目的:分析湖南省人源和水产动物源环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药汤卜逊沙门菌的分子流行特征。方法:对湖南省食源性疾病散发病例粪便样本和水产品样本中分离的汤卜逊沙门菌进行环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药菌株的筛选与鉴定，使用肉汤稀释法对11种抗菌药进行体外药敏试验，并利用全基因组测序技术分析菌株的耐药机制以及进化关系。结果:从粪便样本和水产品样本中共分离到19株汤卜逊沙门菌，其中9株菌对环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药。进一步分析发现8株菌检出IncC质粒，携带质粒介导的喹诺酮类药物耐药基因 qepA- qnrS1、β-内酰胺酶耐药基因 blaCMY-2和大环内酯类耐药基因 mph（A）；1株检出IncR质粒，携带 qnrB4- aac（6 ′） -Ib-cr、 blaOXA-10和 mph（A）耐药基因。遗传环境分析发现 qnrS1、 qepA、 mph（A）和 blaCMY-2基因可能分别通过插入序列IS Kra4、IS91、IS6100和IS Ecp1整合到耐药菌的基因组上。基于核心基因组生成的系统发生树表明，人源和水产动物源环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药汤卜逊沙门菌属于同一进化分支，具有较近的遗传进化关系。 结论:湖南省人源和水产动物源样本中检出对环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药汤卜逊沙门菌，提示此类多重耐药菌已在人和水产动物之间传播。

目的:确定临床分离菌株产气克雷伯菌整合子、质粒介导的喹诺酮耐药(PMQR)基因的分布，并分析整合子与临床常用抗菌药物耐药性的关系。方法:收集2015年11月至2021年3月上海市奉贤区中心医院分离自临床样本中的产气克雷伯菌91株，PCR筛查第1、2类整合酶基因( intI1、 intI2)，分析启动子类型和可变区基因盒组成结构。同时对分离株PMQR基因进行检测，并分析整合子与临床常用抗感染治疗药物间的关系。 结果:91株产气克雷伯菌对氨曲南耐药率>40.00%，对其余常用抗菌药物耐药率均<35.00%。91株产气克雷伯菌中30株检出 intI1，未检出 intI2。第1类整合子检出7种可变区基因盒组合，在产气克雷伯菌中检出基因盒组合 aac(6′)-11 C- ΔereA2- IS1247- aac3- arr- ΔereA2。第1类整合子可变区启动子以活性较弱的PcH1启动子为主。 intI1阳性菌株与 intI1阴性菌株在ICU、神经外科和临床其他科室的检出率差异有统计学意义( P<0.05)。 intI1阳性菌株对部分临床常用抗菌药物耐药率明显高于 intI1阴性菌株( P<0.05)。 qnrS为PMQR基因的主要基因型。除2016年外，其余年份分离的产气克雷伯菌中整合子和PMQR基因的检出率均较低。 结论:产气克雷伯菌耐药性的产生与整合子密切相关，产气克雷伯菌中整合子在不同临床科室的分布具有一定的差异性，ICU和神经外科应持续加强细菌耐药的监测。 qnrS是本地区产气克雷伯菌对喹诺酮类药物产生耐药的主要原因。

通过回顾性研究分析，探究非伤寒沙门菌（NTS）对喹诺酮类药物的耐药性及耐药机制。以南方医科大学第五附属医院2020年5月至2021年2月临床标本中分离的105株NTS为研究对象，采用VITEK2 Compact全自动鉴定药敏分析系统和血清学实验对菌株进行鉴定；用琼脂稀释法检测菌株对环丙沙星、左氧氟沙星和萘啶酸的敏感性；对105株NTS 进行全基因组测序，采用Abricate等软件分析菌株的耐药相关基因，包括质粒介导的喹诺酮耐药基因（PMQR）和喹诺酮耐药决定区（QRDR）；采用SISTR和MLST分析血清型和ST型，并构建系统发育树。结果显示，分离的NTS主要为ST34鼠伤寒沙门菌（53.3%）。药敏结果显示NTS对环丙沙星、左氧氟沙星和萘啶酸的耐药率分别为30.4%、1.9%和22.0%，对环丙沙星、左氧氟沙星的中介率为27.6%、54.2%；62株喹诺酮类非敏感株中共有46株（74.2%）携带PMQR基因，主要为 qnrS1（80.4%），其次为 aac（ 6′） -Ib-cr（15.2%）；QRDR突变分析共有14株和8株NTS分别存在 gyrA和 parC基因突变， gyrA均为第87位氨基酸位点突变，分别为Asp87Tyr、Asp87Asn、Asp87Gly， parC检出Thr57Ser突变。综上，本研究发现，NTS对喹诺酮类药物耐药性相对较高，携带 qnrS1基因主要导致NTS对环丙沙星和左氧氟沙星的敏感性下降，发生 gyrA：87位点突变主要导致NTS对萘啶酸耐药；同时携带多种PMQR和存在QRDR突变，可导致NTS对3种喹诺酮类药物耐药。鼠伤寒沙门菌在临床分离株中存在克隆传播现象，需进一步加强流行病学的监测。

目的:研究多重耐药霍氏肠杆菌霍夫曼亚种临床分离株C37携带 blaNDM-1基因质粒的遗传特征，并对目前可公开获得的66个霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的核心基因组进行系统发育分析，以研究霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的全球流行情况。 方法:收集2014年8月至2021年8月中山大学附属第一医院分离的耐碳青霉烯阴沟肠杆菌复合物（CRECC）。采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术（MALDI-TOF MS）和16S rRNA Sanger测序对C37进行菌种鉴定。使用微量肉汤稀释法进行抗菌药物敏感性试验。采用聚合酶链反应（PCR）检测C37菌株携带的β内酰胺酶耐药基因和质粒介导的喹诺酮类耐药（PMQR）基因。使用接合试验确认C37菌株抗性基因的接合转移性。对C37菌株进行全基因组测序，提取霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的核心基因组，对目前可公开获得的66个霍氏肠杆菌霍夫曼亚种进行系统发育分析。结果:霍氏肠杆菌霍夫曼亚种C37菌株对三代头孢、碳青霉烯类、氨基糖苷类及喹诺酮类抗菌药物耐药，携带 blaACT-5、 blaNDM-1、 qnrA1、 aac（ 6′） -Ib-cr、 oqxAB、 fosA、 dfrA15等多种抗性基因及IncX3、IncX4、IncFIB和IncFII质粒。多位点序列分型（MLST）分析显示其属于阴沟肠杆菌复合体（ECC）ST78型。系统发育分析显示ST78型霍氏肠杆菌霍夫曼亚种与碳青霉烯耐药基因传播密切相关。 结论:ST78型霍氏肠杆菌霍夫曼亚种与碳青霉烯耐药基因传播密切相关，是传播碳青霉烯耐药基因的高风险克隆，需密切监测其流行情况。

目的 研究临床分离喹诺酮耐药大肠埃希菌表型特征及分子机制.方法 通过药敏试验从临床分离大肠埃希菌中筛选喹诺酮耐药株,经多位点序列分型(MLST),采用 PCR 检测和测序分析喹诺酮耐药决定区(QRDR)、质粒介导的喹诺酮耐药基因(PMQR).结果 所收集 53 株大肠埃希菌对左氧氟沙星呈中介耐药或耐药,在 21个MLST分型中以ST53、ST43为主.QRDR测序显示,与敏感菌株相比,以基因 GyrA的 S83L和 D87N、基因 ParC的S80I突变为主,分别占 94.33%、79.25%、79.25%,ST53和 ST43均存在此 3个点突变.32.08%菌株检出PMQR基因,包括aac(6)-Ib-cr、qnrB和qnrS,62.26%菌株检出消毒剂耐药基因 qacE△1.结论 喹诺酮耐药大肠埃希菌的耐药机制主要与 QRDR区域点突变有关,同时也应对质粒介导的耐药基因水平传递加强监测.

目的 了解深圳市ST314肯塔基沙门菌流行情况、遗传特性及耐药特征.方法 对2010-2021年深圳市疾病预防控制中心食源性疾病监测网络收集的14株ST314肯塔基沙门菌全基因组测序进行系统发育进化分析、耐药基因及质粒检测;采用微量肉汤法稀释法进行药物敏感性实验.结果 共收集57株肯塔基沙门菌,14株为ST314.ST314肯塔基沙门菌全球系统发育树显示,深圳分离株与越南和泰国等东南亚国家的分离株聚集分布在clade 314.2上,且深圳本地菌株间单核苷酸多态性距离较大,说明为散发.在ST314肯塔基沙门菌基因组检测到9类共17个耐药基因/突变,携带3种产超广谱β-内酰胺酶基因,包括blblaCTX.M-24(14.3％,2/14)、blaCTX-M-55(7.1％,1/14)、blacTX-M-130(14.3％,2/14),均位于质粒上.关于喹诺酮类的耐药因子,在基因组中鉴定出2种质粒介导的喹诺酮耐药基因:qnrB6(71.4％,10/14)和 aac(6')Ib-cr(78.6％,11/14),一 种喹诺酮耐药决定区突变 T57 S(100％,14/14).深圳市ST314肯塔基沙门菌的多重耐药率为92.86％(13/14),对四环素和复方新诺明的耐药率最高(100％,14/14),其次是氯霉素(92.86％,13/14)、头孢噻肟和氨苄西林(78.57％,11/14)、环丙沙星和萘啶酸(71.43％,10/14),对氨苄西林-舒巴坦的耐药率最低(21.43％,3/14).结论 ST314是深圳市肯塔基沙门菌中的第二大流行的ST型,主要从食品中分离,尤其是禽类;ST314为散发感染,基因组呈现高度的遗传保守型.ST314肯塔基沙门菌耐药十分严重,尤其是喹诺酮耐药决定区突变、喹诺酮耐药基因共同介导的喹诺酮类耐药和质粒介导的头孢类耐药问题突出.

目的 回顾性分析社区尿液分离大肠埃希菌喹诺酮类抗菌药物耐药机制,为临床抗感染治疗提供参考.方法 收集2013年6月-2015年6月门诊就诊患者尿液标本中分离的环丙沙星耐药大肠埃希菌,经VITEK 2全自动鉴定药敏仪进行鉴定和药敏分析,PCR检测质粒介导喹诺酮耐药基因qnrA、qnrB、qnrC、qnrD、qnrS、aac(6')-Ib-cr、qepA、oqxA、oqxB,同时测序分析喹诺酮耐药决定区gyrA、gyrB、parC、parE突变情况.结果 共分离到大肠埃希菌131株,其中环丙沙星耐药56株,耐药率为42.7％,qnrS检出1株(1.7％)、oqxA及oqxB阳性各4株(7.1％)、aac(6’)-Ib-cr阳性26株(46.4％)、qnrA阳性10株(17.9％)、qnrB阳性3株(5.4％),未检出qnrC、qnrD、qepA.此外,gyrA基因发生Ser83→Leu突变3株(5.4％)、gyrB发生基因Asp87→Leu突变3株(5.4％);parC基因发生Ser80→Ile突变2株(3.6％).结论 门诊患者尿液分离大肠埃希菌喹诺酮类耐药机制以质粒介导为主,尤其是aac(6’)-1b-cr耐药基因.由于质粒介导喹诺酮耐药基因易在不同菌株中播散,应加强监测.

目的 调查临床尿液标本中分离的奇异变形杆菌质粒介导喹诺酮类耐药(PMQR)基因的分布情况.方法 采用微量肉汤稀释法测定菌株对环丙沙星和左氧氟沙星的药物敏感性,应用PCR方法扩增PMQR基因qnrA、qnrB、qnrC、qnrD、qnrS、aac(6′)-Ib-cr和qepA,并对PCR阳性产物进行测序分析以确定基因亚型.结果41株尿液标本分离的奇异变形杆菌对环丙沙星和左氧氟沙星的耐药率分别为41.5%和29.3%;检测到2株qnrA基因、3株qnrB基因,经测序证实为qnrA1和qnrB2亚型.未检测到qnrC、qnrD、qnrS、aac(6′)-Ib-cr和qepA基因.结论 PMQR基因存在于临床尿液标本分离的奇异变形杆菌中,主要基因型为qnrA1和qnrB2,介导细菌对喹诺酮类低水平耐药.

喹诺酮类抗菌药物是一种重要的广谱抗生素,属于化学合成抗菌药物.喹诺酮类抗菌药物,由于其优良的抗菌活性,安全性好,目前已在临床、畜牧业和水产业中广泛使用.耐药质粒的水平转移是喹诺酮耐药在不同细菌间传播的主要原因.本文就质粒介导的喹诺酮耐药机制和不同来源菌株质粒介导的喹诺酮耐药在国内的流行情况进行概述.

目的 研究质粒介导的喹诺酮耐药基因在医院内的流行情况,检测菌株的耐药性,分析菌株间的同源性. 方法 收集临床分离的耐喹诺酮产超光谱β-内酰胺酶(ESBLs)肠杆菌科细菌,利用PCR方法对质粒耐药基因进行检测,阳性菌株进行接合试验,然后检测药物对供体菌、受体菌和接合子最小抑菌浓度(MIC)值的变化,通过脉冲场电泳检测菌株间的同源性. 结果 所有菌株均未检出耐药基因qnrA与qnrC,其他7种耐药基因如qnrB均阳性,且部分菌株携带多个耐药基因.阳性菌株接合子对喹诺酮的耐药性增强并且有些质粒携带多种耐药基因,脉冲场电泳分析大肠埃希菌喹诺酮耐药株主要以发散为主,肺炎克雷伯菌主要以相对暴发流行为主. 结论 携带β-内酰胺酶基因的菌株,质粒介导的喹诺酮耐药基因检出率高,二者呈一定程度的共存.携带喹诺酮耐药基因的质粒水平转移,细菌对喹诺酮的耐药性增强,在免疫力低下人群,耐药菌株的传播更为迅速.