头颈肿瘤包含多种肿瘤类型，鼻咽癌、喉癌是最常见的头颈鳞状细胞癌，甲状腺癌是最常见内分泌性恶性肿瘤。近年来头颈肿瘤的发病率迅速上升，尤其是甲状腺癌；而头颈鳞状细胞癌患者缺乏准确的早期诊断手段，且治疗后期患者易对放化疗产生抵抗，仍需不断探索头颈肿瘤新的诊断和治疗手段。目前大量研究证实长链非编码RNAs可通过多种方式参与头颈肿瘤的发生发展。其中长链非编码RNA FOXD2-AS1已被证实在多种恶性肿瘤中表达异常，本文总结了FOXD2-AS1在头颈肿瘤中的表达情况及其生物学功能，探索FOXD2-AS1在头颈肿瘤诊断及治疗中的潜在价值。

目的:研究长链非编码RNA(lncRNA) FOXD2-AS1在骨肉瘤组织及细胞株中的表达及对细胞增殖、凋亡、侵袭和迁移的作用与机制。方法:采用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)检测36例骨肉瘤组织与癌旁组织中FOXD2-AS1的表达量并分析其表达与临床特征的关系。检测FOXD2-AS1在骨肉瘤细胞株(MG63，Saos-2，U2-OS，143B)和人成骨细胞株(hFOB1.19)的表达，并选取两种高表达的细胞株敲降其表达，通过细胞计数试剂盒(CCK-8)实验、膜联蛋白V-异硫氰酸荧光素(Annexin V-FITC)/碘化丙锭(PI)流式细胞术、Transwell实验检测增殖、凋亡、侵袭和迁移，并通过RNA结合蛋白免疫沉淀(RNA-IP)、蛋白质印迹法(Western blot)和ChIP检测FOXD2-AS1对EZH2和p21的影响。结果:FOXD2-AS1在骨肉瘤组织中的表达高于癌旁组织( t＝17.900， P<0.01)；并且在体积大、TNM分期高的骨肉瘤组织中表达量更显著( χ2＝4.208、9.257， P<0.01)。FOXD2-AS1在骨肉瘤细胞株中的表达量均高于人成骨细胞株( t＝14.540、9.970、5.890， P<0.01)，尤其是在MG63和Saos-2细胞株中，敲降FOXD2-AS1的表达能够抑制增殖( P<0.05)、促进凋亡( P<0.01)和抑制侵袭和迁移( P<0.01)。RNA-IP、Western blot和ChIP结果显示FOXD2-AS1与EZH2互作，敲降FOXD2-AS1降低了EZH2和H3K27me3与p21启动子区的分子结合。 结论:FOXD2-AS1能够提示临床预后不良，促进骨肉瘤细胞的恶性生物学行为，其机制可能是通过与EZH2互作，从而抑制p21的表达实现的。

目的:检测长链非编码RNA FOXD3-AS1(lncRNA FOXD3-AS1)在乳腺癌中的表达并观察lncRNA FOXD3-AS1对乳腺癌细胞迁移和侵袭的影响。方法:利用生物信息学的方法对肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中lncRNA FOXD3-AS1在乳腺癌中的表达量进行分析，应用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)技术检测lncRNA FOXD3-AS1在10例乳腺癌及癌旁正常组织的临床样本及细胞系中的表达。细胞计数试剂盒(CCK-8)、5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷(EdU)细胞增殖检测试剂盒及集落形成实验检测敲低lncRNA FOXD3-AS1组和阴性对照组细胞增殖能力。Transwell小室法及划痕实验检测检测敲低lncRNA FOXD3-AS1组和阴性对照组细胞迁移和侵袭能力。配对样本采用配对样本 t检验，或独立样本 t检验。 结果:TCGA数据库分析结果显示lncRNA FOXD3-AS1在乳腺癌组织中表达明显升高[0.860(0.152～2.451)比0.032(0.015～0.078)， P<0.01]。在10例乳腺癌及癌旁正常组织的临床样本中，利用RT-qPCR结果验证lncRNA FOXD3-AS1在乳腺癌组织中高表达( t＝9.297， df＝9， P<0.01)。CCK-8实验及EdU实验显示敲低lncRNA FOXD3-AS1组细胞的增殖活力明显低于阴性对照组[(15.2±0.93)%比(43.17±1.17)%， P<0.01]；克隆形成实验显示敲低lncRNA FOXD3-AS1组细胞的克隆形成能力显著低于阴性对照组[(26.33±2.40)个比(66.33±3.28)个， P<0.01]。Transwell迁移实验显示敲低lncRNA FOXD3-AS1组的细胞穿膜数量显著低于阴性对照组[(93.67±2.33)个比(170.3±3.48)个， P<0.01；(30.67±1.76)个比(103.00±3.79)个， P<0.01]；划痕实验显示敲低lncRNA FOXD3-AS1组细胞较阴性对照组细胞更慢的靠近划痕区域(24 h， t＝6.149， df＝12， P<0.01；48 h， t＝7.938， df＝12， P<0.01)。 结论:lncRNA FOXD3-AS1在乳腺癌中高表达，并具有促进乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的能力。

目的 研究长链非编码RNA叉头框蛋白D2相邻对链RNA1(lncRNA FOXD2-AS1)对胶质瘤生物学行为的影响.方法 首先用qPCR实验检测FOXD2-AS1在U251、LN229、U87这3种胶质瘤细胞系中的表达情况,筛选出高表达的2种细胞系进行培养,再构建慢病毒载体转染2种细胞系敲低FOXD2-AS1作为实验组,将空载慢病毒颗粒转染的细胞作为阴性对照组,将常规培养未进行转染的细胞作为空白组,采用划痕实验、Transwell实验检测2种胶质瘤细胞系中各组细胞迁移及侵袭能力,将FOXD2-AS1敲低后进行转录组测序,进行差异基因取交集,并对共同差异基因进行富集分析.结果 qPCR实验显示FOXD2-AS1在LN229、U251这2种胶质瘤细胞系中明显高表达,与阴性对照组和空白组相比,被慢病毒载体转染敲低FOXD2-AS1时,2种胶质瘤细胞系中实验组细胞迁移及侵袭能力明显下降.生信数据库分析敲低FOXD2-AS1时发现2种胶质瘤细胞系共有48个相关差异性表达基因,进一步通过KEGG通路富集分析发现,2种胶质瘤细胞系中FOXD2-AS1敲低都与多种信号通路(细胞过程中的聚焦粘附、环境信息处理中的神经活性配体-受体相互作用、遗传信息处理中的剪接体、人类疾病中的癌症通路、新陈代谢中的代谢途径、有机系统中的补体和凝血级联反应)存在相关性.结论 LncRNA FOXD2-AS1在胶质瘤细胞迁移、侵袭中发挥作用,其可能的作用机制可还有待后续进一步研究.

目的 探讨长链非编码RNA(lncR)FOXD2-AS1调控微小RNA(miR)-145-5p对非小细胞肺癌(NSCLC)细胞增殖、迁移、侵袭和上皮-间质转化(EMT)等生物学特性的影响.方法 体外培养人NSCLC细胞系A549、H1299、SK-MES-1及人正常肺支气管上皮细胞系16HBE,应用RT-qPCR检测各细胞系中lncR-FOXD2-AS1和miR-145-5p表达.选取lncR-FOXD2-AS1相对高表达的SK-MES-1作为敲低实验的研究对象,将SK-MES-1细胞按照转染处理的不同分为NC组(转染si-NC)和si-FOXD2-AS1组(转染si-FOXD2-AS1),转染后,RT-qPCR检测细胞中lncR-FOXD2-AS1、miR-145-5p表达,CCK-8法检测细胞增殖活性,Transwell实验检测细胞迁移、侵袭能力,Western blotting法检测细胞中E-cadherin、N-cadherin、Fibronectin蛋白表达.双荧光素酶报告基因实验验证lncR-FOXD2-AS1和miR-145-5p的相互关系.结果 与16HBE细胞相比,lncR-FOXD2-AS1在NSCLC细胞系中高表达(P<0.05),miR-145-5p在NSCLC细胞系中低表达(P均<0.05).与NC组比较,si-FOXD2-AS1组细胞miR-145-5p表达升高(P<0.05),0、24、48 h时OD值降低(P均<0.05),迁移及侵袭穿膜细胞数减少(P均<0.05),E-cadherin蛋白表达升高(P<0.05),N-cadherin、Fibronectin蛋白表达降低(P均<0.05).双荧光素酶实验证实miR-145-5p是 lncR-FOXD2-AS1的靶基因.结论 lncR-FOXD2-AS1在NSCLC细胞系中表达升高,敲低lncR-FOXD2-AS1通过靶向调控miR-145-5p抑制NSCLC细胞的增殖、迁移、侵袭和EMT进程.

目的 探讨子宫内膜癌组织中长链非编码RNA HOXA-AS2(lncRNA HOXA-AS2)、长链非编码RNA FOXD2-AS1(lncRNA FOXD2-AS1)、长链非编码 RNA CRNDE(lncRNA CRNDE)的表达与患者临床病理特征及预后的关系.方法 收集2017年10月至2020年2月于该院住院手术的119例子宫内膜癌患者术中切除的子宫内膜癌的癌组织及癌旁组织标本.回顾性分析组织中HOXA-AS2、FOXD2-AS1、CRNDE相对表达水平,以及三者表达与患者临床病理特征、3年生存率的关系.结果 子宫内膜癌患者癌组织HOXA-AS2、FOXD2-AS1、CRNDE相对表达水平均高于癌旁组织,差异有统计学意义(P＜0.05).子宫内膜癌患者癌组织HOXA-AS2、FOXD2-AS1、CRNDE 相对表达水平两两之间均呈正相关(rHOXA-AS2 vs.FOXD2-AS1=0.384,P=0.001;rHOXA-AS2 vs.CRNDE=0.576,P＜0.001;rFOXD2-AS1 vs.CRNDE=0.326,P=0.003).HOXA-AS2、FOXD2-AS1、CRNDE高表达组中国际妇产科学联合会分期为Ⅲ+Ⅳ期、发生淋巴结转移、浸润深度为深层、分化程度为低分化的患者所占比例高于低表达组,差异有统计学意义(P＜0.05).子宫内膜癌患者癌组织HOXA-AS2低表达组3年生存率(52/60,86.67％)高于子宫内膜癌患者癌组织HOXA-AS2高表达组(40/59,67.79％),差异有统计学意义(x2=6.039,P＜0.05);子宫内膜癌患者癌组织FOXD2-AS1低表达组3年生存率(53/59,89.83％)高于子宫内膜癌患者癌组织FOXD2-AS1高表达组(39/60,65.00％),差异有统计学意义(x2=10.456,P＜0.05);子宫内膜癌患者癌组织CRNDE低表达组3年生存率(51/60,85.00％)高于子宫内膜癌患者癌组织CRNDE 高表达组(41/59,69.49％),差异有统计学意义(x2=4.079,P＜0.05).HOXA-AS2、FOXD2-AS1、CRNDE是子宫内膜癌患者死亡的危险因素(P＜0.05).结论 子宫内膜癌的癌组织HOXA-AS2、FOXD2-AS1、CRNDE的表达与患者临床病理特征及预后密切相关.

目的:观察长链非编码RNA(lncRNA)FOXD2-AS1对卵巢癌细胞增殖和迁移的影响.方法:收集2017年2月至2017年9月华中科技大学同济医学院附属武汉儿童医院(武汉市妇幼保健院)手术切除的16例卵巢癌患者的组织标本,采用荧光实时定量聚合酶链式反应(quantitative PCR,qPCR)检测组织标本、人卵巢癌细胞系及人正常卵巢上皮细胞系中的FOXD2-AS1表达水平.将HO-8910细胞分为实验组和对照组,分别转染siRNA-FOXD2-AS1和阴性对照RNA.细胞计数CCK-8法、Transwell迁移实验分别检测沉默FOXD2-AS1表达对卵巢癌HO-8910细胞增殖活性和迁移能力的影响.生物信息学方法预测FOXD2-AS1的下游靶基因,qPCR检测下游靶基因表达,Western blot法检测葡萄糖调节蛋白94(glucose regulated protein94,GRP94)和信号通路Wnt/β-catenin的蛋白表达.结果:卵巢癌组织中的FOXD2-AS1相对表达量8.56±0.51明显高于正常癌旁组织的2.38±0.21(P<0.01),FOXD2-AS1在卵巢癌细胞系OC3、HO-8910、A2780、SKOV-3中表达明显增加(P<0.05).下调FOXD2-AS1表达明显抑制卵巢癌HO-8910细胞的增殖活性和迁移能力(均P<0.01).生物信息学方法显示,FOXD2-AS1靶向结合miR-150-5p后,可靶向结合GRP94基因.实验组和对照组miR-150-5p相对表达量分别为5.45±0.91和1.01±0.08(P<0.01),GRP94 mRNA相对表达量分别为0.32±0.05和1.02±0.11(P<0.01).GRP94和Wnt/β-catenin信号通路蛋白表达减少.结论:FOXD2-AS1在卵巢癌组织和细胞系呈高表达,下调FOXD2-AS1可调控miR-150-5p表达,抑制卵巢癌HO-8910细胞的增殖和迁移,可发挥抑癌基因的功能.

[目的]筛选出在肺癌组织中特异性表达的长链非编码RNA(lncRNA),并探讨其在肺癌中的表达水平与患者预后的相关性.[方法]从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)下载肺癌临床病理和基因表达谱信息.以| FoldChange |＞2和校正后的P值(FDR)＜ 0.05为标准筛选差异表达的lncRNA.对差异表达显著的FOXD3-AS1进行RNA结合蛋白(RBP)预测,并用关联矩阵法构建差异表达的lncRNA-RBP-mRNA共表达网络,继而对共表达mRNA进行Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)通路富集分析;通过Kaplan-Meier Plotter方法研究FOXD3-AS1与预后相关性.[结果]共筛选出1 362个在肺癌中差异表达的lncRNA,其中表达上调的1 184个,表达下调的178个.与FOXD3-AS1具有共表达关系的mRNA共有11个.KEGG分析这些共表达的mRNA主要富集在黏着连接、结肠直肠癌和松弛素信号通路,RBP预测发现FOXD3-AS1可以与人丝氨酸/精氨酸富有剪接因子SRSF1结合.FOXD3-AS1与肺癌患者生存曲线具有极显著相关性(P＜0.01).[结论]SRSF1居于lncRNA-RBP-mRNA共表达网络的核心位置,在肺癌的发生、发展中起到重要的调控作用,有望成为肺癌免疫治疗的分子靶标.差异表达的FOXD3-AS1可以很好地判断肺癌患者的预后,因此,可以作为潜在的肺癌检测分子标志物.

目的 通过生物信息学分析方法筛选滑膜肉瘤组织中关键lncRNA、microRNAs和mRNA,阐述其互相作用机制以及关键信号通路.方法 通过Gene Expression Omnibus (GEO)在线数据库检索并下载人滑膜肉瘤转录组数据,并应用基因本体论分析(Gene Ontology,GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)、竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNAs)互作网络分析和蛋白互作网络分析(Protein-Protein Interaction,PPI)对差异表达基因进行深入分析.结果 共4个数据集纳入本项研究包括GSE28866,GSE 18546,GSE2719和GSE42977,包含21个滑膜肉瘤组织和56个正常对照组织,在这些数据集中共获取了12个差异表达的lncRNA,119个差异表达的miRNA和1637个差异表达的mRNA.构建ceRNA调控网络并展示lncRNA-miRNA-mRNA之间的调控作用,发现6个IncRNA(RP11-123K19.1,RP11-261N11.8,MEG3,FOXD2-AS1,CTD-2228K2.7,LINC00982)和7个miRNA(hsa-miR-142-5p,bsa-miR-548c-3p,hsa-miR-1224-5p,hsa-miR-133b,hsa-miR-206,hsa-miR-378-3p,hsa-miR-765)在滑膜肉瘤病变中具有重要作用.KEGG分析示滑膜肉瘤病变与47个信号通路显著相关(P＜0.05),特别是癌症中转录失调的信号通路(P=5.56×10-8).PPI互作网络分析展示了154种蛋白质,6种转录因子和10个信号通路之间的相互作用.结论 通过对在线数据库进行生物信息学分析,滑膜肉瘤的多个关键分子靶点和信号通路被确认,有助于对滑膜肉瘤病变分子发病机制进行深入研究.

目的:探索长链非编码RNA(lncRNA)LINC00152在食管鳞癌组织中的表达及临床意义.方法:选取2008年1月至2013年12月在温州医科大学附属第一医院行手术切除并经病理科确认的95例食管鳞癌患者.采用lncRNA microarray基因芯片技术,对食管鳞癌患者转移组和非转移组间癌组织和对应的癌旁正常组织lncRNA的相对表达水平进行检测,寻找差异表达的lncRNA;应用qRT-PCR技术对差异表达的lncRNA在鳞癌组织样本中进行验证;分析目标lncRNA表达水平与临床特征的相关性;绘制ROC曲线评价LINC00152作为食管鳞癌转移预测因子的效能;检索国际基因芯片lncRNA数据库相关数据,分析LINC00152表达水平和生存期的关系.结果:LncRNA microarray基因芯片实验发现食管鳞癌转移组和非转移组间lncRNA相对表达量5倍以上差异表达的共有10条;qRT-PCR验证实验发现3条lncRNA(MIR205HG、LINC00152和FOXD2-AS1)的表达量在组间差异有统计学意义(P<0.05);统计分析发现LINC00152的相对表达量和食管鳞癌的淋巴结转移具有相关性(P<0.01);ROC曲线分析显示LINC00152判断食管鳞癌转移的AUC为0.781(95％CI=0.512～0.824,P=0.032);国际基因芯片食管癌组织数据库检索结果显示,LINC00152的高表达预示较差的生存期.结论:LINC00152可能参与了食管鳞癌的转移发生过程,是食管鳞癌预后判断新的生物标志物.