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糖尿病性心肌病小鼠心肌组织差异表达环状RNA的探讨
编辑人员丨5天前
目的:鉴定糖尿病性心肌病(DCM)小鼠心肌组织差异表达的环状RNA(circRNA),并分析其可能的生物学功能及调控网络。方法:C57BL/6小鼠,雄性,8周龄,体重21~27 g。选取8只小鼠作为正常组,15只进行建模。通过腹腔注射链脲佐菌素建立糖尿病小鼠模型。注射1周后,测定小鼠空腹血糖水平,经检测12只小鼠建模成功。在相同的实验室条件下饲养小鼠12周,通过超声心动图检测小鼠的心脏结构和功能,筛选出左心室射血分数≤60%,且二尖瓣舒张早期最大血流速度与心房收缩期最大血流速度比值(E/A)≤1.6的糖尿病小鼠作为DCM组( n=3)。于DCM组确立当天麻醉后处死正常组和DCM组小鼠,取出心脏,从心肌组织中提取RNA备用。采用高通量测序对DCM组和正常组小鼠心肌组织中的RNA进行测序和鉴定分析,并利用DeSeq2进行差异性分析,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)在组织水平上对分析结果进行验证,并对鉴定的差异circRNA进行GO分析和KEGG通路分析。通过微小RNA(miRNA)靶基因预测软件进行差异表达circRNA-miRNA相互作用预测。 结果:DCM小鼠心肌组织中共鉴定出63种差异表达circRNA。RT-qPCR验证结果示同源性分析筛选出的16种差异表达circRNA中8种组织水平的表达与测序结果一致,其中7种表达上调、1种表达下调。KEGG通路分析结果示,上调的circRNA主要与腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)信号通路以及细胞间的黏着连接通路有关,下调的circRNA主要与心肌病有关。GO功能分析显示,上调表达的circRNA在分子功能方面主要与离子、蛋白质、激酶等因子的结合过程有关,并且在细胞组分方面参与调节细胞内结构尤其是细胞器的构成。分子功能与细胞组分方面的功能分析显示,上调的circRNA与细胞组分起源、募集、组织的生物学过程相关,并由此参与细胞生物学过程的调控;下调的circRNA在分子功能方面与催化活性相关,也与蛋白激酶的结合过程、转移酶及钙调蛋白的活性有关,在细胞组分方面与收缩性纤维的组分、肌原纤维的构成密切相关,而在富集的生物学过程GO分析术语中,包括赖氨酸肽基修饰、肌节的构成、肌原纤维的装配、心肌组织的形态学发育、心肌肥厚等生物学过程。本研究鉴定的差异表达circRNA均存在miRNA的结合位点,且部分miRNA与保护心肌细胞正常生理功能、抗氧化应激损伤、抑制心肌细胞凋亡以及抗心肌肥厚有关。结论:DCM小鼠心肌组织中circRNA存在差异表达,且其与DCM的发生发展密切相关。
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编辑人员丨5天前
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Kazal 5型丝氨酸蛋白酶抑制剂基因突变致新生儿Netherton综合征一例并文献复习
编辑人员丨5天前
目的:探讨Kazal 5型丝氨酸蛋白酶抑制剂(serine protease inhibitor of Kazal type 5, SPINK5)基因突变致新生儿Netherton综合征(Netherton syndrome, NS)的临床特征及分子遗传学特点。 方法:回顾性分析2018年11月上海交通大学附属儿童医院收治的1例新生儿NS病例的临床资料,采用高通量测序及Sanger测序对其 SPINK5基因进行分析。在万方数据库、中国知网和PubMed数据库中检索2月龄以内确诊且有 SPINK5基因分析结果的NS病例。结合本例患儿和文献报道的病例,总结新生儿NS的临床特点、基因突变情况、治疗及随访情况。采用描述性统计分析。 结果:本例患儿生后陆续出现全身皮肤弥漫性红斑及脱屑、毛发稀疏、反复感染等表现,实验室检查发现血IgE升高(111 IU/ml),光学显微镜下毛发呈"竹节发"。 SPINK5基因分析发现患儿存在c.2468dup(p.Lys824Glufs*4)和c.377_378del(p.Tys126*)复合杂合突变,家系分析发现患儿的2个突变分别遗传自其父亲和母亲,确诊为 SPINK5基因突变致NS。经抗感染、注射丙种球蛋白、皮肤护理等综合治疗后皮疹好转,但反复感染,后放弃治疗自动出院,生后2月龄死于感染。共检索到NS病例报道11例,合并本例共12例NS新生儿。总结12例患儿最常见临床表现发现,有早期皮肤弥漫性红斑及脱屑12例、感染8例、毛发干结7例、高钠血症性脱水7例、高IgE 5例、生长迟缓4例、呼吸衰竭3例、特应性体质2例、腹泻2例及吞咽不协调、低体温、喘息、高血压、肝衰竭、代谢性碱中毒各1例。 结论:NS由 SPINK5基因突变导致,新生儿期NS临床表现多不典型。生后早期出现全身皮肤弥漫性红斑及脱屑、反复感染、毛发干结,尤其血IgE偏高的患儿,应考虑NS可能,基因检测有助于早期诊断、指导治疗,并为遗传咨询提供依据。
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编辑人员丨5天前
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内质网氨基肽酶1与子痫前期遗传易感性研究
编辑人员丨5天前
目的:探究内质网氨基肽酶1(endoplasmic reticulum aminopeptidase 1, ERAP1)是否为子痫前期发病的遗传易感基因,以及 ERAP1参与子痫前期发病的分子机制。 方法:回顾性选择2018年9月至2021年4月在青岛大学附属医院、枣庄市妇幼保健院等6家山东省地级市三甲医院的990例子痫前期患者(病例组)和1 240例健康孕妇(对照组)。收集所有孕妇的外周血样本,提取DNA,通过Taqman探针聚合酶链反应技术进行rs30187、rs27044及rs469783位点的基因分型;并在构建 ERAP1野生型质粒的基础上使用点突变法构建2种错义变异质粒:rs30187(c.1583A>G)、rs27044(c.2188C>G),将不同的转染分子转染至Htr8细胞中,检测ERAP1的表达水平,并通过Transwell迁移实验、Transwell侵袭实验、细胞划痕实验和细胞增殖实验检测不同转染对细胞功能的影响,根据转染分子的不同,分为以下6组:敲低对照组、敲低组、过表达对照组、过表达组、变异1组及变异2组。采用两独立样本 t检验、秩和检验和 χ 2检验进行统计学分析。 结果:(1)rs30187位点的遗传学分布(基因型: χ 2=29.25;等位基因: χ 2=4.68)、rs27044位点的基因型分布( χ 2=28.95)、rs469783位点的遗传学分布(基因型: χ 2=7.01,等位基因: χ 2=6.45)在病例组和对照组间差异有统计学意义( P值均<0.05)。病例组中rs30187和rs27044位点均是隐性基因CC的频率更高( χ 2值分别为20.82和19.97, P值均<0.05),而rs469783位点的显性基因中CC基因型的频率更低( χ 2=5.82, P=0.016)。(2)细胞转染后,与敲低对照组相比,敲低组ERAP1的表达水平明显下降(mRNA:0.5±0.1与1.0±0.0, t=7.49;蛋白:0.4±0.1与0.7±0.1, t=2.81; P值均<0.05);划痕48 h后,敲低组细胞迁移率明显下降[(16.5%±1.8%)与(23.8%±2.4%), t=3.33, P=0.031];细胞培养24 h后,敲低组Transwell细胞数量明显下降(423.7±21.3与499.0±24.6, t=3.29, P=0.031)。转染变异1组和变异2组后,与过表达组相比,ERAP1的mRNA和蛋白表达也均明显下降,Transwell小室细胞穿过的数量明显下降,划痕48 h后细胞迁移率均表现出下降趋势[变异1组: P=0.004,变异2组:(21.1±4.6)%与(28.3±1.1)%, t=2.10, P=0.099]。转染过表达组至细胞后,与过表达对照组相比,ERAP1的mRNA和蛋白表达明显上升,细胞的增殖能力增强,细胞划痕48 h后迁移率升高,24 h穿过Transwell小室的细胞数量增多,细胞侵袭能力增强( P值均<0.05)。 结论:ERAP1基因rs30187、rs27044和rs46978与子痫前期易感性相关,rs30187和rs27044位点上子痫前期患者CC基因型携带者更多,而rs469783位点上健康孕妇CC基因型的携带者更多。ERAP1可能通过影响滋养层细胞的迁移侵袭能力参与子痫前期的发病。
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编辑人员丨5天前
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基于GEO数据库的三叉神经痛关键基因筛选及相关免疫细胞浸润分析
编辑人员丨5天前
目的:利用生物信息学分析方法挖掘三叉神经痛(trigeminal neuralgia, TN)的关键基因并探索其重要免疫相关生物标志物。方法:从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)获取与TN相关的基因表达谱数据集GSE186505,数据集中包含20个样本的芯片数据,其中10个是TN样本,10个是健康对照(healthy controls, HC)样本。用生物信息学方法对高通量测序数据进行标准化、归一化和显著性检验筛选与TN相关的差异表达基因(differentially expressed genes, DEG),并进行基因本体(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)富集分析探索DEG的潜在生物学功能,通过蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络进一步筛选TN相关的关键基因,利用CIBERSORT分析不同样品中免疫细胞的浸润程度。结果:共筛选出56个DEG,其中包括23个上调基因和33个下调基因。在PPI分析中鉴定了两个必要的PPI模块,基于STRING数据库筛选出ANXA5、ENO1、CA2、FBP1、CD9、SMPD3、VSTM1、SPNS3、PRSS33、FAS、LENG8这11个关键基因可能参与TN的发生机制。富集分析表明,TN与细胞对肿瘤坏死因子的反应、半胱氨酸型内肽酶活性的调节、膜的外在成分、磷脂结合的外部成分和嘧啶代谢等密切相关( P<0.05)。免疫细胞浸润分析显示,幼稚B细胞、M2巨噬细胞在TN样本中表达明显增加,而记忆B细胞、幼稚CD4 + T细胞在HC样本中表达增加。 结论:TN的发病机制可能是通过调节ANXA5、ENO1、CA2、FBP1、CD9、SMPD3、VSTM1、SPNS3、PRSS33、FAS、LENG8等基因,参与细胞对肿瘤坏死因子的反应、半胱氨酸型内肽酶活性的调节等生物过程,调控嘧啶代谢、糖酵解/糖异生、碳代谢等信号通路来完成的。TN发病与幼稚B细胞、M2巨噬细胞增多密切相关。
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编辑人员丨5天前
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孕妇及其子代ERAP-1基因多态性与子痫前期发生的相关性
编辑人员丨5天前
目的:探讨孕妇及其子代内质网氨基肽酶1(ERAP-1)基因多态性与子痫前期(PE)发生的相关性。方法:采用病例对照研究方法,选择2018年10月至2021年10月于首都医科大学附属北京妇产医院住院分娩、发病孕周<34周的PE孕妇51例作为观察对象(PE组),选择同期正常分娩孕妇48例作为对照组。采集孕妇分娩前的静脉血和胎儿娩出后5 min内的脐血,采用二代测序技术检测孕妇及其子代ERAP-1基因的单核苷酸多态性(SNP)位点。使用单因素分析和多因素logistic回归分析对两组所有检测的SNP位点及基因型进行分析,筛选有意义的SNP位点及基因型。结果:(1)单因素分析筛选出孕妇ERAP-1基因的目的SNP位点共计13个,其中,96096828、96121524、96121715、96122260、96122281位点的基因型分布在PE组与对照组之间的差异均有统计学意义( P均<0.05)。多因素logistic回归分析结果显示,96121524位点基因型为TC的孕妇发生PE的风险是基因型为TT孕妇的2.002倍(95% CI为0.687~5.831, P=0.020)。(2)单因素分析筛选出子代ERAP-1基因的目的SNP位点共4个,4个位点的基因分布在PE组与对照组之间的差异均无统计学意义( P均>0.05)。多因素logistic回归分析结果显示,96121406位点基因型为AA的子代发生PE的风险是基因型为GG子代的0.236倍(95% CI为0.055~1.025, P=0.016)。 结论:ERAP-1基因在孕妇96121524位点基因型为TC、在子代96121406位点基因型为GG可能是PE发生的影响因素。
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编辑人员丨5天前
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基于网络药理学及实验验证探讨地骨皮治疗牙周炎的作用机制
编辑人员丨5天前
目的:基于网络药理学及实验验证探讨地骨皮治疗牙周炎的作用机制。方法:查询中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选地骨皮的药物成分,使用SwissTargetPrediction预测药物成分的作用靶点;运用GeneCards获取牙周炎的疾病靶点,利用Venny 2.1获取交集靶点。使用STRING进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析并使用Cytoscape构建网络图,利用Metascape进行基因本体(GO)功能注释及京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。使用Cytoscape软件构建"药物-靶点-通路"网络图。将大鼠随机分为模型组和治疗组,每组5只。建模后8周,治疗组局部注射1 ml地骨皮药液(将150 mg地骨皮颗粒溶于1 ml水中),模型组组局部注射等量生理盐水,治疗4周。结果:地骨皮的10个有效成分通过多条通路直接作用于55个疾病靶点治疗牙周炎,其中β-谷甾醇、豆甾醇、莨菪碱、金合欢素、阿托品、常春藤素等是核心成分,V-Rel网状内皮增生病毒癌基因同源物A(RELA)、B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、JUN、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶-3(CASP3)、肿瘤蛋白53(TP53)、核受体共激活因子2(NCOA2)是重要的靶点。GO分析显示交集基因最可能相关的生物过程(BP)主要涉及对类固醇激素的反应、细胞对有机环化合物的反应、程序性细胞死亡的正调控、对激素的反应、凋亡信号通路、白细胞凋亡过程、正调控神经元凋亡过程、对氧气水平的反应、凋亡过程的正向调节等,细胞组分(CC)主要涉及细胞器外膜、外膜、转录调控复合体、线粒体外膜、RNA聚合酶Ⅱ转录调控复合物、线粒体膜、膜筏、膜微区、细胞质核周区等,分子功能(MF)主要涉及蛋白质结构域特异性结合、转录因子结合、半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡信号通路、DNA结合转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA结合转录因子结合、半胱氨酸型内肽酶活性参与细胞凋亡过程、一般转录起始因子结合、泛素蛋白连接酶结合、泛素样蛋白连接酶结合等。KEGG分析结果提示地骨皮主要通过p53、细胞凋亡、晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)、磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、白细胞介素-17(IL-17)、缺氧诱导因子-1(HIF-1)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、核因子-κB(NF-κB)等信号通路治疗牙周炎。动物实验显示,地骨皮能够明显改善牙周炎,同时也能改善RELA、Bcl-2、PTGS2、JUN、CASP3、TP53、NCOA2表达水平。结论:地骨皮主要通过调节p53、细胞凋亡、AGE-RAGE、PI3K-Akt、IL-17、HIF-1、TNF、MAPK、NF-κB等信号通路的RELA、Bcl-2、PTGS2、JUN、CASP3、TP53、NCOA2等疾病靶点,调节酶类活性、抗炎等生物过程治疗牙周炎。
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编辑人员丨5天前
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基于TCGA数据库初步筛选预测胃癌生存期的基因
编辑人员丨5天前
目的:利用癌症基因组图谱(TCGA)中的大量胃癌基因组数据,在胃癌组织差异表达的基因中挖掘与预后相关的基因。方法:在TCGA数据库中下载胃腺癌相关基因芯片数据,经R语言数据预处理及用edgeR对基因表达数据进行差异表达分析,利用R语言对差异基因进行基因本体论(GO)富集及KEGG生物通路分析。多因素逐步回归Cox分析预测影响生存期的基因,利用Kaplan-Meier Plotter(http://Kaplan-Meier Plotter.com)网站对上述得到的基因进行在线生存分析。结果:TCGA数据库中共筛选胃癌标本305个,癌旁组织30个。得到3 231个胃癌差异基因,其中上调2 005个基因,下调1 226个基因。GO富集主要集中于抗原连接、丝氨酸水解酶活性、受体配体活性、丝氨酸型肽酶活性、丝氨酸型内肽酶活性、糖胺聚糖结合、细胞因子活性、激素活性、肽酶抑制剂活性、金属钛酶活性等分子功能。KEGG生物通路分析主要涉及化学致癌物、神经活性受体-配体相互作用、细胞因子-细胞因子受体相互作用、细胞色素P450对有害物质的代谢、蛋白质的消化与吸收、金黄色葡萄球菌感染、视黄醇代谢、药物代谢P450、类固醇激素生物代谢、胰液分泌等。Cox分析显示,基因GPX3和SERPINE1对胃癌患者生存期有显著影响。受试者工作特征曲线分析显示,GPX3和SERPINE1表达量的高低对胃癌患者生存期有一定的预测价值,二者临界值分别为0.46、0.68时,敏感性为60.35%,特异性为82.06%,曲线下面积为0.763(95% CI为0.828~0.936)。Kaplan-Meier分析发现,GPX3( P<0.001)和SERPINE1基因( P=0.001)高表达与胃腺癌不良预后有明显关系。 结论:SERPINE1、GPX3基因表达越高,胃癌患者生存期越短,二者可能作为胃癌预测预后的靶点。
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编辑人员丨5天前
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基于单细胞RNA测序探讨小鼠全层皮肤缺损创面中真皮成纤维细胞的生长因子调控网络
编辑人员丨5天前
目的:基于单细胞RNA测序探讨小鼠全层皮肤缺损创面中真皮成纤维细胞(dFb)的异质性与生长因子调控网络。方法:采用实验研究方法。取5只8周龄雄性健康C57BL/6小鼠(鼠龄、性别、品系下同)正常皮肤组织,另取5只背部全层皮肤缺损小鼠伤后7 d创面组织,用胶原酶D和DNA酶Ⅰ消化组织获得细胞悬液,用10x Genomics平台构建测序文库,用Illumina Novaseq6000测序仪进行单细胞RNA测序。采用R4.1.1软件的Seurat 3.0程序分析获得2种组织细胞的基因表达矩阵,采用按细胞群、细胞来源、标记皮肤中主要细胞基因分类的二维tSNE云图进行可视化展示。根据已有文献报道和CellMarker数据库检索情况,分析2种组织细胞的基因表达矩阵中标志基因表达情况,对各细胞群进行编号和定义。将基因表达矩阵和细胞分群信息导入R4.1.1软件的CellChat 1.1.3程序,分析2种组织中细胞间通信以及创面组织血管内皮生长因子(VEGF)、血小板衍生生长因子(PDGF)、表皮生长因子(EGF)、成纤维细胞生长因子(FGF)信号通路中的细胞间通信,2种组织中FGF的各亚型与FGF受体(FGFR)各亚型的两两配对(以下简称FGF配受体对)对FGF信号网络的相对贡献,2种组织中相对贡献排名前2的FGF配受体对信号通路中的细胞间通信。取1只健康小鼠正常皮肤组织和1只全层皮肤缺损小鼠伤后7 d创面组织,行多重免疫荧光染色,检测FGF7蛋白的表达与分布及其与二肽基肽酶4(DPP4)、干细胞抗原1(SCA1)、平滑肌肌动蛋白(SMA)和PDGF受体α(PDGFRα)的蛋白共定位表达。结果:健康小鼠正常皮肤组织和全层皮肤缺损小鼠伤后7 d创面组织中均包含25个细胞群,但2种组织中各细胞群中细胞数不一致。 PDGFRα、血小板内皮细胞黏附分子1、淋巴管内皮透明质酸受体1 、受体型蛋白酪氨酸磷酸酶C、角蛋白10和角蛋白79基因在二维tSNE云图上均有各自明确的分布,分别指示特定的细胞群。将25个细胞群按C0~C24编号,分为9个dFb亚群和16个非dFb群,dFb亚群包括C0间质祖细胞、C5脂肪前体细胞、C13具有收缩能力的肌肉细胞相关成纤维细胞等,非dFb群包括C3中性粒细胞、C8 T细胞、C18红细胞等。与健康小鼠正常皮肤组织比较,全层皮肤缺损小鼠伤后7 d创面组织中细胞间通信更多更密集,其中细胞间通信强度排前3位的细胞群为dFb亚群C0、C1、C2,这3个dFb亚群与创面组织中其他细胞群之间均有通信。在全层皮肤缺损小鼠伤后7 d创面组织中,VEGF信号主要由dFb亚群C0发送、脉管相关细胞群C19和C21接收,PDGF信号主要由周细胞C14发送、多个dFb亚群接收,EGF信号主要由角质形成细胞亚群C9和C11发送、dFb亚群C0接收,FGF信号的主要发送者和接收者均为dFb亚群C6。健康小鼠正常皮肤组织和全层皮肤缺损小鼠伤后7 d创面组织FGF信号网络中的FGF配受体对相对贡献,均是FGF7-FGFR1排在首位,排名第2的分别是FGF7-FGFR2、FGF10-FGFR1;与正常皮肤组织比较,创面组织FGF7-FGFR1信号通路中的细胞间通信更多,而FGF7-FGFR2和FGF10-FGFR1信号通路中的细胞间通信稍有减少或无明显变化;创面组织FGF7-FGFR1信号通路中的细胞间通信强于FGF7-FGFR2、FGF10-FGFR1信号通路;在2种组织中,FGF7信号均主要由dFb亚群C0与C1和C2发送、dFb亚群C6和C7接收。与健康小鼠正常皮肤组织比较,全层皮肤缺损小鼠伤后7 d创面组织中FGF7蛋白表达更多;在正常皮肤组织中,FGF7蛋白主要表达于皮肤间质层且在靠近真皮白色脂肪组织附近也有表达;在2种组织中,FGF7蛋白与DPP4、SCA1蛋白共定位表达于皮肤间质层中,与PDGFRα蛋白共定位表达于dFb中,与SMA蛋白无共定位表达,其中创面组织中的共定位表达多于正常皮肤组织。 结论:小鼠全层皮肤缺损创面愈合过程中的dFb存在高异质性,为多种生长因子潜在的主要分泌或接收细胞群落,与生长因子信号通路之间存在紧密、复杂的联系;FGF7-FGFR1信号通路是创面愈合过程中的主要FGF信号通路,靶向调控多个dFb亚群。
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编辑人员丨5天前
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丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶3基因在胶质瘤中的表达及分子调控机制
编辑人员丨5天前
目的:通过分析网络生物数据探讨丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶3(RIPK3)基因在胶质瘤中的表达及分子调控机制。方法:应用Gepia2数据库对进行TCGA肿瘤数据和GTEx正常数据联合分析,筛选差异表达基因,进一步对RIPK3基因的调控机制进行分析。荧光实时定量反转录-聚合酶链反应(RT-qPCR)法检测20例胶质瘤组织及正常组织中RIPK3 mRNA、FGD5-AS1、微小RNA(miR)-223-3p的表达,对其关系进行分析。结果:Gepia2分析显示,胶质瘤和正常组织中存在7 659个差异表达基因。差异表达结果发现RIPK3 mRNA在胶质瘤组织中表达水平(1.862±1.621)显著高于正常组织(0.693±0.801, Z=9.067, P<0.01)。应用STRING数据库分析RIPK3的PPI网络进行富集分析,结果显示RIPK3互相作用的蛋白参与半胱氨酸型内肽酶(cysteine-type endopeptidase)活性、核因子-κB(NF-κB)信号通路等的调控。长非编码RNA FGD5-AS1在胶质瘤中表达水平(6.401±0.683)高于正常组织(5.406±0.796, t=12.697, P<0.01),并与RIPK3呈正相关( rs=0.402, P<0.01);数据库分析显示RIPK3与FGD5-AS1互为内源性竞争RNA(ceRNA),通过miR-223-3p发挥作用。对FGD5-AS1、miR-223-3p、RIPK3 mRNA在胶质瘤及正常组织中表达检测的RT-qPCR结果显示,FGD5-AS1、RIPK3 mRNA在胶质瘤组织中表达水平(1.942±0.695、1.392±0.360)均高于正常组织(0.533±0.208、0.293±0.144, t=8.686、12.676, P<0.01),而miR-223-3p在胶质瘤组织中表达水平(0.843±0.213)低于正常组织(2.334±0.758, t=-8.469, P<0.01)。在胶质瘤组织中RIPK3 mRNA与FGD5-AS1表达呈正相关( rs=0.840, P<0.01),RIPK3 mRNA、FGD5-AS1与miR-223-3p表达呈负相关( rs=-0.914、-0.872, P<0.01)。 结论:RIPK3在胶质瘤组织中呈高表达,与胶质瘤进展有关。FGD5-AS1可能通过内源性竞争机制通过抑制miR-223-3p而调控RIPK3的表达。
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编辑人员丨5天前
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真武汤合桂枝茯苓丸治疗阳虚水泛型慢性心力衰竭的疗效及网络药理学研究
编辑人员丨2024/8/10
[目的]观察真武汤合桂枝茯苓丸治疗阳虚水泛型慢性心力衰竭(CHF)患者的临床疗效并运用网络药理学探究其作用机制.[方法]将64例阳虚水泛型CHF患者随机分为治疗组和对照组,每组各32例.对照组给予西医规范的基础治疗,治疗组在对照组的基础上加用真武汤合桂枝茯苓丸治疗,疗程为4周.观察2组患者治疗前后中医证候积分、超声心动图检测指标、6 min步行试验(6MWT)距离、明尼苏达心衰生活质量调查问卷(MLHFQ)评分以及血清氨基末端脑钠肽前体(NT-proBNP)、网膜素1(Omentin-1)水平的变化情况,并比较2组患者的中医证候疗效.使用网络药理学方法从相关数据库获取真武汤合桂枝茯苓丸的活性成分、靶点与CHF疾病靶点,得到交集靶点后构建交集靶点蛋白质相互作用网络并进行富集分析,以此预测真武汤合桂枝茯苓丸治疗CHF的作用机制.[结果](1)治疗4周后,治疗组的总有效率为90.62%(29/32),对照组为71.87%(23/32),组间比较(χ2检验),治疗组的中医证候疗效明显优于对照组(P<0.05).(2)治疗后,2组患者的气短/喘息、心悸、畏寒肢冷、面浮肢肿、乏力、唇甲紫暗、面色晦暗、尿少、咳嗽等各项中医证候评分及总积分均较治疗前降低(P<0.01),且治疗组对气短/喘息、畏寒肢冷、面浮肢肿、乏力、唇甲紫暗、面色晦暗、尿少等7项中医证候评分及总积分的降低幅度均明显优于对照组(P<0.05或P<0.01).(3)治疗后,2组患者的左室舒张末期内径(LVEDD)、左室收缩末期内径(LVESD)均较治疗前降低(P<0.01),左室射血分数(LVEF)均较治疗前升高(P<0.01),且治疗组对LVEDD、LVESD的降低幅度及对LVEF的升高幅度均明显优于对照组(P<0.01).(4)治疗后,2组患者的6MWT距离均较治疗前升高(P<0.01),MLHFQ积分均较治疗前降低(P<0.01),且治疗组对6MWT距离的升高幅度及对MLHFQ积分的降低幅度均明显优于对照组(P<0.01).(5)治疗后,2组患者血清NT-proBNP水平均较治疗前降低(P<0.01),血清Omentin-1水平均较治疗前升高(P<0.01),且治疗组对血清NT-proBNP水平的降低幅度及对血清Omentin-1水平的升高幅度均明显优于对照组(P<0.01).(6)检索到真武汤合桂枝茯苓丸中共有106个有效活性成分和818个靶点,以及10 660个CHF的疾病基因,筛选得到了包括NOS3、TP53、MMP9、VEGFA、IL6、TNF、CASP3等21个网络核心靶点;富集到的通路包含影响肾素分泌、环磷酸鸟苷酸-蛋白激酶(cGMP-PKG)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)通路、钙信号通路、Th17细胞分化、晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路、胰岛素抵抗等发挥治疗作用.[结论]真武汤合桂枝茯苓丸对CHF的疗效显著,其可通过多成分、多靶点、多通路的中医药作用机制来发挥抑制机体炎症反应、减轻心脏负荷、改善心室重构等作用,从而能有效改善患者临床症状,提高患者的生活质量及预后.
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编辑人员丨2024/8/10