目的:了解青海省玉树藏族自治州（简称玉树州）鼠疫耶尔森菌（简称鼠疫菌）规律成簇的间隔短回文重复（CRISPR）的基因分型，探讨其遗传特征。方法:选取1963 - 2007年分离自玉树州鼠疫自然疫源地的44株代表性鼠疫菌，提取DNA，针对CRISPR的3个位点（YPa、YPb和YPc）设计引物，进行PCR扩增，并对扩增产物进行测序及分析，鉴定CRISPR间区序列（spacer），确定CRISPR基因型和类群。结果:44株鼠疫菌在CRISPR 3个位点上共有23种spacer，YPa位点14种、YPb位点6种、YPc位点3种，其中有2种新spacer，a106和a107。根据spacer阵列形式，44株鼠疫菌被分为15个CRISPR基因型、6个CRISPR类群，6个类群分别为Cb4、Cc3′、Ca7、Ca7′、Ca△5′和Ca35′，其中Ca7为主要流行类群（34株）。结论:玉树州鼠疫菌CRISPR位点具有多种基因型，遗传多态性较高，种群结构复杂。

目的:了解云南松鼠是否携带鼠疫噬菌体，并探讨其流行病学意义。方法:2015 - 2018年，在云南鼠疫疫源地和非疫源地的5个调查点进行鼠疫宿主动物调查。对调查中捕获的松鼠，取其脾、肝、肠道标本，低温保存备用。取肠道标本磷酸盐缓冲液（PBS）增菌液，经0.22 μm滤膜滤过后加入到含有100 μl鼠疫疫苗株（EV76）菌悬液的LB液体培养基中，28 ℃、220 r/min恒温气浴振荡培养18~24 h，采用双层平板法观察噬菌斑的生长情况，电镜下观察鼠疫噬菌体的形态结构；同时取脾、肝、肠道标本进行鼠疫菌特异标志基因caf1检测。结果:共捕获到10只松鼠，其中赤腹松鼠8只，珀氏长吻松鼠2只。共分离出4株鼠疫噬菌体，其中在赤腹松鼠分离出2株，在珀氏长吻松鼠分离出2株；家鼠鼠疫疫源地弥勒县和新平县各分离出1株，野鼠鼠疫疫源地剑川县和洱源县未分离出，非鼠疫疫源地永善县分离出2株。肉眼下观察，家鼠鼠疫疫源地分离出的2株噬菌体产生的噬斑为透明状，生长状态良好；非鼠疫疫源地分离出的2株噬菌体产生的噬斑为半透明状，生长状态欠佳。电镜下观察，噬菌体为较典型的肌尾噬菌体，噬菌体头部直径约40 nm，肌尾约120 nm，肌尾末梢可见尾丝簇。10份松鼠脾、肝、肠道标本caf1检测均为阴性。结论:云南松鼠中携带鼠疫噬菌体的比例较高，虽然鼠疫菌特异标志基因caf1检测均为阴性，但由于鼠疫噬菌体的存在，松鼠有可能成为鼠疫菌传播的一种载体。

鼠疫是由鼠疫耶尔森菌（以下简称鼠疫菌）引起的一种烈性传染病，发病急、传播快且病死率极高。历史上发生过3次鼠疫大流行，导致上亿人口死亡。近20年来全球鼠疫疫情呈上升趋势，2000 - 2018年，世界卫生组织（WHO）共收到来自美洲、非洲和亚洲21个国家报告的2万多起鼠疫病例 [1]。我国动物间鼠疫一直较为活跃，且除个别年份外，几乎每年都有人间鼠疫发生。2019年11月，北京市首先出现2例内蒙古自治区输入性肺鼠疫病例，随后内蒙古自治区又报道2例腺鼠疫病例，提示这一甲类传染病仍对人们的生命安全具有极大的潜在威胁 [2,3,4]。链霉素是WHO鼠疫手册 [5]和我国《鼠疫诊疗方案（试行）》（卫办应急发[2011]第18号） [6]中治疗鼠疫的首选药物。但值得注意的是，2021年Dai等 [7]发现国内1株鼠疫菌因编码核糖体蛋白S12的rpsL基因第128 bp位点的碱基发生了突变，从而产生了对链霉素的高度耐药性。为此，本研究应用基于TaqMan-MGB荧光探针的实时荧光PCR法（简称MGB荧光探针法），选取鼠疫流行较为严重的玉树藏族自治州（以下简称玉树州）鼠疫自然疫源地内分离的鼠疫菌，检测链霉素耐药位点rpsL基因第128 bp位点碱基的突变情况，判断当地菌株的耐药情况，为鼠疫疫情的防控提供参考。

新型冠状病毒肺炎疫情的暴发流行，使全社会重新认识了传染病发生、流行及防控所面临的巨大挑战，即便是当前对传染病防范的认知、应对技术和社会经济条件已有历史上最好的基础。在传染病的监测预警中，研究和利用各类传染病发生与传播相关因素的数据，以期在传染病发生的早期甚至发生前识别疫情信号，成为传染病防控研究的重要命题。病原体是传染病发生的原因，所以以病原学为核心的实验室监测是传染病预警体系的重要组成部分。我国目前已经初步建成了基于国家致病菌识别网的细菌性传染病实验室监测预警系统，其核心是识别病原、识别暴发、识别来源，在鼠疫、霍乱、流脑等细菌性传染病的早期发现、溯源和精准防控中起到重要作用。本期重点号围绕实验室监测在细菌性传染病预警和防控中的作用，从流行和暴发菌株特征分析、与流行病学调查的联合应用、与常规病例监测体系的融合等方面开展研究，体现了实验室监测在传染病风险评估和疫情调查中的作用，同时对实验室监测预警技术及应用场景进行了综述和展望，以期为推动我国传染病监测预警体系的跨越发展提供新思维。

目的:分析贵州省鼠疫疫源地监测结果，掌握当地鼠疫疫情动态，以便制订防控措施。方法:于中国疾病预防控制信息系统鼠疫防治信息管理系统，收集2018 - 2020年贵州省鼠疫监测点的鼠疫监测数据，分析贵州省鼠疫疫情。监测数据中鼠类动物捕获方法为笼夹法、5 m笼夹法和逐日捕鼠法，实验室检测采用细菌培养法和血球凝集法。结果:室内采用笼夹法共捕获鼠类动物2 273只，以褐家鼠为优势种，占47.29%（1 075/2 273）；黄胸鼠和小家鼠为常见种，分别占43.55%（990/2 273）和5.10%（116/2 273）。室外采用5 m笼夹法共捕获鼠类动物1 460只，以斯氏家鼠为优势种，占35.48%（518/1 460）；黄胸鼠和大绒鼠为常见种，分别占16.03%（234/1 460）和8.70%（127/1 460）。共检查鼠类动物5 742只（其中包括笼夹法和5 m笼夹法捕获的3 733只以及逐日捕鼠法捕获的2 009只），检出带蚤鼠类动物1 176只，鼠体染蚤率为20.48%；印鼠客蚤占56.63%（3 020/5 333），为优势蚤种，印鼠客蚤指数为0.53。实验室检测结果均为阴性。结论:贵州省鼠疫疫源地仍然处于静息状态，但不能排除复燃的可能。应进一步加强鼠疫监测工作，提高鼠疫监测质量，做好健康教育宣传，严防人间鼠疫暴发流行。

目的:分析1950-2019年德宏傣族景颇族自治州（德宏州）鼠疫流行情况及影响因素，为制定有效的防控策略提供理论依据。方法:收集1950-2019年德宏州动物和人间鼠疫疫情资料和监测数据资料，进行描述性流行病学方法分析，采用SPSS 20.0软件建立多重线性回归方程，分析动物间鼠疫与鼠密度和蚤指数的相关关系，以及人间鼠疫与动物间鼠疫的相关关系。结果:1950-2019年德宏州鼠疫经历了流行-静息-再流行-再静息的循环流行，在5个县（市）的36个乡（镇）共判定疫点数614个，人间鼠疫流行15个年次，发现1 153例病例，死亡379例。1982-2019年捕获鼠类261 319只，黄胸鼠占70.95%（185 421/261 319）；共检获蚤类70 124匹，印鼠客蚤占76.65%（53 752/70 124）；印鼠客蚤指数为0.57，游离蚤指数为0.22；从285 091份动物标本及60 119组蚤类分离出鼠疫菌1 577及418株；从64 157份血清中检出255份F1抗体阳性标本；2008年后未分离出鼠疫菌，也未发现鼠疫疫情。动物间鼠疫与鼠密度、人间鼠疫与动物间鼠疫回归分析均存在相关关系。结论:德宏州鼠疫呈现长期性、顽固性、稳定性的特点，虽然目前鼠疫处于静息期，但其流行受多种因素的影响，故暴发的不确定性仍然存在。因此，加强动物间疫情的监测对预防人间鼠疫发生至关重要。

目的:分析甘肃省肃北、肃南县喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地内气象因素对鼠疫流行的影响。方法:收集1973 - 2016年肃北、肃南2个县喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫监测资料（来源于甘肃省疾病预防控制中心）和当年及领先1、2、3年（相对于当年作为参照的前1、2、3个年份）的气象因素（年均降雨量、气温、相对湿度）资料（来源于中国气象数据共享服务网）。采用R2.3.2软件，以年鼠疫检菌阳性率为因变量，气象因素为自变量建立时间序列半参数广义相加模型（generalized additive model，GAM），采用非线性效应关系定量研究气象因素对鼠疫的影响。结果:2006 - 2016年与1974 - 1983年相比，年均气温、相对湿度、降雨量的平均值肃北县分别上升了0.99 ℃、3.55%RH、12.16 mm；肃南县分别上升了1.00 ℃、2.01%RH、14.60 mm。1973 - 2016年共发生11起人间鼠疫，发病12例，死亡7例。肃北县鼠疫疫源地内领先3年年均降雨量在一定范围内每升高1.00 mm，动物鼠疫发生增加0.40%；领先2年年均相对湿度在一定范围内每升高1.00%RH，动物鼠疫发生增加11.66%。肃南县鼠疫疫源地内领先1年年均降雨量在一定范围内每升高1.00 mm，动物鼠疫发生增加1.32%；领先3年年均相对湿度在一定范围内每升高1.00%RH，动物鼠疫发生增加11.96%。另外，肃北、肃南县领先2年年均气温在一定范围内每升高1.00 ℃，动物鼠疫发生分别增加73.17%、70.18%。结论:甘肃省肃北、肃南县鼠疫的发生流行与气象因素关系密切，一定范围内的年均气温上升对鼠疫的流行不仅有明显的促进作用，而且存在滞后效应。另外，同一疫源地内不同类型气候对动物鼠疫流行的影响存在一定差异。

目的:分析青海省鼠疫疫情监测结果，掌握青海省鼠疫流行态势，为今后的鼠疫防控工作提供科学依据。方法:收集2011-2020年青海省人间鼠疫疫情资料（来自青海省地方病预防控制所人间病例数据库）和动物间鼠疫疫情资料（来自青海省鼠疫监测数据和鼠疫疫源地调查数据），采用描述性流行病学方法进行分析，包括人间鼠疫疫情，动物间鼠疫疫情地区分布，宿主动物、病原学和血清学监测结果等。结果:2011-2020年，青海省发生人间鼠疫疫情1起，因剥食旱獭时不慎划伤右手中指感染，自死者的心、肝、肺、淋巴结穿刺液、气管分泌物和咽拭子样本中均分离出鼠疫耶尔森菌。共发生动物间鼠疫疫情16起，流行地区分布在海西州、玉树州和海北州，其中海西州动物间鼠疫流行最多，10年间共发生13起。宿主动物监测显示，主要宿主动物为喜马拉雅旱獭，其平均密度为0.07匹/hm 2。病原学监测显示，共分离出鼠疫耶尔森菌31株，其中海西州分离出27株；分离出鼠疫耶尔森菌的宿主动物以喜马拉雅旱獭为主，占总数的77.42%（24/31）。血清学监测显示，共检出鼠疫F1抗体阳性血清66份，其中犬阳性血清最多，为43份；喜马拉雅旱獭次之，为20份。 结论:2011-2020年青海省动物间鼠疫连年不断，局部地区呈活跃态势，鼠疫防控总体形势严峻。

目的:探讨上转换发光技术（up-converting phosphor technology，UPT）检测空气中病原生物的应用。方法:基础研究，以金黄色葡萄球菌、鼠疫菌和大肠杆菌O157作为模拟菌株，对UPT的性能进行验证，包括稳定性、特异度、敏感度与响应时间试验；采用空气粒子采样器采集现场微环境试验舱中的空气样本，并使用UPT进行检测，同时与传统的培养法进行比较，验证UPT的实用性。结果:性能验证中，UPT检测10 7 CFU/ml、10 8 CFU/ml浓度的金黄色葡萄球菌稳定性时，实验室内变异系数分别为9.62%和8.02%，检测结果小于允许目标，检测系统具有较好的稳定性。用金黄色葡萄球菌验证UPT的特异度，结果显示非金黄色葡萄球菌均未检出，不同种类金黄色葡萄球菌阳性检出率均为100%，检测系统特异度较好。UPT检测不同细菌的敏感度不同，其中金黄色葡萄球菌的检测敏感度≥10 4 CFU/ml，鼠疫菌的检测敏感度≥10 3 CFU/ml；大肠杆菌O157的检测敏感度≥10 3 CFU/ml，UPT对细菌类的响应时间为15 min内（均为10 min 15 s）。用UPT对现场微环境试验舱空气细菌含量的检测结果显示，当空气中大肠杆菌O157浓度达到10 4 CFU/m 3以上时，UPT检测结果都为阳性，且随着空气浓度的增大，UPT测得的数值浓度呈上升趋势，与空气中细菌浓度具有正相关性。 结论:UPT可能作为快速评估空气中病原生物种类及含量的方法具有可行性。

目的:调查确定云南省玉龙县鼠疫自然疫源地的流行范围，并评估其流行风险，为鼠疫监测及防控工作提供依据。方法:2017年，在玉龙县8个乡镇，每个乡镇根据地理景观、海拔、人口、面积等各选取2 ~ 3个自然村作为调查样点，10 - 11月采用夹（笼）夜法捕获小型兽类宿主动物及其寄生蚤，采集宿主动物脏器等分离鼠疫菌，并用胶体金试纸条检测鼠疫F1抗原和抗体，自毙小型兽类标本同时进行反向间接血凝试验（RIHA）检测鼠疫特异性抗原；采集犬、猫、鼠等指示动物血清使用间接血凝试验（IHA）进行鼠疫F1抗体检测。结果:共获包括自毙小型兽类在内的宿主动物1 019只，隶属4目6科12属22种。其中工具捕获小型兽类1 016只，室外996只，室外捕获率为25.28%（996/3 940），其构成为齐氏姬鼠占30.32%（302/996）、斯氏家鼠占22.09%（220/996）、大绒鼠占17.37%（173/996）、灰麝鼩占12.35%（123/996），均是调查区小型兽类的优势种；社鼠占8.13%（81/996）、大足鼠占4.02%（40/996）、褐家鼠占1.81%（18/996），均为常见种。居民区室内共捕获小型兽类9种20只，捕获率为1.11%（20/1 800）。其中褐家鼠占30.00%（6/20）、大足鼠占25.00%（5/20）、小家鼠占10.00%（2/20），均为居民区优势鼠种。8种18只小型兽类染带寄生蚤67匹，隶属3科5属5种，总染蚤率为1.77%（18/1 019），总蚤指数为0.070。居民区室内获寄生蚤49匹，3种4只小型兽类染带寄生蚤，染蚤率为19.05%（4/21），蚤指数为2.333。其中缓慢细蚤染蚤率最高，为9.52%（2/21），蚤指数为0.571；猫栉首蚤指名亚种蚤指数最高，为1.571，染蚤率为4.76%（1/21），二者为居民区小型兽类体表主要寄生蚤种。室外5种14只小型兽类染带寄生蚤18匹，染蚤率为1.40%（14/998），蚤指数为0.018。其中缓慢细蚤染蚤率最高，为0.50%（5/998），蚤指数为0.005；特新蚤指名亚种染蚤率次之，为0.40%（4/998），蚤指数为0.004；方叶栉眼蚤的蚤指数最高，为0.007，染蚤率排第三，为0.30%（3/998）；棕形额蚤指名亚种的染蚤率和蚤指数均最低，分别为0.20%（2/998）和0.002。方叶栉眼蚤、缓慢细蚤和特新蚤指名亚种为室外小型兽类体表主要寄生蚤种。共采集指示动物血清419份，其中犬血清402份，IHA检测结果阳性1份，阳性率为0.25%（1/402）；猫、鼠血清共17份，IHA检测结果均为阴性。小型兽类脏器分离培养鼠疫菌、胶体金试纸条检测均为阴性；自毙小型兽类RIHA检测阴性。结论:玉龙县鼠疫自然疫源地新增一个鼠疫指示动物阳性点，应加强该区域的鼠疫疫情监测和防控。