肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas，TCGA)涵盖了多种癌症组学数据，包括转录组数据、表观遗传组学数据、基因突变数据和疾病样本临床数据等，是肿瘤研究中不可或缺的工具。文章介绍近年来围绕TCGA数据库进行的消化系统、呼吸系统部分肿瘤学研究成果，期望利用数据库资源为相关科研人员提供肿瘤基因组学研究的新思路。

表观遗传修饰主要通过DNA甲基化、组蛋白修饰和小型非编码RNA调控等之间繁杂的相互作用，进而影响基因的转录和表达。表观遗传调控介导了遗传和环境因素的相互作用，是大脑适应环境应激的主要机制，其对神经发育、神经干细胞命运的决定和神经系统生理功能的发挥具有重要的调节作用。异常的表观遗传修饰与阿尔茨海默病、帕金森病、神经分裂症和抑郁症等神经系统疾病或精神类疾病的发生和发展有密切关系。本文综述了表观基因组学在神经科学中的重要性，以及其与神经系统疾病或精神类疾病的重要关系。

表观遗传学已成为生物医学领域的研究热点，疾病的发生不仅与遗传因素有关，而且还受到环境因素的影响。老年性黄斑变性、糖尿病视网膜病变等视网膜血管性疾病是一类以视网膜血管病变为核心病理改变的不可逆致盲性眼病，是多种环境因素和基因相互作用的结果。表观遗传学的调控方式主要包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA调控。表观遗传机制介导环境因素，参与视网膜血管病变相关基因的调控，影响疾病最终的发生发展。因此，眼科医生应重视表观遗传在视网膜血管性疾病中的作用，追踪表观遗传学方法在视网膜血管性疾病治疗中取得的进展，关注表观遗传学的应用前景。寻找这些疾病的表观调控因子，不仅可以加深对这些疾病发生机制的认识，同时还能为这些疾病的诊断和治疗提供新的思路。

肝细胞癌(HCC)作为肝癌最常见的病理类型，具有发病率高，预后差等特点。其进展涉及多种基因组学和表观遗传学改变。泛素-蛋白酶体系统(UPS)是一种选择性蛋白水解系统，参与肝癌的生理和病理过程。以蛋白酶体为靶点的抑制剂在肝癌治疗中显示出良好的治疗效果。因此，全面了解UPS在肝癌中的研究现状以及开发UPS特异性肝癌治疗药物至关重要。本文将结合近年来UPS在肝细胞癌中的研究进展和药物研发，为未来的机制和临床转化研究提供新思路。

目的:生物样本库建设在疾病的精准预防、诊治研究中发挥着不可替代的作用，基于大人群队列的可共享生物样本库网络是未来发展方向。本研究的生物样本库是国家精准医学计划"中国乳腺癌专病队列研究"的重点内容之一，旨在解决标准化程度不足、共享性不够的瓶颈。方法:通过建设"实体库-信息库-延伸库"、泛共享的乳腺癌专病队列生物样本库网络以及建立严格的标准制定与质量控制标准建设标准化生物样本库。结果:生物样本库为乳腺癌风险评估、预测预警、早期筛查、分型分类、个体化治疗、疗效和安全性预测及监控等精准防治诊治方案和临床决策系统研究提供可共享的生物样本库资源。结论:生物样本库资料细化完整，病例样本量充足，可满足医疗大数据、基因组学、代谢组学和表观遗传学等多个领域的研究需要。

目的:运用基因芯片技术筛查与黑素瘤相关的DNA异常甲基化位点，初步构建黑素瘤特异性甲基化谱。方法:采用Illumina Human Methylation 450K全基因组甲基化芯片对6例黑素瘤组织及其瘤旁组织标本进行全基因组DNA检测，得出差异DNA甲基化位点。采用Gene Ontology（GO）富集分析及KEGG_Pathway分析了解基因功能。结果:基因芯片检测结果显示，黑素瘤组织与瘤旁组织存在差异甲基化位点，共27 779个，其中16 673个为高甲基化位点，11 106个低甲基化位点。提高筛选条件为 P < 0.01、︳Δβ︳> 0.2，过滤掉所有单核苷酸多态性相关探针、位于XY染色体上的探针以及交叉反应的探针，共筛选得到4 883个差异甲基化位点，其中1 459（30%）个位于启动子区（包括TSS1500、TSS200、5′UTR、1st Exon）。GO富集分析显示，差异甲基化基因参与的生物学过程主要包括细胞生长、分化、黏附、运动迁移、信号转导及转录调控等。KEGG_Pathway分析显示，差异甲基化基因主要参与黏着斑、癌症通路、转化生长因子β信号通路、磷脂酰肌醇信号通路、黑素生成、趋化因子信号通路、黏合连接、钙信号通路、细胞黏附分子、MAPK信号通路、Wnt信号通路、JAK-STAT信号通路。基于"启动子区高甲基化位点对应的前16个基因、出现甲基化频率最高（CpG位点≥ 7）的基因、具有一定的功能或参与某条信号通路"条件，选出8个基因（ KAAG1、 DGKE、 SOCS2、 TFAP2A、 GNMT、 GALNT3、 ANK2、 HOXA9）作为黑素瘤候选生物标志物。 结论:黑素瘤组织存在较多高甲基化基因，8个差异甲基化基因有可能作为黑素瘤的生物标志物。

先天性肛门直肠畸形是一类表型及遗传异质性疾病，了解其发病机制有助于疾病的早期预防与治疗。在基础研究迅猛发展的今天，先天性肛门直肠畸形的研究深度远不如其他先天性疾病，研究方向亦相对局限。本文就先天性肛门直肠畸形基础研究(主要包括胚胎学研究、遗传学研究及表观遗传学研究)的进展与展望进行阐述。

IgA肾病是最常见的原发性肾小球疾病，遗传因素在其发病中起着重要作用。继候选基因关联分析研究及全基因组连锁分析后，全基因组关联分析（GWAS）研究发现了多个易感基因与IgA肾病的发病和临床表型密切相关。同时，结构变异及表观遗传改变也与IgA肾病密切相关。目前已发现的遗传变异可解释约11%的IgA肾病的遗传度。在基因组医学时代，全基因组测序研究（WGS）为进一步了解IgA肾病的遗传变异提供了重要的线索，有助于发现更多的遗传易感位点；而多组学研究可综合分析单细胞测序、表达数量性状位点（eQTL）和基因组学等研究数据，寻找IgA肾病相关的细胞类型特异性易感基因为靶向药物研发的开展提供思路，将是未来研究的趋势和方向。

表观遗传学改变与肿瘤发生、发展和转归密切相关，在肿瘤精准及微创诊疗方面具有很好的应用潜力。DNA甲基化、羟甲基化与组蛋白修饰检测技术的进步，推动了基于表观遗传标志的液体活检研究的开展，在实体肿瘤的溯源定位、早期诊断、临床分期、疗效评价、复发监测及预后判断方面均取得了重要进展。

外周T细胞淋巴瘤非特指型(PTCL-NOS)是淋巴瘤的少见类型之一，导致患者的病情进展迅速，侵袭性强。目前，PTCL-NOS的发病机制尚未明确，其诊断主要依据淋巴瘤典型组织病理学特征、异常T细胞免疫表型及克隆性T细胞受体( TCR)基因重排等，并应排除其他独立分型的T细胞淋巴瘤亚型。近年来，随着基因组学和表观遗传学等基础研究进展，免疫治疗和分子靶向治疗等新治疗方法已应用于PTCL-NOS患者的临床治疗，使其疗效和预后有所改善，但仍未达预期。笔者从PTCL-NOS概述、基础研究进展、初治及复发/难治性(R/R)PTCL-NOS患者的治疗等方面的研究现状进行阐述，旨在为该病患者的疗效提升和预后改善提供依据。