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基于非靶向代谢组学技术探究喂养方式对剖宫产婴儿粪便中代谢物的影响
编辑人员丨5天前
目的:探讨母乳和混合喂养对剖宫产婴儿粪便代谢物的影响。方法:横断面研究。2021年秋季与2022年冬季分别在西安市南、北两家母婴护理机构收集了23例1月龄健康剖宫产婴儿粪便样本,将样品分为母乳喂养组(11例)和混合喂养组(12例)。基于非靶向代谢组学方法,借助气相色谱-质谱联用技术,探索不同喂养方式下剖宫产婴儿粪便代谢产物的变化情况,利用非参数 Mann- Whitney U检验方法筛选差异代谢物,并对差异代谢产物进行代谢通路分析。 结果:共定性出155种代谢物,包括糖及糖类衍生物57种,脂肪酸34种,有机酸25种,氨基酸22种,酯类8种,核苷4种,维生素3种以及2种其他物质。通过对差异代谢物的相对含量进行分析,发现母乳喂养组中部分糖及糖的衍生物含量较高,而混合喂养组中氨基酸、有机酸及脂肪酸含量较高。通过对差异代谢物的代谢通路进行分析,共获得28条代谢通路,其中丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢,缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸代谢,精氨酸代谢及柠檬酸循环(TCA循环)等代谢通路对婴儿健康有一定的影响。结论:喂养方式对剖宫产婴儿粪便中的代谢物存在影响,且混合喂养可能在一定程度上促进剖宫产婴儿肠道中TCA循环和氨基酸代谢的过程。
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编辑人员丨5天前
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肺炎患者血清能量代谢产物的变化及其临床意义
编辑人员丨5天前
目的:探讨肺炎患者血清能量代谢产物的变化及对预后的价值和临床意义。方法:选取2020年9年至2022年9月德驭医疗马鞍山总医院收治的50例肺炎患者作为研究对象,选取50例健康者作为对照研究。根据患者预后情况分为预后良好组(29例)和预后不良组(21例)。收集两组患者外周血,分离血清,采用代谢组学分析患者外周血中能量代谢相关产物的变化;比较不同预后、不同病情程度患者能量代谢产物的变化。采用多因素Logistic回归分析预后相关的独立影响因素;分析外周代谢物水平对预后诊断的价值。组间计量数据比较采用独立样本 t检验。 结果:对照组患者外周血中乳酸、甘油醛3-磷酸、磷酸二羟基丙酮、磷酸烯醇式丙酮酸相对水平(1.29±0.25、1.74±0.57、1.15±0.27、1.14±0.28)明显低于肺炎组(4.61±1.17、3.46±0.77、2.50±0.53、2.66±0.81),差异有统计学意义( t=19.570、12.630、16.190、12.600, P<0.05)。对照组患者外周血中乙酰辅酶A、柠檬酸、a-酮戊二酸相对水平(1.38±0.41、1.60±0.38、1.29±0.27)明显高于肺炎组(0.44±0.19、1.00±0.90、0.67±0.19),差异有统计学意义( t=14.610、8.918、13.170, P<0.05)。对照组患者外周血中核酮糖-5磷酸相对水平(1.42±0.21)明显高于肺炎组(0.62±0.21),差异有统计学意义( t=19.110, P<0.05)。重症组和预后不良组患者外周血中乳酸、甘油醛3-磷酸、磷酸二羟基丙酮、磷酸烯醇式丙酮酸相对水平(5.53±0.94、3.98±0.71、2.81±0.51、3.53±0.76;5.83±0.67、4.22±0.41、2.97±0.33、3.38±0.45)明显高于轻症组和预后良好组(3.68±0.39、2.94±0.39、2.20±0.34、2.04±0.33;3.74±0.38、2.91±0.41、2.16±0.34、2.14±0.56),差异有统计学意义( t=9.040、6.344、4.999、9.218, P<0.05; t=14.230、11.200、8.432、8.299, P<0.05)。重症组和预后不良组患者外周血中乙酰辅酶A、柠檬酸、a-酮戊二酸相对水平(0.38±0.12、0.80±0.25、0.57±0.15;0.32±0.12、0.71±0.12、0.55±0.17)明显低于轻症组和预后良好组(0.55±0.18、1.20±0.15、0.80±0.12;0.52±0.19、1.22±0.15、0.76±0.16),差异有统计学意义( t=5.019、6.940、6.023、4.443、13.170、4.428, P<0.05)。重症组和预后不良组患者外周血中核酮糖-5磷酸相对水平(0.47±0.17、0.42±0.13)明显低于轻症组和预后良好组(0.78±0.12、0.77±0.12),差异有统计学意义( t=97.097、9.851, P<0.05)。乳酸、磷酸烯醇式丙酮酸、乙酰辅酶A、柠檬酸、a-酮戊二酸水均为肺炎患者预后的独立危险因素[比值比( OR)=5.741、6.124、3.416、5.641、5.441, P<0.05]。 结论:肺炎患者血清糖酵解、三羧酸循环和磷酸戊糖途径代谢异常,与肺炎患者病情和预后密切相关。
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编辑人员丨5天前
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胆汁循环肿瘤DNA在肝外胆管癌临床应用中的价值及研究现状
编辑人员丨5天前
肝外胆管癌是一种少见但恶性程度高的恶性肿瘤,预后不良。其诊断的难点在于如何与良性胆管疾病鉴别。目前肝外胆管癌的传统诊断试验敏感度及特异度均不高,最新研究显示胆汁循环肿瘤DNA(ctDNA)的测定可明显提高胆管狭窄良恶性诊断的准确率。目前美国食品药品监督管理局已经批准针对异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变的靶向药物艾伏尼布(ivosidenib),以及针对人成纤维细胞生长因子受体突变的靶向药物英菲格拉替尼(infigratinib)和培米替尼(pemigatinib)用于治疗有相关适应证的胆管癌患者,未来胆汁ctDNA测定可能有助于为胆管癌患者定制更个性化的靶向治疗。
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编辑人员丨5天前
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探讨青蒿琥酯和扶正化瘀方治疗血吸虫病肝纤维化对线粒体的影响
编辑人员丨5天前
目的:比较青蒿琥酯(Art)和扶正化瘀方治疗血吸虫病肝纤维化对线粒体自噬的影响。方法:将80只C57BL/6雌性小鼠随机分为健康组、感染组、Art治疗组和扶正化瘀方治疗组,每组20只。感染组及治疗组小鼠感染日本血吸虫尾蚴16条。6周后,吡喹酮(300 mg/kg)2日疗法杀虫。Art治疗组采用每天100 mg/kg腹腔注射的方式进行治疗,扶正化瘀方治疗组采用每天饲料给药,每1 kg饲料含16 g扶正化瘀方,6周后,取4组小鼠新鲜肝组织。Masson染色观察、蛋白质印迹分析肝组织中参与线粒体三羧酸循环反应的琥珀酸脱氢酶亚单位A(SDHA)、苹果酸脱氢酶(MDH2)、柠檬酸合酶(CS)、酮戊二酸脱氢酶(OGDH);雷帕霉素靶蛋白1(mTORC1)通路;腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)和线粒体自噬通路激酶(PINK1)的相对表达水平。提取各组肝脏组织样品的线粒体检测线粒体的耗氧率。双因素方差分析比较各组间蛋白表达的差异。结果:Masson染色显示,感染组小鼠肝脏纤维化面积显著高于健康组并且Art治疗组和扶正化瘀方治疗组小鼠肝脏纤维化面积均低于感染组。蛋白质印迹法分析结果显示,SDHA蛋白相对表达量感染组(0.82±0.05)与健康组(1.00±0.05)相比显著下降( t = 11.23, P = 0.004),并且Art治疗组(0.73±0.05)显著高于感染组( t = 10.79, P = 0.007),但是扶正化瘀方组(0.98±0.05)与健康组比较,差异无统计学意义( t = 1.925, P = 0.127);感染组p-AMPK的蛋白质相对表达量(1.15±0.05)显著高于健康组(0.98±0.07, t = 12.18, P = 0.003),Art治疗组(0.50±0.05)相比较于感染组p-AMPK的表达显著降低( t = 11.78, P = 0.003)。感染组AMPK的蛋白质相对表达量(0.80±0.05)显著低于健康组(1.00±0.05, t = 10.53, P = 0.005),Art治疗组(0.54±0.05)相比较于感染组AMPK的表达显著降低( t = 13.98, P = 0.004);感染组p-mTORC1的蛋白质相对表达量(0.93±0.08)与健康组相比差异无统计学意义( t = 2.28, P = 0.065),而Art治疗组的表达量(0.63±0.05)显著低于感染组( t = 10.58, P = 0.029);感染组p-mTORC1/m-TORC1(0.98±0.03)相对于健康对照组(0.97±0.03, t = 0.98, P = 0.085)差异无统计学意义,Art治疗组(0.48±0.05)相对于感染组显著下降( t = 14.58, P = 0.009)。感染组PINK1的蛋白质相对表达量(0.55±0.05)显著低于健康组(1.00±0.03, t = 13.49, P = 0.001),Art治疗组(1.21±0.05, t = 9.98, P = 0.005)和扶正化瘀方治疗组(1.31±0.35, t = 6.98, P = 0.027)均显著高于感染组。线粒体功能检测显示,加入复合物Ⅱ底物(琥珀酸)后感染组耗氧量低于健康组而Art治疗组和扶正化瘀方治疗组均高于感染组,加入复合物IV底物(抗坏血酸+三甲基戊二醇)后感染组耗氧量低于健康组而Art治疗组和扶正化瘀方治疗组显著高于感染组。 结论:Art通过抑制AMPK/mTORC1信号通路活性并增强线粒体耗氧量和自噬及SDHA表达而缓解血吸虫病肝纤维化。
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编辑人员丨5天前
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探讨青蒿琥酯和扶正化瘀方治疗血吸虫病肝纤维化对线粒体的影响
编辑人员丨5天前
目的:比较青蒿琥酯(Art)和扶正化瘀方治疗血吸虫病肝纤维化对线粒体自噬的影响。方法:将80只C57BL/6雌性小鼠随机分为健康组、感染组、Art治疗组和扶正化瘀方治疗组,每组20只。感染组及治疗组小鼠感染日本血吸虫尾蚴16条。6周后,吡喹酮(300 mg/kg)2日疗法杀虫。Art治疗组采用每天100 mg/kg腹腔注射的方式进行治疗,扶正化瘀方治疗组采用每天饲料给药,每1 kg饲料含16 g扶正化瘀方,6周后,取四组小鼠新鲜肝组织。Masson染色观察、蛋白质印迹分析肝组织中参与线粒体三羧酸循环反应的琥珀酸脱氢酶亚单位A(SDHA)、苹果酸脱氢酶(MDH2)、柠檬酸合酶(CS)、酮戊二酸脱氢酶(OGDH);雷帕霉素靶蛋白1(mTORC1)通路;腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)和线粒体自噬通路激酶(PINK1)的相对表达水平。提取各组肝脏组织样品的线粒体检测线粒体的耗氧率。双因素方差分析比较各组间蛋白表达的差异。结果:Masson染色显示,感染组小鼠肝脏纤维化面积显著高于健康组并且Art治疗组和扶正化瘀方治疗组小鼠肝脏纤维化面积均低于感染组。蛋白质印迹法分析结果显示,SDHA蛋白相对表达量感染组(0.82±0.05)与健康组(1.00±0.05)相比显著下降( t = 11.23, P = 0.004),并且Art治疗组(0.73±0.05)显著高于感染组( t = 10.79, P = 0.007),但是扶正化瘀方组(0.98±0.05)与健康组比较,差异无统计学意义( t = 1.925, P= 0.127);感染组p-AMPK的蛋白质相对表达量(1.15±0.05)显著高于健康组(0.98±0.07, t = 12.18, P = 0.003),Art治疗组(0.50±0.05)相比较于感染组p-AMPK的表达显著降低( t= 11.78, P= 0.003)。感染组AMPK的蛋白质相对表达量(0.80±0.05)显著低于健康组(1.00±0.05, t = 10.53, P = 0.005),Art治疗组(0.54±0.05)相比较于感染组AMPK的表达显著降低( t= 13.98, P= 0.004);感染组p-mTORC1的蛋白质相对表达量(0.93±0.08)与健康组相比差异不显著( t = 2.28, P= 0.065),而Art治疗组的表达量(0.63±0.05)显著低于感染组( t= 10.58, P = 0.029);感染组p-mTORC1/m-TORC1(0.98±0.03)相对于健康对照组(0.97±0.03, t = 0.98, P= 0.085)差异无统计学意义,Art治疗组(0.48±0.05)相对于感染组显著下降( t= 14.58, P = 0.009)。感染组PINK1的蛋白质相对表达量(0.55±0.05)显著低于健康组(1.00±0.03, t= 13.49, P= 0.001),Art治疗组(1.21±0.05, t= 9.98, P= 0.005)和扶正化瘀方治疗组(1.31±0.35, t= 6.98, P= 0.027)均显著高于感染组。线粒体功能检测显示,加入复合物Ⅱ底物后感染组耗氧量低于健康组而Art治疗组和扶正化瘀方治疗组均高于感染组,加入复合物Ⅲ底物后感染组耗氧量低于健康组而Art治疗组和扶正化瘀方治疗组显著高于感染组。 结论:Art通过抑制AMPK/mTORC1信号通路活性并增强线粒体耗氧量和自噬及SDHA表达而缓解血吸虫病肝纤维化。
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编辑人员丨5天前
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胃癌新辅助化疗不同应答肿瘤微生物组学的改变及其临床意义
编辑人员丨5天前
目的:探究胃癌新辅助化疗不同应答肿瘤微生物组学的改变。方法:采用回顾性观察性研究的方法,收集2017年1月至2023年1月期间,青岛大学附属医院胃肠外科肿瘤样本库中病理确诊为胃腺癌、无转移及术前仅接受新辅助化疗并成功接受胃癌根治术的31例胃癌患者术后新鲜冷冻标本;排除出现转移或其他原发肿瘤病灶和术前1个月内接受过其他转化治疗包括免疫治疗、靶向治疗和益生菌的患者。采用第8版美国癌症联合委员会(AJCC)分期系统和美国病理学家协会肿瘤消退分级系统(TRG)对患者进行分级和分组,TRG 0~1级、ypT0~1和ypN0被归类为新辅助化疗有反应组(12例),而TRG 2~3级和ypT2~4或ypN+则被归类为新辅助化疗无反应组(19例)。采用16S rRNA测序技术对新鲜冷冻样本进行处理和分析。使用QIIME2的Q2-diversity插件进行Alpha多样性和Beta多样性分析,使用STAMP找出默认参数和两组之间的差异富集细菌类群。通过效应大小线性判别分析进行高维类比较,使用PICRUST2(v2.3.0-b)软件预测微生物组的潜在功能分布。结果:新辅助化疗有反应组与无反应组胃癌患者在性别、年龄、体质指数、吸烟史、肿瘤位置、新辅助化疗前的肿瘤cTNM分期和新辅助化疗方案方面比较,差异没有统计学意义(均 P>0.05),但两组的肿瘤长径和新辅助化疗后的肿瘤ypTNM分期差异均具有统计学意义(均 P=0.001)。胃部微生态的Alpha和Beta多样性结果显示,两组Alpha多样性差异没有统计学意义( P>0.05),而两组Beta多样性差异却有统计学意义( P=0.004)。红螺菌科( Coriobacteriaceae)、瘤胃球菌科( Ruminococcaceae)、韦荣球菌科( Veillonellaceae)和毛螺菌科( Lachnospiraceae)等4种科水平细菌分类群在新辅助化疗有反应组患者中富集,而以 Proteobacteria(变形菌门)为主的4种细菌分类群在新辅助化疗无反应组患者中富集。柠檬酸循环和丙氨酸等在内的各种氨基酸的代谢通路被发现具有潜在预测意义。 结论:不同新辅助化疗反应结果的胃癌患者在胃部微生态的丰度和组成方面存在差异。
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编辑人员丨5天前
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Nod样受体蛋白3炎性小体的代谢调控及其在肾脏疾病中的作用
编辑人员丨5天前
近年来随着代谢重编程领域研究的不断深入,人们对免疫细胞生物学效应的认识发生了转变,即在炎性反应刺激下,免疫细胞重新调控其代谢和生物能量学,提供细胞生存的能量和底物,启动免疫效应功能。Nod样受体蛋白3(Nod-like receptor protein 3,NLRP3)炎性小体作为先天免疫系统的重要组成部分,已被证明可以感知如尿酸和胆固醇晶体等代谢物,并可被代谢产物酮体所抑制;也受线粒体活性氧和糖酵解成分(如己糖激酶)的调节。最近的研究表明,多种代谢途径汇聚为NLRP3炎性小体的有效调控因子。该文综述了NLRP3炎性小体激活的代谢调节途径和特异性,以及其在肾脏疾病中的作用。
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编辑人员丨5天前
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瓦斯爆炸致大鼠复合伤的血清代谢组学变化研究
编辑人员丨5天前
目的:分析瓦斯爆炸致大鼠复合伤的血清代谢组学变化,探讨其可能机制。方法:于2018年4月,应用煤矿瓦斯爆炸大型巷道实验和爆炸测试系统模拟瓦斯爆炸实验。将32只SD大鼠随机分为对照组(不参与爆炸)、近距离(40 m)组、中距离(160 m)组和远距离(240 m)组,每组8只。爆炸后,分别检测不同组大鼠2 h呼吸功能和48 h神经行为变化;48 h后麻醉处死大鼠,分离大鼠血清以及肺脏、肝脏等组织,通过HE染色观察肺脏和肝脏组织病理学变化;应用液相色谱-高分辨质谱联用(UPLC-Orbitrap Elite/MS)代谢组学方法检测血清样本,主成分分析评价组间代谢谱差异,筛选并鉴定差异性代谢物,分析代谢通路。结果:爆炸2 h后,与对照组比较,不同爆炸组大鼠的呼吸频率、每分钟通气量、最大吸气流量、最大呼气流量和1/2潮气量呼气流量明显减低( P<0.05),呼吸间歇、吸气时间和2/3潮气量所需时间明显增加( P<0.05);而爆炸48 h后,40 m组、160 m组大鼠神经行为指标停留时间明显增加( P<0.05),运动距离明显减少( P<0.05)。HE染色结果显示,各爆炸组大鼠肺脏组织和肝脏组织结构破坏,细胞排列紊乱,有炎性细胞浸润,有出血和水肿等表现。代谢组学分析显示,组间代谢谱差异明显,血清样本中共鉴定出乌头酸、柠檬酸、烟酰胺、丙酮酸等18个差异代谢物,涉及谷氨酰胺和谷氨酸代谢,苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成,乙醛酸和二羧酸代谢,苯丙氨酸代谢,烟酸和烟酰胺代谢,柠檬酸循环(TCA循环)等12条主要代谢通路。 结论:瓦斯爆炸可导致大鼠多脏器系统损伤,其机制可能与丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成、烟酸和烟酰胺代谢、乙醛酸和二羧酸代谢、TCA循环等有关。
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编辑人员丨5天前
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希特林蛋白缺乏症代谢物组学研究进展
编辑人员丨5天前
希特林蛋白缺乏症(CD)是SLC25A13基因突变导致的一种常染色体隐性遗传病,是我国婴儿胆汁淤积症最重要病因之一。CD代谢机制复杂,涉及尿素循环、苹果酸天冬氨酸循环、柠檬酸苹果酸循环、脂肪酸代谢和糖代谢等多个代谢途径。代谢物组学通过分析代谢产物改变,在CD中已有一些应用。本文就CD代谢物组学研究进展作一综述。
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编辑人员丨5天前
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LINC01600在结直肠癌临床诊断中的应用价值
编辑人员丨5天前
目的:分析长链非编码RNA LINC01600在结直肠癌组织中的表达以及在临床结直肠癌诊断过程中的价值。方法:选取2020年1月至2023年12月新乡医学院第一附属医院收治的37例结直肠癌患者的临床标本作为研究标本,选择对应的癌旁组织作为对照样本。提取癌旁组织和结直肠癌组织的总RNA,采用转录组学技术分析癌组织和癌旁组织差异表达的长链非编码RNA。选取差异最为显著的长链非编码RNA LINC01600作为研究对象。采用荧光定量聚合酶链反应技术检测结直肠癌组织和癌旁组织中LINC01600的表达水平。制作受试者工作特征曲线分析LINC01600对结直肠癌的临床诊断效能。采用单因素方差分析不同临床分期,不同分化程度患者LINC01600表达水平。并分析LINC01600和患者预后的关系。结果:结直肠癌和癌旁组织共检出39 123个长链非编码RNA,其中包括2 018个新的长链非编码RNA。差异分析显示,其中有1 626个差异表达的长链非编码RNA,其中1 019个上调基因,607个下调基因。长链非编码RNA主要富集于核糖体通路、柠檬酸循环通路和RNA剪接相关通路。本研究选取差异最为显著的上调长链非编码RNA LINC01600进行研究。癌旁组织长链非编码RNA LINC01600表达水平(0.85±0.10)明显低于结直肠癌组织(1.99±0.31),差异有统计学意义( t=21.390, P<0.05),中高分化患者肿瘤组织中长链非编码RNA LINC01600表达水平(1.70±0.11)显著低于低分化患者(2.19±0.24),差异有统计学意义( t=7.510, P<0.05)。淋巴结转移患者结直肠癌组织长链非编码RNA LINC01600表达水平(2.24±0.23)显著高于结直肠癌组织(1.80±0.20),差异有统计学意义( t=6.229, P<0.05)。Ⅲ期患者结直肠癌组织长链非编码RNA LINC01600表达水平(2.19±0.32)显著高于结直肠癌组织(1.92±0.27),差异有统计学意义( t=2.796, P<0.05)。LINC01600高表达组结直肠癌患者中位生存时间(14个月)明显低于LINC01600低表达患者(26个月),差异有统计学意义(Log-rank=4.618, P<0.05)。肿瘤组织长链非编码RNA LINC01600诊断结直肠癌的曲线下面积(AUC)为0.814[95%可信区间( CI)=0.754~0.968, P<0.05]。LINC01600敏感性为92.45%,特异性为89.36%。 结论:长链非编码RNA LINC01600在结直肠癌患者肿瘤组织中达水平明显高于癌旁组织,有助于临床结直肠癌患者术前和预后诊断。
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编辑人员丨5天前
