR-454-3p组细胞的侵袭数量明显减少,肺癌细胞的侵袭能力明显减弱(均 P<0.05);空白组和miR-NC组肺癌细胞的侵袭能力比较差异无统计学意义( P>0.05)。流式细胞仪检测结果显示,空白组和miR-NC组细胞的凋亡率比较差异无统计学意义( P>0.05);和空白组及miR-NC组相比,miR-454-3p组肺癌细胞的凋亡率明显增加(均 P<0.05)。 结论:在肺癌细胞中miR-454-3p呈低表达,过表达miR-454-3p能有效地调控肺癌细胞的生物活性,抑制肺癌细胞的增殖和侵袭,导致细胞的凋亡,其作用机制可能与miR-454-3p促进CBX7蛋白表达有关。
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编辑人员丨4天前
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微小RNA-454通过调控过氧化物酶体增殖物激活受体γ/蛋白激酶B轴对食管癌细胞顺铂敏感性的影响
编辑人员丨4天前
目的:探讨微小RNA(miRNA,miR)-454对食管癌细胞顺铂敏感性的影响及机制。方法:将转染anti-miR-454、anti-miR-NC的ECA109细胞(中国科学院上海细胞库)设为anti-miR-454组、anti-miR-NC组。噻唑蓝(MTT)法检测顺铂对ECA109细胞增殖抑制率,并计算半数抑制浓度(IC 50);蛋白质印迹法(Western blot)实验检测磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)、核糖体40S小亚基S6K蛋白激酶(p70S6K)、蛋白激酶B(Akt)、磷酸化Akt(p-Akt)蛋白表达水平。多样本计量资料比较采用单因素方差分析,两两样本比较采用SNK- q检验。 结果:anti-miR-454组IC 50值低于anti-miR-NC组[(0.41±0.05) μg/ml比(0.82±0.08) μg/ml, P<0.01];MTT实验显示,细胞中miR-454下调后,不同顺铂浓度对ECA109细胞增殖抑制率显著升高;Western blot实验显示,细胞中miR-454下调后,PI3K、mTOR、p70S6K蛋白相对表达量,p-Akt/Akt显著降低。 结论:下调miR-454表达可增强食管癌ECA109细胞顺铂敏感性,推测与其靶向上调过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)表达、抑制Akt信号通路有关。
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编辑人员丨4天前
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Identifying miRNA biomarkers of polycystic ovary syndrome through text mining
编辑人员丨4天前
Objective::Polycystic ovary syndrome (PCOS) is an endocrine disorder with diverse clinical manifestations that often occurs in women of childbearing age. However, its molecular pathogenesis remains unclear, and this study aimed to identify miRNA targets in PCOS through text mining and database analysis.Methods::First, three different sets of text mining genes (TMGs) associated with "polycystic ovary syndrome", "obesity/adiposis", and "anovulation" keywords were retrieved from the GenCLiP3 database, and overlapping genes were selected. Second, Gene ontology annotation and biological pathway enrichment analyses of these overlapping TMGs were performed, followed by protein-protein interaction (PPI) network analysis. Third, genes in the gene module clustered in the PPI were selected to predict potential miRNAs for PCOS via miRNA-mRNA analysis.Results::A total of 4291 TMGs related to three different keywords were obtained through text mining; 72 intersect TMGs were retained among the three gene sets, and 62 TMGs participated in the establishment of the PPI network, of which 18 were aggregated in the gene module. Finally, 11 miRNAs that simultaneously bound to two TMGs ( IGF1, ESR1, MAPK1, NAMPT, PIK3CA, and SERPINE1) could be prioritized as targets to study PCOS. Conclusion(s)::The discovery of 11 miRNAs (miR-301a-3p, miR-301b-3p, miR-3666, miR-454-3p, miR-130a-3p, miR-130b-3p, miR-4295, miR-190a-3p, miR-5011-5p, miR-548c-3p, and miR-4799-5p) and 6 TMGs, which are associated with the HIF-1 signaling pathway ( P = 4.799E-08), could be used as potential targets for PCOS.
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编辑人员丨4天前
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白塞氏病患者血浆中微小RNA异常表达的初步研究
编辑人员丨2023/8/6
目的:检测白塞氏病(BD)患者和正常人群血浆中微小核糖核酸(microRNA,miRNA)的差异表达谱,探讨miRNA在BD发病中的作用,寻找与BD相关的血浆生物标记物.方法:收集15例活动期BD患者和15例正常人的抗凝静脉血,离心获得血浆,提取总RNA,经miRNA标记、miRNA阵列杂交、miRNA阵列扫描和分析获得BD患者异常表达的miRNA谱.通过miRTarBase(靶基因数据库)检索差异性表达的miRNA已经过验证的靶基因,并选取与免疫学相关的差异性表达的miRNA进行Real time-PCR验证.结果:活动期BD患者血浆中hsa-miR-34c-5p、hsa-miR-144-3p、hsa-miR-483-3p较正常人表达上调,hsa-miR-301a-3p、hsa-miR-224-5p、hsa-miR-454-3p、hsa-miR-17-5p、hsa-miR-199a-5p较正常人表达下调.结论:miRNA的差异性在BD的发生发展过程发挥重要作用,异常表达的miRNA可能通过Notch1和SMAD4信号通路促进BD发病.
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编辑人员丨2023/8/6
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蚁群优化算法构建乳腺癌中miRNA调控的关键基因互作网络
编辑人员丨2023/8/6
目的 筛选ER阳性乳腺癌中受miRNA调控的关键基因,以此构建乳腺癌中miRNA-mRNA互作网络,进而了解ER阳性乳腺癌的调控机制,为筛选ER阳性乳腺癌诊断预后的生物标志物和治疗靶点打下基础.方法 利用MCF-7细胞系的AGO-IP(HITS-CLIP Protocol for Argonaute)高通测序实验数据,发现miRNA对mRNA的真实调控关系,并以此构建基于RNAs诱导的沉默复合体(RNA-induced silencing complex,RISCs)miRNA-mRNA调控模组.根据调控模组利用蚁群优化算法在基因互作网络中筛选关键基因,构建ER阳性乳腺癌中miRNA调控下的关键基因互作网络,并对关键基因进行功能分析.结果 本研究筛选出106个关键基因,244个调控关键基因的miRNA.根据乳腺癌中miRNA调控的关键基因互作网络识别出了YWHAG、EP300、CHEK1、SMAD2、SMAD1、SYK、FGFR1、PIK3R2、IRS1、TGFBR2、CHUK和CSDE1等12个hub基因;并发现了hsa-miR-940、hsa-miR-545-3p、hsa-miR-3065-5p、hsa-miR-15a-5p、hsa-miR-181b-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-765、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-454-3p、hsa-miR-374a-5p、hsa-miR-34a-5p、hsa-miR-30e-5p、hsa-miR-19a-3p、hsa-miR-15b-5p、hsa-miR-149-5p和hsa-miR-128-3p等16个hub miRNA.这些基因主要对肿瘤细胞的增殖、侵袭、化疗抗性、放疗抗性和耐药性起重要作用.结论 本研究筛选出的关键基因及调控关键基因的miRNA对ER阳性乳腺癌的耐药性、化疗抗性、放疗抗性及肿瘤细胞的增殖、侵袭有重要调控作用,对ER阳性乳腺癌临床治疗及预后起到重要参考作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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喉鳞状细胞癌患者自噬相关微小RNA的鉴定及预后意义
编辑人员丨2023/8/5
目的 鉴定喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)中自噬相关微小RNA(microRNA,miRNA),探讨其在肿瘤发展中的作用.方法 数据库下载自噬相关基因及各个LSCC样本的miRNA表达谱,用limma包筛选差异表达的miRNA,并构建miRNA与自噬相关基因之间的共表达网络,从而筛选出自噬相关miRNA.Cox回归分析用于评估自噬相关miRNA在LSCC中的预后价值,建立基于自噬相关miRNA的风险指数模型以预测LSCC的预后.结果 最终鉴定了6个关键自噬相关miRNA分别为hsa-miR-100-5p、hsa-miR-143-3p、hsa-miR-3607-5p、hsa-miR-454-3p、hsa-miR-455-5p、hsa-miR-99a-5p,均与LSCC的预后显着相关.富集分析表明所有的关键自噬相关miRNA在mTOR信号传导途径中均显著富集,利用多元Cox回归计算每个样品的风险指数,风险指数较低的患者具有更好的生存结果.结论 关键自噬相关miRNA可以做为LSCC潜在的治疗靶标,基于自噬相关miRNA新构建的风险指数模型可以预测LSCC的预后.
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编辑人员丨2023/8/5
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miR-454-3 p在恶性肿瘤中的研究进展
编辑人员丨2023/8/5
近年来,越来越多的国内外研究显示微小RNA(microRNA,miRNA)与恶性肿瘤的发生、发展过程紧密相连.因此,miRNA成为目前肿瘤研究的新热点.miR-454-3p不仅在许多恶性肿瘤中异常表达,同时也发挥着重要作用.本文就miR-454-3p在各种恶性肿瘤中的表达、作用以及调控机制作一综述.
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编辑人员丨2023/8/5
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LncRNA RP11-686D22.10与乳腺癌患者生存期相关并影响乳腺癌细胞系的增殖和侵袭
编辑人员丨2023/8/5
目的 分析长链非编码RNA(lncRNA)RP11-686D22.10 表达水平与乳腺癌患者生存期的关系,探讨过表达RP11-686D22.10 对乳腺癌细胞系增殖和侵袭的影响及其分子机制.方法 GEPIA数据库分析RP11-686D22.10 表达水平与乳腺癌患者生存期的关系.RT-qPCR检测乳腺上皮细胞系 MCF-10A和乳腺癌细胞系 MCF7、SKBR3、HCC1937、BT549 和MB-MDA-468 中RP11-686D22.10 的表达量.选择RP11-686D22.10 表达水平最低的SKBR3 细胞,分别转染对照质粒(NC组)和RP11-686D22.10 过表达质粒(RP11-686D22.10 组).CCK-8 法和Transwell小室法分别检测乳腺癌细胞增殖及侵袭.Linc2Go数据库预测RP11-686D22.10 的靶向微小RNA(miRNA),双荧光素酶报告基因实验检测 RP11-686D22.10 和 miR-454-3p 的靶向关系.RT-qPCR 检测 miR-454-3p 表达量.Western blot 检测 Wnt/β-catenin 信号通路蛋白质表达量.结果 与 RP11-686D22.10 低表达乳腺癌患者相比,RP11-686D22.10高表达患者的总生存期较长(P<0.01),并且无病生存期较长(P<0.01).MCF7、SKBR3、HCC1937、BT549 和MB-MDA-468乳腺癌细胞中RP11-686D22.10 表达量低于MCF-10A细胞(P<0.05),SKBR3 细胞中RP11-686D22.10 表达最低(P<0.01).与NC组比较,RP11-686D22.10 组SKBR3 细胞增殖能力降低(P<0.05),并且细胞侵袭能力降低(P<0.01).RP11-686D22.10 能够靶向结合 miR-454-3p(P<0.01).与 NC 组比较,RP11-686D22.10组miR-454-3p表达量降低(P<0.01),Wnt/β-catenin信号通路蛋白CCND1、β-catenin、JUN、AXIN2和MMP2 表达量降低.结论 RP11-686D22.10 表达水平与乳腺癌患者生存期密切相关,过表达RP11-686D22.10通过靶向调控miR-454-3p抑制乳腺癌细胞系的增殖及侵袭.
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编辑人员丨2023/8/5