目的:分析2019新型冠状病毒奥密克戎变异株感染者的临床特征，为奥密克戎变异株的防控提供参考。方法:纳入2021年12月23日至2022年1月31日深圳市第三人民医院收治的38例2019新型冠状病毒奥密克戎变异株感染者，回顾性分析患者的流行病学资料、临床表现、新型冠状病毒疫苗接种和实验室检查情况。采集鼻咽拭子样本进行病毒核酸检测，采用实时荧光聚合酶链反应扩增2019新型冠状病毒的开放阅读框(open reading frame， ORF)1 ab基因和 N基因。采集血液样本检测2019新型冠状病毒IgM和IgG抗体水平。 结果:38例患者中输入性病例35例(92.1%)，其中美国输入20例(57.1%)。36例(94.7%)患者接种过新型冠状病毒疫苗，其中末次接种后≤1个月发病者占5.7%(2/35)，>3个月发病者占65.7%(23/35)。3例为无症状感染者。35例确诊患者中，咳嗽31例(88.6%)，咽痛14例(40.0%)，发热13例(37.1%)，鼻塞10例(28.6%)，流涕8例(22.9%)；入院时白细胞计数正常者33例(94.3%)，降低者1例(2.9%)；淋巴细胞计数减少者19例(54.3%)；C反应蛋白升高者18例(51.4%)；白细胞介素6水平升高者35例(100.0%)；降钙素原升高者10例(28.6%)；D-二聚体升高者6例(17.1%)；ALT升高者1例(2.9%)；血钾降低者10例(28.6%)。 ORF1 ab基因循环阈值(Ct值)为22.15±6.00，最低值为14.22， N基因循环阈值为21.86±5.72，最低值为13.04。2019新型冠状病毒IgM抗体水平为0.46(0.21，1.12) AU/mL；IgG抗体水平为126.55(8.31，289.85) AU/mL，其中20例患者IgG抗体>100 AU/mL，12例IgG抗体>200 AU/mL，最高达414.48 AU/mL。 结论:目前奥密克戎变异株感染者的主要临床表现为咳嗽、咽痛、发热、鼻塞，接种新型冠状病毒疫苗后仍有可能感染奥密克戎变异株，且病毒核酸水平较高，需注意防护。

脑组织铁沉积性神经变性病（NBIA）是一组罕见的神经系统遗传性疾病，以脑组织不同程度的铁代谢异常和过量铁沉积为特征，其中最常见症状为锥体外系症状，亦可合并不同程度的锥体束、小脑、周围神经系统、自主神经系统、精神认知、视觉功能障碍。文中报道1例2020年12月于西京医院神经内科就诊的NBIA患者，分析其临床特征，并通过全外显子测序技术进行基因突变筛查，根据美国医学遗传学与基因组学学会（ACMG）指南做致病性分析。患者为13岁男性，4岁起病，呈慢性病程，进行性加重，首发症状为痉挛步态，随病情进展出现智能减退、构音障碍、饮水呛咳和视力下降。头颅磁共振成像检查可见视神经萎缩，苍白球及黑质T 2WI、液体衰减反转恢复序列、弥散加权成像及磁敏感成像呈对称性低信号，无泛酸激酶相关神经变性中普遍存在的“虎眼征”。患者经全外显子基因检测可见C19orf12基因第2号外显子c.172G>A纯合突变，导致第58位氨基酸由甘氨酸变为色氨酸（p.Gly58Ser），其父亲和母亲为姨表兄妹（近亲婚育），均携带该位点杂合变异。该突变位点未见文献报道，为新突变，根据ACMG指南考虑为可能致病变异。该位点保守性预测提示高度保守。该患者最终被诊断线粒体膜蛋白相关性神经变性病（MPAN）即NBIA4型，丰富了MPAN的突变数据库，为该病的进一步研究提供了依据。

目的:分析9例新型冠状病毒(2019 novel Coronavirus, 2019-nCoV)无症状感染者的临床特征，为2019-nCoV感染防治提供科学依据。方法:回顾性分析2020年1月21日至2月21日期间石家庄市第五医院收治的9例2019-nCoV无症状感染者的临床资料、实验室检测指标。结果:无症状感染者在各年龄段均有分布，其中男性5人、女性4人。无症状感染者入院第1天，白细胞、淋巴细胞和中性粒细胞的检测值处于正常水平；入院后第3天，检测值增高，持续至入院第12天，结果趋于稳定。谷丙氨酸氨基转移酶、乳酸脱氢酶水平在入院期间处于正常水平，无一过性增高或降低。C反应蛋白水平在入院后第3天达到最高值，但始终在正常范围内。D-二聚体水平在入院期间相对稳定。T细胞亚群绝对值结果显示，无症状感染者在入院第7～15天，CD 3＋、CD 4＋、CD 8＋T细胞水平较入院前升高。无症状感染者咽部核酸检测阳性平均持续时间为11.88 d，ORF1ab基因平均循环阈值为36.94，N基因平均循环阈值为35.43。 结论:2019-nCoV无症状感染者的炎症反应轻微，机体免疫功能相对较好。

目的 分析线粒体膜蛋白相关性神经变性病(MPAN)一家系临床特征与C19ORF12基因突变特点,为了解MPAN的临床特征及分子遗传学特点提供依据.方法 收集于2018年5月在河南省人民医院神经内科就诊的一个脑内铁沉积性神经变性病(NBIA)家系,分析其临床特征,并通过全外显子测序技术结合Sanger单基因位点验证进行基因突变筛查,根据美国ACMG指南做致病性分析.结果 该家系中父母为近亲结婚,包括先证者在内共兄弟3人发病,呈常染色体隐性遗传,3例患者均在儿童期起病,均呈慢性病程,逐渐进展,首发症状为帕金森综合征,随病情进展,还可出现智能减退、共济失调、步态障碍、构音障碍及痉挛性截瘫.头颅磁共振检查可见T2WI、FLAIR及SWI苍白球及黑质呈对称性低信号,无“虎眼征”.3例患者均可见小脑萎缩,先证者二哥尚可见颞叶萎缩.经全外显子测序及sanger验证,3例患者均可见C19ORF12基因第2号外显子c.52G＞T基因纯合突变,导致的第18位氨基酸由天冬氨酸变为酪氨酸(p.Asp18Tyr),其母亲为杂合变异,该突变位点未见文献报道,为新突变,根据ACMG指南考虑为致病变异.该家系最终被诊断为MPAN.结论 我们在1个MPAN家系中成功鉴定出了C19ORF12基因p.Asp 18Tyr新致病突变,丰富了MPAN的突变数据库,为该病的进一步研究提供了依据.

目的 了解黑龙江省哈尔滨市腹泻患者人星状病毒(HAstV)感染情况,并分析其分子流行病学特征.方法 2017年1月-2018年12月共采集340份哨点医院腹泻病人的粪便标本,采用Real-time PCR进行HAstV检测,对HAstV阳性标本采用RT-PCR方法扩增ORF2区,对PCR产物测序并进行系统进化分析.结果 HAstV阳性检出率为6.18％(21/340),男性阳性检出率为8.52％(15/176),女性阳性检出率为3.66％ (6/164),差异无统计学意义(x2=3.466,P=0.063).HAstV感染阳性的患者年龄主要集中在2岁以下年龄组及3～5岁年龄组,检出率分别为10.71％(18/168)、10.53％(2/19);季节高峰在2月,检出率为18.18％(2/11).对阳性标本进行测序,获得16株序列,系统进化分析结果显示,11株HAstV-1,且均为1a型;4株HAstV-5型;1株HAstV-4c型.结论 HAstV是哈尔滨市病毒性腹泻的重要病原之一,且存在多种基因型,HAstV-1型是主要流行株.HAstV-1a型及HAstV-4c型是在黑龙江省哈尔滨市首次发现及报道的型别.

目的 分析1株耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌噬菌体F19的生物学特性和全基因组. 方法 从肺炎患者痰液分离肺炎克雷伯菌为宿主菌分离噬菌体F19,电镜观察其形态,并绘制生长曲线,观察F19对温度及pH值的敏感性.分析F19全基因组序列,预测可能存在的开放读码框.根据F19全基因组序列构建系统进化树,进行比较基因组学分析.结果 分离到1株新型的肺炎克雷伯菌噬菌体,命名为F19,F19可在其宿主菌菌苔上形成裂解性噬菌体所具有的完全透明的滴斑.电镜观察F19具典型的有尾噬菌体目短尾病毒科病毒形态特征.一步生长曲线显示F19的潜伏期为12min,裂解量为(102±13) PFU/细胞.F19全基因组长43 766 bp,(G+C)％的含量为53.8％.预测和注释F19全基因组51个开放读码框(ORF),按照功能分为DNA复制及调控模块,噬菌体结构基因模块,裂解宿主蛋白模块3大类.比较基因组学分析F19与短尾噬菌体科Drulisvirus属噬菌体基因组具有明显相似保守框架,一致性较强.噬菌体DNA酶基因进化分析表明F19属于Drulisvirus属成员. 结论 从污水中分离鉴定1株新的耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌噬菌体F19,在生物学分类上属于Drulisvirus属噬菌体,为噬菌体治疗耐碳青霉烯肺炎克雷伯感染奠定了基础.

目的:探讨19号染色体开放读码框12(C19ORF12)对胃癌MKN45细胞增殖和化疗药物敏感性的影响,并阐明其作用机制.方法:将胃癌MKN45细胞分为对照组和C19ORF12组.CCK-8法检测2组胃癌MKN45细胞的增殖活性,克隆形成实验检测2组胃癌MKN45细胞克隆形成数,CCK-8法检测加入化疗药物阿霉素或过氧化氢(H2O2)后2各组胃癌MKN45细胞存活率,流式细胞术检测2组胃癌MKN45细胞凋亡率,激光共聚焦显微镜技术检测C19ORF12在胃癌MKN45细胞中的亚细胞定位,GEPIA分析癌症基因组图谱(TCGA)中C19ORF12 mRNA在正常胃组织和胃癌组织中的表达差异,KM-plot回顾性分析不同表达水平C19ORF12对胃癌患者预后的影响.结果:与对照组比较,C19ORF12组胃癌MKN45细胞增殖活性明显升高(P<0.05),克隆形成数升高(P<0.01).阿霉素或H2O2作用后,与对照组比较,C19ORF12组胃癌MKN45细胞存活率升高(P<0.05或P<0.01),细胞凋亡率降低(P<0.01).激光共聚焦显微镜下,C19ORF12主要定位于胃癌MKN45细胞的线粒体中.与正常胃组织比较,胃癌组织中C19ORF12 mRNA表达水平明显升高(P<0.01).与低表达C19ORF12的胃癌患者比较,高表达C19ORF12的胃癌患者总体生存期明显缩短(P<0.01).结论:C19ORF12能够促进胃癌细胞的增殖,并且降低胃癌细胞对化疗药物的敏感性.C19ORF12可以作为肿瘤治疗的潜在靶标.

为了了解境外输入的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)变异株的分子特征,本研究对2021年6月深圳市一株从南非输入的SARS-CoV-2毒株进行了全基因组测序和序列分析.Illumina测序技术获得的SARS-CoV-2毒株基因组长度为29567nt.根据"Pango lineages"分型法,本研究测定的毒株属于C.1.2系,该谱系属世界卫生组织定义的监测变异株(Variants Under Monitoring,VUM)成员之一.与参考株 Wuhan-Hu-1(NC_045512.2)比较,本研究 C.1.2系毒株共出现了 58个核苷酸变异位点,其中56个变异位点位于编码区.氨基酸变异位点共有33个,氨基酸变异位点分布于6个开放阅读框,变异数由多到少依次为:S蛋白区12个,ORFlab蛋白区9个,ORF3a蛋白区2个,M区2个,ORF8区2个,E区1个.本研究测定的SARS-CoV-2毒株属我国大陆首例境外输入的C.1.2变异株.开展境外输入的SARS-CoV-2毒株基于基因组测序的分子监测,对防控由境外输入的SARS-CoV-2变异株引起本地新型冠状病毒肺炎(COVID-19)暴发与流行具有重要意义.

目的 基于基因芯片技术探讨短发夹RNA沉默人结直肠癌细胞DNA结合蛋白A(dbpA)表达后利用基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析发现与dbpA相关的结直肠癌发生、发展的信号通路.方法 选取结直肠癌SW620细胞中表达差异的基因进行深度检测和分析,采用基因芯片技术挖掘差异基因,并运用定量反转录聚合酶链反应(RT-PCR)对芯片结果进行验证,综合分析工具进行GO功能富集分析及KEGG信号通路分析.结果 dbpA敲低后基因芯片检测差异表达基因有578条,其中181个基因上调,397个基因下调,显著上调基因有CFL2、C12orf39、EREG、SESN2、CXCL3、CXCL1、VLDVR、DDIT4、INH-BE等60个基因,显著下调基因在PRDM10、PCDH19、SRSF8、FGFBP1、TFF2、MTDH、TCF7、EHHADH、WDR77、CEACAM6等60个基因.dbpA敲除后SW620细胞中与肿瘤形成有关的通路主要与"生物过程"有关,包括丝裂原活化蛋白激酶信号通路、癌症途径、NOD样受体信号通路、趋化因子信号通路、粘着斑、基底细胞癌、Wnt信号通路等.基因网络图分析显示有10个基因表达水平下降(FASLG、PDGFA、FGF18、MAP3K7、FGF3、CSDA、NF1、RAP1A、HSPA1A、LAMTOR3等),4个基因表达水平上升(DUSP5、PRAS2、CDC42、DUSP2等),dbpA与MAPK信号通路相关性最大.选择KMAPK信号通路中的5个相关基因即RAPIA、TAK1(MAP3K7)、DUSP5、CDC42、ZAK进行Western blot验证表明,DUSP5表达水平明显上调(P<0.05),RAP1A、TAK1、ZAK表达水平下降,RAP1A、TAK1表达水平下降明显(P<0.05).dbpA可能通过MAPK通路调节结直肠癌细胞的发生.结论 dbpA参与调控的靶基因和信号通路可能为MAPK相关通路,还需要进一步在多细胞和动物实验中研究揭示dbpA下调通路之间的关系及CDC42在结直肠癌发展中的作用.

17q12 微缺失综合征是一种罕见的常染色体显性遗传病,由17 号染色体长臂上 1 .4 mb的DNA序列缺失引 起,该 区 域 包 括 AATF、ACACA、C17 orf78、DDX52、DHRS11、DUSP14、GGNBP2、HNF1B、LHX1、MRM1、MYO19、PIGW、SYNRG、TADA2A和ZNHIT3基因.其中 17q12 缺失综合征主要是由于 HNF1B、ACACA、LHX1 和 PIGW 的单倍剂量不足引起.17q12 微缺失综合征主要临床表现包括以下 3 个方面:肾囊肿和糖尿病综合征、苗勒管发育不全(MA )、精神/神经发育障碍,个体间的表现具有差异性,临床表现轻重不一.现就 17q12 微缺失综合征的诊断及发病机制等方面的研究进展予以综述.