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miRNA-4469靶向PDIA4基因调控肾癌细胞的增殖和侵袭
编辑人员丨1周前
目的:探讨miRNA-4469(miR-4469)体外调控肾癌细胞增殖和侵袭的机制。方法:基于OncomiR数据库分析miR-4469不同表达水平患者生存差异。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)法检测miR-4469在肾癌细胞株ACHN、OS-RC-2、SK-RC-20、769-P、A498和正常肾小管上皮细胞株HK-2中的表达,将miR-4469表达水平最低的肾癌细胞分为miR-4469组和对照组,分别转染miR-4469模拟物和阴性对照序列。采用CCK-8法检测两组细胞增殖能力(以吸光度值表示),采用Transwell实验分析两组侵袭细胞数。应用TargetScan Release 8.0软件预测miR-4469与蛋白二硫化物异构酶A4(PDIA4)mRNA的结合位点,采用双荧光素酶报告基因实验验证miR-4469与PDIA4 mRNA的靶向关系。采用qRT-PCR法检测各组细胞PDIA4 mRNA的表达量,采用蛋白质印迹法检测各组细胞PDIA4蛋白和PI3K-AKT-m-TOR通路蛋白表达水平。结果:分析OncomiR数据库相关数据显示,miR-4469高表达肾癌患者的总生存优于miR-4469低表达患者( P<0.001)。各肾癌细胞株中miR-4469的相对表达量均低于HK-2细胞(均 P<0.05),其中769-P细胞miR-4469表达量最低,选取769-P细胞进行后续实验。miR-4469组769-P细胞增殖能力低于对照组( P<0.01)。miR-4469组769-P细胞侵袭数少于对照组[(19± 3)个比(64±7)个, t=5.44, P=0.002]。与共同转染野生型PDIA4和miR-4469阴性序列组相比,共同转染野生型PDIA4和miR-4469模拟序列组细胞相对荧光素酶活性低(0.42±0.07比1.01±0.08, t=5.74, P=0.001);共同转染突变型PDIA4和miR-4469阴性序列组与共同转染突变型PDIA4和miR-4469模拟序列组间细胞相对荧光素酶活性差异无统计学意义(0.99±0.11比1.02±0.11, t=0.19, P=0.001)。miR-4469组769-P细胞PDIA4 mRNA相对表达量低于对照组[0.98±0.23比7.19±2.23, t=2.77, P=0.032]。与对照组相比,miR-4469组769-P细胞PDIA4蛋白和PI3K-AKT-m-TOR通路相关的p-PI3K、p-AKT、p-mTOR、p-SGK1蛋白表达量均低(均 P<0.05)。 结论:miR-4469与肾癌患者生存可能有相关性,其在各肾癌细胞株中表达均下调。miR-4469可能通过PDIA4调节PI3K-AKT-m-TOR通路,从而抑制肾癌769-P细胞增殖和侵袭。
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编辑人员丨1周前
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PDIA3Ab与自身免疫甲状腺炎孕妇流产风险的关系研究
编辑人员丨1周前
目的:探究蛋白质二硫化物异构酶A3抗体(protein disulfide isomerase A3,PDIA3Ab)与自身免疫甲状腺炎(autoimmune thyroiditis,AIT)孕妇流产风险的关系。方法:选择2018年5月至2020年5月江苏省海安市人民医院收治的127例AIT孕妇,根据其是否发生流产分为未流产组(n=67)与流产组(n=60),比较两组临床资料及血清PDIA3Ab滴度,采用Spearman相关分析血清PDIA3Ab滴度与AIT孕妇流产的相关性,采用Logistic回归分析AIT孕妇流产的影响因素,采用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)分析血清PDIA3Ab滴度预测AIT孕妇流产的价值。结果:流产组与未流产组患者年龄、孕周、体质量指数、吸烟史、饮酒史及血清游离甲状腺素(free thyroxine,FT4)、促甲状腺激素(thyroid stimulating hormone,TSH)、甲状腺过氧化物酶抗体(thyroid peroxidase antibody,TPOAb)甲状腺球蛋白抗体(thyroglobulin antibody,TgAb)TPOAb、水平差异无统计学意义( P值均>0.05);流产组PDIA3Ab滴度较未流产组高[(53.49±18.77)IU/mL比(38.36±12.60)IU/mL; t=5.382, P=0.000];血清PDIA3Ab滴度与AIT孕妇流产呈正相关( r=0.476, P=0.000);血清PDIA3Ab滴度升高是AIT孕妇流产的危险因素( P=0.039);血清PDIA3Ab滴度预测AIT孕妇流产的AUC(95%CI:0.749~0.894)为0.821,敏感性为59.3%,特异性为98.5%,约登指数为0.578,最佳临界值为51.15 IU/mL。 结论:血清PDIA3Ab滴度升高可增加AIT孕妇流产风险,临床对于血清PDIA3Ab滴度升高的AIT孕妇应予以重视并及时干预,可能改善其妊娠结局。
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编辑人员丨1周前
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基于生物信息学筛选研究衰老小鼠免疫B细胞的基因差异
编辑人员丨2023/11/11
目的 通过生物信息技术分析GSE72224 基因芯片数据,比较衰老小鼠与青年小鼠B细胞基因差异,探索关键基因,为衰老机制研究及药物研发提供思路.方法 通过NCBI提供的GEO数据库下载GSE72224,利用生物信息方法筛选衰老与青年小鼠B细胞差异表达基因,然后对差异表达基因进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因组百科全书(KEGG)信号通路分析,并且构建蛋白质相互作用网络获得关键基因和关键模块.结果 共筛选出 87 个表达基因,包括其中66 个下调基因及 21 个上调基因.差异表达基因主要参与B细胞活化、内质网及内质网蛋白加工通路等.通过构建蛋白质相互作用网络从而筛选出H2A组蛋白家族成员(H2af)x、Zeste基因增强子人类同源物(Ezh)2、蛋白二硫化物异构酶(Pdi)A4、H2B组家族成员b(Hist2h2bb)、白细胞介素(IL)-10、Sel1l、Dnajb9、泛素样含PHD和环指域(Uhrf)1 这 8 个关键基因.并且筛选出两个重要模块,模块中的基因主要也与内质网蛋白加工通路等有关.结论 H2afx、Ezh2、Pdia4、Hist2h2bb、IL-10、Sel1l、Dnajb9、Uhrf1 此 8 个关键基因,主要参与B细胞发育、DNA甲基化和内质网的蛋白质调控等过程.但是有关基因的上下游作用点还需深入研究.
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编辑人员丨2023/11/11
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自身免疫性甲状腺炎血清蛋白质二硫化物异构酶A3抗体的表达
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨自身免疫性甲状腺炎(AIT)患者血清蛋白质二硫化物异构酶A3抗体(PDIA3Ab)的表达,并对该抗体总IgG及各亚型与甲状腺过氧化物酶抗体(TPOAb)、甲状腺球蛋白抗体(TgAb)及甲状腺功能(甲功)进行相关性分析.方法 用ELISA法检测AIT与非AIT患者血清PDIA3Ab总IgG及各亚型滴度,电化学发光法检测TPOAb、TgAb及甲功.结果 与非AIT患者相比,AIT患者血清PDIA3Ab总IgG、IgG1、IgG3滴度均显著增加(P <0.05),AIT甲功正常组与AIT甲减组血清PDIA3Ab总IgG及各亚型滴度无显著差异(P> 0.05),AIT甲减组血清PDIA3Ab IgG1亚型滴度与TgAb呈负相关(r=-0.679,P <0.05),排除TPOAb、TgAb对甲功的影响后,与促甲状腺激素(TSH)呈正相关(r=0.550,P <0.05).AIT患者血清PDIA3Ab总IgG、IgG3亚型滴度与TPOAb、TgAb、甲功均无关(P> 0.05).结论 除甲状腺过氧化物酶(TPO)、甲状腺球蛋白(Tg)之外,PDIA3可能是AIT的一种非经典自身抗原,发挥甲状腺腺外损伤作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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PCA-决策树模型评价PDIA3 Ab与4种甲状腺相关指标对自身免疫性甲状腺炎的诊断价值
编辑人员丨2023/8/5
目的 研究主成分分析(principal component analysis,PCA)-决策树模型评价血清蛋白质二硫化物异构酶A3抗体(PDIA3Ab)与4种甲状腺相关指标对自身免疫性甲状腺炎(autoimmune thyroiditis,AIT)的诊断价值.方法 选取90例甲状腺炎患者,根据是否具有自身免疫性分为非AIT组(42例)、AIT组(48例),选取同期体检健康志愿者50例作为对照组.检测所有受试者血清PDIA3Ab、甲状腺球蛋白抗体(TgAb)、甲状腺过氧化物酶抗体(TPOAb)、游离甲状腺素(FT4)/游离三碘甲状腺原氨酸(FT3)、促甲状腺激素(TSH)水平,分析各组间水平差异和各指标的相关性,并采用PCA-决策树模型评价各指标对AIT的诊断价值.结果 3组受试者间FT4/FT3、TSH、TgAb、TPOAb、PDIA3Ab水平差异显著(P<0.05),其中AIT组各指标水平均显著高于非AIT组、对照组,非AIT组各指标水平显著高于对照组(P<0.05).Spearman检验结果显示PDIA3Ab与甲状腺相关指标均存在正相关性(P<0.05).受试者工作特征(ROC)曲线显示TPOAb的曲线下面积(AUC)最大(0.931),其敏感度、特异度均最高(83.33%、94.44%).决策树、PCA-决策树模型分析AIT组的诊断准确率分别为69.70%、75.76%,预测准确率分别为73.33%、80.00%.结论 FT4/FT3、TSH、TgAb、TPOAb、PDIA3Ab对AIT的诊断均有一定诊断价值,借助PCA-决策树模型可进一步提高AIT的诊断和预测准确率.
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编辑人员丨2023/8/5
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带状疱疹后遗神经痛患者血清非标记定量蛋白质组学分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 采用非标记定量蛋白质组学技术检测带状疱疹后遗神经痛(PHN)患者血清差异表达的蛋白质,探讨PHN可能的发病机制.方法 选择带状疱疹患者80例,经治疗后存在神经痛症状者40例(观察组)、不存在神经痛症状者40例(对照组).收集两组治疗前的血液,采用非标定量法蛋白质组学技术分析血清中的差异蛋白.结果 与对照组比较,观察组有4种蛋白质表达下调、7种蛋白质表达上调.进一步的差异蛋白分析结果显示,表达下调的4种蛋白质分别为纤维胶凝蛋白1(FCN1)、丝氨酸蛋白酶抑制剂家族D成员1(SERPIND1)、脱脂转化酶(LPA)和蛋白二硫化物异构酶A4(PDIA4),表达上调的7种蛋白质分别为Wnt诱导信号通道蛋白2(WISP2)、免疫球蛋白λ变量1-44(IGLV1-44)、免疫球蛋白重常数γ1(IGHG1)、载脂蛋白C3(APOC3)、半乳糖凝集素1(LGALS1)、中间α-球蛋白抑制因子H1(ITIH1)和C1Q肿瘤坏死因子相关蛋白3(C1QTNF3).结论 PHN患者血清FCN1、SER-PIND1、LPA、PDIA4蛋白表达下调,WISP2、IGLV1-44、IGHG1、APOC3、LGALS1、ITIH1和C1QTNF3蛋白表达上调,上述差异表达蛋白可能参与了PHN的发病.
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编辑人员丨2023/8/5
