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肠道微生态与结直肠癌:基础和临床转化研究进展
编辑人员丨6天前
结直肠癌是全球最常见恶性肿瘤之一,在西方国家尤其常见。结直肠癌患者存在肠道微生态紊乱的现象。在病理机制方面,结直肠癌相关富集菌如具核梭形杆菌( Fusobacterium nucleatum)和厌氧消化链球菌( Peptostreptococcus anaerobius)等被证实具有促进结直肠癌发生、发展的作用。现概述结直肠癌患者的肠道微生态特点、肠道细菌改变及其致病机制,其他肠道微生物与结直肠癌的关系,以及肠道微生态在结直肠癌诊断、防治方面的应用。
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编辑人员丨6天前
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复杂性肛瘘患者肠道微生态检测及分析
编辑人员丨6天前
目的:通过16S rDNA基因测序检测复杂性肛瘘患者的肠道菌群分布,探讨其与健康人的菌群分布是否存在差异。方法:采用病例对照研究方法,回顾性收集2020年6月至12月期间杭州市第三人民医院接受手术治疗的30例复杂性肛瘘患者临床资料(复杂性肛瘘组),并按1∶1配比选择本院健康体检人群30例作为对照组(健康对照组)。病例纳入标准:(1)符合腺源性肛瘘诊断的标准,且症状持续3个月以上;(2)术前已行电子结肠镜检查排除肠道炎性反应、炎性肠病等;(3)复杂性肛瘘的定义为符合下面情况之一者:瘘管跨越2/3及以上的肛门括约肌;包含两个以上的外口或瘘管;既往已行肛瘘手术后确认复发者。排除标准:(1)合并有炎性肠病、慢性腹泻或便秘、糖尿病、消化道恶性肿瘤、肝肾功能障碍等;(2)克罗恩病、外伤、特殊感染(如放线菌病和结核病)等引起的肛瘘;(3)近1个月内使用过抗生素、益生元、益生菌等可能影响肠道微生态制剂者;(4)认知缺陷不能配合者。提取研究对象的粪便样本总DNA,扩增细菌16S rDNA基因序列的V4高变区,利用Illumina Miseq平台进行高通量测序,最后进行操作分类单元(OTU)聚类、进行Alpha多样性和LEfSE数据分析,其中Chao指数或ACE指数越大,表明微生物区系的预期物种丰度越高,Simpson指数越小或Shannon指数越大,表明微生物区系多样性越高。两组间性别、年龄、体质指数(BMI)、饮酒吸烟史基线资料比较差异均无统计学意义(均 P>0.05),说明两组具有可比性。本研究观察指标包括两组的测序和质量控制、Alpha多样性分析和物种及其丰度分析以及LEfSE分析。 结果:复杂性肛瘘组与健康对照组的主要优势菌都是厚壁菌门和拟杆菌门,分别占93.4%±32.0%和87.4%±41.2%;在属水平上,复杂性肛瘘组的普雷沃菌属(4.9%±7.4%比0.1%±1.1%, P<0.001)、巨细胞菌属(3.9%±8.2%比0.5%±4.2%, P<0.05)和毛螺菌属(2.6%±5.7%比0.1%±3.4%, P<0.05)的丰度明显更高,而变形菌属(0.02%±4.2%比9.3%±14.4%, P<0.01)、肠球菌属(0.02%±2.3%比9.3%±19.6%, P<0.05)、拟杆菌属(24.7%±9.9%比29.8%±9.1%, P<0.05)和克雷伯菌属(0.4%±4.2%比3.9%±7.3%, P<0.05)相对更低。与健康对照组相比,复杂性肛瘘组肠道菌群多样性更丰富,表现为ACE指数更高[(293.30±44.00)比(218.75±33.83), t=102.069, P<0.001],Chao指数也更高[(318.40±41.99)比(250.00±46.38), t=77.818, P=0.028],Shannon指数更高[(3.36±0.29)比(2.43±0.34), t=9.657, P=0.001];而Simpson指数更低[(0.103±0.013)比(0.131±0.013), t=5.551, P=0.046],差异均有统计学意义(均 P<0.05)。韦荣菌科、Selenemondales 及厌氧菌纲(均属于厚壁菌门)的菌株总体上对两组样本肠道菌群差异的影响最大(LDA 值均>4)。 结论:与健康对照组相比,复杂性肛瘘患者肠道菌群多样性更丰富,提示某些肠道菌群及其代谢产物可能在肛瘘发病中发挥了一定的作用。
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编辑人员丨6天前
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短链脂肪酸与儿童胃肠道功能的研究进展
编辑人员丨6天前
短链脂肪酸是厌氧菌在盲肠和结肠发酵未消化的碳水化合物形成的代谢产物,在结肠中被吸收后可以调节肠道能量代谢、维持肠黏膜屏障功能、调控肠道免疫功能、影响肠道分泌和吸收,并通过以上功能调节肠道微生态,从而改变儿童排便频次。随着对肠道微生态的深入研究,发现肠道菌群代谢产物也在人体中发挥了重要的作用。当儿童排便频次改变时,其肠道菌群的组成改变,肠道菌群代谢产生的短链脂肪酸含量也会改变。该文就短链脂肪酸在儿童不同排便频次中的作用及机制进行综述,为儿童不同排便频次提供治疗思路。
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编辑人员丨6天前
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肠道菌群与早产儿晚发型败血症关系的初步研究
编辑人员丨6天前
目的:通过高通量测序技术比较晚发型败血症(LOS)及肺炎的早产儿肠道菌群的特点及差异,探讨肠道菌群与LOS之间的关系。方法:通过病例对照的方法,选择2018年8月至2019年10月在湖南省儿童医院新生儿科住院诊断为LOS的早产儿作为病例组( n=8),同时选取诊断为肺炎的早产儿作为对照组( n=8)。收集16例早产儿入院第1次的粪便样本并提取DNA,利用PCR技术扩增目标区域DNA,使用NovaSeq 6000平台进行高通量测序,分析两组间肠道菌群的组成和多样性。 结果:(1)Alpha多样性分析显示两组间肠道菌群丰度及多样性差异无统计学意义(均 P>0.05)。(2)LOS组和对照组早产儿肠道菌群在门水平上均以厚壁菌门和变形菌门为主,在属水平上以肠球菌属、埃希菌-志贺菌属等兼性厌氧菌为优势菌群。进行Metastas统计分析,两组在门水平上菌群组成差异无统计学意义( P>0.05)。(3)在目、科、属、种水平进行Metastas统计分析,LOS组放线菌目、消化链球菌科、梭菌属相对丰度高于肺炎组,差异有统计学意义(均 P<0.05)。(4)LOS组葡萄球菌相对丰度大于对照组,但Metastas统计分析显示两组葡萄球菌相对丰度差异无统计学意义( P>0.05)。(5)8例LOS中有3例早产儿血培养阳性,分别为无乳链球菌、缓症链球菌、粪肠球菌。粪肠球菌属于肠球菌属,而肠球菌属在LOS组属于优势菌属。 结论:不同部位感染对早产儿肠道微生态存在影响。LOS与肺炎早产儿肠道菌群构成有差异。
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编辑人员丨6天前
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创伤弧菌感染致急性心力衰竭1例
编辑人员丨6天前
创伤弧菌是一种嗜盐嗜温的条件致病性革兰阴性菌,需氧和厌氧环境下均能生长,毒力较强,常寄生在虾、蟹、蚌及牡蛎等海洋生物体内,并以此为媒介经消化道或肢体破损创口接触带菌海水感染人类而致病。因此创伤弧菌感染具备地域性,临床上少见,且病死率高,临床医师对其诊治缺乏经验。本文报道1例急性创伤弧菌感染致心力衰竭病例诊治经验,供临床参考。
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编辑人员丨6天前
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胃镜下取样肿瘤组织内菌群特征分析
编辑人员丨1周前
目的:探究上消化道肿瘤内细菌群落特征。方法:研究人群为上消化道肿瘤患者(食道癌、胃癌)。对入组患者进行胃镜检查( n=17)并在肿瘤部位进行取材,同时取距离肿瘤组织4 cm以上远端的非肿瘤组织作为对照。对样本总DNA进行提取纯化后进行高通量16S DNA基因测序,应用生物信息学分析肿瘤组织内特有的细菌群落特征及与非肿瘤组织相比细菌群落水平上的差异。 结果:16S DNA PCR结果显示肿瘤内的细菌负荷没有发生明显变化。α和β多样性的比较结果显示,两组的细菌群落组成相似度较高,组内各样本较为离散,菌落构成差异性较大,但整体上两组差异无统计学意义。维恩图展示出肿瘤组织1 358个OTU (operational taxonomic unit),非肿瘤组织2 068个OTU,表明肿瘤组织的细菌群落物种丰富度降低。群落组成分析发现普雷沃菌科(属)、乳杆菌科(属)、梭杆菌科(属)在肿瘤组织中富集(丰度平均百分比均超过非肿瘤组织的1倍以上)。进一步对两组样本菌科和菌属丰度前十的细菌进行配对比较显示,假单胞菌在科( P=0.041)和属( P=0.041)水平上均显示在肿瘤组织中明显减少,而普雷沃菌在科( P=0.031)和属( P=0.007)水平上在肿瘤组织中均显著富集。 结论:上消化道肿瘤微环境的细菌群落发生改变,富集在肿瘤部位的物种主要为口腔常见的厌氧菌如普雷沃菌科(属)、乳杆菌科(属)、梭杆菌科(属),其中以普雷沃菌科(属)最为显著。
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编辑人员丨1周前
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肠道菌群检测在结直肠腺瘤和结直肠癌诊断中的价值
编辑人员丨3周前
目的 探讨人类粪便肠道菌群对结直肠腺瘤(CRA)及结直肠癌(CRC)的诊断价值.方法 横断面研究选取2020年10月至2022年10月浙江大学医学院附属邵逸夫医院收治的行结肠镜检查患者160例.其中经外科手术后病理学检查确诊为CRC者55例(CRC组);经结肠镜检查提示结直肠息肉,并经息肉切除后病理学检查确诊CRA者55例(CRA组);经结肠镜检查未见异常的健康者50名(HC组).采用实时荧光定量核酸扩增检测(qPCR)方法对研究对象肠道准备前粪便标本特定菌群进行相对定量检测.比较3组研究对象肠道菌群[双歧杆菌属(Bb)、乳酸杆菌属(Lb)、产肠毒素脆弱拟杆菌(ETBF)、具核梭杆菌(Fn)、厌氧消化链球菌(P anaerobius)]相对定量;分析肠道菌群相对定量对CRC和CRA的诊断效能.结果 3组研究对象肠道ETBF相对定量比较差异无统计学意义(P>0.05),而Bb、Lb、Fn、P anaerobius相对定量比较差异均有统计学意义(均P<0.05),CRC组Bb、Fn、P anaerobius相对定量>CRA组>HC组(均P<0.05),CRA组Lb相对定量>CRC组>HC组(均P<0.05).ROC曲线分析显示,单细菌P anaerobius对CRA和CRC的诊断效能最好;联合细菌Fn+Lb+P anaerobius对CRA和CRC的诊断效能最好;细菌联合实验室检查中Fn+Lb+P anaerobius+大便隐血实验+癌胚抗原检测对CRA和CRC的诊断效能最好.结论 肠道菌群P anaerobius定量检测在CRA和CRC诊断中的有重要价值;Fn+Lb+P anaerobius联合大便隐血实验及癌胚抗原检测可提高CRA和CRC的检出率.
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编辑人员丨3周前
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慢性骨髓炎混合感染1例
编辑人员丨1个月前
脆弱拟杆菌(Bacteroides fragili)是一种两端钝圆而浓染、有荚膜、无芽胞、无动力的专性厌氧革兰阴性杆状细菌,主要存在于结肠中.此外,其在呼吸道、胃肠道及泌尿生殖道黏膜也可定植生长[1].鸟肠球菌(Enterococcus avium)是人体胃肠道和生殖道的常驻菌群,可引起菌血症、心内膜炎、泌尿系统感染、腹腔感染等[2].放线菌属(Actinomyce-tes)是一种条件致病菌,存在于人体的口腔黏膜、消化道、女性的生殖道中[3],可引起肉芽肿性感染.本文报道了 1例左胫骨上段慢性骨髓炎患者,在其关节液中培养出脆弱拟杆菌、欧洲放线菌和鸟肠球菌.报道如下.
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编辑人员丨1个月前
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结直肠癌肝肾阴虚证与气血两虚证患者肠道菌群差异性研究
编辑人员丨1个月前
目的 探讨结直肠癌虚证中肝肾阴虚证、气血两虚证患者肠道菌群结构的差异,为结直肠癌虚证的辨证分型提供借鉴.方法 收集32例原发性结直肠腺癌患者的粪便标本,根据中医辨证中的虚证分型分为肝肾阴虚证组(LKYDS组)和气血两虚证组(QBDS组),其中LKYDS组19例,QBDS组13例.使用16S rDNA扩增测序法鉴定两组患者肠道菌群的多样性和丰度,并分析组间物种差异.结果 两组间肠道菌群Shannon指数、Simpson指数、Chao1指数差异均无统计学意义(均P>0.05).QBDS组患者肠道菌群ACE指数(924.78±350.46 vs 885.82±558.62,P=0.032)显著高于 LKYDS 组.UPGMA 样本聚类树、PCoA 及Anosim(R=-0.1943,P=0.919)分析表明两组间差异均无统计学意义(均P>0.05).两组患者肠道菌群以厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidota)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteriota)和疣微菌门(Verrucomicrobiota)为主.LEfSe分析显示,QBDS组有13个生物标志物菌群,属水平上的标志性菌群为乳杆菌属(Lactobacillus)、放线菌属(Eggerthella)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、无害梭菌属(Clostridium_innocuum_group)、克里斯滕森菌科-7 群(Christensenellaceae_R_7_group)、UCG_005;LKYDS 组有7个生物标志物菌群,属水平上的标志性菌群为巨单胞菌属(Megamonas)、拟普雷沃菌属(Alloprevo-tella)、厌氧消化链球菌属(Peptostreptococcus)、普雷沃菌属-9群(Prevotella_9),差异均有统计学意义(均P<0.05).结论 结直肠癌虚证中肝肾阴虚证、气血两虚证患者的肠道菌群虽存在一定相似性,但其差异菌群可能有助于区分临床中医证型.
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编辑人员丨1个月前
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肠球菌的有益性和致病性
编辑人员丨2024/2/3
肠球菌是革兰阳性兼性厌氧球菌,主要分布在宿主肠道,生殖道或口腔中也有少量存在.临床常见菌属为粪肠球菌和屎肠球菌.肠球菌作为共生菌,在人类和动物的消化系统定植,并参与免疫调节.一直以来,肠球菌主要用于益生菌食品添加剂,或辅助治疗肠道菌群失调.然而,肠球菌可能因其毒力和多重耐药变化导致临床感染,也是一种条件致病菌.肠球菌可从胃肠道转移到其他组织和器官,其毒力和耐药性是影响感染治疗的危险因素.肠球菌基因组可塑性相关研究预测其有变异为致病菌的可能性.文章对肠球菌的有益性和致病性进行综述.
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编辑人员丨2024/2/3
