为解析江西省辣椒育种骨干亲本材料的遗传多样性并构建其DNA指纹图谱,本研究利用毛细管电泳和SSR分子标记技术对江西60份辣椒种质材料进行位点检测.结果表明,49对SSR引物共检测到202个等位基因,平均4.122个,平均有效等位基因为2.172个,平均香农信息指数为0.850,平均多态信息含量为0.414,说明60份供试材料具有较为丰富的遗传多样性;平均期望杂合度0.475大于观测杂合度0.126,表明多代自交导致材料纯合度较高.聚类分析、群体结构分析和主坐标分析结果一致,即江西辣椒育种亲本材料以南方地区和小果型尖椒材料为主,遗传背景狭窄且保持较纯的血统.此外,本研究根据多位点匹配分析确定了 PM1、CAMS-855、CO911525S、PM22、HpmsE015和Hpms1214为核心引物,并利用这6对核心引物构建了 60份辣椒育种亲本的指纹图谱,为江西辣椒资源的鉴定和保护提供了有力支撑,为分子辅助育种中亲本的选择提供理论依据.

为了培育性状优良、遗传稳定的黄鳝(Monopterus albus)群体,研究探索了人工诱导黄鳝减数分裂雌核发育方法.针对养殖性状优良的深黄大斑鳝进行种质纯合,创制出3个深黄大斑鳝雌核发育群体.流式细胞术和染色体计数分析表明雌核发育黄鳝的细胞DNA含量、染色体数目均与野生型相同.性腺组织学切片观察表明雌核发育黄鳝卵巢发育正常.微卫星多样性分析表明雌核发育黄鳝群体的有效等位基因(Ne)、平均香农指数(I)、平均多态信息指数(PIC)、平均观测杂合度(Ho)及平均期望杂合度(He)等参数均极显著低于野生群体,雌核发育群体的遗传纯合度显著提高.雌核发育群体之间的遗传距离增大,遗传相似系数变小.深黄大斑鳝雌核发育群体为培育性状优良的黄鳝养殖品种提供了育种材料.

目的 研究嘉兴地区献血者HLA-I类(A、B位点)和HPA基因表达情况,建立本地区血小板基因数据库.方法 采用基于序列的多重聚合酶链反应(multiplex PCR-SBT)对嘉兴地区5,411例样本进行HLA-I类(A、B)基因测序,对其中199例单采血小板献血者样本进行HPA1-6、15、21w系统基因分型,统计分析HLA-I类和HPA1-6、15、21w基因频率分布情况.结果 5,411例样本中共检出HLA-A、B位点等位基因53种,其中HLA-A位点等位基因15个,频率前5位为A*2(0.3040)、A*11(0.2384)、A*24(0.1771)、A*33(0.0893)、A*30(0.0493);HLA-B位点等位基因38个,频率前5位为B*46(0.1137)、B*60(0.1136)、B*13(0.0931)、B*62(0.0822)和 B*58(0.0820).HPA1～6、15、21w系统均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律,具有恒定性,以HPA-3杂合度(a/b杂合子基因型)最高(0.482),其次为HPA-15(0.437),HPA-3、15 系统中a、b抗原频率相近,HPA-3、15系统有b/b纯合子基因型,分别为0.196,0.266.其余5个系统均以a/a纯合子基因型为主,分别为0.995、0.8995、0.990、0.975、0.945,未见b/b基因型.结论 HLA-A、B位点和HPA3、15系统基因具有多态性分布特点,建立献血者HLA/HPA基因数据库可有效解决血小板输注无效问题.

在畜禽资源保护中,群体遗传多样性和遗传结构是决定保种效果的重要因素.本研究采用全基因组重测序技术检测 100 头秦川牛(30 头公牛、70 头母牛)的基因组变异,通过分析群体遗传多样性、连续纯合片段(runs of homozygosity,ROH)分布特征、亲缘关系和家系结构,对秦川牛的保种效果进行了综合评估.结果显示,100头秦川牛共检测到 20,968,017 个高质量SNPs位点,平均最小等位基因频率为 0.191±0.124,平均多态信息含量为 0.279±0.131,平均观察杂合度为 0.275±0.131,平均期望杂合度为 0.279±0.131,表明秦川保种群遗传多样性较为丰富.秦川牛保种群体平均状态同源(identity by state,IBS)遗传距离为0.243±0.020,其中公牛为0.242±0.021,亲缘关系 G 矩阵结果与 IBS 距离矩阵结果一致,均显示秦川牛保种群部分个体间亲缘关系较近.100 头秦川牛个体共检测到 8258 个基因组ROH,ROH总长度为 9.64 GB,平均ROH长度为 1.167±1.203 Mb,69.35%的 ROH 是长度为 0.5～1 Mb 的短 ROH.个体平均 ROH 总长度为 96.40 Mb.基于 ROH 的平均近交系数为0.039±0.039,其中30头秦川公牛的平均近交系数为0.044±0.035,表明部分公牛个体存在一定程度的近交积累.进化树结果显示,秦川牛保种群所测个体可分为 8 个家系,包括 7 个含公牛家系和 1 个不含公牛家系.本研究表明,秦川牛保种群的遗传多样性较为丰富,未出现较大程度近交积累,但部分个体间存在近交风险,应强化选配以确保秦川牛资源的可持续发展.

目的 建立近交系长爪沙鼠生化标记遗传检测方法,开展对长爪沙鼠脑缺血模型CMU/1和CMU/2近交系的纯合度进行分析,为判定其遗传状况提供依据.方法 采用醋酸纤维板电泳法,选26个生化标记进行近交系长爪沙鼠各组织器官样品电泳,参考前期方法优化最佳电泳条件,并对样品处理和染色的方法进行一定的改良后;针对F21～23代77只CMU/1和44只CMU/2近交系动物26个生化标记的纯合度进行检测.结果 在2个近交系长爪沙鼠共121只动物中均能成功检测到26个生化标记.其中有24个位点在CMU/1和CMU/2品系内和品系间均显示单态性,但是Es-3和Es-4位点在2个品系间有差异.结论 建立了长爪沙鼠近交系生化标记遗传检测方法;确定近交系CMU/1和CMU/2动物26个生化标记,其纯合度达到100％,说明2个近交系品系符合近交系动物的标准(GB14923-2010).

本文针对濒危植物居群的遗传多样性、生殖适合度、基因流、近交和远交衰退等遗传学问题在居群恢复过程中的应用进行了探讨.濒危植物居群的回归重建,既面临遗传多样性的迅速丧失、近交衰退等遗传风险,还因回归引种地存在较多近缘种而带来远交衰退的风险,最终导致遗传适应性降低,生境适应性变窄,繁殖和竞争能力减弱.为提高濒危物种保护的质量和效率,在构建回归居群时,应分批次从同一来源居群的不同母株采集材料,确保种源的遗传纯正性和遗传组成的多样性,还应使回归居群尽可能远离近缘广布种.另外,还需要对回归种群进行持续的监测和管理才能保证回归引种的成功.

为了拓宽黄淮海区玉米自交系的遗传基础,加快欧美优异种质的融入与利用,本研究利用SSR分子标记对120份来自美国和塞尔维亚及2份中国的玉米自交系进行遗传多样性和聚类分析.结果表明:29个多态性SSR标记共检测到115个等位位点,平均3.97个,位点多态性信息指数(PIC)平均为0.50,较好地揭示了自交系间的遗传多样性;观测杂合度(Ho)仅为0.03,表明参试自交系遗传稳定、纯合度高;美国SS、美国NSS、塞尔维亚和中国骨干自交系4个群之间相比,美国NSS群的等位位点数(3.55)、Shannon信息指数(0.93)最高,而塞尔维亚群的有效等位位点数(2.37)最高,表明美国NSS和塞尔维亚自交系群比其他两个群遗传多样性高;4个自交系群间的遗传距离介于0.1403～ 0.4695之间,美国NSS群与美国SS群、塞尔维亚群之间较小(0.1419,0.1403),与中国骨干自交系群之间最大(0.4695),4个群的遗传一致度介于0.6253 ～ 0.8691之间,美国NSS群与美国SS、塞尔维亚两个群之间的遗传一致度较高,表明美国与塞尔维亚自交系之间基因交流频繁,亲缘关系较近;聚类分析将122份玉米自交系分为9大主要类群,美国SS种质、NSS种质自交系被明显的区分开,并且SS种质被分为2个主要类群(Ⅰ和Ⅸ),NSS种质被分为6个主要类群(Ⅱ-Ⅶ),来自塞尔维亚的材料分散在美国NSS种质类群.本研究结果为来自欧美的自交系在玉米育种中合理利用提供可靠依据.

为了获得适于三叶木通遗传多样性和遗传结构研究的微卫星分子标记,该研究采用磁珠富集法构建了三叶木通微卫星富集文库.结果表明:在150个阳性克隆中发现了70个微卫星位点,富集效率为46.67％,其中含双碱基重复单元的序列占比为79.37％,三碱基和四碱基重复含有量较少.共设计引物63对,其中筛选出16对高多态引物,对1个三叶木通自然居群48个个体进行了遗传分析,结果显示位点的等位基因数为10～22个,观察杂合度和期望杂合度分别为0.370～0.792和0.724～0.936,多态性信息指数为0.725～0.919,表明以上引物均为高多态性引物.其中,12个位点偏离哈迪-温伯格平衡,呈现出纯合子过剩状态,这可能与哑等位基因和其它因素有关.综上结果表明,该研究所开发的16对引物能够用于三叶木通遗传多样性和遗传结构评价工作.

为了解四川核桃 (Juglans) 种质资源的遗传多样性, 利用RAD二代测序技术对42份核桃良种资源进行测序, 分析其遗传结构和遗传多样性.结果表明, 共获得70G clean data, Q30平均为96.3％, 并获得160 309个多态性SNPs.聚类、遗传结构和主成分分析结果高度一致, 42份种质资源聚为两大类, 基本反映了两个原始祖先血统, 即普通核桃类 (AJR, 33份) 和泡核桃类 (AJS, 9份) , 两类群具较高的遗传分化 (FST=0.285) , 且分类与地理位置分布和种群相关;且修正了'威薄01'、'白龙1号'和'石棉巨核'3个品种的类群认定.AJS和AJR类群中分别有9和14个良种为纯血统且亲缘关系较远, 而其余的良种均为两个血统的混杂.42个核桃良种资源的核苷酸多样性[Pi (π) ]和期望杂合度 (He) 分别为0.029和0.286, 表明这些资源具有丰富的遗传多样性, 相对于AJR类群, AJS类群的杂合率 (He) 与核苷酸多态性更大, 而SNP数更少, AJS遗传多样性更丰富.这些为四川的核桃种质资源保存和杂交育种研究奠定了基础.

从江香猪是全国稀有的微型猪种,其细胞色素氧化酶P450基因纯合度较高,遗传稳定,具备开发药物代谢动物模型的良好基础.本研究旨在应用实时荧光定量方法研究从江香猪细胞色素氧化酶P4503A29 mRNA的组织分布及地塞米松对其表达的影响,并比较与人细胞色素氧化酶P450 3A4的相似性.结果 表明,从江香猪细胞色素氧化酶P450 3A29mRNA的组织分布特征及地塞米松对其诱导作用总体上与人体相似,从江香猪可用于人细胞色素氧化酶P450 3A4的诱导研究.