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基于rbcL序列的辽宁省苍术药材DNA条形码研究
编辑人员丨4天前
目的:采用rbcL序列对辽宁采集北苍术根茎进行鉴定,为保证辽宁省道地药材栽培可行性提供依据。方法:收集辽宁省10个地区栽培的北苍术根茎共30份,提取总DNA,采用PCR筛选DNA条形码,并对样本的rbcL序列进行扩增、测序,计算扩增成功率和测序成功率;使用MEGA 7.0软件进行序列比对;使用邻接法(NJ)构建系统聚类树。结果:北苍术根茎DNA提取成功率均为93.3%,PCR扩增和测序成功率均为100%。辽宁省30个北苍术样本中,2个样本存在种内变异,其余北苍术的碱基序列均完全相同。北苍术与菊科近缘种苍术属药材距离较近,与菊科其他属植物之间遗传距离较远。NJ树可区分北苍术及其近缘种药材。结论:辽宁省北苍术栽培品质量基本相似,rbcL序列可作为北苍术DNA条形码鉴定的有效序列片段。
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编辑人员丨4天前
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多元组织移植在眼睑分裂痣整形外科修复中的应用
编辑人员丨4天前
目的:探讨多元组织移植在眼睑分裂痣手术治疗的临床效果及策略。方法:回顾性分析2005年1月至2022年1月,于中国医学科学院整形外科医院尿道下裂整形中心就诊的眼睑分裂痣患者临床资料。手术分为4种。(1)直接切除缝合术;(2)单纯游离植皮术:根据缺损大小,上睑及下睑创面以中厚或全厚皮片覆盖;(3)眼轮匝肌肌皮瓣联合游离植皮术:上睑缺损及下睑近缘处缺损以皮片移植,下睑缺损以同侧眼轮匝肌蒂颞区皮瓣修复;(4)眼轮匝肌为蒂的颞区扩张皮瓣联合游离植皮术:手术分两期,一期手术于患侧颞区置入扩张器,二期手术取出扩张器后,行眼睑病变组织切除,再形成外眦眼轮匝肌眶部为蒂的岛状皮瓣,旋转180°后覆盖下睑缺损,上睑及下睑近睑缘处缺损仍以皮片移植。通过门诊、电话及微信随访患者术后面部外观及眼部运动等情况。采用SPSS 22.0统计软件进行分析,计量资料以 ± s表示,组内术前及术后颜面部修复重建术后疗效评估标准建议(A&F)评分比较采用配对 t检验, P<0.05为差异有统计学意义。 结果:共纳入34例患者,男18例,女16例,年龄(17.7±15.3)岁(2~33岁)。眼睑分裂痣面积为0.3 cm×0.2 cm~14.0 cm×14.0 cm。直接切除缝合术6例,其中同时行重睑术2例,术后A&F评分(4.54±1.32)分较术前(3.28±0.98)分提高,差异无统计学意义( P>0.05);单纯游离植皮术10例,术后A&F评分(5.13±1.59 )分较术前(2.25 ±1.59 )分高,差异无统计学意义( P>0.05);眼轮匝肌肌皮瓣联合游离植皮7例,术后A&F评分(5.54±1.46)分较术前(2.18±1.61)分明显提高,差异有统计学意义( P<0.05);眼轮匝肌为蒂的颞区扩张皮瓣联合游离植皮术11例,术后A&F评分(4.95±0.60)分较术前(2.18±1.48)分提高,差异无统计学意义( P>0.05)。所有患者切口均一期愈合,皮片或皮瓣成活良好,眼睑功能正常。28例患者获得8~81个月随访,其中3例术后继发下睑外翻畸形,3例切口及植皮区黑痣复发,2例植皮区色素沉着较明显,1例继发重力性上睑下垂,其余患者修复效果满意;6例因联系方式变更失访。 结论:眼轮匝肌肌皮瓣联合游离植皮在中到大面积眼睑分裂痣的整形外科修复中可获得更稳定的效果。上睑及下睑近睑缘处以游离植皮修复,下睑以皮瓣移植修复,更加符合上下睑的生理状态,不同的组织移植方式联合,可使面部容外形更美观。
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编辑人员丨4天前
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表面增强拉曼光谱快速鉴定和鉴别耳念珠菌及其近缘菌
编辑人员丨5天前
目的:本研究旨在开发一种无需破坏细胞壁,准确、特异鉴别耳念珠菌及其近缘菌的新技术。方法:于2021年在军事科学院军事医学研究院进行本研究。以柠檬酸钠还原法制备表面增强拉曼光谱(SERS)基底材料,通过SERS检测,使用SIMCA 14.1(瑞典Umetrics公司)软件对采集的SERS指纹谱数据进行正交偏最小二乘判别(OPLS-DA)分析。对4株耳念珠菌、4株希木龙念珠菌、3株 Candida pseudohaemulonii和4株 Candida duobushaemulonii进行有效检测和鉴别。 结果:在95%可信区间内,样本分析结果呈椭圆形。本研究所测的4种念珠菌可以很好地分开。 R2X(cum)=0.629, R2Y(cum)=0.947, Q2(cum)=0.915, R2X、 R2Y、 Q2均为>0.5,且趋近于1,说明本研究的模型建立良好,且该模型具有较好的预测能力。拉曼光谱数据的十折交叉检验结果显示模型训练数据和测试数据的准确率均为100%,本研究建立的模型具有较好的分类能力,该方法能准确地检测和鉴别耳念珠菌及其近缘菌株。 结论:本研究开发了一种无需破坏细胞壁,准确、特异、快速鉴别耳念珠菌及其近缘菌的新技术,成本低,操作简单,在临床检验上具有良好的应用潜力。
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编辑人员丨5天前
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1株血液分离的油葫芦苍白杆菌的鉴定及系统发育分析
编辑人员丨5天前
目的:对临床血液标本分离的细菌7712(=CGMCC 1.17031=NBRC 113783=KCTC 15766)进行生物学特性和系统进化分析,明确其分类学地位。方法:观察菌株的培养特性并进行形态学、生理生化鉴定、基质辅助激光解吸电离子飞行时间质谱鉴定和基因组测序鉴定,并构建基因组发育树以分析其分类学位置。采用在线毒力基因数据库和抗生素抗性数据库,分别对分离株及近缘菌株进行基于全基因组的毒力基因和耐药基因的比较分析。结果:分离株7712为脲酶阳性的需氧革兰阴性非发酵菌,VITEK GN鉴定为人苍白杆菌。16S rRNA基因序列分析显示,分离株7712与苍白杆菌属及布鲁菌属均具有较高的序列一致性;而基于全基因系统发育分析显示,分离株7712与油葫芦苍白杆菌LCB8 T和嗜血苍白杆菌CCUG 38531 T聚类成一个分支,并与其他苍白杆菌属细菌和布鲁菌属聚类成一个大的分支。基因组亲缘性指数分析显示,分离株7712和油葫芦苍白杆菌LCB8 T的平均核苷酸一致性为98.22%,高于原核生物物种的鉴定阈值95%。分离株7712携带多种毒力基因和耐药基因,其中 OCH基因可能与头孢菌素耐药有关。 结论:确定了1例由油葫芦苍白杆菌引起的临床感染,丰富了苍白杆菌属生物多样性信息。
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编辑人员丨5天前
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南洋鼠线粒体基因组结构特征及其属级分类关系的分子证据
编辑人员丨5天前
南洋鼠(Chiromyscus langbianis)是亚洲特有的一种树栖鼠类,其属级分类一直存在争议,不同的分类系统将其归入白腹鼠属(Niviventer)或费氏树鼠属(Chiromyscus),影响了对其生物学特性的认识.本研究旨在通过测定和分析南洋鼠的线粒体基因组,探讨其线粒体基因组结构特征,并利用近邻相接法(neighbor-joining method,NJ)和最大似然法(maximum likeli-hood method,ML)构建22个近缘物种线粒体基因组的系统发育树,厘清南洋鼠的属级分类关系.结果表明,南洋鼠线粒体基因组总长度为16 288 bp,包含22个tRNA基因、13个蛋白编码基因、2个rRNA基因和一段非编码区(non-coding region,NCR),线粒体基因组碱基组成为 A 36.6%、T 28.9%、G 15.0%和 C 19.5%,AT 偏斜(AT-skew)为 0.092,GC 偏斜(GC-skew)为-0.337.在22个tRNA基因中,除tRNASer(AGY)缺少D环外,其余的21个tRNA基因均能够折叠成典型的三叶草结构.同时,部分tRNA基因,如tRNAPhe出现了A-A,tRNAVa1、tRNALeu、tRNAI1e出现了C-U等非经典配对,以维持tRNA二级结构的稳定性.基于近邻相接法和最大似然法构建的系统发育树表明,南洋鼠与费氏树鼠属的亲缘关系更近.进一步基于线粒体Cytb和Cox1构建的系统发育树及遗传距离分析结果,均支持南洋鼠划入费氏树鼠属.本研究为南洋鼠的分类地位和系统发育关系提供了分子证据,也为其种群遗传学的研究提供了数据参考.
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编辑人员丨5天前
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中国林蛙早期胚胎发育及其与近缘种的比较
编辑人员丨5天前
为探究中国林蛙(Rana chensinensis)早期胚胎发育特征,2022年3月收集其在河南省济源市太行山区野外自然抱对产出的受精卵,在室内水温(22.63±2.09)℃的条件下进行连续观察.结果显示,中国林蛙卵径(1.57±0.01)mm(n=5);早期胚胎发育分为25个时期,从受精卵到鳃盖完成期历时158.83 h;卵裂方式为不均等全裂;大约70%的胚胎在鳃血循环期出膜.中国林蛙早期胚胎发育的卵裂特征、出膜方式及出膜时期与近缘种相似,速度较慢;与其他无尾两栖类相比,卵裂特征、出膜方式和发育速度均呈现种属特异性.中国林蛙较小的卵径、较快的早期胚胎发育速度反映了其对静水产卵环境的适应.
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编辑人员丨5天前
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不同基原枳实药材及其混淆品质量差异研究
编辑人员丨1周前
枳实不仅有多基原且有多种合法栽培变种,随着农业技术的进步,栽培品种层出不穷,枳实混淆品繁多导致药材市场混乱.该研究通过外观性状、浸出物、多成分同步测定,以瓤囊-直径比(瓤囊占比,Pc/Cs)、浸出物及 11 种成分含量轮廓等指标,构建枳实与其近缘混淆品的特异性辨识方法.研究发现:①Pc/Cs可方便地将枳、橘及耙耙柑等混淆品检识出来;②浸出物含量可区分香圆来源的混淆品与酸橙;③除枳、香圆、常山胡柚和沃柑混淆品的辛弗林含量不合格外,其余样品均符合《中国药典》要求,个别甜橙可达 1.40%以上;橙皮苷在甜橙的质量分数高于 10.00%,而酸橙均低于 2.50%;酸橙中柚皮苷(3.96%~15.21%)和新橙皮苷(9.38%~21.93%)质量分数较高;④枳及香圆混淆品的成分与代代花较接近,但新橙皮苷(0.03%~0.14%)远低于酸橙,且不含橙皮素和桔红素;混淆品衢枳实(胡柚基原)与臭橙、酸橙-枳杂交品的成分较接近,但其橙皮苷较酸橙高(3.13%);橘与甜橙较为接近且均不含柚皮苷和新橙皮苷;耙耙柑、沃柑的橙皮苷与甜橙相近,且不含野漆树苷.各指标相互配合可准确区分甜橙、酸橙及其近缘混淆品(绿衣枳实、香圆、衢枳实、沃柑、青皮),为枳实药材质量控制提供一套甄别方法.
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编辑人员丨1周前
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集中空调通风系统马链球菌的特异PCR检测方法的建立
编辑人员丨2周前
目的 为对公共场所空调系统有害微生物进行有效检测与预防,本研究拟建立空调通风系统中重要致病菌——马链球菌(Streptococcus equi)的高效、特异的PCR检测方法.方法 基于序列相似性比对方法挖掘物种特异DNA片段,设计扩增引物并优化PCR条件,通过梯度稀释法构建不同浓度DNA模板并检测PCR扩增效果,确定PCR检测灵敏度.结果 从马链球菌基因组序列中挖掘到6个特异的DNA区段,长度分别为233、189、74、54、112、196bp.以189bp的特异DNA片段为检测靶标设计PCR引物,优化确定最优退火温度为58.4℃,确定该引物能有效区分马链球菌的多个近缘种;当PCR循环数为25、30、35时,20 μl PCR扩增体体系最低可检出400 fg(1.27×105拷贝)、4 fg(1.273×103拷贝)、0.4 fg(1.27×102拷贝)的模板DNA.结论 本研究建立的马链球菌PCR检测体系具有很好的物种特异性,检测灵敏度远高于多个已报道的马链球菌PCR检测体系,为公共场所空调系统有害微生物马链球菌的防控提供了新的技术选择.
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编辑人员丨2周前
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黄栌枯萎病拮抗细菌CCBC3-3-1的全基因组测序及比较基因组分析
编辑人员丨1个月前
[目的]从黄栌枝干内部分离到的细菌CCBC3-3-1 菌株对黄栌枯萎病菌(Verticillium dahliae)表现出较强的拮抗作用,从基因组层面深入研究其拮抗机理,为进一步研发生防菌剂提供理论依据.[方法]利用PacBio RS测序平台完成CCBC3-3-1 的全基因组测序,根据 16S rDNA序列信息构建系统发育树,并与同属近缘种菌株进行比较基因组学分析;对其发酵液进行LC-MS非靶标代谢组检测.[结果]CCBC3-3-1 基因组总长度为 5.16 Mb,由 1 条环状双链染色体和 3 个环状质粒组成,GC含量 48.08%,含有 5 013 个编码基因.经过antiSMASH预测,CCBC3-3-1 基因组中有 8 个抗生素及次生代谢物合成相关的基因簇,其中 2 个与已知基因簇相似度较低,5 个基因簇功能未知,其发酵液中检测出 6 种已知抗生素类物质.比较基因组学分析结果表明CCBC3-3-1 基因组与泛菌属内 4 个近缘种均有显著差异,而且CCBC3-3-1 在 16S rDNA系统发育树上形成一个相对独立的分支.[结论]CCBC3-3-1 是泛菌属的一个新变异种Pantoea sp.,能够产生多种抗生素类物质,在黄栌枯萎病生物防治方面具有重要应用潜力.
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编辑人员丨1个月前
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山西省鸟类新记录——黄腿渔鸮
编辑人员丨1个月前
2024年5月4日,在山西省临汾市翼城县泉头村河谷附近(111°51'44"E,35°35'19"N,海拔950 m)的树上观察并拍摄到1只鸮形目Strigiformes鸟类(图1).发现地生境为针阔混交林,林下生有稀疏灌丛及其他草本植物,同域还记录到大山雀Parus minor、黄腹山雀Pardaliparus venustulus、绿背姬鹟Ficedula elisae等雀形目Passeriformes鸟类.本次观察到的这只鸮类体型较大,通体橙棕色,具深褐色纵纹,飞羽和尾羽具橙棕色横斑和端斑,具耳羽束,喉部覆羽蓬松,虹膜黄色,喙角质黑色.与近缘物种褐渔鸮Ketupa zeylon-ensis的区别在于下体棕色较明亮、上体纵纹更宽(约翰·马敬能等,2022).经比对《中国鸟类观察手册》(刘阳,陈水华,2021)和《中国鸟类野外手册》(约翰·马敬能等,2022),鉴定为黄腿渔鸮Ketupa flavipes.
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编辑人员丨1个月前
