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Delta样典型Notch配体3基因在脑胶质瘤中的表达及其临床意义
编辑人员丨2天前
目的:研究Delta样典型Notch配体3(DLL3)基因在脑胶质瘤中的表达特征及其临床意义,进而探索其在脑胶质瘤中的生物学功能。方法:回顾性分析中国脑胶质瘤基因组图谱计划数据库(CGGA)的两套mRNA测序数据集及其匹配的临床数据,其中数据集1包含325例样本,数据集2包含693例样本。应用R软件分析DLL3在不同世界卫生组织(WHO)分级、不同分子分型脑胶质瘤的表达模式,并应用免疫组织化学染色检测方法验证DLL3蛋白在不同WHO级别脑胶质瘤中的表达水平。通过Kaplan-Meier生存曲线评价DLL3不同表达水平的脑胶质瘤患者的生存差异。采用单因素和多因素Cox回归分析法分析影响脑胶质瘤患者总体生存期的因素。通过Pearson相关性检验分析与DLL3表达相关的基因。采用功能富集分析方法分析与DLL3表达相关基因的生物学功能。结果:在数据集1中,DLL3的表达随着WHO级别的升高而下调,差异有统计学意义( P<0.001);DLL3在异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变型患者中的表达量高于IDH野生型患者( P<0.001);DLL3在IDH野生型患者中的表达量低于IDH突变型且染色体1p/19q共缺失患者和IDH突变型且染色体1p/19q非共缺失患者( P<0.001);DLL3在O 6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化患者中的表达量高于非甲基化患者( P<0.001);通过免疫组织化学染色方法验证DLL3表达随着WHO级别的升高而下调( P<0.01);DLL3的上述结果在数据集2中得到相似结果。在两个数据集中,DLL3高表达组患者的总体生存期均长于低表达组患者(均 P<0.01)。多因素Cox回归分析结果显示,WHO分级(WHO Ⅲ级: HR=2.861,95% CI:1.910~4.287;Ⅳ级: HR=4.655,95% CI:3.010~7.199)、染色体1p/19q共缺失( HR=0.439,95% CI:0.293~0.657)以及DLL3高表达( HR=0.593,95% CI:0.427~0.823)均为脑胶质瘤患者预后的独立影响因素(均 P<0.001)。与DLL3表达相关的基因有661个(| r|≥0.4, P<0.05);生物信息学分析提示,DLL3可能与脑胶质瘤患者的轴突发生、突触组织、负向调控神经系统发育等功能相关。 结论:随着脑胶质瘤病理学级别的升高,DLL3的表达水平下调;DLL3表达水平与脑胶质瘤患者的生存期密切相关,可作为判断脑胶质瘤患者预后的潜在指标和治疗靶点。
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编辑人员丨2天前
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积雪草酸对糖尿病大鼠血—视网膜屏障的保护作用
编辑人员丨2天前
目的:研究积雪草酸(AA)对糖尿病大鼠血—视网膜屏障(BRB)的保护作用及其可能机制。方法:取健康8周龄雄性SD大鼠96只,按照随机数字表法分为正常对照组、糖尿病模型组、低剂量AA组和高剂量AA组,每组24只。取糖尿病模型组、低剂量AA组、高剂量AA组大鼠采用腹腔注射链脲佐菌素建立糖尿病模型,正常对照组注射等量枸橼酸盐缓冲液,模型建立后1个月,低剂量AA组和高剂量AA组分别给予37.5 mg/kg、75.0 mg/kg AA灌胃;正常对照组及糖尿病模型组给予等量0.5%羧甲基纤维素钠灌胃,每日1次。在给药第0、1、2、3、4周称量大鼠体质量并检测鼠尾静脉血糖值。给药后1个月取大鼠视网膜组织进行实验。采用苏木精—伊红染色法观察大鼠视网膜组织的病理变化;采用伊文思蓝定量法检测BRB的破坏情况;采用免疫荧光染色法检测视网膜组织中Occludin、Notch1、Jagged典型Notch配体1(JAG1)、Delta样典型Notch配体4(DLL4)蛋白的表达分布;采用实时荧光定量PCR法及Western blot法检测Occludin、Notch1、JAG1、DLL4 mRNA及蛋白的表达。结果:给药第4周,高剂量AA组体质量明显高于糖尿病模型组,低剂量AA组和高剂量AA组血糖浓度均低于糖尿病模型组,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。正常对照组大鼠视网膜细胞排列整齐,结构层次清晰。糖尿病模型组大鼠视网膜明显增厚,外核层增厚,细胞排列紊乱,结构层次不清晰。低剂量AA组和高剂量AA组大鼠视网膜厚度和结构均较糖尿病模型组明显改善。正常对照组、糖尿病模型组、低剂量AA组和高剂量AA组视网膜中伊文思蓝含量依次为(3.07±1.30)、(13.73±3.88)、(9.57±2.69)和(6.55±1.61)ng/mg,总体差异有统计学意义( F=18.50, P<0.01),其中高剂量AA组视网膜中伊文思蓝含量明显低于糖尿病模型组,差异均有统计学意义(均 P<0.01)。糖尿病模型组Occludin蛋白相对表达量明显低于其余3个组,Notch1、JAG1和DLL4蛋白相对表达量明显高于其余3个组,差异均有统计学意义(均 P<0.05);高剂量AA组Occludin蛋白相对表达量明显高于低剂量AA组,Notch1、JAG1和DLL4蛋白相对表达量明显低于低剂量AA组,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。与正常对照组比较,糖尿病模型组及低剂量AA组Occludin mRNA相对表达量明显下调,Notch1、JAG1和DLL4 mRNA相对表达量明显上调,差异均有统计学意义(均 P<0.01);高剂量AA组Occludin mRNA相对表达量明显高于糖尿病模型组和低剂量AA组,Notch1 mRNA相对表达量明显低于糖尿病模型组和低剂量AA组,JAG1和DLL4 mRNA相对表达量明显低于糖尿病模型组,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。 结论:AA可能通过抑制Notch1信号通路发挥对糖尿病大鼠BRB的保护作用。
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编辑人员丨2天前
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Notch信号通路相关受体及配体在复发性流产患者绒毛及蜕膜组织中的表达
编辑人员丨2023/8/5
目的:研究Notch信号通路相关受体Notch1、Notch2、Notch3、Notch4及配体Delta样典型Notch配体1、3、4(DLL1、DLL3、DLL4)、Jagged1、Jagged2在复发性流产(RSA)患者绒毛及蜕膜组织中的表达情况.方法:收集行人工流产术的RSA患者(RSA组)及正常早孕终止妊娠患者(正常组)绒毛及蜕膜组织标本各15例,并提取组织中总RNA及蛋白,实时定量PCR(qRT-PCR)及蛋白免疫印迹(Western blot)法检测两组绒毛及蜕膜组织中Notch1、Notch2、Notch3、Notch4及DLL1、DLL3、DLL4、Jagged1、Jagged2在mRNA及蛋白水平的表达情况.结果:与正常组相比,RSA组绒毛中Notch1、Notch2、Notch4、DLL4、Jagged1、Jagged2在mRNA及蛋白水平表达均降低(均P<0.01),Notch3、DLL1、DLL3在两组间表达水平比较无统计学差异(均P>0.05);与正常组相比,RSA组蜕膜中Notch1、Notch2、Notch4、DLL1、DLL4、Jagged1、Jagged2在mRNA及蛋白水平表达均降低(均P<0.01),Notch3、DLL3在两组间表达水平表达比较无统计学差异(均P>0.05).结论:Notch信号通路部分相关受体及配体在RSA患者绒毛及蜕膜组织中呈现病理性差异表达,提示Notch信号通路与RSA发病相关,从妊娠建立伊始即参与了RSA发生.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于单细胞转录组的多级别胶质瘤异质性及免疫微环境分析揭示了潜在的预后生物标志物
编辑人员丨2023/8/5
脑胶质瘤(glioma)是中枢神经系统最常见的内在肿瘤,具有发病率高、预后较差等特点.本研究旨在鉴定多形性胶质母细胞瘤(glioblastoma multiforme,GBM)和低级别胶质瘤(lower-grade gliomas,LGG)之间的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),以探讨不同级别胶质瘤的预后影响因素.从NCBI基因表达综合数据库中收集了胶质瘤的单细胞转录组测序数据,其中包括来自3个数据集的共29 097个细胞样本.对于不同分级的人脑胶质瘤进行分析,经过滤得到21 071个细胞,通过基因本体分析、京都基因与基因组百科全书途径分析,从差异表达基因中筛选出70个基因,我们通过查阅文献,聚焦到delta样典型Notch配体3(delta like canonical Notch ligand 3,DLL3)这个基因.基于TCGA的基因表达谱交互分析(gene expression profiling interactive analysis,GEPIA)数据库用于探索LGG和GBM中DLL3基因的表达差异,采用基因表达谱交互式分析和肿瘤免疫学估计资源(tumor immune estimation resource,TIMER)数据库,研究关键基因在不同分级的脑胶质瘤中的表达,预测了与免疫治疗密切相关的生物标志物.cBioPortal数据库用于探索DLL3表达与25个免疫检查点之间的关系.基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)进一步确定了与中心基因相关的途径.最后,在中国胶质瘤基因组图谱(Chinese glioma genome atlas,CGGA)中验证了生物标志物在预后和预测中的疗效.这些结果发现,预后基因与肿瘤增殖和进展有关,通过生物学信息和生存分析,表明这些基因可能作为一种有前途的预后生物标志物,并作为选择治疗策略的新靶点.
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编辑人员丨2023/8/5
