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环状RNA的研究进展
编辑人员丨5天前
环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类具有闭合环状结构的非编码RNA分子,大量存在于真核转录组中。环状RNA在不同的物种中具有保守性,同时存在组织及不同发育阶段的表达特异性。由于环状RNA对核酸酶不敏感,故比线性RNA更稳定。环状RNA具有竞争性内源RNA机制(competing endogenous RNAs,ceRNA),调控可变剪切和转录过程,以及与功能蛋白结合等功能。基于环状RNA的特征和生物功能,其在疾病中发挥着重要的调控作用。随着研究发展,环状RNA在组织和疾病的表达机制和功能机制也取得了进步。本综述旨在总结环状RNA的起源、特征、生物功能以及在疾病中的最新作用。
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编辑人员丨5天前
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circFAT1对胶质母细胞瘤细胞生物过程的机制研究
编辑人员丨2023/8/26
目的 探讨circFAT1吸附miR-1182调控转化生长因子(TGF)-β/Smad信号通路对胶质母细胞瘤(GBM)增殖、侵袭、上皮-间充质转化(EMT)的调控作用及机制.方法 收集50例GBM样本和5例非瘤脑组织(NBT)样本,随机抽取3例GBM和3例NBT样本进行组织RNA测序.体外培养GBM细胞系U87、U251、T98G、LN229及星形胶质细胞系NHA,通过qRT-PCR检测组织和细胞系中circFAT1表达.通过RNase R选择性降解线性转录本以明确circFAT1成环特性.将GBM细胞分为sh-对照组和sh-circFAT1组,采用慢病毒进行转染.转染后集落形成实验、Transwell实验、Western blot实验分别检测细胞增殖、侵袭及EMT能力.荧光原位杂交(FISH)检测circFAT1在GBM细胞内定位,通过双萤光素酶报告基因和RNA免疫共沉淀(RIP)实验验证circFAT1和miR-1182的相互作用.Western blot实验验证敲低circFAT1后或抑制miR-1182表达对TGF-β/Smad信号通路的调控作用.结果 circFAT1在GBM组织和细胞中表达增加(P<0.05).RNase R可减少线性FAT1表达(P<0.05),而不影响circFAT1.敲除circFAT1抑制了GBM细胞的增殖、侵袭和EMT(P<0.05).双萤光素酶报告基因和RIP实验证实circFAT1靶向结合miR-1182.敲低circFAT1后TGFB2、p-SMAD2、p-SMAD3蛋白表达下降,抑制miR-1182表达后GFB2、p-SMAD2、p-SMAD3蛋白表达升高.结论 敲除circFAT1可抑制GBM细胞增殖、侵袭和EMT,其作用机制可能与吸附miR-1182调控TGF-β/Smad信号通路有关.
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编辑人员丨2023/8/26
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环状RNA在肿瘤中的研究进展
编辑人员丨2023/8/6
环状RNA(circRNA)是一类不同于线性RNAs,可形成共价闭锁环结构,在哺乳动物体内具有巨大基因调控功能的非编码RNAs,其主要来源于外显子或内含子,经索尾插接或套索内含子方式产生,具有数量巨大,进化保守、在细胞质中稳定性高等特点,具有microR-NA分子海绵、结合RNA相关蛋白形成RNA-蛋白质复合物和基因转录调控等作用.CircRNA可与肿瘤相关的miRNA形成circRNA-miRNA轴参与肿瘤相关信号通路的调控.全文从circRNA的种类、成环机制、功能及其在肿瘤中的作用及最新进展等方面作一综述.
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编辑人员丨2023/8/6
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植物二萜合酶结构和功能研究进展
编辑人员丨2023/8/6
植物二萜合酶是二萜类化合物生物合成的关键酶,可催化香叶基香叶基焦磷酸的长碳链发生环化的级联反应,形成多样的环状骨架结构.研究表明,环化过程导致的成环、构象等差异是植物中二萜化合物多样性的重要来源之一;二萜合酶的结构在其环化功能中发挥着重要作用.本文将主要从晶体结构和功能角度阐述二萜合酶的作用机制,功能特点和结构信息.
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编辑人员丨2023/8/6
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缓激肽B2受体对人绒毛外滋养细胞生长及生物学功能的影响及可能机制
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨缓激肽B2受体(bradykinin B2 receptor,B2R)对人绒毛外滋养细胞增殖和功能的影响及其可能机制. 方法 人绒毛外滋养细胞(HTR-8/SVneo细胞)分为4组:空载体质粒组转染pcDNA-3.1质粒;B2R表达质粒组转染pcDNA3.1-B2R质粒;小干扰RNA(small interference RNA,siRNA)阴性对照组转染siRNA阴性对照序列;B2R特异性siRNA组转染B2R特异性siRNA序列.采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应技术和蛋白质印迹技术检测转染后细胞中B2R以及基质金属蛋白酶-2、基质金属蛋白酶-9、细胞周期蛋白-1和血管内皮生长因子-A mRNA及蛋白的表达变化.采用细胞计数试剂盒-8及流式细胞术检测细胞活性以及细胞周期;细胞迁移实验和侵袭实验检测细胞迁移和侵袭能力;细胞成环实验检测细胞成血管能力.采用t检验进行统计学分析. 结果 (1)与空载体质粒组相比,B2R表达质粒组细胞中B2R mRNA(5.06±0.49与1.00±0.28,t=7.226,P=0.002)及蛋白表达水平升高(1.34±0.07与1.00±0.05,t=3.727,P=0.006);与siRNA阴性对照组相比,B2R特异性siRNA组细胞中B2R mRNA(0.34±0.05与1.00±0.17,t=3.667,P=0.021)及蛋白表达水平降低(0.74±0.03与1.00±0.05,t=4.097,P=0.006).(2)与空载体质粒组相比,B2R表达质粒组细胞增殖活性升高(1.50±0.03与1.34±0.04),使细胞周期由G0/G1期向S期转变;与siRNA阴性对照组相比,B2R特异性siRNA组细胞增殖活性降低(1.06±0.04与1.20±0.02),并使细胞周期停滞于G0/G1期;差异均有统计学意义(P值均< 0.05).(3)与空载体质粒组相比,B2R表达质粒组细胞迁移距离[(80.67±0.33)与(41.33±5.24)μm]、穿膜细胞数[(360.70±12.33)与(268.70±14.45)个]及细胞成环数增加[(28.20±2.47)与(14.00±1.67)个];与siRNA阴性对照组相比,B2R特异性siRNA组细胞迁移距离[(56.00±3.51)与(87.00±1.53)μm]、穿膜细胞数[(143.30±12.91)与(252.30±17.07)个]及细胞成环数减少[(6.25±1.49)与(15.75±2.02)个];差异均有统计学意义(P值均<0.05).(4)基质金属蛋白酶-2和基质金属蛋白酶-9 mRNA,以及细胞周期蛋白-1和血管内皮生长因子-AmRNA及蛋白表达水平在B2R表达质粒组高于空载体质粒组,在B2R特异性siRNA组低于siRNA阴性对照组,差异均有统计学意义(P值均< 0.05). 结论 B2R可能通过促进基质金属蛋白酶-2、基质金属蛋白酶-9、细胞周期蛋白-1和血管内皮生长因子-A的表达,从而增强人绒毛外滋养细胞活性,以及迁移、侵袭及成环能力.
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编辑人员丨2023/8/6
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环状RNA在心血管疾病中的研究进展
编辑人员丨2023/8/6
环状RNA是一种在真核细胞中广泛存在的非编码RNA,具有闭合环状结构,其生成机制、功能和作用机制均受到广泛关注,已成为非编码RNA研究领域的热点之一.许多研究发现环状RNA在包括心血管疾病、神经系统疾病及肿瘤等多种疾病的发生及发展过程中起重要作用,具有可作为疾病生物标志物的潜力.心血管疾病是世界范围内的常见疾病,具有发病率高、早期不易诊断、预后差的特点,其发病机制还不完全清楚,阻碍了心血管疾病治疗手段的进步.本文综述了环状RNA的特性、生物学功能及其在心血管疾病中的研究进展.
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编辑人员丨2023/8/6
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细胞终末分化过程中三维基因组结构与功能调控的分子机制
编辑人员丨2023/8/6
真核细胞中的染色质DNA高度折叠形成复杂的三维结构,其空间组织方式对精准调控基因的表达和细胞发挥正常功能都起着重要的作用.细胞终末分化成熟过程中形态及基因表达谱常发生显著改变,同时伴随着明显的基因组三维结构变化.本文在简单介绍三维基因组多层次组织结构(染色质领域、A/B区室、拓扑相关结构域和成环构象等)基础上,重点综述了细胞终末分化过程中三维基因组结构变化与功能调控方面的研究进展,并探讨了当前三维基因组研究在解析细胞分化成熟过程时存在的问题和前景.
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编辑人员丨2023/8/6
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环状RNA与口腔鳞状细胞癌研究进展
编辑人员丨2023/8/5
环状RNA(circRNA)是一种在真核生物中广泛存在的闭合环状非编码RNA,其生成机制、生物学功能的研究进展显示环状RNA可能在包括肿瘤、神经系统疾病、心血管疾病的发生发展过程中扮演重要角色,具有作为疾病标志物的潜能.口腔鳞状细胞癌(OSCC)是口腔外科最常见的恶性肿瘤之一,具有难治疗、易转移、预后差等的特点,由于其发生机制尚不明确,从基因层面阻断OSCC尚不能实现.而环状RNA在OSCC领域的研究进展将为OSCC的生物治疗带来新的思路.本文归纳综述了环状RNA的成环机制、生物学功能及在肿瘤尤其是OSCC发展中的研究进展.
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编辑人员丨2023/8/5
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环状RNA的功能及其在原发性肝癌中的作用
编辑人员丨2023/8/5
环状RNA是一类通过特殊成环机制形成的具有相对稳定结构的RNA,广泛存在于真核细胞中.环状RNA在众多病理生理过程中发挥重要作用,包括肿瘤的发生发展.原发性肝癌的发病率和病死率在全球肿瘤发生和死亡中均居前列,探索环状RNA在原发性肝癌中的作用将丰富对原发性肝癌的发生发展及防治的了解.有不少研究表明环状RNA参与原发性肝癌的发生发展及预后,本文就环状RNA的产生及功能,及其在原发性肝癌中的作用进行综述,为原发性肝癌的早期诊断、预后预测及治疗靶点选择提供依据.
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编辑人员丨2023/8/5
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套索肽研究进展
编辑人员丨2023/8/5
套索肽(Lassopeptide)是一类由核糖体合成并经过翻译后修饰的天然肽类产物(RiPPs),其C端穿过N端内酰胺环形成套索结构,这种刚性和折叠结构赋予了套索肽抗化学、热及蛋白酶水解等的强稳定性,同时这种特性也使得套索肽可作为生物活性化合物的分子支架.研究表明套索肽具有受体拮抗、酶抑制及抗菌活性等一系列生物活性.目前通过异源表达获取套索肽生物合成相关蛋白进行体外反应实验,已帮助阐明了一小部分套索肽生物合成机制,但由于参与套索肽进行环化的C一直难于表达纯化,阻碍了对套索肽生物合成过程中最关键的成环机制的深入了解及阐明,仍需科研人员的进一步研究.
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编辑人员丨2023/8/5
