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原发性胶质母细胞瘤瘤内细菌特征基因及其功能研究
编辑人员丨1天前
目的 分析原发性胶质母细胞瘤(GBM)患者肿瘤组织中细菌相关特征基因,并研究肿瘤内细菌相关特征基因在GBM中的功能及作用机制.方法 采用基于癌症基因组图谱(TCGA)数据分析得到的原发性GBM瘤内细菌相关特征基因的公开数据,共152例.根据GBM患者总生存时间的中位数,将其分为低生存组(78例)和高生存组(74例).使用秩和检验评估组间α多样性的差异;采用非度量多维尺度(NMDS)分析和主坐标分析(PCoA)评估组间β多样性的差异;采用线性判别分析(LDA)比较两组GBM样本中丰富度存在显著差异的细菌种类.分别根据各差异细菌相关特征基因的相对丰富度将152例患者分为高丰富度组和低丰富度组,采用Kaplan-Meier法分析高丰富度组与低丰富度组患者生存率的差异.对与良好预后相关的高丰富度细菌相关特征基因GBM样本中显著上调的基因进行基因本体论(GO)生物过程功能注释和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过TCGA转录组测序数据集分析肿瘤免疫微环境景观,应用曼特尔检验分析免疫细胞浸润含量与预后相关细菌特征基因的相关性.所有数据分析均采用R软件,以P<0.05为差异有统计学意义.结果 152例GBM组织中共鉴定出252种细菌相关特征基因,其中234种特征基因在低生存组与高生存组均存在,8种仅存在于低生存组,10种仅存在于高生存组.NMDS和PCoA结果显示,两组的β多样性的差异有统计学意义(P<0.05).LDA显示,高生存组与低生存组的肿瘤组织中细菌相关特征基因的丰富度存在差异(P<0.05),其中脆弱拟杆菌相关特征基因在高生存组的丰富度较高(P<0.05),并与患者的总生存期呈正相关(x2=4.13,P<0.05).功能富集分析显示,肿瘤内脆弱拟杆菌相关特征基因丰富度较高的患者肿瘤组织中高表达与免疫途径相关的基因(P<0.05).曼特尔检验分析结果显示,原发性GBM肿瘤组织中脆弱拟杆菌相关特征基因的丰富度与M1巨噬细胞浸润呈正相关(P<0.05).结论 脆弱拟杆菌相关特征基因在高生存原发性GBM患者肿瘤组织中的丰富度较高,并影响肿瘤的免疫微环境.
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编辑人员丨1天前
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基于全长16S rRNA测序的高尿酸血症人群肠道菌群特征
编辑人员丨1天前
目的:对高尿酸血症(hyperuricemia,HUA)患者和健康对照人群的肠道菌群特征进行差异性分析,探索肠道菌群与高尿酸之间的相关性。方法:在中国人民解放军战略支援部队特色医学中心2021年健康体检人群中招募63名成年志愿者,其中HUA患者25例,健康对照人群38例,采集他们的粪便样本,通过使用全长16S rRNA测序技术,对所有受试者粪便样本进行分析,研究不同尿酸水平人群的肠道菌群构成特征。结果:HUA组与健康对照组肠道菌群的整体组成存在差异,α多样性指数在HUA组明显降低,β多样性分析可以看出两组间存在明显差异。在菌群组成上,HUA组表现为拟杆菌门增多,厚壁菌门降低。通过LEfSe差异分析,发现HUA组具有独特的菌群结构,以普拉梭菌( Faecalibacterium prausnitzii)为代表的多种短链脂肪酸(SCFAs)产生菌明显降低;唾液链球菌( Streptococcus salivarius)、脆弱拟杆菌( Bacteroides fragilis)、 Fusobacterium hwasookii、 Flavonifractor plautii、黏液分枝杆菌( Mycobacterium mucogenicum B)、 Blautia sp003287895在HUA组明显升高。此外,通过PICRUSt2功能基因预测发现HUA组人群肠道菌群短链脂肪酸合成途径等相关代谢降低,与特有的菌群结构一致。 结论:HUA人群与健康对照人群比较,存在特有的肠道菌群构成和代谢特征。
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编辑人员丨1天前
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肠道菌群与结直肠癌的关系
编辑人员丨1天前
结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是一种发生在人体下消化道结肠或直肠的恶性肿瘤。世界范围内,其在各种癌症中的发病率和死亡率分别居于第三和第二位,严重威胁人类的健康。近来的数据表明,肥胖、饮食和运动会影响CRC的发病率。而这些因素对CRC的影响很大程度上依赖于肠道菌群的代谢活动。肠道致病菌可以通过其表面蛋白定殖于结直肠组织,并通过其毒力蛋白与宿主细胞受体结合使肠道微环境发生变化,进而促进结直肠癌的发展。目前,已经有大量的研究表明核梭杆菌( Fusobacterium nucleatum, F.n)、产肠毒脆弱拟杆菌( Enterotoxigenic Bacteroides fragilis,ETBF)和大肠杆菌( Escherichia coli,E.coli)是结直肠癌相关的重要致病菌。本文就 F.n、 ETBF和 E.coli的毒力蛋白及代谢物,在CRC发展中的作用机制,以及益生菌柔嫩梭菌群对CRC的影响等作一简要综述。
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编辑人员丨1天前
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肠内延伸型胆管支架置入前后实验猪胆道菌群多样性分析
编辑人员丨1天前
目的:通过动物实验对比肠内延伸型胆管支架(enteral extended biliary stent,EEBS)和传统塑料支架置入前后的胆道菌群变化,初步探索EEBS在预防支架堵塞中的可能机制。方法:12只健康巴马小型猪采用简单随机方法分为传统塑料支架组( n=6)和EEBS组( n=6),在支架置入前及置入后4周拔除支架时采集胆汁标本进行16S rRNA基因测序,分析比较不同支架置入前后胆汁菌群结构及多样性。 结果:12只实验猪均未发生急性胆管炎、穿孔、出血、死亡等并发症,支架置入8 d后内镜复查两组支架均已脱落,于此时采集胆汁标本进行菌群分析。两组实验猪的胆道菌群在门水平主要是变形菌门、厚壁菌门和拟杆菌门。Alpha多样性分析显示传统塑料支架组支架置入后Shannon指数( P=0.004)和Simpson指数( P=0.008)较前显著减小;Beta多样性分析也提示传统塑料支架置入前后菌群结构发生显著变化(Anosim: R=0.514 8, P=0.011)。EEBS组支架置入前后Observed species指数( P=0.095)、Chao1指数( P=0.136)、Shannon指数( P=0.353)和Simpson指数( P=0.227)及Beta多样性(Anosim: R=0.059 3, P=0.187)差异均无统计学意义。差异菌LEfSe分析显示,传统塑料支架组支架置入后脆弱拟杆菌、变形菌门-γ变形菌纲-肠杆菌目-肠杆菌科-埃希_志贺菌属-大肠埃希菌丰度显著升高,EEBS组支架置入后脱硫菌门-脱硫菌纲-脱硫菌目-脱硫菌科-嗜胆菌属丰度显著升高。 结论:EEBS短期置入后胆道菌群变化较小,可能通过延长反流路径达到了预防肠胆反流的效果。
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编辑人员丨1天前
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脓毒症早期发生血流感染患者的临床特点及危险因素分析
编辑人员丨1天前
目的:分析宁夏医科大学总医院重症医学科脓毒症患者早期发生血流感染(BSI)的临床特点、发生的危险因素及预后情况。方法:采用前瞻性观察研究,纳入2019年11月1日至2021年8月31日宁夏医科大学总医院重症医学科收治的脓毒症患者,脓毒症诊断24 h内留取血培养。记录患者的一般资料、诊断脓毒症24 h内实验室检查指标、血培养结果,随访患者并观察患者预后相关指标,包括机械通气时间、重症监护病房(ICU)住院时间及28 d存活情况。根据患者血培养结果分为BSI组和非BSI组,对两组患者的一般临床特征进行单因素和多因素Logistic回归分析,筛选脓毒症患者早期发生BSI的危险因素。绘制受试者工作特征曲线(ROC曲线),评价各危险因素对脓毒症患者早期发生BSI的预测价值。结果:共纳入脓毒症患者202例,其中BSI组62例,非BSI组140例。BSI组患者以合并腹腔感染为主(61.3%),非BSI组以合并肺部感染为主(49.3%)。BSI组脓毒症患者共分离出菌株76株,主要病原菌从多到少依次为大肠埃希菌26株(34.2%)、肺炎克雷伯菌11株(14.4%)、肠球菌7株(9.2%)、脆弱拟杆菌6株(7.9%)和金黄色葡萄球菌6株(7.9%)。BSI组与非BSI组之间的机械通气时间、ICU住院时间、28 d病死率比较差异均无统计学意义。单因素分析显示,两组间体温、急性生理学与慢性健康状况评分Ⅱ(APACHEⅡ)、入ICU前使用抗菌药物、腹腔感染、超敏C-反应蛋白(hs-CRP)、血肌酐(SCr)、总胆红素(TBil)、血小板计数(PLT)、血乳酸(Lac)及高降钙素原(PCT)水平比例比较差异均有统计学意义(均 P<0.05)。多因素Logistic分析显示,低PLT 〔优势比( OR)=1.004, P=0.019〕、高Lac ( OR=1.314, P=0.002)、高体温( OR=1.482, P=0.027)、合并腹腔感染( OR=2.354, P=0.040)、入ICU前未使用抗菌药物( OR=2.260, P=0.049)是脓毒症患者早期发生BSI的独立危险因素。ROC曲线分析显示,PLT、Lac、体温、腹腔感染及入ICU前未使用抗菌药物预测脓毒症患者早期发生BSI的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.711、0.686、0.594、0.592和0.590,PLT、Lac和体温的最佳截断值分别为PLT 122.50×10 9/L、Lac 2.95 mmol/L和体温39.45 ℃,5项联合预测时的AUC最大,为0.754,敏感度为75.8%,特异度为68.8%。 结论:脓毒症早期发生BSI患者的病情严重程度比非BSI患者更重;低PLT、高Lac、高体温、合并腹腔感染及入ICU前未使用抗菌药物是脓毒症患者早期发生BSI的独立危险因素,5项联合时具有良好的预测价值。
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编辑人员丨1天前
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新型益生菌与肠道疾病防治
编辑人员丨1天前
益生菌指在足量条件下能对宿主产生确切有益健康功效的微生物。在肠道疾病防治中,传统益生菌如乳杆菌属( Lactobacillus)、双歧杆菌属( Bifidobacteria)、链球菌属( Streptococcus)经过长期的研究已被证实安全、有效,但使用二代测序技术和生物信息学工具鉴定出的新型益生菌的具体作用和机制亟待阐明。本文重点回顾脆弱拟杆菌( Bacteroides fragilis)、嗜黏蛋白阿克曼菌( Akkermansia muciniphila)、普氏栖粪杆菌( Faecalibacterium prausnitzii)3种新型益生菌与肠道疾病防治的研究进展,其通过改善肠道炎症,维护肠黏膜屏障结构和功能完整,抑制肠道肿瘤的进程,辅助诊断,以及预测疗效等多种作用促进肠道疾病的防治。虽然现阶段仍面临安全性、准确性和可利用性的挑战,但相关研究与转化的不断改进将使新型益生菌更好地服务于肠道疾病防治。
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编辑人员丨1天前
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肠道菌群与结直肠癌非手术治疗的相关研究进展
编辑人员丨1天前
近年来,肠道菌群逐渐成为恶性肿瘤治疗相关研究的热点。肠道机会致病菌(如具核梭杆菌、脆弱拟杆菌)、肠道益生菌(如丁酸梭菌、乳酸菌)以及肠道致病菌(如沙门氏菌、志贺菌)可通过影响信号通路、调节自噬、调节免疫反应、产生代谢产物及毒素以及通过粪菌移植等途径影响结直肠癌放化疗和免疫治疗疗效及相关不良反应,同时为结直肠癌靶向治疗提供大量潜在靶点。进一步研究肠道菌群与结直肠癌非手术治疗的关系,可为结直肠癌非手术治疗相关基础与临床研究提供参考。
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编辑人员丨1天前
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吗啉硝唑治疗肛周脓肿根治术后感染的临床疗效
编辑人员丨1天前
目的:总结吗啉硝唑治疗肛周脓肿根治术后感染的的临床疗效。方法:将30例确诊的肛周脓肿患者作为研究对象,随机分为观察组和对照组各15例,观察组予吗啉硝唑静脉滴注,对照组予奥硝唑静脉滴注。结果:观察组术后创面感染率较对照组差异无统计学意义( P>0.05);术后第2天、第7天创面愈合质量与对照组相比差异有统计学意义( P<0.05)。两组在术后第7天血白细胞计数、中性粒细胞计数比治疗前降低明显,且观察组显著低于对照组( P<0.05);观察组治疗后较对照组对大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、脆弱拟杆菌、金黄色葡萄球菌的清除率差异无统计学意义( P>0.05),但对总体细菌清除率较对照组差异有统计学意义( P<0.05);用药期间观察组不良反应发生率低于对照组( P<0.05)。 结论:吗啉硝唑对肛周脓肿患者术后创面感染治疗临床疗效确切。
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编辑人员丨1天前
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脆弱拟杆菌脑膜炎1例
编辑人员丨1天前
脆弱拟杆菌为革兰阴性杆菌,专性厌氧,可作为机会致病菌引起机体感染。脆弱拟杆菌脑膜炎是由脆弱拟杆菌引起的细菌性脑膜炎,较为罕见。本文报道1例由脆弱拟杆菌引起的脑膜炎并发双侧硬膜下脓肿病例,供临床参考。
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编辑人员丨1天前
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脆弱拟杆菌BF839可改善 Fmr1 KO小鼠的学习记忆能力及社交新奇偏好能力
编辑人员丨1天前
目的:观察脆弱拟杆菌BF839干预对脆性X智力低下基因1( Fmr1)敲除( Fmr1 KO)小鼠学习记忆能力及社交新奇偏好能力的影响。 方法:将3周龄30只FVB系 Fmr1 KO小鼠按随机数字表法分为 Fmr1 KO组( n=15)和 Fmr1 KO+BF839组( n=15), Fmr1 KO组小鼠每天自由饮用高压灭菌自来水, Fmr1 KO+BF839组小鼠每天饮用BF839菌液(10 mL/d)。另取11只每天自由饮用高压灭菌自来水的野生型(WT)小鼠作为对照(WT组)。干预4周后,采用Morris水迷宫实验观察各组小鼠间逃避潜伏期、穿越原平台次数的差异,采用三箱社交实验观察各组小鼠间与陌生小鼠接触次数、接触时间的差异。 结果:Fmr1 KO组小鼠第4天的逃避潜伏期[(46.06±10.29) s]明显高于WT组[(33.39±12.02) s], Fmr1 KO+BF839组小鼠第4天的逃避潜伏期[(28.39±9.07) s]明显低于 Fmr1 KO组,差异均有统计学意义( P<0.05); Fmr1 KO+BF839组小鼠第4天的逃避潜伏期略低于WT组,差异无统计学意义( P>0.05)。 Fmr1 KO组小鼠穿越原平台次数[0.00(0.00,1.00)次]略低于WT组[1.00(0.00,1.00)次],差异无统计学意义( P>0.05); Fmr1 KO+BF839组小鼠穿越原平台次数[1.50(1.00,2.00)次]明显高于 Fmr1 KO组及WT组,差异均有统计学意义( P<0.05)。 Fmr1 KO组小鼠与陌生小鼠的接触次数[5.50(0.50,12.75)次]少于WT组[7.00(4.00,17.00)次],但差异无统计学意义( P>0.05); Fmr1 KO+BF839组小鼠与陌生小鼠的接触次数[23.00(16.00,36.00)次]明显多于 Fmr1 KO组及WT组,差异均有统计学意义( P<0.05)。 Fmr1 KO组小鼠与陌生小鼠的接触时间[9.50(0.50,41.95) s]明显少于WT组[142.00(65.00,171.60) s],差异有统计学意义( P<0.05); Fmr1 KO+BF839组小鼠与陌生小鼠的接触时间[69.60(50.40,98.40) s]明显多于Fmr1 KO组,差异有统计学意义( P<0.05); Fmr1 KO+BF839组小鼠与陌生小鼠的接触时间少于WT组,但差异无统计学意义( P>0.05)。 结论:BF839早期干预能明显提高 Fmr1 KO小鼠的学习记忆能力及社交新奇偏好能力,甚至使 Fmr1 KO小鼠恢复至正常水平,提示BF839有可能成为治疗脆性X综合征及孤独症的新工具。
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编辑人员丨1天前
