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脓毒症相关性脑病差异基因以及发病机制的数据分析
编辑人员丨5天前
目的:探讨脓毒症相关性脑病(sepsis-associated encephalopathy, SAE)的相关差异表达基因(differentially expressed gene, DEG)和信号转导途径。方法:基于基因表达数据库(gene expression omnibus, GEO)的脓毒症患者脑组织的基因组数据,采用基因本体(gene ontology, GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析,以及蛋白-蛋白相互作用网络(protein-protein interaction, PPI)分析,确定SAE的DEG。结果:DEG在免疫应答、炎症反应、凋亡过程的负调控、蛋白质水解等方面显著富集。通过PPI分析筛选出10个枢纽基因,包括固醇调节元件结合转录因子1(sterol regulatory element binding transcription factor 1, SREBF1)、细胞因子信号转导抑制因子-3(suppressor of cytokine signaling 3, SOCS3)、封闭蛋白5(claudin 5, CLDN5)、免疫球蛋白结构域蛋白4(V-set and immunoglobulin domain containing 4, VSIG4)、DNA损伤诱导蛋白45β(growth arrest and DNA damage inducible protein 45β, GADD45β)、细胞间黏附分子-1(intercellular adhesion molecule 1, ICAM1)、血管生成素-2基因(angiopoietin 2, ANGPT2)、CD14、CD163、血栓反应蛋白1(thrombospondin 1, THBS1)。结论:通过生物信息学方法挖掘出与SAE相关的10个枢纽基因,这些基因和机体的免疫炎症相关。
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编辑人员丨5天前
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细胞衰老在青光眼中的作用研究进展
编辑人员丨5天前
细胞衰老是细胞在缺血、缺氧、氧化应激、DNA损伤、活性氧沉积等刺激下被激活的一种应答程序。衰老细胞的特征包括:衰老相关β-半乳糖苷酶(SA-β-gal)活性升高、P16INK4a高表达、衰老相关易染色质(SAHF)聚集、衰老相关分泌表型(SASP)产生、端粒缩短等。介导细胞衰老的经典信号通路包括P16INK4a/Rb途径和P19 ARF/P53/P21 Cip1途径,这2条通路既相互作用,又相互独立。近年来,青光眼被认为是与细胞衰老密切相关的致盲眼病。细胞衰老在青光眼中的研究主要集中在小梁网和Schlemm管内皮细胞衰老引起房水流出通路阻力增加,以及细胞衰老在青光眼视网膜神经节细胞损伤中的作用机制及干预研究。细胞衰老作为细胞死亡前的不可逆阶段,深入研究其在青光眼发生和发展中的作用机制,并特异性阻断细胞衰老信号传递,有助于为降低房水流出阻力和青光眼视神经保护治疗提供新的切入点。本文就细胞衰老的特征、诱因、分子信号通路以及其在青光眼中的研究进展进行综述。
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编辑人员丨5天前
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N6-甲基腺苷修饰在肿瘤及病毒感染中的研究进展
编辑人员丨5天前
表观转录组学代表核糖核酸(RNA)修饰的基因转录后水平调控,参与调控真核生物基因的表达。RNA修饰多存在于真核生物中,方式众多,具有重要功能,其中N6-甲基腺苷(m6A)修饰是真核生物RNA序列中信使RNA(mRNA)上最常见的一种修饰,表现为甲基转移酶催化腺嘌呤在6号氮原子位置发生甲基化修饰,它通过"写入器"、"擦除器"、"阅读器"三类分子生物精准调控来维持动态平衡。m6A修饰与组织发育、生物钟、脱氧核糖核苷酸(DNA)损伤反应、性别决定、肿瘤的发生发展密切相关。人类肿瘤细胞中m6A修饰通过调控多种癌基因和抑癌基因,对肿瘤的发生、发展、增殖、侵袭、转移和免疫应答有重要影响。因此,肿瘤细胞的m6A修饰有望成为一个潜在的抗癌治疗靶点,这对于阐明肿瘤机制和临床治疗具有重要意义。本文还讨论了m6A修饰与病毒感染的关系,包括严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)感染,这种新发现的病毒导致了2019年12月以来的2019冠状病毒病(COVID-19)全球大流行。
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编辑人员丨5天前
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泛素化修饰和SUMO化修饰在电离辐射诱导的DNA损伤修复中的作用机制
编辑人员丨5天前
泛素和小泛素样修饰物(SUMO)以共价键形式连接到特定的蛋白底物上,进行泛素化修饰或SUMO化修饰,通过调控蛋白质的稳定性、活性、定位或相互作用来影响多种细胞活动,其中包括DNA损伤修复、细胞周期、细胞凋亡和免疫应答等。当细胞受到DNA损伤时,泛素化修饰和SUMO化修饰能够调控相关蛋白质的功能和相互作用,参与到DNA损伤修复和信号传导的过程中。这些修饰作用对于维持基因组的完整性至关重要。近年来,研究发现泛素化修饰和SUMO化修饰在DNA损伤修复中都发挥着重要作用。笔者对这些作用机制进行综述,为深入了解电离辐射诱导的DNA损伤修复机制提供参考。
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编辑人员丨5天前
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DNA损伤修复蛋白NBS1在BPD新生大鼠模型中表达及其作用的研究
编辑人员丨5天前
目的:研究DNA损伤修复蛋白奈梅亨断裂综合征蛋白1(Nijmegen breakage syndrome protein 1,NBS1)在新生大鼠支气管肺发育不良(bronchopulmonary dysplasia ,BPD)模型中的动态表达规律,探讨其对BPD疾病发生、发展的影响。方法:新生大鼠在生后12 h内随机分为BPD模型组50只和对照组50只,模型组吸入氧浓度为80%~85%,对照组吸入空气,两组分别于1 d、3 d、7 d、10 d、14 d收集肺组织标本,分离并培养肺泡Ⅱ型上皮细胞(alveolar type Ⅱ epithelial cell,AECⅡ)。光镜下观察肺组织形态学、辐射状肺泡计数(radial alveolar count,RAC)评价肺泡发育,免疫组织化学法及细胞免疫荧光观察NBS1的定位及表达,蛋白质免疫印迹、实时荧光定量PCR方法检测NBS1的表达水平。结果:与对照组相比,模型组RAC值从生后7 d开始显著降低(对照组7.58±1.24,模型组5.42±1.24, P<0.01)。免疫组织化学法可见NBS1蛋白主要定位在肺泡上皮细胞的细胞核内,模型组1 d时主要在细胞核内表达,随暴露时间延长,胞质染色细胞数量增多,核内表达减弱。细胞免疫荧光可见NBS1蛋白在AECⅡ中主要定位于细胞核内,与对照组相比,模型组3 d开始细胞质染色增强,细胞核染色逐渐减弱,14 d时主要定位于细胞质。蛋白质免疫印迹结果显示,与对照组相比,模型组NBS1的蛋白表达于生后1d达高峰(对照组0.72±0.29,模型组1.28±0.22, P<0.01),随后逐渐下降,14 d表达低于对照组(对照组0.73±0.19,模型组0.49±0.11, P<0.05)。同样与对照组相比,模型组NBS1的mRNA表达水平于生后1 d达高峰(对照组1.00±0.00,模型组1.18±0.06, P<0.01),随后逐渐下降,14 d表达低于对照组(对照组1.07±0.13,模型组0.76±0.11, P<0.05)。 结论:在新生大鼠BPD模型中,NBS1蛋白的表达下调及核富集障碍可能影响了DNA损伤应答,这可能是介导BPD氧化应激损伤发生的机制之一。
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编辑人员丨5天前
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线粒体DNA释放在肠缺血再灌注损伤中作用的研究进展
编辑人员丨5天前
肠缺血再灌注(I/R)损伤是指肠缺血一定时间后再恢复血供所引起的损伤。肠组织缺血可由失血性休克、绞窄性肠梗阻和急性肠系膜缺血等引发,当肠组织再灌注后虽然血氧水平恢复,但活性氧(ROS)的大量产生,直接促进中性粒细胞浸润缺血肠组织并加重组织损伤,这是造成肠I/R损伤患者肠坏死和高死亡率的主要原因 [1]。肠I/R损伤主要有两个阶段:首先是肠组织发生缺血,此时有氧代谢障碍,ATP合成减少,而无氧代谢生成大量乳酸,细胞内电解质紊乱,线粒体功能障碍,导致细胞死亡,上皮细胞屏障功能破坏,血管通透性增加 [2,3]。由于长时间缺血,肠组织恢复血流后,富含氧气的血液进入肠组织,产生大量氧自由基、细菌易位、炎症反应,最终导致细胞死亡、组织损伤、器官衰竭 [4]。肠I/R损伤的发生会破坏肠壁的屏障功能 [5],一旦引起肠壁屏障破坏超过其代偿能力,肠道菌群和毒素可进入血液循环,导致全身炎症反应综合征(SIRS) [6],甚至导致多器官功能衰竭(MODS)和死亡 [7]。人体肠组织富含线粒体,它参与了能量的产生、免疫应答、细胞代谢、死亡等一系列过程。当细胞受到损伤或应激时,线粒体释放许多损伤相关的分子模式(DAMPs),线粒体DNA(mtDNA)是其中之一 [8]。mtDNA可通过Toll样受体9(TLR9)、NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NLRP3)炎症小体和环磷酸鸟苷-腺苷酸合成酶(cGAS)-干扰素基因刺激因子(STING)信号通路激活先天免疫反应并诱导炎症,使肠道屏障功能受损,参与肠I/R损伤 [8]。本文主要综述了mtDNA释放在肠I/R损伤中的作用,为其防治提供理论参考。
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编辑人员丨5天前
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可溶性程序性死亡配体1在慢性乙型肝炎和慢性丙型肝炎患者中的意义
编辑人员丨5天前
目的:程序性死亡受体1/程序性死亡配体1(PD-1/PD-L1)通路可负调控机体的免疫应答,血清可溶性PD-L1(sPD-L1)可反映PD-L1的表达水平。通过比较血清sPD-L1在慢性乙型肝炎(CHB)和慢性丙型肝炎(CHC)患者间的表达差异,探讨CHB临床治愈的影响因素。方法:收集CHB患者60例、CHC患者40例和健康对照组60例,采用酶联免疫吸附试剂盒检测血清sPD-L1的水平,分析CHB和CHC患者中sPD-L1的水平及其与病毒载量、肝损伤指标等的关系。根据数据的分布类型,进行单因素方差分析或者Kruskal-Wallis检验,以及Pearson相关或者Spearman秩相关分析,以 P < 0.05时为差异具有统计学意义。 结果:CHB患者的血清sPD-L1水平[(414.6±214.9)pg/ml]显著高于CHC患者[(58.9±122.1)pg/ml]和健康对照组[(66.27±24.43)pg/ml],而CHC患者与健康对照组的血清sPD-L1差异无统计学意义。进一步的分组分析和相关性分析显示,CHB患者的血清sPD-L1水平与HBsAg含量呈正相关,与HBV DNA和丙氨酸转氨酶、白蛋白等肝损伤指标无相关性;CHC患者的血清sPD-L1水平与HCV RNA和肝损伤指标也无相关性。结论:CHB患者的血清sPD-L1水平显著高于健康对照组和CHC组患者,且sPD-L1水平与HBsAg呈正相关,HBsAg持续存在是PD-1/PD-L1通路活跃的重要机制,表明PD-1/PD-L1通路活跃可能是CHB目前尚不能被临床治愈的重要因素。
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编辑人员丨5天前
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DNMT1与DNA损伤应答反应
编辑人员丨5天前
DNMT1不仅是一种重要的DNA甲基转移酶,维持子代与亲代甲基修饰的统一,它的N端还含有特异性序列,使其在DNA损伤应答反应中发挥重要作用。DNA损伤应答反应是细胞对DNA损伤反应的统称,包括对DNA损伤信号的识别和放大、招募DNA修复因子启动修复通路和协调周期调控、诱发细胞凋亡。本文对DNMT1的作用、DNA损伤应答反应过程以及DNMT1通过参与损伤信号的感知和传导,调控DNA修复、周期检查点停滞和细胞凋亡参与DNA损伤应答反应过程加以综述。
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编辑人员丨5天前
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慢性乙型肝炎病毒感染免疫耐受期的新认识
编辑人员丨5天前
慢性乙型肝炎病毒感染"免疫耐受期"患者为HBsAg阳性、HBeAg阳性、HBV DNA高水平、丙氨酸转氨酶正常、肝脏病理学无明显炎症坏死和纤维化。但近年来,一些研究发现,慢性HBV感染"免疫耐受期"患者存在HBV DNA整合、克隆性肝细胞扩增、HBV特异性T细胞免疫应答,以及肝损伤和疾病进展。因此,对"免疫耐受期"的概念提出挑战。现对慢性乙型肝炎病毒感染"免疫耐受期"的新认识,包括新的命名及其诊断、治疗和管理的新理念作了简要综述。
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编辑人员丨5天前
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肺炎衣原体假定蛋白Cpn0423通过NOD2信号途径诱导炎症反应的作用机制
编辑人员丨5天前
目的:了解肺炎衣原体( Chlamydia pneumoniae,Cpn)假定蛋白Cpn0423的生物学活性及其诱导宿主细胞炎症反应的作用途径。 方法:生物信息学软件初步分析Cpn0423的生物学特性,激光共聚焦显微技术检测核苷酸结合寡聚化结构域样受体2(nucleotide-binding oligomerization domain-like receptor 2, NOD2)在骨髓源性的巨噬细胞(bone marrow-derived macrophages, BMDMs)中的亚细胞定位。采用NOD2-siRNA干扰试验检测其抑制BMDMs细胞中NOD2的表达水平,ELISA法检测Cpn0423诱导BMDMs细胞分泌的巨噬细胞炎性蛋白2(MIP-2)和IL-6,PCR法检测Cpn阳性患者支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)中Cpn0423 DNA水平。结果:Cpn0423与衣原体Ⅲ型分泌系统效应蛋白同源性为85%~93%。NOD2-siRNA能有效抑制BMDMs细胞中NOD2 mRNA的表达水平。NOD2-siRNA干扰后,Cpn0423诱导BMDMs细胞分泌的细胞因子MIP-2 [(920.5±99.1) pg/ml vs (130.1±11.5) pg/ml, P<0.001]和IL-6 [(266.2±58.4) pg/ml vs (165.7±21.5) pg/ml, P<0.001]水平显著降低。83.3%(10/12)Cpn阳性患者BALF中Cpn0423 DNA为阳性,对照组未检出Cpn0423 DNA。 结论:Cpn0423通过NOD2途径诱导宿主细胞免疫应答,与Cpn引起机体慢性炎症损伤密切相关。
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编辑人员丨5天前
