目的:探究CLEC14A在阿霉素诱导局灶节段性肾小球硬化(FSGS)小鼠模型中对足细胞损伤的保护作用，并通过半胱氨酸蛋白酶-3(Caspase-3)、B淋巴细胞癌-2相关蛋白(Bax)和B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)信号通路探讨其机制。方法:将30只C57BL/6小鼠随机分成Sham组(n＝10)、Model组(n＝10)和CLEC14A siRNA组(siRNA组，n＝10)。将小鼠足细胞MPC5分为对照组、FSGS组、FSGS-siCLEC14A组。采用定量聚合酶链反应(qPCR)检测小鼠肾脏中CLEC14A mRNA及血管内皮生长因子(VEGF)mRNA的水平。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测小鼠肾脏组织中Caspase-3、Bax和Bcl-1水平。结果:FSGS组及FSGS-siCLEC14A组各时间点的细胞增殖能力低于对照组，差异均有统计学意义(均 P<0.05)。FSGS-siCLEC14A组的48 h及72 h细胞增殖能力均低于FSGS组，差异均有统计学意义(均 P<0.05)。与对照组比较，FSGS组和FSGS-siCLEC14A组的细胞凋亡率、Caspase-3、Bax水平上升，而Bcl-2水平下降，差异均有统计学意义(均 P<0.05)；与FSGS组比较，FSGS-siCLEC14A组的Caspase-3、Bax水平增加，而Bcl-2水平下降，差异均有统计学意义(均 P<0.05)。与对照组比较，FSGS组和FSGS-siCLEC14A组的24 h尿蛋白定量(24 h UTP)、血肌酐(Scr)及血尿素氮(BUN)水平增加，差异均有统计学意义(均 P<0.05)；与FSGS组比较，FSGS-siCLEC14A组的24 h UTP、Scr及BUN水平增加，差异均有统计学意义(均 P<0.05)。与Sham组比较，Model组和siRNA组小鼠的CLEC14A mRNA水平下降，VEGF mRNA上升，差异均有统计学意义(均 P<0.05)；与Model组比较，siRNA组小鼠的CLEC14A mRNA水平下降，VEGF mRNA上升，差异均有统计学意义(均 P<0.05)。与Sham组比较，Model组和siRNA组小鼠肾脏中的Caspase-3、Bax水平上升，而Bcl-2水平下降，差异均有统计学意义(均 P<0.05)；与Model组比较，siRNA组小鼠肾脏中的Caspase-3、Bax水平升高，而Bcl-2水平下降，差异均有统计学意义(均 P<0.05)。 结论:CLEC14A可通过抑制Caspase-3、Bax、Bcl-2信号通路起到保护FSGS小鼠足细胞的作用。

目的:通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）识别脓毒症发生发展过程中的关键基因。方法:从基因表达数据库（GEO）中下载基因表达数据集GSE154918，其中包含对照40例、无症状感染12例、脓毒症39例、脓毒症随访14例，共105例芯片数据。采用R软件筛选出脓毒症差异表达基因（DEG），用分布式访问视图集成数据库（DAVID）、检索交互基因的搜索工具（STRING）和可视化软件Cytoscape进行基因功能和通路富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析及关键基因分析，筛选出脓毒症发生发展过程中的关键基因。结果:通过WGCNA并结合DEG表达分析得到46个候选基因，对这46个基因进行基因本体（GO）、京都市基因与基因组百科全书（KEGG）途径富集分析得到基因功能和参与的信号通路。进一步使用STRING数据库构建PPI网络，通过PPI网络可视化软件Cytoscape选出5个关键基因，包括肥大细胞表达膜蛋白1基因（MCEMP1）、S100钙结合蛋白A12基因（S100A12）、脂肪因子抵抗素基因（RETN）、c型凝集素结构域家族4成员基因（CLEC4D）、过氧化酶增殖因子活化受体基因（PPARG），对这5个基因分别进行表达差异分析，结果显示，在脓毒症患者中上述5个基因的表达水平较健康对照者显著性上调。结论:本研究通过构建WGCNA方法筛选出有关脓毒症的5个关键基因，可能成为潜在的脓毒症诊疗相关候选靶点。

目的 探究特应性皮炎(atopic dermatitis,AD)患者血清C型凝集素结构域家族4成员G(C-type lectin domain family 4 member G,CLEC4G)水平及其临床价值.方法 收集60例AD患者(观察组)和29例对照者(对照组)血液样本,检测样本中CLEC4G、白细胞介素-33(interleukin-33,IL-33)、总免疫球蛋白E(total IgE,tIgE)、特异性免疫球蛋白E(specific IgE,sIgE)及嗜酸性粒细胞水平;分析CLEC4G水平与AD患者临床资料及IL-33间的相关性;采用logistic回归分析CLEC4G、IL-33等指标评估AD发病的风险.结果 与对照组相比,观察组患者血清CLEC4G水平显著降低[(359.4±57.3)pg/mL vs(521.8±48.1)pg/mL];CLEC4G水平在儿童期、青少年与成年期及男、女性AD患者中均差异无统计学意义(P>0.05);与tIgE≤100 kU/L组相比,CLEC4G水平在100～200 kU/L组、tIgE≥200 kU/L组患者中显著降低,但在100～200 kU/L组、tIgE≥200 kU/L组间无显著差异;血清CLEC4G水平只在AD病情中度组中显著降低,在其他组间差异无统计学意义(P>0.05);IL-33在观察组患者血清中水平升高,但CLEC4G与IL-33间无显著相关性(r = 0.090,P = 0.495);年龄小于14岁、IL-33是AD发病的危险因子,OR值分别为2.756、1.241,95%CI分别为1.076～7.060、1.030～1.495;而CLEC4G为AD发病的保护因子(OR = 0.890,95%CI:0.809～0.979).结论 CLEC4G可能是独立于IL-33介导AD发病的保护因子.

目的 利用生物信息学分析颅内动脉瘤(LA)的公共数据库中的表达谱芯片数据,为疾病机制研究提供重要信息.方法 基于数据集(GSE75436)进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)构建其基因共表达网络,并识别枢纽基因;同时,使用在线工具DAVID对与IA具有高度相关的模块进行GO功能富集及KEGG通路分析.结果 筛选出三个与IA相关的模块,以及识别了棕色模块中的14个枢纽基因COL3A1、SPARC、CDH11、COL5A1、HOPX、CLEC11A、GALNT10、ADAMTS2、CEMIP、KIAA1755、COL11A1、ZIC2、CDKN2A和LINC00460;GO分析显示棕色模块主要富集在细胞外基质组织、胶原蛋白分解代谢过程、细胞黏附等生物过程;KEGG分析显示棕色模块参与了ECM-受体相互作用、局部粘连、蛋白质消化和吸收、PI3K-Akt信号通路等通路.结论 基于WGCNA,我们识别出了对IA发生发展至关重要的模块与枢纽基因,它们可能成为潜在的生物标志物和(或)治疗靶点.

目的:研究CLEC14 A、VEGF及超声血流参数在胚胎停育组和正常妊娠组蜕膜组织中的表达差异及相互关系,探讨血管生成对胚胎停育的影响机制.方法:选取2016年5月至2017年2月于苏州大学附属第一医院接受清宫术的胚胎停育患者30例为胚胎停育组(胚停组),选取同期因个人原因要求实施人工流产且经B超证实为宫内胚胎存活的正常早期妊娠妇女50例为正常妊娠组(对照组).Western blot和RT-PCR法检测两组孕妇蜕膜组织中CLEC14 A和VEGF表达水平;多普勒超声技术检测两组孕妇双侧子宫动脉和孕囊周围螺旋小动脉的搏动指数(PI)、阻力指数(RI)、收缩期最大血流速度与舒张末期血流速度的比值(S/D).结果:胚停组和对照组的年龄、停经天数等一般情况比较,差异无统计学意义(P>0.05).胚停组的子宫动脉优势侧RI、PI、S/D及双侧子宫动脉平均RI、PI均明显高于对照组(P<0.05).胚停组蜕膜组织中CLEC14 A和VEGF蛋白和Mrna表达水平均明显低于对照组(P<0.05).蜕膜组织中CLEC14 A与VEGF蛋白表达水平呈正相关(r=0.355,P=0.018);胚停组蜕膜组织中VEGF表达水平与优势侧子宫动脉S/D呈负相关(r=-0.731,P<0.001).结论:CLEC14A可能通过调节VEGF表达引起子宫动脉血流动力学改变,尤其是优势侧子宫动脉S/D升高,从而影响胚胎血供,参与胚胎停育的发病过程.

Accumulating evidence suggests that C-type lectin-like receptor-2 (CLEC-2) plays an important role in atherothrombosis.In this case-control study,we investigated the association between CLEC-2 and incidence of coronary artery disease (CAD).A total of 216 patients,including 14 cases of stable angina pectoris (SAP,non-ACS) and 202 cases of acute coronary syndrome (ACS),and 89 non-CAD control subjects were enrolled.Plasma levels of soluble CLEC-2 (sCLEC-2) were measured using the enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA).Compared with the control group (65.69 (55.36-143.22) pg/mL),the plasma levels of sCLEC-2 were significantly increased in patients with CAD (133.67 (88.76-220.09) pg/mL) and ACS (134.16 (88.88-225.81) pg/mL).The multivariate adjusted odds ratios (95％ confidence interval) of CAD reached 2.01 (1.52-2.66) (Ptrend ＜ 0.001) for each 1-quartile increase in sCLEC-2.Restricted cubic splines showed a positive dose-response association between sCLEC2 and CAD incidence (Plinearity ＜ 0.001).The addition of sCLEC-2 to conventional risk factors improved the C statistic (0.821 vs.0.761,P =0.004) and reclassification ability (net reclassification improvement:57.45％,P ＜ 0.001;integrated discrimination improvement:8.27％,P ＜ 0.001) for CAD.In conclusion,high plasma sCLEC-2 is independently associated with CAD risk,and the prognostic value of sCLEC-2 may be evaluated in future prospective studies.

目的:观察胰高血糖素样肽-1(glucagon-like peptide-1,GLP-1)受体激动剂Exendin-4对体外培养小鼠胚胎成骨细胞前体细胞增殖和向成骨分化的影响.方法:根据前期预实验选用浓度为30 nmol/L的Exendin-4处理小鼠胚胎成骨细胞前体细胞MC3T3-E1细胞72 h后,收集细胞进行测序,获得的RNA-seq数据,筛选差异表达变化在2倍以上的基因(差异表达基因),用KEGG PATHWAY富集分析和GO富集分析其基因功能,确定相关生物通路.结果:用Exendin-4处理MC3T3-E1细胞后,细胞出现增殖,共筛选得到418个差异表达基因,其中表达上调的基因有236个,表达下调的基因有182个.经GO富集分析显示,上调的差异表达基因主要富集在免疫系统、细胞黏着和蛋白质水解等通路中.KEGG PATHWAY富集分析显示,下调的差异表达基因主要富集在PI3K-Akt信号通路、癌症中异常转录、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)受体信号通路、缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)信号通路等.结合文献分析发现,与骨质疏松症相关的上调基因Fosl1、Cxcl13、Clec11a、Phex、Fasl、Camk4、Stab1、Zbp1、Adora2a、Igfbp7、Cxcr2、Hp、MTI;与骨质疏松症相关的下调基因包括Nog,Zeb1,Esr1,Igf2bp2,Plxnb3,Rgs14.结论:Exendin-4可能通过影响细胞免疫、细胞黏着和蛋白质水解相关基因的表达水平,促进前体细胞向成骨细胞的分化过程,改善骨质疏松.

目的 运用生物信息学方法筛选特应性皮炎(atopic dermatitis)的差异表达基因(DEGs),明确其功能并探讨AD的发病机制.方法 从GEO数据库中获取GSE120721、GSE16161、GSE6012 与 GSE329244 基因芯片数据集,以"Adjust P＜0.05,llog2FC|＞1"为条件筛选出各个数据集中AD皮损组织与正常人皮肤组织的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并通过合并去重获得共表达的DEGs.通过STRING 11.0在线工具以及Cytoscape 3.9.0软件构建共表达DEGs的蛋白互作(PPI)网络筛选关键基因,并对DEGs进行GO功能注释与KEGG通路富集分析.结果 共筛选出75个共表达的DEGs;PPI网络分析获得GZMB、MMP12、ISG15、CCR7、CCNB1、MKI67、IRF7、BIRC3、CLEC7A、S100A9、CCL22、BIRC5、S100A7、SERPINB4等14个关键基因;GO富集结果表明共表达的DEGs主要参与炎症反应、防御反应、免疫反应等生物进程;KEGG通路分析筛选出显著富集的IL-17信号通路,且富集在该通路上的DEGs为S100A8、S100A7、S100A9、DEFB4A、FOSL1 和 MMP1,其中 S100A7、S100A9 属于枢纽基因.结论 IL-17信号通路和枢纽基因S100A7、S100A9可能是AD发病机制中可进行干预的新靶点.

为探究大黄鱼(Larimichthys crocea)抗溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)感染的免疫应答机制,研究通过转录组测序及生物信息学分析的手段,在转录组水平分析了溶藻弧菌感染24h后大黄鱼头肾中基因表达水平的变化,共获得1903个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),其中641个上调表达基因,1262个下调表达基因.通过Gene Ontology(GO)和Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)富集分析发现,一些先天性免疫相关基因,包括补体(C1qbp、C1QL2和C7)、热休克蛋白(hspd1、hspa4、hspa5和hspa9)、抗菌肽(Hepcidin-1)、C型凝集素受体(Clec4e和MR1)、己糖激酶(hex1)、精氨酸酶(Arg-II)和线粒体翻译延伸因子(TUFM)等基因表达水平均显著上调;而许多与获得性免疫相关基因,包括T、B淋巴细胞增殖分化(FcR5和CCL17)、T细胞调控(TCRα、TCRβ、CD3ε、CD3γδ、CD3ζ、ZAP-70和ITK)及免疫球蛋白参与抗原识别(Ighv 5A、Ighv 914和Ighv XIG14)等基因表达水平均显著下调.结果表明,在感染早期,大黄鱼先天性免疫在抵御溶藻弧菌感染中发挥重要作用,而此时获得性免疫受到了抑制.

目的:检测子宫蜕膜组织中缺氧诱导因子1α多肽(hypoxia-inducible factor-1 alpha,HIF-1α)、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)信号通路及下游靶蛋白表达,从血管生成途径探讨胚胎停育肝郁证的分子生物学机制.方法:选取45例胚胎停育患者和15例自愿终止妊娠的正常早孕女性为研究对象,采用Western Blot法及实时荧光定量PCR法检测子宫蜕膜组织中VEGF、C型凝集素家族14A(C-type lectin clomain containing 14A,CLEC14A)、CD81、HIF-1α mRNA及蛋白表达量.结果:与对照组比较,胚胎停育组子宫蜕膜组织中VEGF mRNA表达下降,差异具有统计学意义(P＜0.05),CLEC14A、CD81、H1IF-1α mRNA表达水平有改善,但差异无统计学意义(P＞0.05).与肝郁证比较,非肝郁证子宫蜕膜组织中VEGF mRNA表达升高,具有统计学意义(P＜0.05),CD81、CLEC14A、HIF-1α mRNA表达水平降低,但差异无统计学意义(P＞0.05).与对照组比较,胚胎停育组子宫蜕膜组织中CLEC14A、VEGF蛋白表达水平下降,差异具有统计学意义(P＜0.05),CD81、HIF-1α蛋白表达水平无明显变化,差异无统计学意义(P＞0.05).与肝郁证比较,非肝郁证子宫蜕膜组织中CD81蛋白表达水平升高,差异具有统计学意义(P＜0.05),VEGF、CLEC14A、HIF-1α蛋白表达水平变化不明显,差异无统计学意义(P＞0.05).结论:胚胎停育肝郁证的分子生物学机制与子宫蜕膜组织HIF-1α、VEGF信号通路的异常表达密切相关.