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PCR荧光探针技术对结核分枝杆菌复合群及利福平耐药性检测性能的评价
编辑人员丨1天前
目的:评价PCR荧光探针技术检测痰液样本中结核分枝杆菌复合群(Mycobacteriumtuberculosis complex,MTBC)和利福平耐药性效果,为进一步开展"结核分枝杆菌复合群及利福平耐药核酸检测试剂盒"多中心临床试验提供可行性研究数据.方法:采用前瞻性研究方法,参照入组标准收集2021年12月至2022年8月上海市3家结核病定点医院肺科门诊就诊的205例初诊疑似肺结核患者的3份痰液样本(即时痰、夜间痰、晨痰),分别进行痰涂片、BACTEC MGIT 960(MGIT 960)、GeneXpert MTB/RIF(Xpert)和 PCR 荧光探针法检测,评价 PCR 荧光探针法对痰液样本中MTBC及利福平耐药性的检测效能.另对随机选取同期上海市疾病预防控制中心结核病实验室菌株库中保存的96株MTBC临床菌株(包括利福平表型耐药菌株47株和利福平表型敏感菌株49株)分别进行PCR荧光探针法和Xpert检测利福平耐药性,分析两种检测方法对利福平耐药相关基因突变的检出情况.结果:205例疑似肺结核患者中,PCR荧光探针法对MTBC的检出率为22.44%(46/205),与MGIT 960[21.95%(45/205)]、Xpert[20.98%(43/205)]和痰涂片[16.10%(33/205)]的差异均无统计学意义(x2=0.014,P=0.904;x2=0.129,P=0.719;x2=2.650,P=0.104).以临床诊断为参照标准,PCR 荧光探针法、Xpert、MGIT 960 和痰涂片检测 MTBC 的敏感度(95%CI)分别为 48.10%(36.93%~59.56%)、48.10%(36.93%~59.56%)、50.63%(39.23%~61.97%)和 40.51%(29.79%~52.15%),特异度(95%CI)分别为 93.65%(87.47%~97.12%)、96.03%(90.52%~98.53%)、96.03%(90.52%~98.53%)和 99.21%(95.01%~99.96%),一致率分别为76.10%(156/205)、77.56%(159/205)、78.54%(161/205)和 76.59%(157/205),Kappa 值分别为 0.453、0.482、0.507和0.446.PCR荧光探针法检测痰液样本中MTBC的涂阴和极低级别阳性样本的检出率[10.73%(19/177)]与Xpert检测结果[8.47%(15/177)]的差异无统计学意义(x2=0.793,P=0.373).PCR荧光探针法在检出MTBC的46份样本中同时检出6份样本发生利福平耐药基因突变,突变率为13.04%(6/46);而Xpert在检出MTBC的43份样本中仅同时检出1份样本发生利福平耐药基因突变,突变率为2.33%(1/43).在96株临床菌株中,两种分子检测方法均检测到56株菌株发生利福平耐药基因突变,除2株探针突变类型不一致外,其他探针突变类型均一致,且多发生在probe E(529~533)和FAM通道(531/533突变).结论:以临床诊断为参照标准,PCR荧光探针法检测MTBC的效能与MGIT 960、Xpert和痰涂片基本相当,且与Xpert检测MTBC临床菌株的利福平耐药性效果一致,认为PCR荧光探针法不仅是一种等同于Xpert检测功能的新技术,还具有操作简单、价格低于Xpert、真正实现一体化和全封闭等优势.建议在临床推广过程中进一步优化PCR荧光探针法以提高MTBC检出率,并开展多中心临床试验验证研究.
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编辑人员丨1天前
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血液恶性肿瘤并发重症肺部感染患者病原菌检出特点及耐药性分析
编辑人员丨1天前
目的:探究血液恶性肿瘤并发重症肺部感染患者病原菌分布特征与耐药性.方法:前瞻性选取 2019 年 10 月—2022 年 10 月晋江市医院收治的 209 例血液恶性肿瘤并发重症肺部感染患者,采集其痰液行细菌培养与药敏试验,探究 209 例患者的病原菌检出情况、耐药性.结果:209 例血液恶性肿瘤并发重症肺部感染患者总计分离出病原菌 218 株,其中革兰阴性菌检出 116 株,占比 53.21%(116/218);以 46 株(21.10%)大肠埃希菌、35 株(16.06%)鲍曼不动杆菌、17 株(7.80%)肺炎克雷伯菌、14 株(6.42%)铜绿假单胞菌多见;革兰阳性菌共检出 89 株,占比 40.83%(89/218),以 41 株(18.81%)粪肠球菌、26 株(11.93%)金黄色葡萄球菌、18 株(8.26%)肺炎链球菌常见;真菌共检出 13 株,占比5.96%(13/218);主要革兰阴性菌对阿米卡星(AMK)、头孢唑林(CFZ)、头孢曲松(CRO)、氨苄西林(AM)、头孢呋辛(CXM)、氨曲南(ATM)、头孢他啶(CAZ)、环丙沙星(CIP)、复方新诺明(SMZ-TMP)、左氧氟沙星(LVX)耐药率高,对厄他培南(ETP)、庆大霉素(GEN)、妥布霉素(TOB)、亚胺培南(IPM)、头孢吡肟(FEP)、四环素(TE)、头孢哌酮(CFP)、美罗培南(MEM)耐药率低;主要革兰阳性菌对TE、CIP、庆大霉素(GM)、青霉素(PEN)、LVX、苯唑西林(OX)、AMP、克林霉素(CM)、莫西沙星(MXF)耐药率高,对呋喃妥因(NFT)、万古霉素(VAN)、利福平(RIF)、替加环素(TGC)、替考拉宁(TEC)、利奈唑胺(LNZ)耐药率低.结论:血液恶性肿瘤并发重症肺部感染患者感染的致病菌以革兰阴性菌为主,而多种病原菌的耐药性均处在较高水平,对此临床需予以高度关注.
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致关节感染皮疽诺卡菌的耐药表型及全基因组测序分析
编辑人员丨1天前
目的:对临床分离的致关节感染的两株皮疽诺卡菌( Nocardia farcinica)进行全基因组测序并分析其耐药性。 方法:2020年1月收集两株导致老年患者膝关节感染的皮疽诺卡菌菌株,采用全基因组测序对细菌进行鉴定,根据CLSI M24推荐的微量肉汤稀释法和E-test法进行药物敏感性分析,通过ABRicate工具比对获得性耐药和毒力基因,Snippy等生物信息学工具进行同源性等基因特征分析。结果:本研究的临床分离株均为皮疽诺卡菌,对头孢曲松、头孢吡肟、头孢噻肟、甲氧苄氨嘧啶/磺胺甲噁唑(TMP/SMX)耐药,对亚胺培南、利奈唑胺和含有酶抑制剂类抗生素阿莫西林/克拉维酸敏感。携带A类β内酰胺酶基因 far-1、RNA聚合酶结合蛋白基因 RbpA、多耐药外排泵转录激活因子基因 MtrA和调节转录因子基因 vanR-O,分别介导对β内酰胺抗生素、利福平、大环内酯类药物和万古霉素的耐药性。不含有获得性TMP/SMX耐药基因,二氢叶酸还原酶家族基因存在多个错义突变,均携带与结核分枝杆菌同源的 icl、 mbtH、 phoP、 relA毒力基因,SNP同源分析表明两株皮疽诺卡菌具有很近的亲缘关系,两株菌仅存在10个SNP位点、6个复合基因和1段基因缺失变异。 结论:全基因测序技术有助于研究诺卡菌的分子特征和耐药机制;皮疽诺卡菌对TMP/SMX耐药现象需要重视,参与二氢叶酸代谢途径的酶基因突变有可能是TMP/SMX耐药的原因之一。
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编辑人员丨1天前
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内蒙古地区皮肤化脓性感染部位分离的金黄色葡萄球菌耐药及毒力特征研究
编辑人员丨1天前
目的:分析皮肤化脓性感染部位分离的金黄色葡萄球菌(简称金葡菌)耐药、毒力及分子流行病学特征,为临床抗感染用药提供实验依据。方法:收集内蒙古医科大学附属医院2020年5-12月皮肤科住院患者皮肤化脓性感染部位及鼻腔分泌物样本进行细菌分离培养。采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定疑似金葡菌菌落,用微量肉汤稀释法进行药物敏感性试验,PCR扩增金葡菌毒力基因,实时荧光定量PCR检测tsst-1、pvl、hla、clfA 4种毒力基因在不同来源金葡菌菌株中的相对表达量。对金葡菌菌株进行多位点序列分型(MLST)。耐药率及毒力基因检出率比较采用 χ2检验或Fisher确切概率法,计量资料组间比较采用 t检验或曼-惠特尼 U非参数检验。 结果:在210例住院患者中,共分离金葡菌85株,包括皮肤化脓性感染部位54株(病例组),鼻腔部位31株(对照组)。药敏试验结果显示,85株金葡菌中14株为耐甲氧西林金葡菌(MRSA)。85株菌对青霉素耐药率[90.59%(77/85)]最高;对克林霉素和红霉素耐药率分别为60.00%(51/85)、61.18%(52/85),未发现对利福平、万古霉素和利奈唑胺耐药菌株。PCR显示,病例组菌株pvl基因检出率(33.33%,18/54)高于对照组(12.90%,4/31, χ2 = 4.28, P = 0.038)。实时荧光定量PCR显示,对照组菌株clfA相对表达量[3.87(2.30,5.94)]高于病例组[1.63(0.95,2.62), P = 0.007]。85株金葡菌分型共得到17个ST型别,其中主要优势型别为ST398-甲氧西林敏感金葡菌(20/71)和ST22-MRSA(9/14)。ST22-MRSA菌株毒力基因pvl检出率(14/14)明显高于非ST22型MRSA(0, P < 0.001)。 结论:皮肤化脓性感染部位分离的金葡菌对青霉素、克林霉素和红霉素耐药率较高,这些抗生素不应作为临床经验治疗的首选药;皮肤金葡菌感染性疾病发病可能与毒力基因pvl有关;金葡菌鼻腔定植可能与clfA基因有关。
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编辑人员丨1天前
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2020-2022年某三甲妇产科医院多药耐药菌的流行病学及耐药性
编辑人员丨1天前
目的 探讨妇产科患者分离的多药耐药菌(MDRO)的临床分布特点及耐药性,为医院制定有效的防控干预措施和临床合理用药提供依据.方法 采用回顾性分析方法,收集2020年1月-2022年12月复旦大学附属妇产科医院住院患者分离的MDRO菌株,分析MDRO临床感染情况、分布科室、标本来源及耐药性.结果 临床共分离5 257株细菌,其中1 308株MDRO,来自1 168例患者,MDRO检出率为24.88%;其中59株为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)、1 143株为产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)的大肠埃希菌、91株产ESBLs的肺炎克雷伯菌、9株碳青霉烯耐药的大肠埃希菌(CREC)、5株碳青霉烯耐药的肺炎克雷伯菌(CRKP)和1株碳青霉烯耐药的鲍氏不动杆菌(CRAB),未检出耐万古霉素的肠球菌(VRE)和碳青霉烯耐药的铜绿假单胞菌(CRPA);检出MDRO患者,科室分布为:产科(15.24%),妇科(82.96%),新生儿科(1.71%),乳腺科(0.09%);标本来源主要是尿液,分离409株(31.27%),其次是阴道分泌物和宫颈分泌物,分别分离386株(29.51%)、145株(11.09%);1 308株MDRO,经判定分离自584例次(44.65%)的医院感染患者,184例次(14.07%)的社区感染患者和540例次(41.28%)的定植患者;产ESBLs的大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌除对碳青霉烯类、哌拉西林/他唑巴坦、头孢替坦和阿米卡星等药物耐药率较低外,对其他抗菌药物耐药较严重;MRSA对万古霉素、替加环素、利奈唑胺、呋喃妥因和奎奴普丁/达福普汀均敏感,对磺胺甲噁唑/甲氧嘧啶、利福平、莫西沙星等耐药率较低.结论 妇产科医院CRE检出率不高,产ESBLs的大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌是MDRO的主要类型,主要分离自妇科肿瘤患者.可通过对目标患者入院的主动筛查,强化感染防控和抗菌药物的临床管理.
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江苏省233例耐多药/利福平耐药肺结核患者直接经济负担及影响因素研究
编辑人员丨1天前
目的:了解江苏省耐多药/利福平耐药肺结核(MDR/RR-PTB)患者直接经济负担及自付直接费用影响因素。方法:纳入2021年1月1日至2022年12月31日在江苏省13家市级结核病定点医院确诊治疗的MDR/RR-PTB患者,通过调查问卷和医院信息系统获得患者基本信息和直接经济费用。使用逐步多重线性回归分析患者自付直接费用的影响因素。结果:纳入的233例MDR/RR-PTB患者年龄为(44.04±15.64)岁。患者直接医疗费用 M( Q1, Q3)为134 051.00(98 934.01,163 205.73)元,其中医保报销或政策减免费用 M( Q1, Q3)为100 462.10(78 120.00,130 816.00)元,自付费用 M( Q1, Q3)为21 694.62(14 734.83,37 813.00)元。直接非医疗费用 M( Q1, Q3)为4 971.00(3 138.00,7 870.00)元。年龄、户籍所在地、结核病导致与配偶(伴侣)离异/分居、药敏情况和治疗方案是MDR/RR-PTB患者自付直接费用相关的影响因素。 结论:MDR/RR-PTB对江苏省造成的直接经济负担较重。需重视耐药患者的心理疏导与关怀,进一步提高MDR/RR-PTB诊断、治疗和管理水平,切实减轻耐药患者经济负担。
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编辑人员丨1天前
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152例金黄色葡萄球菌血流感染的临床特征及预后分析
编辑人员丨1天前
探讨金黄色葡萄球菌血流感染的临床特征及影响预后的主要危险因素,为临床预防和控制金黄色葡萄球菌血流感染提供参考依据。本研究回顾性分析广东省人民医院2019年1月至2021年12月诊治的152例金黄色葡萄球菌血流感染患者的临床资料,包括基础疾病、临床特点、危险因素、细菌耐药性、治疗药物及预后等临床因素,采用 χ2检验、 t检验等统计学方法对可能影响金黄色葡萄球菌和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)血流感染患者临床特征及预后的相关危险因素进行单因素分析,然后将单变量分析中 P<0.05的变量纳入多因素logistic回归模型分析其预后不良的独立危险因素。结果显示,152例金黄色葡萄球菌血流感染患者中,检出MRSA 50例(32.89%),甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)检出102例(67.11%)。MRSA组留置导尿管、留置引流管、使用碳青霉烯类抗生素、使用β-内酰胺酶抑制剂比率明显高于MSSA组( χ2分别为8.272、11.972、4.998、4.776, P均<0.05)。MRSA组血流感染预后不良发生率高于MSSA组(34.00% vs 13.73%)( χ2=8.495, P<0.05)。在纳入研究的MRSA血流感染患者中尚未发现与预后不良相关的独立危险因素。除对利福平外,MRSA对常用抗菌药物的耐药率均高于MSSA( P<0.05),未发现对万古霉素、利奈唑胺和奎奴普丁/达福普汀耐药株。多因素logistic回归模型分析显示,恶性实体肿瘤( OR=13.576、95% CI:3.352~54.977、 P<0.05)、机械通气( OR=7.468、95% CI:1.398~39.884、 P<0.05)是金黄色葡萄球菌血流感染患者预后不良的独立危险因素。综上,MRSA血流感染的预后不良率高于MSSA。临床上应加强对相关危险因素的评估,采取有针对性的防控干预措施,以改善金黄色葡萄球菌血流感染患者的预后,合理规范抗菌药物的使用,有效控制细菌感染和耐药性的发生。
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老年复治涂阳肺结核患者的临床特征及耐药性特点分析
编辑人员丨1天前
目的:分析复治涂阳肺结核老年患者的临床特征及耐药性特点,为临床治疗提供参考。方法:回顾性分析2017年7月至2019年7月同济大学附属上海市肺科医院结核科收治的复治涂阳肺结核患者100例,以60岁年龄为界限分为老年组(77例)和非老年组(23例),分析并比较两组患者的临床特征,并按照相关规程操作检测12种抗结核药物的敏感性数据,计算耐药率以及比较不同药物的耐药情况。结果:本研究中的100例复治涂阳肺结核患者,男性74例(74.0%)、女性26例(26.0%);并发症以气管支气管结核为主(18.0%)、并发症主要为糖尿病(12.0%);且80.0%以上者接受过1~2次治疗方案。在12种抗结核病药物敏感性测试中,耐药率居于前3位的分别为异烟肼(52.0%、52/100)、利福平(39.0%、39/100)和乙胺丁醇(23.0%、23/100),且老年组对于异烟肼(62.3%、48/77)和利福平(46.8%、36/77)的耐药率显著高于非老年组17.4%(4/23)、13.0%(3/23)( χ2=14.334、8.459, P=0.000、0.004);在耐多药菌谱中,以异烟肼和利福平的组合比例最高,其中也包括含有乙胺丁醇或氧氟沙星的药物组合。比较老年组和非老年组的耐药率结果显示,老年人群的耐药率(67.5%、52/77)显著高于非老年人群(34.8%、8/23)( χ2=10.203, P=0.001),且涵盖耐药谱广泛。 结论:耐多药菌谱的形式具有多样性,了解本地区老年患者群体耐药监测数据有助于以此为基础设计更优化合理的治疗方案,为老年人肺结核的规范化诊治指南的制定及干预措施、防控策略的制定提供依据。
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编辑人员丨1天前
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《世界卫生组织2022儿童与青少年结核病处理指南》的解读
编辑人员丨1天前
2022年9月21日世界卫生组织发布了《世界卫生组织2022儿童与青少年结核病处理指南》,对儿童和青少年结核病提出了新的推荐,包括结核病诊断方法、非重症的药物敏感儿童结核病短程治疗、结核性脑膜炎治疗新方案、含贝达喹啉或德拉马尼方案治疗耐多药/利福平耐药结核病,以及儿童和青少年结核患者发现和预防的综合关怀模式等。现对其关键点进行解读,帮助临床深入理解和进行临床诊治。
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编辑人员丨1天前
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温州市利福平耐药肺结核流行病学特征(2015—2020年)
编辑人员丨1天前
目的:了解2015—2020年温州市利福平耐药肺结核患者的流行病学特征。方法:收集2015—2020年温州市利福平耐药肺结核患者病例资料,并对其采用描述流行病学方法进行分析。结果:温州市2015—2020年利福平耐药肺结核患者512例,男性375例,女性137例,年登记率为0.92/10万,不同年度登记率变化趋势无统计学意义( χ 2趋势=30.00, P=0.224)。利福平耐药患者中以初治患者多见(307例,59.96%),不同年度初治、复治构成比差异具有统计学意义( χ 2趋势=37.97, P<0.001)。地区分布以乐清市、永嘉县、鹿城区和瑞安市多见,分别有80例(15.63%)、75例(14.65%)、70例(13.67%)、65例(12.70%),鹿城区利福平耐药患者占比呈下降趋势( χ 2趋势=8.43, P=0.004),苍南县呈上升趋势( χ 2趋势=6.66, P=0.010)。患者以<40岁和温州市户籍患者为主(45.90%和87.89%)。利福平耐药患者登记的最常见职业是其他及不详,其中家政家务及待业( χ 2趋势=13.74, P<0.001)、学生( χ 2趋势=4.94, P=0.026)占比呈逐年升高趋势。 结论:温州市耐药结核发生率总体平稳,但结核防控形势仍较严峻。
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编辑人员丨1天前
