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染色体6p21.1区遗传变异与缺血性脑卒中易感性的研究进展
编辑人员丨5天前
缺血性脑卒中(IS)是脑卒中的主要亚型,它是一种复杂的多基因疾病,由多种环境因素和遗传因素共同影响,因此了解IS的遗传危险因素是阐明IS发病机制、优化预防策略、确定新的治疗靶点的重要步骤。2012年和2015年2项全基因组关联研究(GWAS)结果显示在染色体6p21.1区存在与IS发病相关的风险位点,但后续的重复验证研究结果却存在争议,而且染色体6p21.1区遗传变异影响IS易感性的生物学功能和分子机制的探索目前尚处于初始阶段。本文对染色体6p21.1区遗传变异与IS易感性之间的关联研究进行综述,以期进一步阐明其在IS中的作用机制,从而为IS的防治提供理论依据。
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编辑人员丨5天前
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拷贝数变异测序在智力障碍、发育迟缓及孤独谱系综合征的病因学分析中的应用
编辑人员丨5天前
目的:探讨拷贝数变异测序(CNV-seq)对于智力障碍(ID)、发育迟缓(DD)及孤独谱系障碍(ASD)患儿的诊断价值。方法:收集2018年9月至2022年1月在深圳市南山区妇幼保健院诊断为ID、DD及ASD的患儿40例,采集其外周血样,分别进行染色体核型分析和CNV-seq检测,查询ClinVar、DECIPHER、OMIM等数据库并结合生物信息学分析评估拷贝数变异(CNVs)的致病性。结果:40例患者检测出ID 16例(40.0%)、DD 15例(37.5%)、ASD 6例(15.0%)、ID合并DD为1例,ID合并ASD为2例。核型分析发现47,XY,+mar、46,XY,inv(8)(p11.2q21.2)、46,XX,del(5)(p14)以及46,XX[76]/46,X,dup(X)(p21.1q12)各1例,染色体多态性2例。CNV-seq在20例患儿中共检出32处CNVs,检出率(50.0%)明显高于核型分析。在10例(25.0%)患儿中发现了致病性CNVs(检出率为25.0%),12例患者中发现了15处意义未明的CNVs(检出率为30.0%),4例患者中发现了7处良性/可能良性的CNVs(检出率为10.0%)。结论:基因组CNVs是ID/DD和ASD重要的遗传学病因,CNV-seq可为明确其病因提供重要的参考。
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编辑人员丨5天前
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Xp21邻近基因缺失综合征家系分析并文献复习
编辑人员丨5天前
目的:探讨Xp21邻近基因缺失综合征的临床特征和遗传学特点,提高临床医师对该病的认识。方法:对Xp21邻近基因缺失综合征一家三兄弟的临床表现、诊治过程、基因特点等进行分析。以"Xp21邻近/临近基因缺失综合征"、"复合型甘油激酶缺乏症"和"Xp21 contiguous gene deletion syndrome"、"complex glycerol kinase deficiency"为关键词,分别对中国知网、维普数据库、万方数据和生物医学文献数据库(PubMed)及Web of Science数据库自建库至2019年12月收录的文献进行检索,并复习相关资料。结果:先证者为男童,第4胎,第4产,在新生儿期因"皮肤色素沉着、促肾上腺皮质激素显著升高"诊断为"先天性肾上腺皮质增生症(失盐型)",患儿血清三酰甘油、肌酸激酶水平显著升高,尿甘油酸水平显著升高,17羟孕酮水平正常,经微阵列单核苷酸多态性分析技术分析发现患儿X染色体p21.3p21.1区域5.16 Mbp缺失,确诊Xp21邻近基因缺失综合征,予氟氢可的松、氢化可的松替代治疗,患儿皮肤颜色转为正常,血清促肾上腺皮质激素降至正常。现患儿3岁8个月,智力运动发育落后,腓肠肌假性肥大,无电解质紊乱。患儿父母健康,患儿姐姐18岁,健康;患儿长兄及次兄均在出生不久后皮肤颜色变黝黑、智力运动落后,外院诊断为"脑性瘫痪、肌肉萎缩",分别于1岁及1岁6个月死亡。患儿母亲及姐姐X染色p21.3p21.1区带杂合缺失。文献检索共收集到22例资料完整、基因诊断明确的国内外个案报道,其中13例于新生儿期起病,主要表现为肾上腺皮质功能不全、肌营养不良、高三酰甘油血症、发育迟缓等,少数有特殊面容;Xp21区域大片段缺失变异,主要缺失基因均包括 NR0B1、 GK和 DMD。 结论:Xp21邻近基因缺失综合征临床表型复杂,且易被误诊,在新生儿期即可发生肾上腺皮质功能不全,预后不良,需要通过血清生化及基因分析明确诊断。
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编辑人员丨5天前
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染色体微阵列分析技术在室间隔缺损胎儿中的应用研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 应用染色体微阵列分析(chromosome microarray analysis,CMA)探讨胎儿室间隔缺损(ventricular septal defect,VSD)的病因.方法 选取248例产前超声提示为VSD伴或不伴其他结构畸形的胎儿,将其分为单纯VSD组、VSD合并其他心内异常组、VSD合并心外异常组(包括其他畸形和超声软指标异常)以及VSD合并心内外异常组.对所有胎儿进行常规染色体分析,对6例核型为异常者以及部分核型为正常者进一步进行CMA检测,随访所有胎儿的妊娠结局,对新生儿随访至1岁.结果 在248例胎儿中,共发现60例核型异常(包括50例数目异常、7例结构异常、3例嵌合体),检出率为24.2%.CMA检测明确了6例核型异常者衍生染色体的来源和性质,其中2例的缺失区段包含Wolf-Hirschhorn 综合征的关键区域,其中包含的WHSC1、LBX1、LDB3、BBS10等可能是先天性心脏病的候选致病基因.在143例核型正常的胎儿中,CMA在11例中发现了致病性拷贝数变异(copy number variants,CNVs),检出率为7.7%(11/143),其长度介于0.33~4.53 Mb,其中9例为已知的微缺失或微重复综合征,包括22q11.2微缺失综合征、17p11.2微缺失综合征(Smith-Magenis综合征)、17p13.3微缺失综合征(Miller-Dieker综合征)、1p36微缺失综合征、1q21.1微重复综合征和4q缺失综合征.其致病性CNVs所包含的可能与VSD相关的致病基因包括TBX1、LZTR1、FAT1、AKAP10、SKI、PRDM26、GJA5、ERCC4以及YWHAE.在CMA结果正常的新生儿中,48.4%的VSD在出生后1年内自然闭合.结论 CMA技术可将胎儿VSD的遗传学病因检出率提高7.7%,但不同组别的VSD胎儿之间致病性CNVs的检出率无明显差异.对于染色体核型正常的VSD胎儿,建议进一步行CMA分析.
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编辑人员丨2023/8/6
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一例合并6q21-q22.31微缺失的锁骨颅骨发育不良患者的遗传学分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 对1例发育迟缓伴多发畸形患儿进行遗传学检测,分析其预后及发生机制,为临床咨询提供依据.方法 采用常规G显带和微阵列比较基因组杂交(array comparative genomic hybridization,aCGH)技术分析患儿及其父母的外周血染色体核型和DNA.结果 G显带分析结果显示,患儿染色体核型为46,XX,del(6)(q22),inv(6) (p21.1q21),其父母染色体核型未见异常.aCGH检测结果显示患儿6p21.1区存在800 kb杂合缺失,包含RUNX2基因,6q21-q22.31区存在11.79 Mb杂合缺失,其父母未检测到染色体微重复/微缺失.结论 患儿为染色体新发倒位,两处微缺失均为新发突变,具有致病性.6p21.1区域RUNX2基因微缺失导致锁骨颅骨发育不良,6q21-q22.31区域微缺失可能与患儿脑部结构发育异常相关.
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编辑人员丨2023/8/6
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5例环状染色体综合征的产前诊断和表型分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 通过对5例环状染色体综合征患者进行细胞遗传学分析,探讨高分辨率G显带核型分析和微阵列比较基因组杂交两种方法对环状染色体的诊断优势,并探讨5例环状染色体综合染色体缺失片段和定位于其中的基因与临床表型的关系.方法 201 7年就诊于深圳市妇幼保健院的5例环状染色体综合征病例纳入研究.用染色体G带高分辨显带和微阵列比较基因组杂交技术对5例环状染色体进行识别与定位.结果 病例1羊水染色体核型结果:45,XN,-18[13]/46,XN,r(18) (p11.2q22.3) [47],羊水微阵列比较基因组杂交结果:arr[GRCH37]18q22.3q23 (70,06 3,358-78,01 3,728) x1;18p11.32p11.23 (136,227-8,002,810) x1;18p11.23p11.22 (8,013,797-8,877,061) x3.病例2脐血染色体核型结果:4 6,XN,rec (21)r(21q) dup (21q)(q11.2-q22.2)?,脐血微阵列比较基因组杂交结果:arr [GRCH37]21q11.2q22.3 (15,016,486-47,044,951) x2~4;32MB.21q22.3 (47,052,734-48,093,361)x1.病例3脐血染色体核型结果:4 5,XY,-21 [14]/46,XN,r(21) [86],脐血微阵列比较基因组杂交结果:arr [GRCh37]21q11.2q22.3 (15016486 _476 32178) x3[0.47];21q22.3 (47632178 _480 933 61) x1.病例4羊水染色体核型结果:46,XX,r(4) (p16q35),羊水微阵列比较基因组杂交结果:arr[GRCH37]4p16.3p16.1 (68,345-8,721,580) x1;4q35.2 (190,6 02,426-190,9 5 7,460) x1.病例5羊水染色体核型结果:mos45,X[46]/46,x,r(x) (p22.3 q21.1)[34],羊水微阵列比较基因组杂交结果:Xq21.1q28 (82119329_155233098) x1;Xp22.33p22.32 (168551_5677733) x1;Xp22.32q21.1(5677733-82119329) x1 [0.4].结论 (1)环状染色体综合征患儿的临床特征与染色体区带缺失重复部位和大小相关.(2)G显带核型分析和微阵列比较基因组杂交诊断环状染色体各有优势:第一传统的G显带核型分析首先可判断是否存在嵌合的染色体核型;第二即使微阵列比较基因组结果提示染色体仅有长臂或短臂的缺失,也不能排除环状染色体的可能,亦需要传统的G显带染色体核型共同分析;第三微阵列比较基因组杂交能够精确基因组微小缺失和重复,利于基因组拷贝数变异与临床表型分析.因此联合G显带核型分析和微阵列比较基因组杂交对于环状染色体的诊断和遗传咨询具有指导意义.
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编辑人员丨2023/8/6
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全基因组染色体微阵列分析及核型分析在颈项透明层增厚胎儿遗传学诊断中的价值
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨全基因组染色体微阵列分析(CMA)及核型分析在颈项透明层(NT)增厚胎儿中的临床检测效能和价值,分析NT增厚在染色体显微及亚显微水平上的遗传学发病原因.方法 选取2017年1月1日—2018年9月30日在安徽省妇幼保健院产前诊断中心就诊的62例早孕期(11~13+6周)孕妇,经超声检查提示胎儿NT厚度≥2.5 mm,经羊水穿刺获取标本,再行标准的"核型分析+CMA"检查,确定遗传学诊断,结合临床资料分析检测结果 .结果 ①核型分析的检出率为16.13%(10/62),其中唐氏综合征5例,18三体综合征2例,1例嵌合体,另有2例结构畸变;CMA总检出率为24.19%(15/62),7例非整倍体与核型结果一致,8例为染色体微缺失/微重复.②按照NT值分组,核型分析和CMA在2.5 mm≤NT<3.5 mm、3.5 mm≤NT<4.5 mm、NT≥4.5 mm组中检出率分别为13.33%(4/30)/20.00%(6/30)、22.73%(5/22)/22.73%(5/22)、10.00%(1/10)/40.00%(4/10).③受检样本中3例核型与CMA结果不符,1例核型为46,XN(28)/47,XN,+mar(14),CMA显示12p13.33p11.1区段发生2次重复,1例核型为46,XN,t(1:16)(q41:q23)pat,CMA正常,1例核型提示18号衍生染色体46,XN,der(18),CMA提示18p11.32p11.21区带存在14.9 Mb缺失,同时Yp11.31p11.2区域存在约8.2 Mb重复.在52例核型正常、NT增厚的胎儿中,CMA额外检出6例(11.54%)亚显微拷贝数变异(CNV),大小介于459 kb~2.03 Mb,涉及1q21.1q21.2、2q13、Xq28、11p15.4等区带.结论 胎儿NT增厚与染色体异常关系密切,且随NT值升高合并染色体病风险增大,CMA能检测传统核型分析无法识别的染色体微缺失/微重复,建议对NT增厚胎儿,应采用核型分析+CMA的标准遗传学诊断模式.
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编辑人员丨2023/8/5
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新发8p重复伴缺失综合征患儿细胞分子遗传学研究
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨8号染色体短臂倒位重复伴末端缺失[inv dup del(8p)]综合征的临床特征及细胞分子遗传学特点.方法 回顾分析1例inv dup del(8p)综合征患儿的临床资料以及细胞分子遗传学分析资料.结果6月龄女性患儿,具有发育迟缓、特殊面容、先天性心脏病及喉软化症等临床表现.外周血淋巴细胞染色体核型分析显示,患儿为46,XX,der(8)inv dup(8)(p21),del(8)(p23),父母均无异常;高通量测序染色体组拷贝数分析(CNV)精确定位拷贝数异常改变的染色体片段区域,检出患儿在8p23.3-p23.1(160001-7120000)区域缺失6.96 Mb片段,在8p23.1-p21.1(12560001-27940000)区域,重复15.38 Mb片段;荧光定量PCR验证CNV显示在重复和缺失片段之间有一个5.4 Mb的拷贝数正常片段.结合临床表现及各检测结果确诊患儿为inv dup del(8p)综合征.结论 结合临床特征、外周血染色体核型分析、CNV及荧光定量PCR技术可有效确诊inv dup del(8p)综合征.
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编辑人员丨2023/8/5
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儿童母细胞性浆细胞样树突细胞瘤1例诊治及移植后MRD转阳后相关治疗
编辑人员丨2023/8/5
1 病例资料 患儿,女,6岁,以"发现淋巴结肿大"起病,查体:颈部、耳后、颌下、颏下、腋窝及右侧腹股沟区淋巴结肿大.外院淋巴结活检免疫组化染色示:异型细胞CD43(弥漫性+)、LLCA(弥漫性+)、CD4(弥漫+)、CD56(弥漫+)、CD10(-)、CD7(部分弱至中等强+)、CD123(-至灶性微弱+)、Ki-67(+80%)、S-100(极少数散在+)、TDT(-)、MPO(-)、CD34(-)、CD68(-)、CD3(-)、CD20(-)、CD38(-)、CD79a(-)、CD5(-)、Granzyme B(-),考虑母细胞性浆细胞树突细胞瘤(blastic plasmacytoid dendritic cell neoplasm,BPDCN)可能性大.后转入我院,骨髓形态原始细胞占有核细胞80.8%,根据PAS染色,BPDCN可能性大.流式分析58.1%细胞表达CD56、HLA-DR、CD33、CD304、CD123、CD371、CD4dim,部分表达CD36、CD7,可疑为BPDCN.染色体:46,XX,t(6;8)(p21.1;q24.1).血液肿瘤突变组分析NRAS Q61K突变阳性.综合各项检查结果,确诊为BPDCN.
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编辑人员丨2023/8/5
