目的:探讨同型异型盒C11(HOXC11)基因在结肠癌增殖中的作用及其机制。方法:在肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库检索结肠癌相关基因进行分析。定量聚合酶链反应(qPCR)法检测河北医科大学第四医院胃肠外科2019年1月至2019年12月行结肠癌根治术的70例临床结肠癌组织、癌旁正常黏膜组织中HOXC11表达；检测结肠癌细胞株人类肿瘤细胞系116(HCT116)、人类大肠癌H-29细细胞(HT-29)、人结肠癌SW480细胞(SW480)及肠上皮细胞株新型人肠胚胎细胞模型(HIEC)(均购自中国科学院上海细胞资源中心)中HOXC11表达，对数据库结果进行验证。用HOXC11-小干扰RNA(siRNA)转染SW480细胞，检测转染对SW480细胞活性及增殖的影响；同时检测抑制HOXC11后SW480细胞增殖相关基因表达。使用STRING数据库对结肠癌中HOXC11的功能进行蛋白相互作用(PPI)网络分析及富集分析。两组间比较采用独立样本 t检验，多组间比较采用单因素方差分析。 结果:TCGA数据库结果显示HOXC11在结肠癌高表达(|logFC| >2， P<0.05)，高表达HOXC11是患者预后差的标志( χ2＝3.92， P<0.05)，验证结果与数据库结果一致。结肠癌细胞株HOXC11水平在SW480为1.073±0.190、HT-29为0.743±0.029，明显高于HIEC(0.247±0.042)，SW480细胞中HOXC11水平最高( F＝40.221， P<0.05)，差异均有统计学意义。PPI网络分析显示HOXC11与其相邻节点呈现出共表达趋势，功能富集分析显示HOXC11的靶基因影响了生长、发育、增殖等很多生物学过程。HOXC11-siRNA转染后SW480细胞活性低于对照物及无关序列组，细胞活性在对照组、无关序列组、HOXC11-siRNA组分别为0.993±0.114、0.980±0.077、0.468±0.077( F＝65.011， P<0.05)、细胞周期处于G 0/G 1期的细胞比例高于对照物及无关序列组，处于S期的比例明显低于对照物及无关序列组，处于G 0/G 1期3组数值分别为53.767±9.150、53.433±6.240、79.300±6.252( F＝12.248， P<0.05)；处于S期3组数值分别为33.200±7.529、36.167±7.731、13.367±4.565( F＝10.071， P<0.05)；G 2/M期3组数值分别为12.967±3.584、10.367±1.620、7.300±2.022( F＝3.700， P<0.05)。HOXC11-siRNA转染后SW480细胞Cyclin D1、CDK4表达分别为1.032±0.142、0.967±0.058、0.439±0.101；1.028±0.139、0.964±0.091、0.467±0.075明显低于对照组及无关序列组( F＝18.798， P<0.05； F＝17.011， P<0.05)，而p21的表达分别为0.457±0.105、0.486±0.132、0.847±0.060( F＝8.932， P<0.05)，明显高于对照组及无关序列组，差异均有统计学意义。 结论:HOXC11在结肠癌中表达增强与预后有关，并可能通过促进细胞增殖导致肿瘤进展。

基因组拷贝数变异(copy number variants，CNVs)是人类遗传病的重要致病原因，也是儿科神经发育障碍和多种先天性畸形、产前胎儿超声异常等疾病的必检项目。尽管CNVs的检测技术日趋成熟，但其临床意义的解读却仍不够规范。2020年，美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics，ACMG)和临床基因组资源中心(Clinical Genome Resource，ClinGen)基于循证原则，采用定量计分，就结构性(constitutional)基因组CNVs的致病性评估和临床报告制定了推荐指南。本文对该指南中涉及拷贝数增加的分析要点进行了详细的解读，并利用6个不同类型的案例来展示如何正确使用打分系统，以鼓励临床诊断实验室根据这一专业标准对检测出的基因组变异开展解读、报告，以期提升遗传诊断报告中拷贝数增加临床评估的正确性和一致性。

目的:探讨1例颅额鼻综合征(CNFS)患者的临床特征及遗传学病因。方法:选取2021年11月13日于贵阳市妇幼保健院就诊的1例CNFS患者为研究对象。收集患者的临床资料，抽取患者及其父母的外周静脉血样，进行家系全外显子组测序(trio-WES)与Sanger测序验证，并对候选变异进行生物信息学分析。结果:患者为15岁女性，以前额膨凸、眼距与鼻背过宽、双鼻尖为主要临床表现。基因检测结果提示其携带 EFNB1基因c.473T>C(p.M158T)杂合错义变异，其父母均未携带该变异。生物信息学分析： EFNB1基因c.473T>C(p.M158T)变异在HGMD及ClinVar数据库中未见收录，在1000 Genomes、ExAC、gnomAD及神州基因组数据云等数据库中均未见人群携带频率收录；经REVEL在线软件预测，该变异对基因或基因产物可造成有害影响；经UGENE软件分析，该变异位点所编码的氨基酸在不同物种间高度保守；经AlphaFold2软件进行3D建模显示，该变异可能影响Ephrin-B1蛋白的结构与功能。根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)指南与临床基因组资源中心(ClinGen)的建议，该变异被评级为致病性变异。 结论:结合患者的临床特征与基因检测结果，确诊其为CNFS， EFNB1基因c.473T>C(p.M158T)杂合错义变异可能为该患者的遗传学病因。上述发现为其家系的遗传咨询和产前诊断提供了依据。

目的:对比2015年美国医学遗传学与基因组学学会（American College of Medical Genetics and Genomics，ACMG）和分子病理学会（Association for Molecular Pathology，AMP）发布的变异解读标准与指南（本文中简称2015 ACMG/AMP指南）与2018年临床基因组资源中心（Clinical Genome Resource，ClinGen）耳聋专病小组针对遗传性听力损失（hearing loss，HL）发布的变异解读指南专家规范（本文中简称2018HL专病指南）在评估听神经病患者 OTOF基因变异致病性中的异同。 方法:以38例 OTOF基因变异听神经病患者作为研究对象（男23例、女15例，年龄范围0.3~25.9岁），经全基因组重测序、全外显子组测序或目标区域靶向（Panel）测序结合一代Sanger测序验证，38例听神经病患者均检出携带两个以上 OTOF变异位点，共计59个候选位点，分别使用2015ACMG/AMP指南以及2018HL专病指南对其致病性进行判断。与2015年指南判断结果相比，2018年指南判断的致病性等级更强定义为升级，更弱定义为降级。采用SPSS 20.0软件进行统计学分析。 结果:2015 ACMG/AMP指南和2018 HL专病指南的变异分类一致率为72.9%（43/59）。致病性升级变异位点占13.6%（8/59），致病性降级变异位点占13.6%（8/59）。两指南致病性判定不一致主要集中在PVS1、PM3、PP2、PP3以及PP5等级证据的应用上。剪接变异、错义变异、框内插入/缺失以及同义变异致病性分布发生改变，其中剪接变异改变差异具有统计学意义（ P=0.013）。 结论:针对听神经病患者 OTOF基因变异进行致病性判断时，2018HL专病指南与2015ACMG/AMP指南存在不一致，2018HL专病指南对证据进行删减及进一步细分，打破常规对于变异类型的固化思维，使得致病性分级更有迹可循，提高可信度。

孕妇 　28岁，G 1P 0，为 F8基因第22内含子倒位携带者，2023年1月于衢州市妇幼保健院产前诊断中心进行遗传咨询。本研究通过了衢州市妇幼保健院医学伦理委员会的审查(KY-2023第11号)，孕妇及其家属签署了临床研究知情同意书后，于孕18周接受羊膜腔穿刺，进行核型分析、全外显子组测序(whole exome sequencing，WES)，同时对孕妇父母也进行WES检测。孕妇既往体健，夫妻双方否认近亲婚配和有毒有害物质接触史。羊水细胞G显带核型为46，XX；WES检测结果为seq[GRCh37]Xq28(154124531_154578447)×3，即胎儿染色体Xq28区存在453.9 kb重复，遗传自母亲(图1,图2)，该重复包含 RAB39B、 CLIC2、 MTCP1、 FUNDC2、 CMC4、 BRCC3、 VBP1等7个基因，与 F8基因(第1～21外显子)部分重叠。该重复明确包含三倍剂量敏感和单倍剂量不足区域——Xq28的int22h1/int22h2区域(包括 RAB39B基因和 F8基因的第1～21外显子)。未发现与该重复区域相关的微重复综合征。依据美国医学遗传学与基因组学学会和临床基因资源库的拷贝数变异(copy number variation，CNV)致病性分类指南 [1]，判定该重复为致病性CNV。夫妻经遗传咨询后于孕24周选择终止妊娠。

精准医学是以个体化医疗为基础，随着基因组测序技术以及生物信息与大数据科学的交叉应用，而发展起来的新型医学模式。精准医疗模式的建立，有利于医疗资源的合理利用，实现患者利益最大化。减重代谢外科是新世纪的新兴学科，其发展任重道远，精准医疗的加入，使得减重代谢学科实现快速、正向发展。在精准医疗的大环境下，减重代谢外科现正处于起步阶段，现阶段精准减重代谢外科的成功实施初步着眼于对于术后体质量的预测以及表观生物遗传学在体质量差异方面的研究。而对于术后恢复、营养支持治疗、对患者的精确随访以及个体化治疗等方面，还有待填补空缺。未来可以通过建立多中心、大样本临床研究库，并完善临床登记数据，完成长期精准随访，实现大规模资源与数据的整合；利用好大数据平台进行深度的生物数据挖掘，以期利用大数据参考达到对肥胖治疗的精准预测与掌控，从而制定出详实的实施方案与细则标准。同时要注意患者隐私的保护，避免个人健康数据泄露。

目的:通过对单中心拷贝数变异(copy number variations，CNVs)的大样本进行回顾性分析，探讨2019年美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics，ACMG)和临床基因组资源(Clinical Genome Resource，ClinGen)共同提出的《拷贝数变异解读和报告的技术标准指南》对CNVs评级以及临床实验室CNVs解读一致性的影响。方法:对本中心2018年8月至2019年12月行单核苷酸多态性微阵列分析、按2011年ACMG指南评估为致病性以及不明临床意义(包括可能致病、临床意义不明和可能良性)的235例CNVs进行重新分析。4名工作人员根据2019年最新指南的解读标准重新进行分类。结果:4名工作人员重新进行CNVs临床意义分类的一致性达91%，α检验系数为0.98。对比2011年和2019年版ACMG指南对于CNVs分类的结果显示，原致病性和临床意义不明确的变异解读基本保持一致；原可能致病和可能良性的变异重分析后90%(45/50)被分类为临床意义不明确，差异较为明显。结论:最新的CNVs解读和报告标准通过半定量评分系统，结合本中心自建数据库，有助于提高实验室对CNVs结果分析的一致性，也让CNV的解读变得更加规范和透明。

随着高通量基因组测序技术的不断成熟,人们深刻认识到遗传因素在妇科肿瘤的发生、发展中具有重要作用,肿瘤遗传咨询也随之广泛应用于肿瘤精准筛查、诊断、治疗及预防等方面.2023年3-9月,20余位来自中国三级妇产科医院/妇幼保健院联盟妇科肿瘤遗传咨询协作组和中国抗癌协会中西整合子宫内膜癌专业委员会的妇科肿瘤临床专家,以及流行病学、循证医学研究的多学科专家共同参与,经过前期临床问题调研并召开方法学专家专题会和妇科肿瘤临床专家编写会反复讨论,起草了《妇科肿瘤遗传咨询专家共识(2023年版)》.本共识围绕制定背景、遗传性妇科肿瘤的特征及常见类型、遗传性妇科肿瘤检测、遗传咨询的适用群体、遗传咨询流程及咨询内容、相关资源推荐等多个方向,参照牛津大学循证医学中心证据分级系统,最终形成16条专家共识及推荐意见.希望通过本共识,提高妇科肿瘤临床工作者对于遗传性肿瘤的识别,有助于为患者提供更精准的诊断和治疗,也为其家系成员提供有效的预防和生殖管理措施.本共识将根据妇科肿瘤诊疗和遗传咨询相关领域的发展定期进行更新.

目的 了解中国南方Prader-Willi综合征(PWS)患儿临床表现及分子特征,为临床筛查和进一步行分子诊断提供依据.方法 分析2012年11月至2014年11月于广州市妇女儿童医疗中心经微阵列比较基因组杂交(Array-CGH)和/或甲基化特异性PCR(MS-PCR)方法确诊为PWS患儿的临床表现和分子分型资料.结果 共诊断PWS患儿27例,其中Array-CGH确诊21例,MS-PCR确诊13例,确诊年龄16 d～16岁;男13例(48.1％),女14例(51.9％).对包括7例经Array-CGH检查在内的13例患儿行MS-PCR均出现170 bp母源片段而缺失100 bp父源片段;21例经Array-CGH确诊患儿中,18例15q11.2-q13.1区域缺失,平均片段缺失长度为(5.48 ±0.51) Mb,单纯缺失型18例患儿根据DECIPHER数据库(基于Ensembl资源的人类基因组拷贝数异常数据库)分为缺失Ⅰ和缺失Ⅱ,其中缺失Ⅰ6例,缺失Ⅱ12例,2种缺失型患儿临床表现差异均无统计学意义(P均＞0.05),2例15q11.2-q13.1区重复,1例复合杂合性79.58 Mb缺失.27例患儿均有新生儿肌张力低下和婴儿期喂养困难(100.0％),22例不哭或哭声微弱(81.5％),25例性腺发育不良(92.6％),22例皮肤色素减退(81.5％).14例1岁以上患儿中,均出现不同程度的精神运动发育迟缓和认知行为异常(100.0％),13例存在不同程度语言发育落后和/或清晰度异常(92.9％),13例(92.9％)在1～6岁[(2.80±1.32)岁]开始食欲旺盛、体质量增长过快,12例(85.7％)存在肥胖症和睡眠障碍.结论 中国南方单纯缺失型PWS患儿中缺失Ⅰ和缺失Ⅱ临床表现差异无统计学意义.中国南方PWS患儿普遍存在典型的临床特征,可作为进一步行PWS分子诊断的初步筛选指标.

美国医学遗传学与基因组学学会及临床基因组资源中心于2019年11月6日发布了“原发性拷贝数变异的报告解读技术标准的联合共识”[1],现将核心内容整理如下.@@一、主要更新要点@@1.拷贝数变异(copy number variations,CNVs)分类借鉴“ACMG/AMP基因序列变异解读指南”更新为五分类法.@@2.来自不同病例的相同变异分类应保持一致.尽管临床表型可作为分类证据之一,但不可据此造成同一变异分类不同.支持或否定变异的致病性证据,同期应一致.因此,无论患者个体因素(如指征、性别、年龄等)如何,变异分类不因此改变.