目的:了解上海市疱疹性咽峡炎(herpangina, HA)病原学特征，为HA防控措施的制定提供科学依据。方法:收集2017—2019年上海市哨点医院上送的HA病例咽拭子标本，采用荧光定量PCR(Real-Time PCR)进行肠道病毒(enterovirus, EV)、EV-A71、柯萨奇病毒(coxsackievirus, CV)-A16、CV-A6和CV-A10核酸检测，并对非EV-A71、CV-A16、CV-A6、CV-A10的其他EV感染病例样本进行病毒分离、测序以鉴定EV的分型。用Excel和IBM SPSS Statistics 22.0进行统计学分析。结果:264例HA病例中，主要为0～1岁的婴儿，占比为32.95%(87/264)；EV阳性检出率为69.70%(184/264)，共检出EV-A71、CV-A16、CV-A6、CV-A10、CV-A4、CV-A2、CV-A5、CV-B5 8种EV，其中构成比占前3位的血清型分别为CV-A6(39.13%，72/184)、CV-A10(17.39%，32/184)和CV-A4(16.85%，31/184)。2017—2019年各个年份其他EV占比逐年增多，分别为19.23%(10/52)、41.10%(30/73)、47.46%(28/59)。结论:上海市2017—2019年HA中常见病原体为CV-A6、CV-A10和CV-A4，其他EV占比逐年增多。

目的:对从云南重症手足口病患者的粪便样品中分离出的1株柯萨奇病毒A组4型(coxsackievirus A4，CV-A4)毒株的全基因组特征和部分区段重组情况进行分析，为深入认识CV-A4的流行和分子进化提供基础数据。方法:分别使用人类横纹肌肉瘤(human rhabdomyosarcoma，RD)细胞、人胚肺二倍体(human embryonic lung diploid，KMB17)细胞和人非小细胞肺癌(human lung cancer，A549)细胞进行病毒分离。提取病毒RNA，通过逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction，RT-PCR)分段扩增CV-A4全长基因，利用MEGA7.0和SimPlot 3.5.1等软件对全基因组及各区段进行分析。结果:从RD细胞上分离到一株CV-A4分离株R11-20/YN/CHN/2011，系统进化分析显示该分离株属于C2基因亚型。在VP1和全基因组核苷酸序列上与其同源性最高的分别是CV-A4毒株09214/SD/CHN/2009和CVA4/SZ/CHN/09。重组分析显示该分离株与肠道病毒A71(enterovirus A71，EV-A71)云南分离株R993/YN/CHN/2010在3D区发生过重组。结论:CV-A4分离株R11-20/YN/CHN/2011为C2基因亚型且与EV-A71在3D区发生重组。

目的:了解2016—2018年昆明市手足口病病原构成情况，阐明昆明市流行的柯萨奇病毒A组6型（CV-A6）基因特征。方法:对2016—2018年云南省手足口病实验室监测系统收集的昆明市手足口病患儿样本使用CV-A16和肠道病毒71型（EV-A71）+ EV通用型核酸检测试剂盒进行实时荧光RT-PCR检测，并对非EV-A71和非CV-A16阳性样本进行普通RT-PCR扩增得到VP1全长序列。用MEGA 5.2软件对本次研究分离到的昆明市CV-A6毒株序列与参考序列构建系统进化树，分析其分子流行病学特征。结果:2016—2018年昆明市手足口病病原监测结果显示，昆明市实验室诊断手足口病共2 318例，其中，检出EV-A71阳性417例，CV-A16阳性883例，其他EV阳性1 018例。2016年的优势病原为CV-A16（50.26%），2017和2018年优势病原均为其他EV，分别占56.06%和54.03%。从其他EV共分离出CV-A6毒株57株，均属于国内流行的D3a亚型。结论:2016—2018年引起昆明市儿童手足口病的主要病原体是CV-A16和其他EV，应加强常规监测中其他EV的监测，并关注CV-A6毒株的持续流行。

目的:分析大理白族自治州手足口病的流行病学和病原学构成，为制订手足口病的防控措施提供科学决策和依据。方法:通过中国疾病预防控制信息系统收集2015年1月至2019年12月大理白族自治州手足口病病例的人口学资料，分析患者的发病率，流行病学特征，采用实时反转录聚合链反应检测手足口病患者粪便标本中的柯萨奇病毒A组16型、肠道病毒71型和其他肠道病毒核酸。统计学方法采用 χ2检验。 结果:2015年至2019年，大理白族自治州共报告手足口病30 730例，年均发病率为171.50/10万，2016年至2019年发病率呈上升趋势，其中重症病例24例(0.08%)。年均发病率居前3位者分别为永平县、宾川县和大理市。6月至7月为夏季发病高峰，共报告病例9 168例(29.83%)；9月至10月为秋季流行高峰，共报告病例5 988例(19.49%)，夏季高峰流行强度高于秋季高峰。30 730例病例中，男17 373例，女13 357例，男性年均发病率为120.29/10万，高于女性的75.83/10万，差异有统计学意义( χ2＝1 637.467， P<0.01)。幼儿期(1~<3岁)的发病率最高，其次为学龄前期(3~<6岁)，分别为4 158.96/10万和1 953.11/10万。从幼儿期开始，发病率随年龄的增长而降低；重症病例集中在幼儿期，共报告16例，占重症病例数的66.67%。人群分类以散居儿童为主，共报告20 516例(66.76%)。1 294例实验室确诊病例中，柯萨奇病毒A组16型感染者792例(61.21%)，肠道病毒71型感染者为320例(24.73%)，其他肠道病毒感染者182例(14.06%)。 结论:大理白族自治州手足口病发病具有明显的季节、年龄和人群特征，应加强部门合作、健康教育，严格落实各项防控措施，以降低发病率，并提高重症病例的早期识别救治能力。

目的:了解2019年云南省曲靖地区手足口病（HFMD）病原学特征。方法:采集曲靖地区2019年HFMD患儿的粪便样本，从粪便悬液中直接提取病毒RNA，先用MD91/OL68-1引物扩增肠道病毒（EV）VP4区基因并测序，序列在GenBank确定病毒型别，用各型病毒的相关引物扩增病毒VP1区全序并测序，通过肠道病毒在线定型工具（Enterovirus Genotyping Tool Version 0.1）进行病毒型别初步鉴定，之后计算与原型株的核苷酸相似性并进行基因进化树分析定型。结果:470份样本中共检测到62株EV毒株，总阳性检出率为13.19%，其中EV-A组病毒42株（8.94%），EV-B组病毒9株（1.91%），EV-C组病毒11株（2.34%），全为脊灰病毒1型疫苗株（Sabin株），未检测到肠道病毒71型（EV-A71）和EV-D组病毒。检出率较高的病毒依次为柯萨奇病毒A10型（CV-A10，4.47%，21株）、柯萨奇病毒A16型（CV-A16，2.55%，12株）、脊髓灰质炎病毒1型疫苗株（2.34%，11株）和CV-A6（1.70%，8株）。结论:2019年云南省曲靖地区儿童HFMD病例的主要病原是CV-A10、CV-A16和CV-A6，未检出EV-A71。与往年国内其他省份相比，曲靖地区2019年HFMD病原体已经发生改变，今后要加强对CV-A10、CV-A16和CV-A6等病原的实验室监测工作。

肠道病毒A71型(enterovirus-A71，EV-A71)感染引起的手足口病(hand, foot, and mouth disease, HFMD)给婴幼儿身心健康带来巨大威胁，明确EV-A71的致病机制能够为EV-A71的防控提供科学依据。miRNA作为一类非编码RNA，通过靶向结合mRNA控制蛋白表达进而调控宿主细胞的多个生物过程，同时也参与病毒与宿主细胞的互作过程。本文主要从miRNA的生成、EV-A71感染宿主细胞后引起的miRNA表达谱改变、miRNA靶向EV-A71基因组和宿主基因调控EV-A71复制、宿主细胞抗EV-A71的天然免疫应答、细胞凋亡等方面进行综述，以期为进一步明确miRNA在EV-A71与宿主细胞互作和EV-A71致病机制中的作用提供科学依据。

目的:了解安徽省柯萨奇病毒A组4型(coxsackievirus A4，CV-A4)毒株全基因组序列变异及分子进化情况，为今后手足口病的病原学监测和科学防治提供理论依据。方法:采用一代测序法对2020年5株CV-A4分离株进行全基因组测序。运用MEGA11.0对5株CV-A4分离株，32株CV-A4代表株和肠道病毒A71型(Enterovirus A71，EV-A71)原型株BrCr基于VP1区构建系统进化树，对分离株以及肠道病毒A组(enterovirus A，EV-A)原型代表株基于P1、P2、P3区分别构建系统进化树；选用DNAStar进行毒株VP1区氨基酸序列比对，使用BioEdit7.2进行氨基酸置换熵分析并作氨基酸位点熵值图，使用SimPlot3.5和RDP4对CV-A4分离株和EV-A原型代表株进行重组分析，使用DnaSP6软件进行分离株和参考代表株的选择压力分析。结果:系统进化树显示：分离株属于C2亚型，与中国大陆地区流行的CV-A4毒株属于同一分支，C2亚型分支的毒株氨基酸序列同源性为97.30%～100%，分离株同原型相比，均有6个氨基酸变异位点。选择压力分析表明C2亚型的CV-A4毒株受负选择压力的影响，置换熵分析编码区氨基酸序列有25个易突变位点，占比1.14%，毒株进化主要依赖重组。重组分析表明分离株在P2、P3区域与多种EV-A原型株发生不同区段的重组，与CV-A5原型株重组区段较长，尤其在3A-3C区段，P1是相对保守的区段。结论:安徽省CV-A4在P2、P3区与其他EV-A原型株发生频繁重组事件，应对安徽省CV-A4的分子进化研究继续保持密切关注。

目的:探讨手足口病合并细菌感染患儿血清降钙素原（PCT）早期检测的临床意义，为患儿的临床诊断提供参考。方法:选取台州市第一人民医院2017年12月至2018年12月收治的手足口病患儿126例为研究对象，根据患儿的感染情况将患儿分为合并细菌感染组和单纯病毒感染组，每组63例。同时，选取同期在台州市第一人民医院体检中心体检健康儿童20例为对照组。两组均进行外周血白细胞介素6（IL-6）、白细胞介素10（IL-10）、外周白细胞计数（WBC）、C反应蛋白（CRP）、PCT水平的比较分析，并对患儿的致病菌感染情况进行分析。结果:单纯病毒感染组患儿IL-6［（3.75±0.76）ng/L］、IL-10［（55.31±11.27）ng/L］、CRP［（10.91±1.16）mg/L］均明显高于对照组［（1.39±0.41）ng/L、（11.72±9.58）ng/L、（2.16±0.65）mg/L］，均差异有统计学意义（ t=8.040、16.982、7.825，均 P<0.05）；合并细菌感染组IL-6［（4.10±1.09）ng/L］、IL-10［（66.64±7.42）ng/L］均明显高于对照组和单纯病毒感染组，均差异有统计学意义（ t=13.088、9.053、10.031、15.021，均 P<0.05）。合并细菌感染组CRP（26.28±4.35）mg/L］高于单纯病毒感染组［（10.91±1.16）mg/L］（ t=21.938， P<0.05）。合并细菌感染组PCT［（0.63±0.04）μg/L］、WBC［（15.12±3.97）×10 9/L］均高于对照组［（0.13±0.02）μg/L、（7.93±1.91）×10 9/L］和单纯病毒感染组［（0.07±0.01）μg/L、（8.78±1.12）×10 9/L］，均差异有统计学意义（均 P<0.05）。单纯病毒感染患儿肠道病毒71型（EV71）、通用型肠道病毒（EV）的感染率均低于合并细菌感染患儿，均差异有统计学意义（χ 2=20.329、31.924，均 P<0.05）。 结论:检测血清PCT水平对手足口病合并细菌感染有特异性高、准确性好的特点，与WBC检测可共同作为鉴别手足口病患儿是否存在细菌感染的敏感指标。

目的:了解上海市松江区2019年手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)病原中A组肠道病毒(enterovirus, EV)VP1基因特征。方法:使用实时荧光逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction, RT-PCR)检测HFMD疑似病例的标本，EV阳性标本接种人横纹肌肉瘤细胞(rhabdomyosarcoma cells, RD)培养病毒。分离到的A组EV毒株经VP1区基因测序后使用MEGA X软件进行系统进化分析及核苷酸、氨基酸同源性分析。结果:2019年共检测207份HFMD标本，其中188份检出EV，柯萨奇病毒(coxsackievirus, CV)-A6、CV-A16、CV-A10、CV-A4阳性分别为47.34%(89/188)、41.49%(78/188)、3.72%(7/188)、2.66%(5/188)，其他EV阳性为4.79%(9/188)，未检出EV-A71。HFMD夏季流行高峰(5~7月)多检出B1基因亚型的CV-A16，B1a和B1b进化分支共同流行，秋冬季的次高峰(9~12月)检出D3a进化分支的CV-A6较多。CV-A10和CV-A4散在发病，均为C2基因亚型。与原型株相比，CV-A6、CV-A16、CV-A10、CV-A4 VP1基因核苷酸(氨基酸)序列同源性分别为79.22%~81.78%(95.97%~97.19%)、62.70%~65.54%(90.10%~91.30%)、81.76%~82.65%(91.63%~92.03%)、81.09%~81.79%(97.27%~97.67%)。结论:HFMD病原体流行的多样性及复杂性增加了HFMD防控难度。EV监测项目的拓展及分子流行病学的研究有助于防控HFMD。

目的:分析并比较2016年浙江省温岭地区EV71型轻、重症手足口病(HFMD)患儿病毒分离株VP1和VP4区基因特征及进化关系。方法:研究对象为2016年浙江省温岭市第一人民医院分离鉴定的EV71型HFMD患儿，随机选取轻、重症HFMD患儿EV71病毒株各6例，进行VP1和VP4区基因扩增和测序，利用DNAStar和Mega 6.0软件对测序结果与美国国立生物信息中心公布的EV71典型基因代表株(A、B1～5、C1～4亚型)进行核苷酸和氨基酸比对分析，并构建系统进化树。结果:轻、重症手足口病患儿性别(χ 2＝14.51， P<0.05)和年龄( t＝2.82， P<0.05)差异无统计学意义。两组EV71分离株的VP1区核苷酸同源性为95.8%～99.6%，氨基酸同源性为99.1%～100%；VP4区核苷酸同源性为95.0%～99.9%，氨基酸同源性为99.0%～100%，轻、重症EV71分离株同源性高。它们与典型C4a基因型代表株最接近，氨基酸同源性为：96.6%～100%(VP1)和94.3%～100%(VP4)。3例EV71型重症HFMD患儿分离株分别出现VP1区V170L突变(缬氨酸→亮氨酸)，VP1区A293S(丙氨酸→丝氨酸)以及VP4区T7A(苏氨酸→丙氨酸)，其他未见明显突变。 结论:2016年浙江温岭地区轻、重症HFMD患儿EV71病毒分离株VP1和VP4区同源性高，且均属于C4a基因亚型。其中几个位点的氨基酸突变可能与浙江温岭地区HFMD患儿疾病危重有关。