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三江源地区藏原羚冬、夏季生境适宜性差异与影响变量
编辑人员丨4天前
藏原羚是青藏高原特有的珍稀有蹄类动物,广泛分布于三江源地区.预测三江源地区藏原羚的生境适宜性季节变化,了解环境变量的改变对藏原羚栖息地利用的影响,有利于制定对应的保护对策,也有助于了解藏原羚的生态位特征.本研究基于同一年冬季(2019年1月)和夏季(2019年8月)两次相同调查路线下藏原羚野外出现点,结合选取的8个环境变量,采用最大熵模型预测三江源地区藏原羚冬、夏季的生境适宜性和分布格局的差异,并通过环境响应曲线探讨环境变量对分布格局的影响.结果表明:冬、夏季,研究区藏原羚的适宜生境的接收者操作特征曲线下的面积平均值分别为0.901±0.023和0.882±0.024,拟合精度良好;三江源地区藏原羚冬、夏季适宜生境总面积分别为6.83×104、9.78×104 km2,夏季适宜生境面积比冬季明显增加,有向长江源园区以南及黄河源园区方向扩散的趋势.冬、夏季的生境适宜性都呈现出以三江源国家公园为中心、分布概率由中心的高值向周边逐渐递减的模式.季均温、海拔、人口密度和坡度是影响冬、夏季藏原羚分布的主导环境变量.与冬季相比,在气温明显升高的夏季,藏原羚适宜生境向海拔5000 m以上的地区和坡度小于25°的地区扩散,同时,夏季人类活动范围扩大侵占了藏原羚的适宜栖息地.
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编辑人员丨4天前
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基于MaxEnt和ArcGIS的山西省蒙古黄芪适宜性区划研究
编辑人员丨4天前
目的 掌握影响蒙古黄芪生长的主要环境因子,对蒙古黄芪在山西省适宜区分布进行预测,为山西省蒙古黄芪资源的合理布局提供参考.方法 采用山西省"第四次中药资源普查"数据库收录的蒙古黄芪样点经纬度信息,查询中国数字植物标本馆及检索文献记录补充,将筛选后的347个蒙古黄芪样点分布数据和环境因子添加到最大熵(MaxEnt)模型中运行,筛选出影响蒙古黄芪地理分布的主要环境因子及贡献率.应用地理信息系统软件ArcGIS对山西省蒙古黄芪生态适宜区进行划分.结果 建立的MaxEnt模型受试者工作特征曲线下面积为0.909,表明模型预测结果准确.共筛选出19个环境因子,其中气候因子是影响蒙古黄芪分布最重要的环境因子,其次是生物因子与地形因子,土壤因子的影响最小.山西省蒙古黄芪潜在适宜区主要分布在省内北部山区,呈现从北到南适宜等级逐渐降低的趋势,在当前气候条件下山西省蒙古黄芪最适宜区面积为15 424 km2,适宜区面积为19 856 km2,次适宜区面积为59 436 km2,不适宜区面积为61 894 km2.结论 基于MaxEnt模型和ArcGIS软件预测山西省蒙古黄芪适宜区分布状况,对山西省蒙古黄芪资源的保护与合理布局具有一定参考价值.
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编辑人员丨4天前
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增强CT灰度共生矩阵预测cN0期甲状腺乳头状癌中央区淋巴结转移
编辑人员丨4天前
目的 探讨增强CT灰度共生矩阵预测cN0期甲状腺乳头状癌中央区淋巴结转移的价值.资料与方法 回顾性分析2020年1月—2021年12月徐州市中心医院经临床、手术病理确诊的cN0期甲状腺乳头状癌患者55例,根据术后病理结果分为中央区淋巴结转移阳性组34例、阴性组21例,患者术前均行颈部CT双期增强检查.采用Image J软件分别提取动、静脉期肿瘤最大层面灰度共生矩阵参数(能量、对比、相关、逆差矩、熵)并比较两组各参数的差异,使用受试者工作特征曲线评估参数的预测效能.结果 两组间动脉期能量、熵及静脉期熵差异有统计学意义(t/Z=-2.140、2.753、2.736,P<0.05),其他参数差异均无统计学意义(P>0.05).动脉期能量、动脉期熵、静脉期熵、动脉期能量动脉期熵联合预测中央区淋巴结转移的曲线下面积分别为 0.672、0.706、0.686、0.734,动脉期能量动脉期熵联合预测效能最佳,敏感度和特异度分别为 76.47%、66.67%.结论 增强CT灰度共生矩阵有助于术前预测cN0期甲状腺乳头状癌患者中央区淋巴结转移,动脉期参数能量联合熵的预测效能最佳.
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编辑人员丨4天前
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肝脏质子密度脂肪分数直方图参数评估肝纤维化对肝脂肪变性影响的实验研究
编辑人员丨4天前
目的:探讨肝脏质子密度脂肪分数(PDFF)直方图参数评估实验兔肝脂肪变性和纤维化程度的价值,以及肝纤维化对PDFF直方图参数评价肝脂肪变性效能的影响。方法:2020年3月至12月,选取135只新西兰大白兔,采用随机数表法将实验兔分为对照组(30只)、实验组(105只)。将CCl 4和橄榄油按体积比1∶1配成50% CCl 4油溶液,实验组连续皮下注射;对照组皮下注射等剂量生理盐水。实验组及对照组在第4、8、12周末采用随机数表法分别随机选取35只、10只进行三维多回波mDixon-Quant扫描。选择全肝组织为感兴趣区进行PDFF直方图分析,提取直方图参数,包括体积、平均值、中位值、标准差、第25、50、75、90百分位数(20 th、50 th、75 th、90 th)、峰值、偏度、熵值、异质性。扫描后即刻处死实验兔,获得肝组织病理学脂肪分数(PSH)和纤维沉积分数(POF),并以中位数为界分为轻度肝脂肪变性组(61只)、中重度肝脂肪变性组(64只)和轻度肝纤维化组(63只)、中重度肝纤维化组(62只)。采用Spearman相关性分析用于评价PDFF直方图参数与PSH、与POF相关性;多重线性回归分析筛选评估PSH及POF的独立PDFF直方图参数。以受试者操作特征(ROC)曲线分析PDFF直方图参数评估轻度与中重度肝脂肪变性和肝纤维化的效能。在存在肝纤维化的实验兔中(POF>0,96只),对肝纤维化进行校正,比较校正前后最优参数评估轻度与中重度肝脂肪变性的曲线下面积(AUC),AUC的比较采用DeLong检验。 结果:125只实验兔纳入本研究。PDFF平均值、中位值、标准差、75 th、90 th、PSH、熵值与PSH有相关性( r=0.558、0.522、0.319、0.723、0.646、-0.589, P均<0.05)。PDFF 75 th及熵值为评估PSH的独立参数(β=2.347、-5.960, P=0.018、0.001)。PDFF 75 th评价肝脂肪变性的AUC最大,为0.915( P=0.001)。PDFF体积、平均值、中位值、标准差、75 th、90 th、熵值与POF有相关性( r=0.355、0.393、0.376、0.298、0.485、0.426、-0.681, P均<0.05)。熵值、标准差及肝体积为评估POF的独立参数(β=-11.041、1.356、0.190, P=0.001、0.026、0.016)。PDFF熵值鉴别肝纤维化AUC最大,为0.771( P=0.001)。肝纤维化组与非肝纤维化组中,PDFF 75 th与PSH相关系数分别为0.512( P=0.001)和0.751( P=0.002);在肝纤维化实验兔中,评估肝脂肪变性的AUC分别为0.895、0.950,差异有统计学意义( Z=2.970, P=0.025)。 结论:肝脏PDFF直方图分析可用于实验兔肝脂肪变性及肝纤维化评估,肝纤维化的存在降低了PDFF 75 th评价肝脂肪变性的效能。
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编辑人员丨4天前
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基于合成MRI的直方图参数对直肠癌壁外静脉侵犯的预测价值
编辑人员丨4天前
目的:探讨合成MRI直方图参数对直肠癌壁外静脉侵犯(EMVI)的预测价值。方法:回顾性分析2018年11月至2019年12月中国医学科学院肿瘤医院经手术病理证实为直肠腺癌的76例患者。所有患者术前4周内接受合成MRI序列检查。由1名低年资和1名高年资放射科医师独立评估EMVI状态。基于T 1、T 2和质子密度(PD)mapping提取直方图参数,包括均值、方差、最大值、最小值、第10百分位数、中位数、第90百分位数、能量、峰度、熵和偏度。以术后病理诊断为金标准,分为EMVI阳性组( n=18)和阴性组( n=58)。采用Mann-Whitney U检验比较两组间直方图参数的差异,采用ROC曲线评价两组间有统计学差异的直方图参数诊断EMVI的效能,采用logistic回归分析将曲线下面积(AUC)>0.7的直方图参数与医师评估相联合,以ROC曲线评估其预测效能,并采用Delong检验分析不同方法预测EMVI的AUC的差异。 结果:EMVI阳性组与阴性组间T 1、T 2和PD mapping能量值和PD mapping偏度值差异有统计学意义( P<0.05),其诊断EMVI的AUC分别为0.744、0.728、0.708、0.652。低年资医师诊断EMVI的AUC为0.711,其与T 1、T 2和PD mapping能量值联合诊断的AUC为0.817,差异有统计学意义( Z=2.281, P=0.023)。高年资医师诊断EMVI的AUC为0.837,与能量值联合诊断的AUC为0.856。低年资医师与高年资医师诊断EMVI的AUC差异有统计学意义( Z=2.587, P=0.010),低年资医师联合能量值与高年资医师诊断EMVI的AUC差异无统计学意义( Z=0.578, P=0.563)。 结论:合成MRI的能量值有助于提高低年资医师评估直肠癌EMVI的诊断信心,其直方图参数有助于预测直肠癌EMVI。
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编辑人员丨4天前
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深度学习重建方法改善快速采集PET图像质量的临床研究
编辑人员丨4天前
目的:通过深度学习(DL)PET图像重建方法,提升不同采集时间 18F-脱氧葡萄糖(FDG)PET图像质量。 方法:回顾性分析2020年9月至10月间山西医科大学第一医院核医学科45例恶性肿瘤患者[男20例、女25例,年龄(52.0±13.6)岁]PET图像。选择原始列表模式PET数据的短时30 s/床位PET图像作为输入,采用Unet网络,以全剂量标准采集时间(3 min)PET图像为模型判别标准,建立DL图像重建模型,以预测全剂量PET图像。分别对DL、30 s、90 s和120 s 4组图像进行图像质量评估及定量分析。采用5分法主观评估4组的图像质量。分别测量各组图像肝本底及肿瘤病灶定量参数:最大标准摄取值(SUV max)、平均标准摄取值(SUV mean)、标准差(SD)、信噪比(SNR)、对比度噪声比(CNR)及一阶纹理特征(偏度、峰度、均匀度和熵)。采用 Kappa检验、 χ2检验、单因素方差分析(最小显著差异 t检验)进行数据分析。 结果:4组图像质量评分具有高度一致性( Kappa=0.799, P<0.001),DL组评分≥3分共6例,30 s、90 s和120 s组评分≥3分别有4、7和8例( χ2=125.47, P<0.001)。DL组肝SD明显低于30 s组(0.26±0.07与0.43±0.11; F=3.58, t=-7.91, P<0.05),SNR高于30 s组(11.04±4.36与5.41±1.41; F=10.22, t=5.40, P<0.05);DL组肝SD及SNR与90 s组一致(0.39±0.16, 8.46±3.34; t值:-0.87和2.17,均 P>0.05)。在18个高摄取肿瘤病灶中,DL组病灶SNR及CNR均高于30 s组(60.21±29.26与38.38±16.54,22.26±15.85与15.41±9.51; F值:13.09和7.05, t值:5.20和4.04,均 P<0.001)。4组肝一阶纹理特征差异有统计学意义( F值:4.30~9.65,均 P<0.05),但DL组与120 s组间差异无统计学意义( t值:-1.25~0.15,均 P>0.05)。 结论:DL重建模型能较好地改善短帧PET图像质量,可以满足临床诊断、疗效评估和组学研究的需求。
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编辑人员丨4天前
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2020年全国艾滋病综合防治示范区评估结果分析
编辑人员丨4天前
目的:评估2020年国家艾滋病综合防治示范区(示范区)不同工作领域指标情况,为后续更好地开展示范区工作提供基础依据。方法:计算2020年全国示范区各领域指标的得分,比较不同类型示范区得分情况。采用 M( Q1, Q3)描述各指标得分,采用熵权法计算各指标综合得分,并换算为百分制得分,比较不同指标的得分情况。 结果:一级指标层面,组织领导和管理(96.0分)、预防艾滋病宣传教育(94.0分)和创新策略措施(98.0分)的得分相对较高,预防艾滋病社会综合治理(72.0分)领域的得分最低。城市示范区的预防艾滋病宣传教育、艾滋病综合干预2个领域得分均明显高于县(区)示范区。得分较低的二级指标包括暗娼人群最近1次性行为安全套使用情况(70.0分)、至少本地1类重点人群每年检测人次数较上年增加(70.0分)、普通高等学校、职业院校设立校内艾滋病自助售卖设施情况(65.0分)、对抓获的涉嫌卖淫嫖娼、聚众淫乱、吸毒贩毒人员进行HIV检测和出台相关政策文件/工作方案(55.0分)和MSM最近1次性行为安全套使用情况(50.0分)。指标3艾滋病综合干预对评估结果的贡献最大,指标7创新策略措施对评估结果的发挥作用最小。结论:2020年示范区工作总体情况良好,但各领域工作进展尚不够均衡。建议今后重点加强艾滋病综合干预和预防艾滋病社会综合治理2个领域工作;进一步完善评估指标体系,更全面推动示范区工作。
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编辑人员丨4天前
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≤20 mm孤立性肺结节良恶性预测模型的建立与验证
编辑人员丨4天前
目的:基于人工智能(AI)建立并验证≤20 mm孤立性肺结节(SPN)良恶性预测模型。方法:收集2018年11月至2020年5月在厦门大学附属中山医院接受手术切除并获得明确病理诊断的≤20 mm SPN患者279例(338个SPN),回顾性分析其临床特征(年龄、性别、吸烟史、恶性肿瘤史及家族恶性肿瘤史)、影像特征(最大径、最小径、实性占比、体积、分叶征、毛刺征、空泡征、空洞征、胸膜凹陷征)、及影像组学特征(最大CT值、最小CT值、平均CT值、中位数CT值、CT值标准差、偏度、峰值、能量、熵)。采用完全随机法将SPN按8∶2比例分为训练集(271个)和验证集(67个)。训练集数据中,首先使用最小收缩和选择算子(LASSO)回归方法对临床特征、影像特征及影像组学进行筛选,再进行多因素logistic回归分析筛选出≤20 mm SPN良恶性相关的独立危险因素,并实现列线图预测模型构建。最后将测试集数据传入该模型进行验证,绘制ROC曲线和校准曲线,评估模型预测价值。结果:训练集中271个≤20 mm SPN,其中良性81个、恶性190个。经LASSO回归及多因素logistics回归分析筛选得出年龄、性别、最大径、空泡征、实性占比5个因素为预测最大径≤20 mm SPN良恶性的独立预测因子, 构建预测模型为:P=e x/(1+e x),x=-2.583+0.027×年龄+1.519×性别+0.127×结节最大径-2.132×实性占比+1.720×空泡征。该模型预测≤20 mm的SPN为恶性的ROC曲线下面积为0.850, 灵敏度为73.7%,特异度为82.7%,准确度为82.3%。验证集67个SPN,其中良性22个、恶性45个, 预测模型的AUC为0.882,灵敏度为82.2%,特异度为81.8%,准确度为85.1%。训练集和验证集预测模型的校准曲线与理想曲线重合度良好(训练集: P=0.688,验证集: P=0.618)。 结论:基于AI建立的≤20 mm SPN的良恶性预测模型可获得预测概率并具有良好的诊断效能。
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编辑人员丨4天前
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基于生态位模型预测甘肃省内脏利什曼病传播风险
编辑人员丨4天前
目的:基于生态位模型分析并预测甘肃省内脏利什曼病传播风险,为精准防控措施的制定和疫情监测提供依据。方法:自全国传染病报告信息管理系统收集甘肃省2015 - 2021年报告的内脏利什曼病病例,获取病例分布点经纬度坐标以及区域内19个气候变量、5个地理变量和2个社会经济变量数据。基于生态位模型,采用最大熵算法(MaxEnt)构建内脏利什曼病传播风险预测模型,利用受试者工作特征曲线下面积(AUC)进行模型性能评价,并对构建模型的各环境变量进行重要性评估,以及预测甘肃省内脏利什曼病传播风险分布区域。结果:2015 - 2021年甘肃省共报告368例内脏利什曼病病例,其中,89.13%(328/368)集中在陇南市和甘南藏族自治州(甘南州);2017年病例数达到高峰(79例,21.47%)。构建模型具有较高的预测准确度(AUC = 0.985)。模型分析结果显示,影响甘肃省内脏利什曼病分布的主要气候变量为最冷季度平均温度(贡献值为3.1),地理变量为土地利用类型(贡献值为52.6)和植被覆盖类型(贡献值为8.5),社会经济变量为人口数(贡献值为14.3)。传播风险分布结果显示,高、中、低风险区从甘肃省南部向西北部呈现逐渐过渡的接壤分布特点。高风险区主要集中在甘肃省陇南市中南部和甘南州南部,占全省面积的0.18%;中、低风险区分别占全省面积的0.48%和2.47%,无风险区占96.87%。结论:生态位模型预测甘肃省内脏利什曼病传播呈现点状分散、局部高聚集性分布特征,应加强对陇南市和甘南州等高风险区的监测和防控。
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编辑人员丨4天前
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基于 18F-FET PET影像组学分析预测脑胶质瘤IDH1基因表型模型的建立与验证
编辑人员丨4天前
目的:构建基于 O-(2- 18F-氟代乙基)- L-酪氨酸( 18F-FET)PET图像影像组学特征的回归分析模型,探讨其对未经治疗的脑胶质瘤患者异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)基因表型的预测效能。 方法:回顾性分析2017年11月至2019年2月间复旦大学附属华山医院经病理学证实的58例脑胶质瘤患者[男36例、女22例,年龄(41.8±15.1)岁]的 18F-FET PET/CT脑显像数据,应用PyRadiomics软件包提取105个影像组学特征,使用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归构建预测模型,计算每个病灶的影像组学评分(RS),使用受试者工作特征(ROC)曲线量化模型RS的预测效能,并与 18F-FET半定量参数{肿瘤靶本比[TBR,包括最大TBR(TBR max)、TBR峰值(TBR peak)和平均TBR(TBR mean)]、肿瘤代谢体积(MTV)及病灶总代谢摄取(TLU)}对IDH1基因表型的预测效能进行对比(Delong检验)。 结果:LASSO回归模型共纳入7个影像组学特征,分别为最大二维切片直径、一阶最大特征值、一阶灰度值范围、灰度共生矩阵_能量、灰度共生矩阵_反差方差、灰度相关矩阵_熵、灰度相关矩阵_大相关低灰度级增强。构建的LASSO回归模型对IDH1基因表型(突变型20例,野生型38例)的预测效能准确性为81.0%(47/58),灵敏度为65.0%(13/20),特异性为89.5%(34/38),曲线下面积(AUC)为0.842; 18F-FET半定量参数中TLU诊断效能较优,其诊断准确性为60.3%(35/58),灵敏度为85.0%(17/20),特异性为47.4%(18/38),AUC为0.661;LASSO回归模型对IDH1基因表型的诊断效能优于传统参数( z=3.426, P<0.01)。 结论:基于 18F-FET PET脑显像的影像组学分析可提高对未经治疗的脑胶质瘤患者IDH1基因表型的预测效能。
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编辑人员丨4天前
