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产前诊断46,XX,t(2;21)(q23;q22),t(7;11)(q32;q21)复杂染色体重排携带者1例
编辑人员丨4天前
女,37岁,G 4P 1,因不良妊娠史就诊。患者曾于孕7周左右胚胎停育1次,另外生化妊娠1次。6年前足月顺产一唐氏综合征患儿,已夭折,未见染色体核型报告。在征得其知情同意后,对患者及其配偶进行外周血染色体核型分析,结果提示患者核型为46,XX,t(2;21)(q23;q22),t(7;11)(q32;q21)(图1),其配偶为46,XY。患者本次妊娠为自然受孕,妊娠19周时胎儿发育与孕周相符。经遗传咨询后,患者于孕20周接受羊膜腔穿刺,行羊水细胞染色体核型分析以及低深度全基因组拷贝数变异测序,结果提示胎儿核型为46,XN,t(7;11)(q32;q21)(图2),并未检测出致病性拷贝数变异。孕期超声未见异常,经充分遗传咨询后患者选择继续妊娠,孕期平顺,孕40周顺娩一男婴,体质量2 980 g,身长50 cm。随访至今未见异常。本研究通过了天津医科大学总医院医学伦理委员会的审查(IRB2023-WZ-056)。
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编辑人员丨4天前
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成人肝脏间叶性错构瘤的临床病理学分析
编辑人员丨4天前
目的:探讨成人肝脏间叶性错构瘤(MHL)的临床病理及分子遗传学特征。方法:收集2009-2022年解放军总医院第一医学中心病理科明确诊断的成人MHL病例共5例,对其进行组织形态学观察及免疫组织化学染色,并运用二代测序方法进行基因检测。结果:5例中男性4例,女性1例,年龄46~67岁,平均年龄56.2岁。最大直径5.3~13.5 cm,平均直径9.2 cm。肿瘤大体可以为囊性、实性或囊实性混合。病理组织学上5例MHL中有4例发生恶性转化,其中3例恶变为未分化胚胎性肉瘤,1例恶变为恶性孤立性纤维性肿瘤并检测到NAB2-STAT6基因重排。结论:成人MHL是一种罕见的、具有恶性潜能的肿瘤,术前影像学检查诊断难度大。细针活检很少用于诊断,建议手术切除有症状或增大的病变以排除恶性肿瘤的可能性并进一步诊断。基因检测结果显示了MHL复杂的基因学改变,并发现成人MHL可以恶变为恶性孤立性纤维性肿瘤,推测全基因组分析对于确定MHL独特的分子特征以及寻找治疗干预的潜在靶点是必要的。
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编辑人员丨4天前
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《人类细胞基因组学国际命名体系(ISCN2020)》更新内容的介绍与解读
编辑人员丨4天前
人类细胞基因组学国际命名体系(An International System for Human Cytogenomic Nomenclature,ISCN)是用于描述通过染色体核型分析、荧光原位杂交、微阵列、多种特定区域的检测技术以及高通量测序等技术所检测到的基因组重排结果的国际通用准则。2019年,人类细胞基因组学国际命名委员会对ISCN进行了修订,并于2020年10月正式颁布。本文对《人类细胞基因组学国际命名体系(ISCN2020)》的更新内容进行了介绍和总结。
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编辑人员丨4天前
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外周T细胞淋巴瘤非特指型的研究现状
编辑人员丨4天前
外周T细胞淋巴瘤非特指型(PTCL-NOS)是淋巴瘤的少见类型之一,导致患者的病情进展迅速,侵袭性强。目前,PTCL-NOS的发病机制尚未明确,其诊断主要依据淋巴瘤典型组织病理学特征、异常T细胞免疫表型及克隆性T细胞受体( TCR)基因重排等,并应排除其他独立分型的T细胞淋巴瘤亚型。近年来,随着基因组学和表观遗传学等基础研究进展,免疫治疗和分子靶向治疗等新治疗方法已应用于PTCL-NOS患者的临床治疗,使其疗效和预后有所改善,但仍未达预期。笔者从PTCL-NOS概述、基础研究进展、初治及复发/难治性(R/R)PTCL-NOS患者的治疗等方面的研究现状进行阐述,旨在为该病患者的疗效提升和预后改善提供依据。
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编辑人员丨4天前
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NTRK3重排甲状腺乳头状癌的临床病理学特征
编辑人员丨4天前
目的:探讨NTRK3重排甲状腺乳头状癌(PTC)的临床病理学特征、诊断和鉴别诊断。方法:收集2015年1月至2020年1月福建省立医院南院诊断的BRAF V600E阴性的PTC病例174例。对这些病例行免疫组织化学染色和荧光原位杂交(FISH)检测,筛选出NTRK3重排PTC的病例。总结确诊病例的临床资料、病理学特征、免疫组织化学特点及分子病理学改变。同时复习相关文献,并对癌症基因组图谱(TCGA)相关PTC病例进行分析和总结。结果:共确诊3例NTRK3重排PTC,患者均为女性(年龄26、49和34岁)。镜下观察:2例呈多结节状浸润性生长,除1例主要为滤泡结构,其余2例均具有滤泡、乳头及实性混合结构。3例可见典型的PTC细胞核特征,并具有一定的核异质性,胞质透亮或嗜酸性,其中2例可见肾小球样小体形成。肿瘤背景均呈淋巴细胞性甲状腺炎改变,间质见沙砾体形成。并见淋巴结转移、脉管癌栓和被膜外侵犯等侵袭性特征,但均未见明确凝固性肿瘤坏死和核分裂象。免疫组织化学表达甲状腺转录因子1(TTF1)和pan-TRK,不表达S-100蛋白和Mammaglobin,FISH均检测到NTRK3重排。复习并分析相关文献及TCGA数据集病例显示了相似的结果。结论:NTRK3重排PTC是一种罕见的PTC类型,因临床病理学特征不明显很容易漏诊、误诊,需要借助免疫组织化学染色pan-TRK,FISH甚至二代测序等技术明确诊断。对BRAF V600E阴性病例进行pan-TRK免疫组织化学染色具有很好地快速筛查作用。随着pan-TRK抑制剂出现,他们的识别可以帮助改善诊断和预后,并确定适当的治疗方法。
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编辑人员丨4天前
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胎儿染色体复杂重排两例
编辑人员丨4天前
孕妇1 25岁,G1P0,表型及智力均正常。因继发不孕来我院就诊。患者既往孕早期自然流产1次,未进行流产物检查。外周血染色体核型分析女方未见异常,男方为46,XY,t(8;13;10)(q21;q31;p15)(图1A),在遗传咨询后患者要求借助植入前遗传学检测技术进行辅助生殖。成功妊娠后,于孕19周接受羊膜腔穿刺术,胎儿羊水荧光定量PCR(quantitative fluorescence PCR,QF-PCR)、低深度全基因组拷贝数变异测序(copy number variation sequencing,CNV-seq)结果均未见异常,染色体核型分析结果为46,X,t(8;13;10)(q21;q31;p15)(图1B)。
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编辑人员丨4天前
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光学基因组图谱技术在染色体结构变异检出的效能及初步应用评估
编辑人员丨4天前
探讨光学基因组图谱技术(OGM)在检测染色体结构变异方面的效能和应用价值。在复杂性遗传性疾病的高精度染色体结构变异分析的临床研究中,回顾性分析2021年1至12月于北京协和医院妇产科及内分泌科就诊进行染色体核型分析检测的病例。对10例染色体核型技术检出异常的样本,进行OGM技术检测,部分样本行FISH、SNP array芯片或CNV-seq验证。结果显示,利用OGM技术,在9例样本中检出结构变异,其中3例为非平衡性结构变异,6例为平衡性结构变异,包括5例易位和1例臂内倒位,检测结果与核型、芯片等技术一致,并能精细化断裂点位置、确定重复或插入的片段方向。另有1例断裂和重接位点位于着丝粒的易位样本未被检出。综上所述,光学基因组图谱技术作为一种新型分子检测技术,不仅能够发现拷贝数变异等非平衡性结构变异以及易位、倒位等平衡性结构变异,更重要的是能够精细化断裂点位置以及确定重复或插入片段的方向,有助于遗传病的诊断,预防出生缺陷的发生。但目前该技术还无法检测断裂点位于着丝粒等空白区域的平衡性结构变异。
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编辑人员丨4天前
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表观遗传修饰与肿瘤细胞基因组不稳定性的关系
编辑人员丨4天前
表观遗传修饰在细胞的正常生长发育及肿瘤发生的过程中均发挥重要功能,且在肿瘤发生早期就会有显著改变。基因组不稳定性是肿瘤细胞的重要特征之一,对表观遗传修饰与基因组不稳定性关系的研究有利于未来进一步了解肿瘤发生的机制,为临床上癌症的早期诊断及治疗提供合理的依据。本文综述了部分表观遗传修饰的功能和机制,以及这些表观遗传修饰的改变与肿瘤细胞基因组不稳定性的关系。
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编辑人员丨4天前
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同时携带平衡易位和罗氏易位衍生染色体的胎儿一例
编辑人员丨4天前
孕妇 29岁,孕1产0,因丈夫同时携带染色体平衡易位和罗氏易位行胚胎植入前结构重排遗传学检测(preimplantation genetic testing: structural rearrangement,PGT-SR)。植入未见染色体拷贝数异常的胚胎后,于孕20周就诊于我院。本研究通过了我院伦理委员会审查(202201247)。在签署知情同意书后,常规进行羊膜腔穿刺,抽取羊水分别进行细胞原位培养和单核苷酸多态性微阵列分析(single nucleotide polymorphism array,SNP-array)。胎儿SNP-array分析未见明显异常。羊水细胞G显带分析提示胎儿为平衡易位合并罗氏易位衍生染色体携带者。其母亲核型未见异常,父亲为45,XY,t(3;13)(q26.2;q21.3),der(13;14)(q10;q10)(图1)。胎儿的染色体核型如图2所示,结合其父亲的染色体核型,根据2020版人类细胞基因组学国际命名体制(International System for Human Cytogenetic Nomenc, ISCN 2020)确定胎儿的染色体核型为45,XN,der(3)t(3;13)(q26.2;q21.3)dpat,der(13;14)(q10;q10)t(3;13)dpat。
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编辑人员丨4天前
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杭州地区7株重排乙型流感病毒基因组特征分析
编辑人员丨4天前
目的:研究杭州地区2014—2020年乙型流感流行情况并分析7株乙型流感病毒重排株遗传进化特征。方法:收集2014年1月—2020年12月杭州地区流感样病例16 943例,通过实时荧光定量PCR法检测乙型流感病毒,使用特异性引物扩增阳性样本的8个基因片段( PB2、 PB1、 PA、 HA、 NP、 NA、 MP和 NS)进行纳米孔三代测序并分析其遗传进化特征。 结果:2014年1月—2020年12月杭州地区共鉴定了乙型流感病毒阳性样本1 090份,总阳性率6.43%(1 090/16 943)。其中乙型Yamagata支系474份,乙型Victoria支系616份。采用高通量测序获得乙型流感病毒全基因组228个,发现7株乙型流感病毒重排株,其中4株Yamagata系乙型流感病毒的 NA基因与Victoria系乙型流感病毒重排,2株Yamagata系乙型流感病毒(H644_BY和H648_BY)的 NP和 NA基因与Victoria系乙型流感病毒重排,1株Victoria系乙型流感病毒的 PB2、 PB1、 PA和 NS基因与Yamagata系乙型流感病毒重排,同时发现 HA和 NA基因存在多个抗原位点突变。 结论:2014—2020年杭州地区乙型流感病毒出现多株罕见重排株,具有潜在流行风险,需改进传统检测方法并密切关注乙型流感病毒的变异重排情况及其与疫苗株的匹配度。
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编辑人员丨4天前
