目的:探讨凋亡通路相关基因的遗传变异与直肠癌患者术后同步放化疗不良反应的关系。方法:选择362例接受术后同步放化疗的Ⅱ～Ⅲ期直肠癌患者，同步放化疗前抽取静脉血，采用Sequenom MassARRAY检测凋亡通路中的Fas细胞表面死亡受体(FAS)、Fas配体(FASL)、凋亡蛋白活性因子1(APAF1)、Bcl-2相关X蛋白(BAX)、肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL)、肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体受体1(TRAILR1)、肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体受体2(TRAILR2)和半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶7(CASP7)基因共29个标签单核苷酸多态位点(htSNP)的基因型，分析基因型与放化疗不良反应之间的关系。基因型与放化疗不良反应的关联分析采用非条件Logistic回归模型。结果:362例患者接受全直肠系膜切除手术后，行照射总剂量为50 Gy、化疗方案为卡培他滨单药的同步放化疗。106例(29.3%)发生≥2级骨髓抑制，FAS rs1468063 ( OR＝1.51，95% CI为1.07～2.15， P＝0.020)、APAF1 rs11296996( OR＝0.69，95% CI为0.49～0.98， P＝0.039)、BAX rs4645904( OR＝0.69，95% CI为0.50～0.97， P＝0.030)与该不良反应发生有关。161例(44.5%)患者发生≥2级的腹泻，APAF1 rs11296996( OR＝1.42，95% CI为1.02～2.00， P＝0.040)和rs74619561( OR＝2.16，95% CI为1.27～3.68， P＝0.005)、CASP7 rs12263370( OR＝1.67，95% CI为1.05～2.66， P＝0.029)和rs12247479( OR＝1.85，95% CI为1.12～3.08， P＝0.017)、TRAIL rs112822654 ( OR＝0.68，95% CI为0.48～0.96， P＝0.027)与该不良反应发生有关。其余位点与直肠癌放化疗不良反应的发生无关(均 P>0.05)。直肠癌患者的性别与中重度骨髓抑制的发生有关( P＝0.046)；手术方式、病灶距齿状线距离与中重度腹泻的发生有关(均 P<0.001)，也与中重度放射性皮炎的发生有关(均 P<0.05)。 结论:凋亡通路相关基因FAS、APAF1、BAX、TRAIL和CASP7遗传变异与直肠癌患者接受术后同步放化疗不良反应的发生有关，可能作为直肠癌个体化治疗的潜在遗传生物标志物。

目的:探讨焦亡通路关键基因的遗传变异与直肠癌患者术后同步放化疗不良反应的关系。方法:抽取2005年1月至2015年6月中国医学科学院肿瘤医院347例Ⅱ~Ⅲ期直肠癌患者术后同步放化疗治疗前的外周血，提取DNA，采用Sequenom MassARRAY方法检测焦亡通路中的黑色素瘤缺乏因子2(AIM2)、半胱天冬酶1(CASP1)、CASP4、CASP5、CASP11、消皮素D (GSDMD)、消皮素E(GSDME)和含Nod样受体家族pyrin域蛋白3(NLRP3)共8个关键基因的43个标签单核苷酸多态(htSNP)的基因分型，采用非条件logistic回归模型分析htSNP基因型与直肠癌患者术后同步放化疗不良反应发生的关系。结果:347例患者术后接受持续5周的术后同步放化疗，发生中重度骨髓抑制101例(29.1%)，发生中重度腹泻156例(45.0%)，发生中重度放射性皮炎66例(19.0%)。手术方式、病灶距齿状线距离与直肠癌患者术后同步放化疗发生中重度腹泻和放射性皮炎有关(均 P<0.01)。CASP4基因的rs11226565( OR＝0.41，95% CI：0.21~0.79)、rs579408( OR＝1.54，95% CI：1.03~2.29)和rs543923( OR＝0.63，95% CI：0.41~0.98)3个遗传变异位点与中重度骨髓抑制发生有关；CASP11 rs10880868( OR＝0.55，95% CI：0.33~0.91)和GSDME rs2954558( OR＝1.52，95% CI：1.01~2.31)与中重度腹泻发生有关；GSDME rs2237314( OR＝0.36，95% CI：0.16~0.83)、GSDME rs12540919( OR＝0.52，95% CI：0.27~0.99)和NLRP3 rs3806268( OR＝1.51，95% CI：1.03~2.22)与中重度放射性皮炎的发生有关。其余35个htSNP位点与直肠癌患者术后同步放化疗不良反应发生无关(均 P>0.05)。 结论:焦亡通路相关基因CASP4、CASP11、GSDME和NLRP3的遗传变异与Ⅱ~Ⅲ期直肠癌患者术后同步放化疗的不良反应发生有关，可能是直肠癌个体化治疗的潜在遗传标志物。

目的:探究前纤维蛋白-1（profilin-1，PFN1）基因单核苷酸变异与脑卒中后偏瘫继发骨质疏松症（osteoporosis, OP）的相关性及其对骨代谢指标的影响。方法:选择2019年1月至2023年6月于临沂市中心医院就诊并治疗的120例脑卒中后偏瘫患者作为研究对象，分为骨质疏松组和非骨质疏松组。检测所有患者的25-经维生素D[25-（OH）D]、抗酒石酸酸性磷酸酶（tartrate resistant acid phosphatase，TRAP）、骨钙素（bonegla protein，BGP）、血清I型前胶原氨基端延长肽（type I procollagen amino ends lengthen the brain，P1NP）和I型胶原基端 β特殊序列（type I collagen terminal β special sequence， β-CTX）水平。对PFN1基因中的2个标签基因单核苷酸多态性（rs6559、rs78224458）进行了基因分型。 结果:骨质疏松组和非骨质疏松组的血清25-（OH）D、TRAP、P1NP和 β-CTX水平比较差异有统计学意义（ P=0.001、0.002、0.004、0.009）。骨质疏松患者和非骨质疏松患者的PFN1基因rs6559位点GG、GA、AA基因型分布比较差异有统计学意义（ P=0.002）。相加模型显示，相较于GG基因型携带者，GA和AA基因型携带患者继发骨质疏松的风险分别增大3.250和5.417倍；显性模型结果表明，相较于携带GG基因型的患者，携带突变基因（GA或AA）患者继发骨质疏松的风险增大3.792倍；隐性模型结果显示，相较于GG与GA携带患者，AA基因型患者继发骨质疏松的风险增大3.810倍。骨质疏松患者和非骨质疏松患者的PFN1基因rs78224458位点TT、TC、CC基因型分布、遗传模型和等位基因频率比较差异无统计学意义（ P=0.320）。不同PFN1基因rs6559位点GG、GA、AA基因型患者的P1NP、 β-CTX水平比较差异有统计学意义（ P=0.004、0.006）。 结论:PFN1基因rs78224458位点变异与脑卒中后偏瘫患者继发骨质疏松有关，并可能影响患者的骨代谢指标。

目的:探讨Toll样受体4( TLR4)基因单核苷酸多态性(SNPs)是否与中国汉族人群原发性开角型青光眼(POAG)有关联。 方法:采用病例对照关联研究设计，2014年5月至2018年3月在四川省人民医院收集样本数据，选取799例POAG患者及799名正常对照，用单碱基延伸法(SNaPshot)对已报道的 TLR4基因的2个标签SNPs位点rs4986790和rs4986791进行基因分型。 χ2检验用于评估2个SNPs的基因型和等位基因频率。 结果:等位基因关联分析显示，在POAG病例组和正常对照组之间 TLR4基因SNP位点rs4986790( P＝0.317)和rs4986791( OR＝1.000，95% CI＝0.062 5～16.002 2， P＝1.000)的等位基因分布中未检测到显著关联。在病例组与对照组之中对这2个SNPs进行条件分析，未显示出基因型和等位基因频率的显著差异。在4种不同的遗传模型下，包括纯合子、杂合子、显性和隐性模型，同样未检测到2个SNPs与POAG的关联。 结论:TLR4基因的SNPs位点rs4986790和rs4986791与中国汉族人群的POAG无关。

目的 探究不同生态类型菘蓝Isatis tinctoria表型差异和特异位点扩增片段测序(specific-locus amplified fragment sequencing,SLAF-seq)分子标记.方法 以25个不同生态类型菘蓝为研究对象,利用SLAF-seq技术开发SLAF标签,再结合菘蓝叶片叶表观特征的田间观测,分析不同生态类型菘蓝植株表观差异.结果 测序后各样品所获得的读长总量各不相同,测序质量值Q30为95.66％～96.60％,GC比例为38.13％～41.37％.共开发535 105个菘蓝SLAF标签,多态性SLAF标签有34 412个,共得到63 002个群体单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记.测序分析结果与叶表观特征调查结果相结合,可以将25个不同生态类型菘蓝分为5类,分别为倒卵圆形无缺刻皱缩叶、倒卵圆形缺刻皱缩叶、倒卵圆形无缺刻平坦叶、倒卵圆形缺刻平坦叶、披针形无缺刻平坦叶.结论 为后期进一步研究不同类型菘蓝的基因来源和遗传进化提供参考,为菘蓝种质分类、品种鉴定和分子辅助育种提供借鉴.

目的 探讨髓样分化因子88(myeloid differentiation factor 88,MyD88)和Toll样受体衔接分子1(Toll-like receptor adaptor molecule 1,TICAM1)基因的单核苷酸多态性及其交互作用与儿童社区获得性肺炎(community-acquired pneumonia,CAP)的相关性.方法 前瞻性采用改良多重高温连接酶检测反应技术对2015年8月—2017年9月在延安大学医学院第二附属医院儿科就诊的375例CAP患儿和306例健康体检儿童的MyD88和TICAM1基因的9个标签位点进行分型,并采用logistic回归分析评价各位点基因型及其交互作用与儿童CAP的关联.结果 TICAM1基因rs11466711T/C位点多态性与儿童CAP易感性密切相关(P<0.05);rs35747610G/A位点AA基因型可显著降低CAP患儿并发脓毒症的风险(P<0.05);rs6510826G/A位点AA基因型与CAP患儿急性期C反应蛋白水平的增高显著关联(P<0.05).MyD88基因rs7744A/G位点GG基因型能显著增加患儿发生呼吸衰竭和循环衰竭的风险(均P<0.05).MyD88基因rs7744A/G位点与TICAM1基因的rs11466711T/C、rs2292151G/A、rs35299700C/T和rs35747610G/A位点之间存在多个与儿童CAP易感性、严重程度及并发脓毒症风险显著关联的相乘交互作用模式(均P<0.05).结论 MyD88和TICAM1基因多态性及其交互作用与儿童CAP密切相关,对儿童CAP的发生及病情发展具有协同作用.

目的 新近研究发现,FKBP5影响精神性疾病的发生,但尚未知其对甲基苯丙胺使用障碍(MAUD)的影响及神经生物学机制.本研究将从临床样本-细胞-模式动物3个层次研究FKBP5在MAUD中的作用,新机制新靶点的发现将为MAUD临床治疗策略的制定提供理论依据.方法 对282名甲基苯丙胺(MA)使用者和170名健康受试者的外周血细胞进行FKBP5 单核苷酸多态性(SNP)检测,寻找危险等位基因;细胞水平上,利用FKBP5 rs1360780 CC/TT人诱导型多能性干细胞(hiPSC)来源的多巴胺能神经元,研究FKBP5表达量高低对多巴胺能神经元功能的影响及对MA的反应特征;小鼠水平上通过行为敏化模型,明确多巴胺能神经元中FKBP5对MAUD的影响.结果 FKBP5 SNP rs1360780T-rs3800373C-rs9296158A-rs9470080T 是MAUD易感和严重程度相关的危险标签SNP.FKBP5 rs1360780 CC/TT hiPSC均可向多巴胺能神经元分化,分化比例无明显差异;但TT型神经元DA分泌能力降低,电活动降低.MA作用的TT型神经元的电活动表现为不敏感,易失代偿.成功建立多巴胺能神经元条件敲除FKBP5的模型小鼠(FKBP5flox/flox;DAT-Cre+/-),MA作用的行为敏化模型结果显示特异性敲除多巴胺能神经元中FKBP5后,抑制了小鼠行为敏化的形成与点燃.结论 FKBP5可能通过下调多巴胺能神经系统功能参与了MAUD形成的病理生理过程.

目的 分析参与多不饱和脂肪酸代谢的FADS1和FADS2基因单核苷酸多态性(SNPs)与中国汉族孤独症谱系障碍(ASD)患儿的相关性.方法 采用病例对照的研究方法,收集病例和对照各243例,采集外周血并提取DNA.利用人类基因库数据和Haploview 4.2软件筛选FADS1和FADS2基因的标签SNPs,采用Sequenom Mass ARRAY系统对SNPs进行基因分型,采用Logistic回归分析标签SNPs与ASD发病风险之间的关联.结果 病例组和对照组儿童FADS2基因的rs526126等位基因频率和基因型频率差异有统计学意义[G等位基因OR=0.54(0.41～0.72),G/G基因型OR=0.05(0.02～0.19),P均＜0.001].结论 FADS2基因可能与中国汉族儿童ASD发病风险存在关联性.

目的:分析姜黄表达序列标签(EST)中简单重复序列(SSR)位点的分布特点,开发近缘种广西莪术EST-SSR引物,探讨EST-SSR用于进行广西莪术遗传多样性分析及分子育种的可行性.方法:下载NCBI中公布的姜黄EST 12 678条,利用SSR-FINDER搜索SSR位点,筛选符合条件的序列,采用Primer 5.0设计SSR引物,挑选30个表现型差异较大的广西莪术种质进行引物有效性及多态性检测,对50份广西莪术种质进行遗传多样性分析.结果:12 678条EST序列含有SSR位点1 243个,其中二核苷酸出现频率为50.36％,三核苷酸31.54％,四核苷酸10.30％,以AT/TA和CT/GA出现频率最高.利用Primer 5.0设计引物共325对,聚合酶链式反应(PCR)检测表明,104对引物可以扩增出理想PCR产物,在至少30份不同种质广西莪术中检测到48对SSR引物具有多态性,占设计引物的38.09％.遗传多样性分析研究,聚类分析结果表明50份广西莪术种质在相关系数0.7处,聚类为2类,遗传相似性系数变化范围较窄.结论:姜黄EST资源中含有高频率的SSR位点,且EST-SSR标记开发效率较高.本研究开发了48对广西莪术EST-SSR标记,并筛选出富含SSR位点的候选序列,用聚类图验证了植物之间的亲缘关系,为广西莪术遗传多样性分析和分子育种研究提供参考.

目的 探讨老年小细胞肺癌(SCLC)患者谷胱甘肽合成酶(GSS)基因遗传变异与铂类药物化疗效果及预后的关系.方法 使用dbSNP数据库和千人基因组计划数据库筛选中国汉族且在该院接受铂类药物化疗的451例老年SCLC患者GSS基因4个标签单核苷酸多态位点(htSNP)的基因型,Logistic回归分析和Cox模型分析其遗传变异与铂类药物化疗效果和患者总生存时间的关系.结果 451例患者中化疗有效327例,无效124例,有效率72.51%.位于GSS基因3'近基因区的rs836632位点与铂类药物化疗效果有关,携带C等位基因的化疗效果明显低于携带T等位基因的患者,差异有统计学意义(P<0.05),化疗无效的发生率明显增加1.39倍;而rs3136185、rs8376881、rs3384795 htSNP位点化疗效果差异无统计学意义(P>0.05).携带rs8376881 GG、GA、AA基因型的SCLC患者生存时间之间差异有统计学意义(P<0.01),携带A等位基因的SCLC患者总生存时间明显短于G等位基因,死亡风险明显增加;携带rs836632 TT、TC、CC基因型的SCLC患者生存时间之间差异有统计学意义(P<0.01),携带C等位基因的SCLC患者总生存时间明显短于T等位基因,死亡风险明显增加.携带rs3136185、rs3384795 htSNP位点与SCLC患者化疗后总生存时间之间无明显相关性(P>0.05).携带不同风险等位基因数量患者总生存时间之间差异有统计学意义(P<0.01),随着携带风险等位基因数量增加,患者死亡风险明显增加.结论 GSS基因遗传变异位点rs836632是影响老年SCLC患者铂类药物化疗效果的独立因素,rs8376881、rs836632位点遗传变异影响患者总生存时间,可作为预测铂类药物化疗预后的重要标志物.