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红盲高原鳅线粒体基因组测定及其系统发育关系分析
编辑人员丨1周前
红盲高原鳅(Triplophysa erythraea Liu&Huang,2019)是2019年发表的一种真洞穴鱼类,具有重要的洞穴生物学和进化生物学研究意义以及物种保护价值.2021年7月,在湖南省湘西土家族苗族自治州花垣县大龙洞采集到2尾样本.通过高通量测序技术对其中1尾的线粒体DNA序列进行分析,该线粒体DNA呈双链闭合环状结构,全长为16 585 bp,共含有37个基因,其中包括13个蛋白编码基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因,以及两段非编码区,即L链复制起始区OL和H链复制起始区OH,碱基组成为 A(31.2%)、G(15.8%)、C(26.0%)、T(27.0%),A+T 的含量为 58.2%.基于蛋白编码基因使用最大似然法和贝叶斯法构建高原鳅属系统进化树,确定了红盲高原鳅在进化树上的位置.本研究为高原鳅属鱼类的进化研究以及物种保护工作提供了基础数据.
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编辑人员丨1周前
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新疆额敏河干流鱼类群落结构及其与环境因子的关系
编辑人员丨2023/8/6
2016年10月在额敏河干流设置4个监测断面,对该水域鱼类群落结构进行研究.结果表明:调查共采集鱼类3148尾,隶属于3目4科10属,共计11种;额敏河干流的鱼类优势种为鲫(Carassius auratus Linnaeus)、新疆高原鳅(Triplophysa strauchii Kessler)、麦穗鱼(Pseudorasbora parva Temminck et Schlegel)、斯氏高原鳅(Triplophysa stoliczkae Steindachner)和棒花鱼(Abbottina rivularis Basilewsky).对各个采样断面鱼类群落生物多样性的分析结果表明,第1断面与第4断面多样性指数较高.利用去趋势对应分析(DCA)与冗余分析(RDA),将鱼类群落在空间上分为3组:1、2断面为一组,其余两个断面各占一组.排序结果显示,pH与溶解氧是影响鱼类群落变异的主要环境因素,其次是温度与电阻率.本研究结果初步揭示了额敏河干流鱼类群落结构特征,为该流域鱼类资源的养护及利用提供参考.
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编辑人员丨2023/8/6
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西藏高原鳅、细尾高原鳅和异尾高原鳅消化道结构的比较
编辑人员丨2023/8/6
运用解剖学、组织学方法比较研究西藏高原鳅(Triplophysa tibetana)、细尾高原鳅(Triplophysa stenura)和异尾高原鳅(Triplophysastewarti) 3种高原鳅的消化道结构.结果表明: (1)3种高原鳅的消化道均由口咽腔、食道、胃、肠组成.胃"U"型, 无幽门盲囊, 肠道短, 可分为前、中、后三个部分.异尾高原鳅胃长与消化道长比值最大, 比肠长最短, 为0.51±0.07, 与西藏高原鳅比肠长0.64±0.08和细尾高原鳅比肠长0.70±0.06, 差异显著.(2)异尾高原鳅胃黏膜层相对高度大于西藏高原鳅和细尾高原鳅, 肌肉层相对厚度也比其他2种鱼厚.前肠黏膜层为异尾高原鳅相对高度最大, 肌肉层为西藏高原鳅相对最厚.中肠与后肠黏膜层相对厚度由大到小为异尾高原鳅>细尾高原鳅>西藏高原鳅.综上所述, 3种高原鳅的消化道结构均符合肉食性鱼类特征, 推测异尾高原鳅的结构特征适于消化更多的动物性饵料.
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编辑人员丨2023/8/6
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玫瑰高原鳅肠道微生物多样性研究
编辑人员丨2023/8/5
研究旨在分析玫瑰高原鳅(Triplophysa rosa)肠道微生物的结构组成和多样性,探索其肠道微生物的潜在功能.提取了5尾玫瑰高原鳅的肠道总DNA,运用Illumina Miseq平台对肠道微生物16S rRNA的V3—V4区进行了测序,统计样品肠道微生物的操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTUs)数量,分析物种组成、丰度及Alpha多样性,并预测肠道微生物的功能.结果显示,玫瑰高原鳅的肠道微生物有19门、31纲、87目、146科、253属、320种,451个OTUs.在门水平上,优势菌群为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actino-bacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes);在属水平上,优势菌群为气单胞菌属(Aeromonas)、爱德华菌属(Ed-wardsiella)、邻单胞菌属(Plesiomonas)和希瓦氏菌属(Shewanella).功能预测表明,肠道微生物编码的大多数基因与新陈代谢相关,其中"碳水化合物运输和代谢"和"氨基酸转运与代谢"功能类群的相对丰度较高.玫瑰高原鳅肠道内微生物组成复杂,其功能分析有助于理解肠道微生物对玫瑰高原鳅摄食的影响,为进一步研究玫瑰高原鳅的食性提供了理论基础.
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编辑人员丨2023/8/5
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瓦氏雅罗鱼SLC26A1基因的克隆及表达特性分析
编辑人员丨2023/8/5
以瓦氏雅罗鱼为研究材料,利用团队前期转录组数据对瓦氏雅罗鱼SLC26A1基因进行克隆.结果表明,SLC26A1基因CDS长度为2 562 bp,编码蛋白质长度为854 aa,蛋白理论等电点为8.97,蛋白大小为94.18kD.预测SLC26A1属于膜蛋白,含有12个跨膜区.进化树分析结果显示,瓦氏雅罗鱼的SLC26A1与西藏高原鳅、鱇浪白鱼的SLC26A1序列遗传关系较近.qRT-PCR组织特异性表达分析表明,SLC26A1基因在瓦氏雅罗鱼肾和肠中表达量较高,在鳃、头肾、脑、脾脏和肝脏中少量表达;碱胁迫处理后SLC26A1基因的表达上调,表明该基因可能参与碱胁迫反应.研究推测,SLC26A1可能以转运阴离子的方式参与了瓦氏雅罗鱼的耐高碱机制.
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编辑人员丨2023/8/5
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云南星云湖长臀云南鳅两性异形及其生境适应性
编辑人员丨2023/8/5
云南鳅属鱼类是云贵高原及邻近区域特有鱼类,其独特两性异形现象可能是对喀斯特高原特定生境的一种重要适应.本文对云南星云湖特有鱼类长臀云南鳅两性异形、个体繁殖力及与之关联的雌雄摄食分化问题进行了研究,以揭示其两性异形特征并探讨其与生境的关系.结果表明:长臀云南鳅两性异形指数为0.23,表明它是偏向于雌性体型较大的两性异形类型.同时,雌雄外部形态存在明显的色斑差异,雌鱼体侧密布横向色斑,而雄鱼体侧则有一明显的纵向条纹,横向色斑稀少或缺乏.单因素方差分析、主成分分析、判别分析及单因素相似性分析(ANOSIM)等进一步证实长臀云南鳅雌雄形态性状明显分离,全长、叉长、体长、头宽/头长、腹鳍起点-胸鳍起点(JK)/体长等对两性形态差异起主导作用.雌鱼繁殖力为(1364.5±489.3)粒,变化幅度为470~2430粒,其繁殖力随体长的增长而增大.食物分析显示,长臀云南鳅以摇蚊幼虫、蜉蝣稚虫为主要食物,食性较为狭窄.雌雄长臀云南鳅食物组成较为相似,但两者具有统计学意义上的显著差异.繁殖力选择压力、食物分化等可能对星云湖长臀云南鳅两性异形的形成起重要驱动作用,而两性异形的出现是长臀云南鳅对喀斯特贫营养龙潭生境的一种重要适应.
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编辑人员丨2023/8/5
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金沙江下游支流黑水河鱼类资源现状
编辑人员丨2023/8/5
为了解黑水河鱼类资源现状,于2018年11月-2019年9月在黑水河23个采样点开展了4次鱼类资源调查,共采集到鱼类44种,隶属于4目10科33属,其中长江上游特有鱼类11种.黑水河鱼类以红尾副鳅(Paracobitis varigatus)、短须裂腹鱼(Schizothorax wangchiachii)、大桥高原鳅(Triplophysa daqiaoensis)、宽鳍鱲(Zacco platypus)、短体副鳅(P.potanini)和中华纹胸鮡(Glyptothorax sinense)为优势种,分别占渔获物总重量的28.44%、28.01%、16.66%、7.18%、5.09%和3.36%.不同河段鱼类组成相似性指数分析结果显示,苏家湾坝上河段和765回水点以下河段相似性指数最低,为24.32%;苏家湾坝上河段和松新坝址至老木河坝址河段相似性指数最高,达61.90%.通过个体生态学矩阵分析,黑水河鱼类群落以亲流型、口下位和杂食性类群为主.黑水河从上游到下游,鱼类多样性指数呈上升趋势,不同季节多样性指数变化整体上差异不显著(P>0.05).丰度生物量比较曲线显示,黑水河鱼类群落结构整体上受到中度干扰.与历史资料相比,黑水河鱼类存在小型化趋势,需加强保护.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于mtDNA D-loop分析高原鳅群体遗传多样性和系统发育
编辑人员丨2023/8/5
本研究以高原鳅属6个群体共82尾个体的线粒体DNA D-loop高变区为标记,采用分子生物信息学方法分析其遗传多样性及系统发育关系.结果表明,在570 bp的mtDNA D-loop中共检测到149个多态位点,由此界定了 39个单倍型.在6个群体中,单倍型多样度(Hd)由高到低依次为细尾高原鳅(T.stenura)(0.899)>东方高原鳅(T.orientalis)>似鲶高原鳅(T.siluroides)>达里湖高原鳅(T.dalaica)/黄河高原鳅(T.pap-penheimi)>湘西盲高原鳅(T.xiangxiensis)(0.286);核苷酸多样度(Pi)由高到低依次为似鲶高原鳅(0.042 59)>黄河高原鳅>细尾高原鳅>东方高原鳅>达里湖高原鳅>湘西盲高原鳅(0.000 5);细尾高原鳅与湘西盲高原鳅群体间遗传距离(0.186)最大,达里湖高原鳅与东方高原鳅群体间遗传距离(0.027)最小;细尾高原鳅与达里湖高原鳅群体间遗传分化程度(0.989)最大,似鲶高原鳅与东方高原鳅群体间遗传分化程度(0.222)最小.其中仅有一个单倍型(Hap29)为达里湖高原鳅与似鲶高原鳅群体所共有,其余均为特有单倍型.进化树显示6个高原鳅群体分为三大支,其中细尾高原鳅自成一支;湘西盲高原鳅与黄河高原鳅聚成一支;其余东方高原鳅、达里湖高原鳅和似鲶高原鳅聚成一支.Network与系统发育树结果基本一致.就单倍型丰富度和核苷酸多样性而言,似鲶高原鳅遗传多样性较高,湘西盲高原鳅遗传多样性较低.就系统发育而言,群体间的分化程度支持了其分类地位;似鲶高原鳅、东方高原鳅和达里湖高原鳅的亲缘关系相对较近;不同的聚类推测高原鳅可能至少经历了 3次驯化事件.本研究结果为高原鳅鱼类生物多样性保护和评价提供遗传学理论依据.
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编辑人员丨2023/8/5
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似鲇高原鳅肠道细菌组成、产酶能力及生长特性研究
编辑人员丨2023/8/5
[目的]为探讨黄河上游特有鱼类似鲇高原鳅(Triplophysa siluroides)肠道菌群组成、产酶能力及其生长特性.[方法]采用传统培养法分离似鲇高原鳅的肠道细菌,并通过16S rRNA序列分析对其肠道菌群种类进行鉴定,同时利用筛选培养基筛选产蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶的菌株,进而对产酶活性较强的菌株进行生长特性分析.[结果]研究发现似鲇高原鳅肠道菌群主要归属于变形细菌门(Proteobacteria)中的气单胞菌属(Aeromonas)、假单胞菌属(Pseudo-monas)、不动杆菌属(Acinetobacter)和希瓦氏菌属(Shewanella),其中气单胞菌属为优势菌群.产酶能力分析发现产酶菌株有11株,分别为隶属于不动杆菌属的G1、G2、G3、G4、G7、G10和气单胞菌属的G5、G6、G8、G9、G11,其中G1、G2、G4、G5、G6、G7这几株菌株综合产酶能力强,G1、G5产蛋白酶和脂肪酶,G2、G4产蛋白酶和淀粉酶,G3、G11产蛋白酶,G6产蛋白酶、脂肪酶和淀粉酶,G7产脂肪酶和淀粉酶.生长特性分析发现G1、G2、G4、G5、G6、G7这几株菌株最适温度都是28℃,最佳pH值是7.0~8.0,最佳盐度是0.6%~1.0%,最佳接种量是6%~8%,在培养24 h~30 h后生长趋于平缓、进入稳定期.[结论]似鲇高原鳅肠道菌群可分为1门4属,其中产酶菌株有11株,对其中6株具有较强产酶能力的菌株进行了生长特性分析,这为似鲇高原鳅肠道细菌的开发利用奠定了基础.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于线粒体Cytb基因分析高原鳅种群遗传多样性与系统发育关系
编辑人员丨2023/8/5
以高原鳅(Triplophysa)属鱼类8个种群共75个个体的线粒体Cytb基因为标记,通过生物信息学分析高原鳅属种群遗传多样性和系统发育关系.结果表明,全长1 140bp的Cytb基因序列中共检测到527个多态位点,界定了61个单倍型,A+T含量(55.9%)高于G+C含量(44.2%).8个种群单倍型多样度(Hd)范围在0.667~1.000之间,核苷酸多样度(Pi)在0.001~0.089之间,其中似鲶高原鳅(T.siluroides)遗传多样性水平最高(Hd=1.000,Pi=0.089),壮体高原鳅(T.robusta)遗传多样性水平最低(Hd=0.667,Pi=0.001);叶尔羌高原鳅(T.yarkandensis)与黄河高原鳅(T.pappenheimi)间的遗传距离最远(D=0.243),达里湖高原鳅(T.dalaica)与壮体高原鳅间的遗传距离最近(D)=0.086);遗传分化系数表明:8个高原鳅种间存在着高度遗传分化(Fst>0.25),并且种群之间基因流较弱(Nm<1);分子系统发育进化树显示,细尾高原鳅与西藏高原鳅聚为一支,黄河高原鳅、似鲶高原鳅、壮体高原鳅、达里湖高原鳅四大种群聚为一支,贝氏高原鳅与叶尔羌高原鳅聚为一支.本研究为进一步对高原鳅属鱼类系统分类研究提供资料,以及对高原鳅保护措施提供了遗传学依据.
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编辑人员丨2023/8/5