-
大鼠尘肺病模型肠道与呼吸道共有差异菌群和代谢产物相关性研究
编辑人员丨1周前
目的:筛选大鼠肠道和呼吸道共有差异菌群和差异代谢物,分析大鼠肠道菌群和代谢物的变化在大鼠尘肺病进展中可能的作用。方法:于2020年4月,将18只SD大鼠随机分为3组(对照组、煤矿粉尘组和二氧化硅组,每组各6只)。煤矿粉尘组和二氧化硅组大鼠采用非气管暴露法分别灌注1 ml 50 mg/ml煤矿井下粉尘悬浊液和二氧化硅悬浊液,对照组大鼠灌注同等剂量灭菌生理盐水。染尘24周后采集大鼠粪便、咽拭子和肺灌洗液。采用16SrDNA基因测序技术和UHPLC-QTOF-MS非靶向代谢组学技术检测各组大鼠粪便、咽拭子和肺灌洗液中菌群和代谢物,筛选肠道和呼吸道共有差异菌群和共有差异代谢物。并采用Spearman法对差异菌群和代谢物进行相关性分析。结果:与对照组比较,煤矿粉尘组门水平下共筛选到9种肠道和呼吸道共有差异菌群,属水平下共筛选到9种肠道和呼吸道共有差异菌属,主要为厚壁菌门、放线菌门、链球菌属、乳杆菌属;与对照组比较,二氧化硅组门水平下共筛选到9种共有差异菌群,属水平下共筛选到5种共有差异菌群,主要为变形菌门、放线菌门、异杆菌属、粘液杆菌属。与对照组比较,煤矿粉尘组共筛出7种共有差异代谢物,标桩菌素、芳樟醇氧化物和异亮氨酸-亮氨酸在肠道和呼吸道中均上调;二氧化硅组与对照组比较,共筛出19种共有差异代谢物,其中二乙醇胺、1-氨基环丙烷羧酸、异亮氨酸-亮氨酸、鞘氨醇、棕榈酸、二氢鞘氨醇、1,2-二油酰基-sn-甘油-3-磷脂酰胆碱、1-硬脂酰-2-油酸甘油酯磷酸化胆碱在肠道和呼吸道中均上调。结论:尘肺病大鼠肠道和呼吸道菌群存在移位现象,大鼠在尘肺病进展过程中存在脂质代谢失衡。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
变应性鼻炎及非变应性鼻炎患者鼻腔微生态特征分析
编辑人员丨1周前
目的:探究变应性鼻炎(AR)及非变应性鼻炎(nAR)患者的鼻腔菌群特征及差异菌的致病作用。方法:选取2022年2—7月于哈尔滨医科大学附属第二医院鼻科门诊就诊的AR患者35例、nAR患者35例为试验组,选取同期体检的健康人群20名为对照组,合计男性39例,女性51例,年龄8~55岁。利用16SrDNA高通量测序分析3组受试者鼻腔菌群相对丰度特征,使用R软件进行Alpha多样性指数分析,利用LEfSe、Metastats、 t检验进行组间差异分析,同时利用R软件分析菌群的作用及与环境因子的关系。 结果:3组样本的菌群构成存在显著差异,AR组内金黄色葡萄球菌( P=0.032)、丙曲棒状杆菌( P=0.032)的相对丰度显著高于nAR组,鼠李乳杆菌、昆可乳杆菌、产碱菌( P值分别为0.016、0.005、0.001)的相对丰度显著低于nAR组,nAR组内嗜黏蛋白阿克曼菌的相对丰度高于对照组( P=0.009)。环境因子相关性分析显示昆可乳杆菌与IgE呈负相关关系( P=0.044),鼠李乳杆菌与年龄呈正相关关系( P=0.019)。分别构建5个属的AR、nAR随机森林预测模型,AR组肺炎链球菌-FF10、黄体假单胞菌、副氏假单胞菌、熊不动杆菌和固氮杆菌模型的曲线下面积(AUC)为100%(95%CI:100%~100%),nAR组副氏假单胞菌、固氮杆菌、巴拉蒂梭菌、土瑞酸杆菌和黄链球菌模型的AUC为98.4%(95%CI:94.9%~100%)。 结论:AR、nAR患者与健康受试者鼻腔菌群相对丰度显著不同,菌群丰度的改变与AR及nAR的发生具有显著关系。菌群的联合检测具有诊断AR及nAR患者的潜力。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
益生菌结合蒙脱石散对轮状病毒感染乳鼠肠道黏膜、肠道微生物功能相关基因表达的影响
编辑人员丨1个月前
目的 分析益生菌结合蒙脱石散对轮状病毒(RV)感染乳鼠肠道黏膜、肠道微生物功能相关基因表达的影响.方法 用灌胃SA11株轮状病毒构建RV感染模型.将48只乳鼠随机分为正常组(0.9%NaCl)、模型组(0.9%NaCl)、实验组(0.06g·mL-1蒙脱石散)和联合组(0.06 g·mL-1蒙脱石散+6.5 × 107 CFU·mL-1布拉氏酵母菌散),每组12只.4组乳鼠每天给药1次,连续给药5 d.收集粪便进行评价,用酶联免疫吸附试验法检测血清肿瘤坏死因子a(TNF-a)、白细胞介素-1β(IL-1 β)和IL-17水平,用实时荧光定量聚合酶链反应法检测肠道组织中水通道蛋白(AQP)水平,用细菌16srDNA荧光定量聚合酶链反应法检测粪便中双歧杆菌和大肠埃希菌含量.结果 正常组、模型组、实验组和联合组的粪便评分分别为(1.01±0.10)、(2.97±0.08)、(2.84±0.03)和(2.77±0.03)分,TNF-a 水平分别为(132.54±14.63)、(185.66±19.64)、(165.25±17.63)和(149.95±15.76)pg·mL-1,IL-1 β 水平分别为(172.32±18.68)、(265.34±27.72)、(202.34±21.34)和(186.24±19.46)pg·mL-1,IL-17 水平 分别为(118.62±12.44)、(173.24±18.25)、(152.32±16.72)和(122.54±13.58)pg·mL-1,AQP2 mRNA表达水平分别为 1.02±0.05、0.72±0.07、0.89±0.08 和 1.21±0.12,AQP4 mRNA 表达水平分别为 1.04±0.07、0.42±0.05、0.78±0.08 和 1.19±0.12,AQP8 mRNA 表达水平分别为 1.00±0.06、0.63±0.06、0.91±0.09 和 1.30±0.13,双歧杆菌含量分别为(6.35±0.64)、(4.31±0.44)、(4.93±0.50)和(5.34±0.54)CFU·g-1,大肠埃希菌含量分别为(6.14±0.62)、(8.78±0.88)、(8.46±0.85)和(8.12±0.83)CFU·g-1.模型组的上述指标和实验组、联合组、正常组比较,在统计学上差异均有统计学意义(均P<0.05).结论 蒙脱石散联合益生菌干预RV感染乳鼠可改善粪便性状,降低血清炎症因子水平,纠正肠道菌群紊乱,其可能是通过改善肠道AQP2、AQP4和AQP8表达实现的.
...不再出现此类内容
编辑人员丨1个月前
-
基于肠道菌群和肠黏膜屏障探讨玉液汤防治气阴两虚证糖尿病肾病大鼠的作用研究
编辑人员丨1个月前
目的 基于肠道菌群和肠黏膜屏障探讨玉液汤对气阴两虚证糖尿病肾病大鼠模型的影响.方法 采用一测多评法对玉液汤冻干粉中的有效成分葛根素、芒果苷和毛蕊异黄酮葡萄糖苷的含量进行检测,以控制玉液汤冻干粉的质量.将45只Wistar大鼠按照体质量随机分为正常组(NC组)、气阴两虚证糖尿病肾病组(M组)和玉液汤组(YYD组;5.03 g·kg-1).采用腹腔注射链脲佐菌素(STZ)25 mg·kg-1,佐以附子,青皮,枳壳灌胃8周构建气阴两虚证糖尿病肾病大鼠.期间YYD组大鼠同时干预玉液汤提取物.期间分别检测一次各组大鼠每周体质量和血糖水平,并记录大鼠的体征变化、摄食量和饮水量、游泳时间以及尿量.8周后采用全自动生化仪分析大鼠血清中胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白(LDL-C)、高密度脂蛋白(HDL-C)、血清肌酐(SCr)、尿氮素(BUN)水平;苏木精-伊红染色法(HE)观察肾脏和结肠组织的病理变化;酶联免疫吸附法(ELISA)检测尿液的尿蛋白浓度和血清中IgG、IgM、cAMP和cGMP的含量;16S rRNA对大鼠粪便菌群进行分析,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法对部分菌群进行验证;Western blot法检测大鼠肾脏及结肠炎症因子TNF-α和IL-6蛋白水平及结肠组织肠道屏障蛋白表达水平.结果 玉液汤水提物冻干粉得率为27.36%,其中玉液汤中有效成分葛根素的含量为0.3496 mg·g-1、芒果苷的含量为0.1851 mg·g-1、毛蕊异黄酮葡萄糖苷的含量为0.0429 mg·g-1.动物实验结果表明,玉液汤能显著改善气阴两虚证糖尿病肾病模型大鼠倦怠、乏力等证候表征,提高大鼠游泳时间,降低饮水量和进食量等症状;增加粪便中拟杆菌门和降低厚壁菌门的丰度;改善模型大鼠血脂四项、血糖、肾功指标、免疫指标IgG、IgM以及机体能量平衡因子cAMP、cGMP水平;HE染色表明玉液汤能显著改善模型大鼠肾脏及结肠黏膜屏障损伤;抑制肾脏及结肠炎症因子TNF-α、IL-6的表达,显著提高结肠动力蛋白CHRM3、5-HT3A以及黏膜屏障蛋白Occludin、ZO-1的表达水平.结论 玉液汤可能通过纠正模型大鼠肠道菌群失调,延缓肠黏膜损伤,改善肾脏和结肠炎症,发挥防治气阴两虚证糖尿病肾病的作用.
...不再出现此类内容
编辑人员丨1个月前
-
心房颤动患者肠道菌群变化及其与导管消融术后复发的相关性
编辑人员丨2024/7/20
目的 利用16S rDNA测序技术检测心房颤动患者肠道菌群的多样性及丰度变化,探究导管消融术后未复发与复发患者的肠道菌群差异并分析其相关性.方法 采用前瞻性队列研究的方法,根据标准纳入2021年1月至5月我院收治的53例房颤患者作为房颤组,患者均行导管消融术,根据术后是否复发房颤将其再分为未复发组与复发组.未复发组患者47例,复发组患者6例.选取同期性别、年龄等匹配的健康体检者29例作为健康组.所有入选者均使用16S rDNA测序法检测肠道菌群.采用生物信息学方法分析房颤组与健康组、复发组与未复发组之间的肠道菌群差异.结果 在alpha多样性上,房颤组患者肠道菌群多样性低于健康组.在门水平和纲水平,健康组与房颤组肠道菌群结构差异均无统计学意义(均P>0.05).房颤组患者肠道 Dinococcus-Thermophilus(Q=0.020,P=0.001)、Thermoleophilia(Q=0.023,P<0.001)、WSP-1 菌纲(Q=0.025,P<0.001)、Ktedonobacteria(Q=0.028,P<0.001)、Thermomicrobia(Q=0.037,P<0.001)、Bacillales(Q=0.018,P<0.001)、Tepidisphaerales(Q=0.025,P<0.001)、JG30-KF-CM45 菌目(Q=0.029,P<0.001)、JG30-KF-AS9 菌目(Q=0.032,P<0.001)、DA111 菌科(Q=0.039,P<0.001)、BIrii41 菌科(Q=0.045,P<0.001)相对丰度均低于健康组.在属水平,房颤组和健康组菌群差异无统计学意义(P>0.05).复发组患者肠道Proteobacteria、Spirochaetae、Betaproteobacteria、Epsilonproteobacteria、Spirochaetes、JG30_KF_AS9、Burkhold-eriales、Campylobacterales、Spirochaetales、Enterococcaceae、Alcaligenaceae 相对丰度增高,未复发组中 Neis-seriales、Neisseriaceae、Christensenellaceae、Rikenellaceae 相对丰度增高.两个亚组间 Proteobacteria 的 LDA 得分最高,LDA得分>4.结论 房颤组患者较健康组肠道菌群多样性降低,但群落结构没有显著差异.肠道菌群失调的房颤患者进行导管消融术后较易复发,这可能是导管消融术后患者房颤复发的潜在预测因素.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/7/20
-
麻芥六君子联合方组对变应性鼻炎模型大鼠治疗与鼻黏膜菌群的影响
编辑人员丨2024/7/13
目的 比较联合处方麻芥颗粒与六君子颗粒及其单独处方对变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)小鼠鼻黏膜紧密连接蛋白、炎症因子、鼻黏膜菌群的影响,研究联合处方麻芥颗粒与六君子颗粒及其单独处方治疗变应性鼻炎大鼠的机制.方法 将60只小鼠随机分为6组,每组10只,除空白组外,其余5组用卵清蛋白诱导AR模型后,根据所给药物分为模型组、六君子组、麻芥组、联合组、辛芩组.用反转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reac-tion,RT-PCR)法检测AR大鼠鼻黏膜紧密连接蛋白(tight junction,TJ)和肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)和转化生长因子-β(transforming growth factor-β,TGF-β)的基因表达水平,并采用16SrDNA测序法评价鼻黏膜菌群结构的变化.结果 各治疗组均能显著降低AR大鼠行为学得分;各治疗组均能显著下调血清中免疫球蛋白E(immunoglobulin E,IgE)水平;麻芥组、联合组、辛芩组显著提升连接蛋白-1(claudin-1)mRNA表达(P<0.05),各治疗组均能显著提升闭合蛋白(occludin)mRNA表达水平(P<0.05);除六君子组外各治疗组均降低AR大鼠鼻黏膜TNF-α的表达(P<0.05);除六君子组外各治疗组对AR大鼠鼻黏膜TGF-β的mRNA表达均显著上调(P<0.05).各治疗组均可提升AR大鼠鼻黏膜菌群多样性和相对丰度;在门水平上,与空白组比较,AR大鼠模型组变形菌丰度升高,这种变化被除辛芩组外的各治疗组逆转;在科水平上,相较于空白组,模型组肠杆菌相对丰度显著降低;在麻芥颗粒联合六君子颗粒组中以乳杆菌科(Lactobacilliaceae)相对丰度最为丰富,与模型组对比显著升高(P<0.01);在麻芥组、六君子大鼠中检测到芽孢菌科(Bacillaceae)与葡萄球菌科(Staphylococcaceae)相对丰度升高(P<0.01);线性判别分析(linear dis-criminant analysis,LDA)得分结果检测到AR大鼠富集大肠杆菌志贺菌属,六君子组富集芽孢杆菌、麻芥组富集芽孢杆菌与粪便细菌、联合组富集乳杆菌等厚壁菌属.结论 麻芥颗粒联合六君子颗粒可使炎症因子表达量恢复至正常水平并提高变应性鼻炎大鼠TJ蛋白表达水平而增强鼻黏膜屏障功能,其作用机制可能是通过调整鼻黏膜菌群多样性与相对丰度.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/7/13
-
习练路氏八段锦对纤维肌痛患者肠道微生态的影响
编辑人员丨2024/7/6
目的:观察路氏八段锦对纤维肌痛(FM)患者肠道微生态的影响.方法:选取2019年6月至2022年5月中国中医科学院广安门医院收治的完成12周路氏八段锦习练且干预后疼痛视觉模拟评分法评分改善不小于50%的FM患者10例.在路氏八段锦习练前后留取新鲜粪便样本,提取粪便样本的总DNA,根据16S rDNA编码基因的V3-V4高变区设计引物进行扩增,使用HiSeq平台进行高通量测序,比较干预前后肠道菌群的差异.结果:路氏八段锦可以显著降低FM患者疼痛视觉模拟评分法、修订版纤维肌痛症影响问卷、贝克抑郁量表和多维疲劳量表评分.测序后共获得1 404 904条有效序列,平均每个样本序列数有70 245.2条,平均有效长度419.75 bp.路氏八段锦干预前后患者肠道微生物的Alpha和Beta多样性差异无统计学意义,干预后多个菌在门和属水平都有相应增高或降低的趋势,但差异无统计学意义,线性判别分析的结果表明韦荣氏球菌属为干预前相对丰度增加且差异有统计学意义的菌属.结论:路氏八段锦可能通过调节以韦荣氏球菌属为代表的肠道微生物发挥治疗FM的作用.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/7/6
-
Classical taxonomy,molecular phylogeny and genetic analysis of the genus Exitianus Ball,1929(Hemiptera:Cicadellidae:Deltocephalinae)from Egypt
编辑人员丨2024/6/8
Egyptian species of the leafhopper genus Exitianus Ball,1929,E.capicola(St?l,1855),E.nanus(Distant,1908),and E.pondus Ross,1968 are reviewed.Illustrations,morphological descriptions,and a key for their identification are provided.In this study,we used molecular techniques to confirm morphological identification and detect phylogeny among the three Exitianus species.The partial nucleotide sequences of the amplified products obtained were determined by Macrogen Korea.The nucleotide sequences of 28S rDNA and COX genes of the EGY-ARC-9,EGY-ARC-4,and EGY-ARC-5 were determined by Macrogen Korea,blasted into BLAST at the National Center for Biotechnology Information website(NCBI)and compared with those deposited in the GenBank DNA database.The results represented the homology percentage between the partial sequences of the 28S rRNA and COX genes from each species and related species obtained from GenBank DNA database.The morphological identifications of the three Exitianus species were confirmed by molecular characterization and sequencing of 28S rDNA and COX genes and identified as E.capicola,E.nanus,and E.pondus.Also,their sequences of 28srDNA and COX genes were deposited in GenBank with an accession number(LC670610,LC670607,and OQ196105)for 28srDNA gene and(LC775357,LC775358,and LC775359)for the COX gene.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/6/8
-
地衣芽孢杆菌活菌胶囊治疗溃疡性结肠炎的临床疗效及对患者肠道黏膜通透性和肠道菌群的影响
编辑人员丨2024/4/27
目的:探究地衣芽孢杆菌活菌胶囊在溃疡性结肠炎(UC)中的应用效果及对患者肠道黏膜通透性、肠道菌群的影响.方法:选取2019年1月至2021年5月的200例UC患者,按随机数字表法分为观察组和对照组,每组100例,观察组给予美沙拉嗪肠溶片+地衣芽孢杆菌活菌胶囊口服,对照组给予美沙拉嗪肠溶片口服,连续治疗12周后评价临床疗效,并比较两组治疗前后活动度分级、肠道黏膜通透性指标[内毒素(ETX)、二胺氧化酶(DAO)]、肠道菌群(大肠埃希菌、乳酸杆菌、双歧杆菌)菌落数及16SrDNA拷贝数、血清免疫球蛋白(IgA、IgG、IgM)水平,记录药物不良反应.结果:治疗12周后,观察组总有效率为89.00%,高于对照组的77.00%(P<0.05);两组活动度分级均明显优于治疗前(P<0.05),且观察组优于对照组(P<0.05);两组血清ETX、DAO水平均较治疗前明显下降(P<0.05),且观察组血清ETX、DAO水平均明显低于对照组(P<0.05);观察组大肠埃希菌菌落数及16SrDNA拷贝数明显低于治疗前及对照组治疗后(P<0.05),乳酸杆菌、双歧杆菌菌落数及16SrDNA拷贝数均高于治疗前及对照组治疗后(P<0.05);观察组血清IgA、IgM水平均明显高于治疗前及对照组治疗后(P<0.05);观察组不良反应发生率为9.00%,与对照组的13.00%比较差异无统计学意义(P>0.05).结论:地衣芽孢杆菌活菌胶囊用于UC辅助治疗可提高临床疗效、减轻疾病活动度,且有利于改善肠道黏膜通透性、调整肠道菌群、调节免疫功能.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/4/27
-
鲇楚克拉虫的地理新记录及不同地理株系的比较研究
编辑人员丨2024/3/30
为探索地理隔离对鲇楚克拉虫(Zschokkella parasiluri Fujita,1927)株系分化的影响规律,研究对鲇楚克拉虫进行了广泛采样并获得了鲇楚克拉虫重庆沙坪坝株系(S3)、重庆渝北株系(S4)、重庆秀山株系(S5)、贵州铜仁株系(S6)及河南信阳株系(S7)等5个地理株系,其中重庆秀山、贵州铜仁和河南信阳为鲇楚克拉虫的地理新记录.基于形态与18SrDNA分子数据对鲇楚克拉虫不同地理株系进行了比较研究.结果表明,研究获得的鲇楚克拉虫5个地理株系的形态与原始报道及已发表的其他株系一致,主成分及显著性差异分析进一步显示,5地理株系间(S3-S7)形态量度无显著差异.联合已有分子信息的湖北株系(S1)和重庆渝北株系(S2)进行遗传学比较分析,结果显示7株系间(S1-S7)18SrDNA序列相似度为98.7%-100%,遗传距离为0-0.006.这表明,鲇楚克拉虫不同地理株系间已有一定程度的遗传分化.系统发育分析表明,鲇楚克拉虫各株系间并未形成地理种群特有的单系,地理隔离可能并非鲇楚克拉虫株系分化的决定性因素.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/3/30