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基于多数据库分析转移性黑色素瘤和乳腺癌脑转移的关键调控基因及其生物学特征
编辑人员丨4天前
目的:通过生物信息数据库的挖掘,探究转移性黑色素瘤和乳腺癌脑转移的关键调控基因、生物学特征和通路。方法:使用基因表达综合(GEO)数据库中转移性黑色素瘤和乳腺癌脑转移的样本数据集GSE8401、GSE46517和GSE12237进行差异基因筛选,设定 P<0.05及logFC>2具有统计学意义,找出差异基因(DEGs)。进一步对DEGs进行基因本体论(Gene Ontology)分析和DAVID数据库通路分析,使用String数据库制作DEGs的蛋白质相互作用(PPI)网络并利用Cytoscape可视化,使用分子复合物检测(MCODE)插件用于筛选Cytoscape中PPI网络的显著交互模块,使用cytoHubba插件对网络进一步分析,采用六种算法来选择枢纽基因,最后使用GeneMARIA数据库构建了枢纽基因和具有共同生物学功能的基因的共表达网络。 结果:最终得到158个DEGs( P<0.05,logFC>2),其中45个基因显著下调,113个显著上调。筛选所得的DEGs主要GO富集为:(1)生物过程(BP):DEGs主要富集在RNA剪接的调控,通过剪接体调控mRNA的剪接,DNA重组的正调控,双链断裂修复的正调控。(2)细胞成分(CC):DEGs主要集中在核小体,焦点黏附,细胞-基质结合点,核染色体,原始溶酶体,嗜酸性颗粒体。(3)分子功能(MF):DEGs主要集中在DNA转录因子结合和RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA结合转录因子结合上。通过string数据库,获得初步的DEGs的PPI网络(度截止=2,节点分数截止=0.2,k核心=2,最大深度=100),得到158个蛋白质节点和196条连线。通过Cytoscape筛选获得显著的交互模块,模块1的MCODE得分为4.8,而其seed基因为UBE2V1。筛选出核心DEGs 5个,分别为UBE2N、UBE2V2、RBX1、UBE2B和RXRA。 结论:泛素化途径和核调控的细胞死亡和代谢在转移性黑色素瘤和乳腺癌脑转移中发挥重要作用。
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编辑人员丨4天前
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肛管直肠恶性黑色素瘤14例临床病理学分析
编辑人员丨4天前
目的:探讨肛管直肠恶性黑色素瘤的临床及病理学特点。方法:对14例肛管直肠恶性黑色素瘤的临床特点、免疫组织化学染色及分子病理学特点进行分析,并复习相关文献。结果:14例患者,男女各7例,年龄52~88岁,平均年龄69岁。肿瘤肉眼观呈息肉样或溃疡型改变。镜下肿瘤细胞排列方式多样,大多呈巢状排列,部分围绕血管呈假菊形团样排列,梭形细胞呈条束状及鱼骨状排列;肿瘤细胞形态丰富,细胞呈上皮样、梭形及气球样改变,部分区域失黏附,胞质嗜双染或嗜酸性,核分裂象多见,细胞异型性显著,染色质粗糙,核仁明显,部分肿瘤细胞中可见黑色素沉着。免疫组织化学染色14例HMB45、S-100蛋白、SOX10及Melan A均为阳性。分子检测14例患者中有1例发现C-KIT基因第11号外显子存在c.1659_1660insA移码突变,14例患者均未发现BRAF及NRAS突变。14例患者随访时间为20~95个月,10例存活,1例复发及3例发生转移的患者死亡。结论:直肠肛管恶性黑色素瘤因缺乏特异的临床表现容易漏诊,确诊依赖HE形态及免疫组织化学染色,本组中1例患者发现C-KIT基因第11号外显子存在c.1659_1660insA移码突变,可能会为后期临床治疗提供新的靶点。
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编辑人员丨4天前
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CD146在视网膜血管内皮细胞中的功能和机制
编辑人员丨4天前
目的::研究黑色素瘤细胞黏附分子(CD146)在视网膜血管内皮细胞中的功能及机制。方法::实验研究。于2021年1—6月构建氧诱导视网膜病变模型(OIR)小鼠16只作为实验组,以同日龄正常饲养小鼠16只作为对照组。采用免疫磁珠法分离视网膜血管内皮细胞;定量PCR分别检测2组小鼠mRNA的表达水平;免疫荧光染色检测小鼠视网膜上CD146的定位和表达。取人视网膜微血管内皮细胞(HRMEC)在1% O 2环境中培养,Western blot检测HRMEC细胞和小鼠视网膜中CD146的蛋白表达水平。CD146小干扰RNA(siCD146)转染HRMEC作为siCD146转染组,无义小干扰RNA转染作为转染对照组(NC)。采用细胞活力测定实验(MTS)、细胞增殖实验(EDU)、流式细胞术分别检测siCD146转染组和NC细胞活力、细胞增殖和细胞周期;Transwell和划痕实验检测HRMEC的迁移能力;血管生成实验检测HRMEC的血管形成能力。OIR小鼠右眼玻璃体腔注射siCD146作为siCD146注射组,左眼注射无义小干扰RNA作为阴性注射对照组(NC),采用血管免疫荧光染色观察注射后OIR小鼠眼底新生血管的情况。采用独立样本 t检验进行实验数据分析。 结果::免疫荧光染色显示,CD146在小鼠视网膜血管上特异性表达。OIR小鼠视网膜血管内皮细胞中CD146 mRNA表达水平是正常小鼠的2倍( t=6.57, P=0.003)。与21% O 2处理相比,1% O 2处理的HRMEC中CD146蛋白表达升高( t=5.79, P=0.010)。与NC组细胞相比,siCD146转染组细胞迁移和血管生成能力均受到明显抑制(Transwell:siCD146-1: t=6.15, P=0.003;siCD146-2: t=3.88, P=0.005。划痕:siCD146-1: t=2.73, P=0.041;siCD146-2: t=4.10, P=0.006。血管生成:siCD146-1: t=2.81, P=0.048;siCD146-2: t=3.10, P=0.036)。Western blot结果显示:与NC相比,siCD146转染组的Ras同源家族成员A(RHOA) (siCD146-1: t=3.60, P=0.023;siCD146-2: t=4.12, P=0.015)、磷酸化p38蛋白(siCD146-1: t=2.89, P=0.044;siCD146-2: t=3.07, P=0.038)表达均下调。视网膜铺片结果显示:与NC相比,siCD146注射组小鼠视网膜上的新生血管、无血管区面积均减少( t=8.94, P=0.001; t=11.24, P=0.001)。视网膜Western blot结果显示:相较于NC,siCD146注射组中CD146 ( t=5.62, P=0.030)、磷酸化p38蛋白( t=6.87, P=0.021)、RHOA( t=5.06, P=0.037)表达均下调。 结论::敲减CD146可以通过下调p38和RHOA的表达从而抑制视网膜血管内皮细胞的迁移和血管生成。
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编辑人员丨4天前
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紫外线促进皮肤恶性黑色素瘤转移研究进展
编辑人员丨4天前
皮肤恶性黑色素瘤(CM)是一种早期即可发生转移,预后不良的侵袭性恶性皮肤系统肿瘤。紫外线(UV)辐射已被公认在CM发生中起重要作用,但其在CM远处转移过程中的作用尚不明确。该文从UV辐射对瘤细胞运动迁移能力、黏附特性、代谢特点的影响及对肿瘤微环境的改变等多个方面进行归纳,综述了UV辐射对CM远处转移的影响及相关分子机制,以期为CM转移机制的研究及临床预防和治疗提供新的思路。
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编辑人员丨4天前
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15例脉络膜黑色素瘤患者临床及病理学特征分析
编辑人员丨4天前
目的:观察脉络膜黑色素瘤(CM)患者的临床及病理学特点。方法:回顾性病例研究。2011年至2021年于苏州大学附属第二医院病理科收检并经病理检查确诊的CM患者15例15只眼的石蜡标本纳入研究。通过医院信息系统回顾性收集患者年龄、性别、临床表现、治疗方案、病理检查结果等。分析其临床特点、免疫组织化学(免疫组化)染色、分子病理学特点。结果:15例患者中,男性8例,女性7例;平均年龄61岁;均为单眼发病。主述视力下降、视物模糊、眼前黑影遮挡感8例;眼红、流泪、脓性分泌物1例;视力丧失、无光感2例;伴视网膜脱离4例。肿瘤平均直径1.4 cm。肿瘤大体外观呈半球形、"蘑菇形"或扁平弥漫形。肿瘤细胞多呈实性、片状、交叉簇状排列,部分围绕血管呈假"菊形"团样排列伴坏死。15只眼中,梭形细胞型、上皮样型、混合细胞型分别为6、2、7只眼。胞质部分嗜双色或嗜酸性,部分透明,部分富含色素;细胞黏附性差,异形性显著,染色质粗糙,核分裂象多见,核仁明显。免疫组化染色结果显示,所有患眼肿瘤组织中HMB45、SOX10、S100、Melan-A均为阳性;上皮源性标记AE1/3、淋巴源性标记LCA以及神经内分泌标记CgA、Syn均为阴性。基因检测结果显示,所有患者均未发现 C-KIT、 BRAF、 NRAS基因突变。随访时间为8~ 98个月。15例患者中,生存12例;肿瘤复发和(或)转移死亡3例。 结论:CM临床无特异性表现,确诊依赖组织学形态及免疫组化染色。
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编辑人员丨4天前
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基于转录组学分析CD146在人类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞条件培养液状态下的EAhy.926细胞中的基因表达差异
编辑人员丨1周前
黑色素瘤细胞黏附分子CD146作为一种新的内皮细胞标志物,其表达与肿瘤、自身免疫性疾病的进展密切相关.类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是一种以对称性、慢性多关节炎症为特征表现的系统性自身免疫性疾病,滑膜血管翳作为RA的代表性病理产物在疾病的发生发展中起着重要作用.为了研究CD 146分子在人类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞(human rheumatoid arthritis fibroblast like synovial cell,HFLS-RA)条件培养液状态下的人脐静脉内皮细胞株 EAhy.926 的基因表达差异及其影响机制,本研究通过慢病毒介导的RNA干扰技术抑制EAhy.926细胞中CD146的表达.培养并提取HFLS-RA上清液制备条件培养液.将转染后的EAhy.926细胞用HFLS-RA条件培养液培养24 h构建RA损伤模型,并对其进行转录组测序,筛选出差异表达基因(differentiallly expressed genes,DEGs),并通过GO、KEGG通路分析,探索CD146调控的DEGs主要参与的相关信号通路及生物学过程.结果显示,与对照组细胞相比,HFLS-RA条件培养液状态下CD146敲低的EAhy.926细胞有341个DEGs,其中上调基因有173个,下调基因有168个;GO、KEGG通路分析发现DEGs主要富集在Wnt信号通路、PPAR信号通路、TRP通道的炎症介质调节、脂肪细胞因子信号通路上,参与了细胞黏附、细胞运动、细胞定位、半胱氨酸生物合成过程等生物过程.本研究通过转录组学分析发现在HFLS-RA条件培养液状态下,CD146分子可能通过多条关键信号通路及多个基因影响EAhy.926.研究结果为探讨CD146分子在类风湿关节炎滑膜血管生成中的作用及机制的研究提供了理论依据.
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编辑人员丨1周前
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EB病毒阴性胃淋巴上皮瘤样癌1例并文献复习
编辑人员丨2023/12/2
回顾性分析1例胃淋巴上皮瘤样癌(lymphoepithelioma-like gastric carcinoma,LELGC)患者的临床病理特点并复习相关文献.本例患者因剑突下疼痛入院,外院胃镜提示胃窦部巨大溃疡,入院增强CT提示胃窦部胃壁增厚并明显强化,考虑胃窦部恶性肿瘤,行根治性手术切除.术后病理检查提示:远端胃可见一大小约为4.5 cm×5.5 cm×1.0 cm的溃疡型肿物,似侵及深肌层.特殊染色结果示幽门螺杆菌阳性.原位杂交结果示Epstein-Barr病毒(Epstein-Barr virus,EBV)编码区阴性.免疫组织化学染色示广谱细胞角蛋白、表皮生长因子受体、P53(野生型)、上皮膜抗原、细胞黏附分子、黏蛋白(mucin,MUC)-6均为阳性,细胞增殖的相关抗原Ki-67为60%阳性,淋巴细胞共同抗原和CD3均为部分阳性,人髓细胞增生原癌基因、细胞周期蛋白D1和CD5均为弱阳性,人类表皮生长因子受体-2、D20、CD10、多发性骨髓瘤癌基因1、CD79a、B细胞白血病/淋巴瘤(B-cell leukemia/lymphoma,BCL)-2、BCL-6、CD56、间变性淋巴瘤激酶、配对盒蛋白5、突触素、嗜铬粒蛋白A、CD8、波形蛋白、黑色素瘤相关抗原HMB45、黑色素A、神经特异性蛋白质S-100、SOX10、E-钙黏蛋白、尾侧型同源盒转录因子-2、MUC-5ac、MUC-2均为阴性.苏木精-伊红染色结果示:肿瘤细胞核分裂活跃,可见病理性核分裂象.通过文献复习发现,80%以上的LELGC患者与EBV感染相关,早期LELGC主要通过内镜黏膜下剥离或根治性切除术治疗,而晚期患者多采用姑息性治疗.LELGC患者过度表达程序性死亡受体配体1,这表明程序性死亡受体1/程序性死亡受体配体1抑制剂可作为LELGC的潜在治疗靶点,具有广阔的治疗前景.
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编辑人员丨2023/12/2
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ALCAM在不同肿瘤中的表达及其作用
编辑人员丨2023/8/6
活化白细胞黏附分子(activated leukocyte cell adhesion molecule,ALCAM),最早发现于转移性黑色素瘤细胞系,随之发现ALCAM在活化的T细胞、活化的单核细胞、上皮细胞和成纤维细胞等中均有表达.近年发现,ALCAM在胰腺癌、结肠癌、子宫颈癌、前列腺癌、卵巢癌和口腔鳞状细胞癌等多种肿瘤中的表达量较正常组织升高,与癌症进展有关,且参与肿瘤的浸润和转移,可被视作潜在的肿瘤细胞标志物.
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编辑人员丨2023/8/6
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上皮样血管肉瘤6例及文献复习
编辑人员丨2023/8/5
目的 分析上皮样血管肉瘤的临床及病理学特点.方法 收集原发于肾上腺、脾脏、头顶皮肤、外阴和乳腺上皮样血管肉瘤6例的临床资料,应用组织病理学及免疫组织化学法并结合相关文献分析其镜下及临床特点.结果 6例标本大体均呈结节状,与周围组织界限不清,部分呈囊壁样伴出血及坏死.镜下肿瘤细胞部分呈上皮样弥漫生长,部分形成不规则裂隙结构,细胞体积大,圆形、多边形或梭形,胞质丰富嗜酸性或嗜双色性,核仁明显,核分裂相多少不等.6例均弥漫表达波形蛋白(Vimentin)、血小板-内皮细胞粘附分子(platelet endothelial cell adhesion molecule-1,CD31)和ERG且部分表达广谱细胞角蛋白(cytokeratin,CK),5例表达CD34、Fli-1和凝血因子Ⅷ(factor Ⅷ,FⅧ),Ki-67指数20%~30%,6例均不表达嗜铬粒蛋白A(chromogranin A,CgA)、突触素(synapsin,Syn)、神经细胞黏附分子56(neuronal cell adhesion molecules 56,CD56)、黑色素A(melan-A)、S-100蛋白、HMB45、抑制素α(α-Inhibin)和配对盒基因(paired box gene 8,PAX-8).结论 上皮样血管肉瘤十分罕见,易漏诊、误诊,明确诊断需要结合病理形态学和免疫表型.
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编辑人员丨2023/8/5
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光动力疗法抑制黑色素瘤的迁移、侵袭和上皮间质转化
编辑人员丨2023/8/5
目的 研究以5-氨基乙酰丙酸为光敏剂的光动力疗法(AlA-PDT)对黑色素瘤细胞A375迁移、侵袭和上皮间质转化的影响.方法 体外培养人黑色素瘤A375细胞,采用不同光照强度的ALA-PDT处理,采用CCK8检测不同光照强度对A375细胞增殖能力的影响,采用划痕实验、Transwell法实验检测A375细胞迁移和侵袭能力,采用免疫印迹法(Western blot)检测上皮间质转化相关分子,如上皮性钙黏附蛋白(E-cadherin)、Snail、TGF-β、Smad2和Smad3蛋白表达情况.结果 与对照组相比,ALA-PDT处理组A375细胞迁移和侵袭能力有不同程度的降低(P<0.05),上皮间质转化相关分子E-cadherin表达量显著增加(P<0.01),而Snail、Smad2、Smad3和TGF-β的表达量则显著降低(P<0.05).结论 ALA-PDT不但可以抑制黑色素瘤的迁移和侵袭能力,而且还可以抑制黑色素瘤的上皮间充质转化.
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编辑人员丨2023/8/5
