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粪便钙卫蛋白和嗜酸性粒细胞源性神经毒素在非IgE介导的食物过敏中的意义
编辑人员丨1周前
非IgE介导的食物过敏多在接触致敏食物后数小时到数天出现腹泻、黏液便、血便、反流、呕吐等消化道症状。其发病机制可能与食物过敏原激活肠道T细胞分泌TNF-α、IL-4等促炎细胞因子,导致中性粒细胞和嗜酸性粒细胞向肠腔迁移,引起肠道炎症反应、造成肠道通透性增加有关。目前尚无快速特异的诊断方法,主要根据临床表现结合食物回避及口服食物激发试验诊断。近年来粪便生物标志物作为判断肠道炎症的特异性指标广泛应用于肠道感染、炎症性肠病等疾病的辅助诊断和病情评估,但在胃肠道过敏性疾病中的应用报道甚少。该文将重点阐述粪便钙卫蛋白、粪便嗜酸性粒细胞源性神经毒素在非IgE介导的食物过敏中的意义。
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编辑人员丨1周前
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挥发性有机化合物在艰难梭菌感染快速检测中的应用进展
编辑人员丨1周前
艰难梭菌感染(clostridium difficile infection,CDI)是社区和医院较常见的病原菌感染之一,可导致不同程度的腹泻、假膜性肠炎,是全球性的公共健康问题。CDI现有诊断依赖于患者粪便中艰难梭菌(clostridium difficile,CD)相关毒素或毒素编码基因的鉴定,这些传统的细菌学技术具有一定的局限性,可能延误疾病诊疗。研究发现CD有一种特殊的"马粪样"臭味,这种特殊气味来自CD挥发性有机化合物(volatile organic compounds,VOCs)。近年来,越来越多的研究将人体呼气、血液、尿液和粪便中的VOCs作为潜在的非侵入性诊断生物标志物用于感染性疾病和消化道等多种疾病诊断。研究发现,CD的VOCs有助于CDI的快速诊断,其具有潜在的特征性VOCs成分。该文就VOCs及其在CDI快速检测中的应用进行综述。
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编辑人员丨1周前
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肺结核患者与健康人群肠道菌群差异及其生物标志物的比较研究
编辑人员丨1周前
目的:分析活动性肺结核患者与健康对照者肠道菌群在物种组成、丰度上的差异,识别并评估特定菌群作为生物标志物区分两组人群的潜能。方法:以2017年9月至2019年9月在四川、江苏、上海3个市区级结核病定点医疗机构收治的活动性肺结核患者88例为病例组,其中男65例,女20例,年龄(44.2±15.7)岁。同期在当地体检人群中招募无结核病史的健康人62名为对照组,其中男33名,女29名,年龄(41.4±11.9)岁。采用16S rRNA基因测序技术检测两组人群的粪便样本,分析两组研究对象肠道菌群的多样性差异,以及门和属水平上的物种组成和丰度差异,采用随机森林方法构建预测模型,探索特定菌群是否可以作为区分结核病患者和健康人群的生物标志物。结果:α多样性分析结果表明,病例组肠道菌群物种丰富度和均匀度低于对照组,差异有统计学意义( P<0.001),两组人群的肠道菌群整体构成差异有统计学意义(基于Bray-Curtis距离, P<0.001)。与对照组相比,病例组肠道菌群中机会致病菌相对富集,而部分产生短链脂肪酸的有益菌丰度较少,由毛螺菌属( Lachnospira)、毛螺菌科ND3007组( Lachnospiraceae ND3007 group)、罗斯拜瑞菌属( Roseburia)3个菌属训练的随机森林分类器判别两组人群的准确率为76.67%,曲线下面积(AUC)=75.29%(95% CI:0.661~0.845)。 结论:活动性肺结核患者与健康人群的肠道菌群存在差异,特定菌群有作为生物标志物区分两组人群的潜能。
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编辑人员丨1周前
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新生儿坏死性小肠结肠炎相关生物标志物的研究进展
编辑人员丨1周前
新生儿坏死性小肠结肠炎(necrotizing enterocolitis,NEC)是一种危及新生儿生命的肠道疾病,早期识别NEC是临床一大难题。尽管临床表现、常规实验室检验及影像学检查对NEC至关重要,但基于对NEC发病机制的理解,近年来越来越多的研究报道NEC相关生物标志物如脂肪酸结合蛋白、细胞因子、肠道菌群等在其预测、早期诊断、严重度评估、预后方面具有潜在价值。该文从血液、尿液、粪便三方面对近年研究较多的与NEC相关的生物标志物进行综述,以指导临床应用。
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编辑人员丨1周前
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粪便宏基因组学在结直肠癌早期筛查中的应用前景
编辑人员丨1周前
近年来,我国结直肠癌发病率和死亡率逐年上升,结直肠癌的早期筛查与早诊早治是遏制该趋势的有效措施。目前普遍应用的结直肠癌筛查手段还存在一定的局限性。肠道微生态在结直肠癌的发生发展中发挥重要的作用,通过粪便检测基于宏基因组学的微生物标志物有望成为结直肠癌早期筛查的新型无创检测手段。本文综述了粪便宏基因组学在结直肠癌早期筛查中多种微生物标志物的研究进展及其应用前景。
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编辑人员丨1周前
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不同炎症类型支气管哮喘患者肠道菌群差异探索性分析
编辑人员丨1周前
目的:通过宏基因组分析观察不同炎症类型哮喘患者肠道菌群的特点和差异。方法:选取2021年8月1日至2022年8月31日期间在北京大学第三医院呼吸内科就诊且主要诊断为哮喘的≥18岁成人作为研究对象。最终纳入病情稳定的哮喘患者29例,男13例、女16例,年龄(63±15)岁。留取新鲜粪便标本,提取粪便DNA进行肠道菌群16sRNA高通量测序,比较不同分组哮喘患者肠道菌群的多样性及群落结构,通过物种随机森林和LEfSe分析物种间差异。结果:不同炎症类型哮喘患者存在性别差异,中性粒细胞性哮喘患者中女性患者占比更高( χ2=4.14, P=0.042)。不同炎症类型哮喘患者肠道菌群Alpha多样性无明显组间差异,但微生物组间存在明显差异,中性粒细胞性哮喘患者芽孢杆菌目( Bacillales)( P=0.029)、颤螺菌科( Oscillospiraceae)( P=0.015)相对丰度更高,在物种LEfSe分析中,嗜酸粒细胞性哮喘患者真菌(Fungi)相对丰度更高。 结论:不同炎症类型哮喘患者肠道菌群微生物存在组间差异,真菌是区分嗜酸粒细胞性哮喘和中性粒细胞性哮喘患者肠道菌群差异的生物标志物。
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编辑人员丨1周前
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基于16S rRNA基因测序的寻常型银屑病患者肠道菌群差异研究
编辑人员丨1周前
目的:研究成年寻常型银屑病患者和健康人群之间肠道微生物的差异。方法:采集2017年9月至2018年2月于中国医学科学院皮肤病医院确诊的22例寻常型银屑病患者和23例健康对照者粪便样本,提取肠道菌群总DNA扩增,并采用二代16S rRNA基因靶向测序技术测序,分析菌群多样性及菌群分布。对照Silva数据库进行物种注释及分类,采用秩和检验分析各层级样本物种差异;采用QIIME软件(Version 1.9.1)计算OTU数目及α多样性主要指数(Chao1指数、Shannon指数和Simpson指数), t检验分析指数差异;PCoA分析反映样本β多样性差异,置换多元方差分析两组群落组成结构差异;秩和检验及LEfSe分析评估物种差异。 结果:银屑病组OTU数目(147.55 ± 57.07)与健康对照组(148.96 ± 50.45)比较,差异无统计学意义( t = 0.088, P = 0.930)。银屑病组Shannon指数(4.08 ± 0.80)、Chao1指数(169.52 ± 63.17)、Simpson指数(0.87 ± 0.07)与健康对照组(分别为4.11 ± 0.94、175.36 ± 53.59、0.86 ± 0.90)比较,差异均无统计学意义( t = 0.12、0.34、0.27,均 P > 0.05)。PCoA分析银屑病组与健康对照组的第一主成分差异为49.8%,第二主成分差异为15.62%,置换多元方差分析显示两组间β多样性差异有统计学意义( P = 0.011)。银屑病组与健康对照组有差异的菌群包括在银屑病组中显著升高的厚壁菌门、梭菌纲、梭菌目,丹毒丝菌目、丹毒丝菌科,健康对照组中显著升高的艾普西隆变形杆菌纲、弯曲杆菌目、弯曲杆菌科、弯曲杆菌属,拟杆菌目、拟杆菌科。 结论:寻常型银屑病患者与健康人的肠道菌群存在一定差异,肠道菌群有可能成为寻常型银屑病的潜在生物标志物。
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编辑人员丨1周前
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微小RNA-92a在结直肠癌患者血清、肿瘤组织和粪便中的表达及其临床意义
编辑人员丨1周前
目的:分析血清、肿瘤组织和粪便样本中微小RNA(miRNA,miR)-92a在结直肠癌患者中的表达及意义。方法:选取45例结直肠癌患者作为实验组,同期45例健康体检人群为对照组,分别检测两组血清、肿瘤与癌旁组织、粪便样本中miR-92a的表达量,通过实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)定量,对表达量结果进行差异统计学分析,临床特征与肿瘤样本的表达量的分析,临床特征与miRNA表达量相关性。结果:miR-92a在肿瘤组与正常对照对比表达有统计学意义,肿瘤组表达均高于正常组,其中肿瘤组织中的miRNA表达量明显高于血液和粪便(血液样本中: t=28.88, P<0.001,肿瘤组织样本: t=22.78, P<0.001,粪便样本: t=15.97, P<0.001)。血清、肿瘤组织与淋巴结转移、浸润深度、TNM分期和分化程度表达呈正相关,粪便样本仅与分化程度正相关,血液样本比淋巴结转移( r=0.674),血液样本比TMN分期( r=0.691),血液样本比浸润深度( r=0.715),血液样本比分化程度( r=0.648),肿瘤组织比淋巴结转移( r=0.494),肿瘤组织比TMN分期 r=0.526,肿瘤组织比浸润深度( r=0.486),肿瘤组织比分化程度( r=0.545),粪便组织比分化程度( r=0.495)。粪便组织比淋巴结转移( r=0.258),粪便组织比TMN分期( r=0.226),粪便组织比浸润深度( r=0.341, P>0.05)。 结论:粪便、血浆、组织样本中可检测的miR-92a作为临床生物标志物具有可行性。
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编辑人员丨1周前
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肠道菌群联合血清肿瘤相关物质在鉴别诊断近端结肠癌中的应用
编辑人员丨1周前
目的:探索不同部位结直肠癌肠道菌群的差异以及特征菌联合肿瘤标志物在近端结肠癌中的鉴别效能。方法:病例对照研究。选取2019年5月至2022年7月在安阳市肿瘤医院普外科确诊的结直肠癌(CRC)85例和结直肠腺瘤(CRA)患者8例,根据原发部位CRC又分为近端结肠癌组(PC)22例、远端结肠癌组(DC)15例和直肠癌组(RC)48例。肠道准备前采集患者血液和粪便样本分别进行肿瘤标志物检测和16S rDNA基因测序。采用SPSS(27.0.1)软件进行单因素方差分析、Mann-Whitney U检验、Kruskal-Wallis H检验或χ 2检验比较组间差异,并利用SPSS对肿瘤标志物、特征菌分别进行单独和联合绘制鉴别PC的受试者工作特征(ROC)曲线。 结果:PC组、DC组、RC组和CRA组进行组间比较,糖类抗原125(CA125)、CA72-4以及血清肿瘤相关物质(TAM)差异有统计学意义( F=3.543, P<0.05; F=3.596, P<0.05; F=5.787, P<0.01)。其中PC组的CA125水平和CA72-4水平高于RC组[PC组比RC组,(36.84±6.30)kU/L比(12.73±4.21)kU/L, P<0.01;PC组比RC组,(45.56±10.86)kU/L比(3.30±7.63)kU/L, P<0.01],PC组的TAM水平高于RC组和CRA组[PC组比RC组,(124.84±5.19)U/ml比(102.44±3.63)U/ml, P<0.001;PC组比CRA组,(124.84±5.19)U/ml比(95.39±8.42)U/ml, P<0.01]。LEfSe分析显示PC组的特征菌包括拟杆菌科、奈瑟菌科、梭菌科和螺旋体科等。TAM联合拟杆菌科鉴别诊断PC的曲线下面积最大,为0.845(95% CI 0.747~0.944),敏感度为0.857,特异度为0.815。 结论:不同部位CRC以及CRA间的肠道菌群组成具有异质性,肠道菌群联合肿瘤标志物在区分近端结肠癌中具有良好的鉴别效能。
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编辑人员丨1周前
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结直肠癌标志物粪便检测的研究现状
编辑人员丨1周前
结直肠癌(CRC)标志物粪便检测主要有以下4种方法:粪便隐血试验、粪便DNA检测、粪便微小RNA检测、粪便具核梭杆菌(Fn)检测。免疫法粪便隐血试验已经被国内外专家共识推荐作为CRC筛查的首选方法。由于粪便DNA检测费用偏高,目前国内尚未进行大样本的人群筛查,被推荐为CRC筛查的第二级检查。粪便微小RNA检测逐渐受到学者的重视。近年来,粪便微生物标志物检测越来越热门,特别是粪便Fn检测,有望成为CRC筛查的微生物指标。
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编辑人员丨1周前