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GnRH缺陷疾病致病基因 RNF216互作蛋白的筛选
编辑人员丨6天前
目的:通过酵母双杂交实验筛选与环指蛋白216(ring finger protein 216, RNF216)相互作用的蛋白,进一步阐明RNF216在GnRH缺陷疾病中的作用。方法:构建pGBKT7- RNF216重组表达载体,将其转化到Y2HGold酵母中,与人cDNA文库进行杂交,筛选与RNF216相互作用的蛋白,然后在Y2HGold酵母中进行验证。 结果:成功构建了pGBKT7- RNF216重组表达载体,并在Y2HGold酵母中成功表达;通过酵母双杂交实验,筛选到了一个与RNF216相互作用的蛋白——丝状蛋白B(filamin B, FLNB),并在Y2HGold酵母中验证了它们之间的相互作用。 结论:成功筛选到一个与RNF216相互作用的FLNB蛋白,RNF216可能通过调节FLNB或FLNB/FLNA异源二聚体影响GnRH神经元的增殖和迁移。
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编辑人员丨6天前
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基于TCGA数据库构建肝细胞癌双硫死亡相关基因(DRGs)预后风险模型及评价
编辑人员丨2024/4/27
目的 基于癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库构建肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)双硫死亡相关基因(disulfidptosis-related genes,DRGs)预后风险模型及评价.方法 通过生物信息学方法分析TCGA数据库中 371 例HCC样本及 50 例癌旁样本中 15 个DRGs的表达情况,并进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释和京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析、Kaplan-Meier(KM)生存分析;通过单因素COX回归分析筛选出有统计学意义的DRGs,通过LASSO回归分析及多因素COX回归分析筛选出关键DRGs构建预后风险模型,并根据风险评分将HCC患者分为高风险组和低风险组,制作KM生存曲线和时间依赖的受试者工作特征(receiver operator characteristic,ROC)曲线进行验证评价.结果 与癌旁样本相比,HCC样本 15 个DRGs中FLNA,MYH9,TLN1,ACTB,MYL6,CAPZB,DSTN,ACTN4,SLC7A11,INF2,CD2AP,PDLIM1 和FLNB均表达上调,且差异具有统计学意义(t=1 793~6 310,均P<0.001);经GO功能注释和KEGG富集分析显示,DRGs主要与肌动蛋白细胞骨架和细胞黏附相关的生物过程或途径密切相关.经KM生存分析结果显示,SLC7A11,INF2,CD2AP,MYL6,ACTB高表达组生存率低于低表达组[HR=1.46(1.03~2.07)~1.93(1.36~2.75),均P<0.05].通过单因素COX回归分析、LASSO分析及多因素COX回归分析构建预后风险模型riskscore=(0.247×SLC7A11)+(0.289×INF2)+(0.076×CD2AP)+(0.06×MYL6);计算样本的风险评分,风险评分越高,预后不良的HCC患者人数越多;KM生存分析显示高风险组的总生存率比低风险组低;1,3,5 年的AUC值分别为 0.709,0.661 和 0.648;通过多因素COX回归分析表明SLC7A11[HR=1.832(1.274~2.636),P=0.001]是独立的预后危险因素.结论 四个DRGs构建的预后风险模型在预测HCC患者预后情况有一定的作用.
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编辑人员丨2024/4/27
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敲低细丝蛋白B对小鼠颅顶成骨前体细胞增殖、迁移及凋亡的影响
编辑人员丨2024/3/30
背景:细丝蛋白B(FLNB)能将肌动蛋白细胞骨架交联成动态结构,对细胞的定向移动至关重要,可调控软骨细胞的增殖、分化及凋亡的发生.然而,细丝蛋白B对成骨细胞增殖、迁移及凋亡的影响尚未报道.目的:探究细丝蛋白B对MC3T3-E1细胞的增殖、迁移及凋亡的影响.方法:构建敲低细丝蛋白B表达的腺病毒载体(sh-FLNB1、sh-FLNB2、sh-FLNB3),感染小鼠颅顶成骨前体细胞(MC3T3-E1),嘌呤霉素药筛,通过Western Blot以及RT-PCR技术检测敲低效率,选取敲低细丝蛋白B效率最佳的MC3T3-E1细胞株作为稳转细胞株.将细胞分为Blank组、mc3t3组、sh-NC组(空载体)、sh-FLNB组(sh-FLNB慢病毒),Blank组为α-MEM完全培养基无细胞;mc3t3组为单纯α-MEM完全培养基培养;sh-NC组、sh-FLNB组为含有嘌呤霉素2.5 μg/mL的α-MEM完全培养基培养.培养3 d采用CCK-8法和划痕实验检测MC3T3-E1细胞增殖和迁移能力;流式细胞仪检测细胞凋亡情况;RT-PCR进一步验证细胞凋亡相关基因的表达.结果与结论:①Western Blot及RT-PCR结果显示,sh-FLNB3组细丝蛋白B敲低效率最佳,差异有显著性意义(P<0.000 1),以此作为后续实验稳转细胞株;②CCK-8数据显示,敲低细丝蛋白B后MC3T3增殖能力显著减弱(P<0.05);③划痕实验显示,敲低细丝蛋白B后MC3T3的迁移能力明显下降;④流式细胞仪及RT-PCR显示,敲低细丝蛋白B后,MC3T3-E1细胞凋亡率增加,促凋亡因子Bax表达显著上升,抑凋亡因子Bcl-2表达下降(P<0.05);⑤结果说明,细丝蛋白B敲低可降低MC3T3-E1细胞的增殖能力,细胞迁移能力下降,并增加细胞凋亡的发生.
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编辑人员丨2024/3/30
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全外显子测序盘状半月板的病因学分析
编辑人员丨2023/8/5
背景:盘状半月板是一种半月板形态学改变,至今发病机制不明,目前尚无关于盘状半月板的基因组学研究.目的:通过外显子测序结合生物信息学分析筛选盘状半月板可疑致病基因.方法:提取7例盘状半月板患者的外周血DNA,分别建库后进行全外显子测序,测序数据与公共基因组数据库对比筛选变异位点,并进行可疑致病突变注释及解读.结果 与结论:①7例患者共筛选出变异位点6943个,其中错义突变3620个,同义突变732个,剪接位点附近的突变488个,剪接位点突变45个,外显子重复20个,外显子缺失84个,非移码突变136个,截断突变54个,延长突变5个,起始位点突变8个;②基于共有突变基因和公共基因数据库筛选出可疑致病基因6个,分别为PADI4、FLNB、SYNE1、COL11A2、COL2A1、MYO9A,包含变异位点15个,结合突变频率数据库、蛋白危害性分析结果和国内外相关研究确定盘状半月板可疑基因为PADI4、FLNB、SYNE1、COL11A2、COL2A1.
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编辑人员丨2023/8/5
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细丝蛋白B在钙化性主动脉瓣疾病中的表达及其临床意义
编辑人员丨2023/8/5
目的 研究细丝蛋白B(FLNB)在钙化性心脏瓣膜中的表达及其临床意义.方法 2021年8月~2022年1月在我院手术切除的钙化性主动脉瓣标本9例,同期因主动脉夹层行手术切除的正常主动脉瓣膜标本8例作为对照.组织切片茜素红染色观察瓣膜钙化结节.采用免疫组化分析方法对瓣膜中细丝蛋白B的表达进行分析.利用冰冻组织标本进行蛋白质免疫印迹检测,验证相应分子表达水平间差异.结果 钙化瓣膜切片经茜素红染色可以看见明显钙化结节.免疫组化检查显示细丝蛋白B表达于细胞质,钙化瓣膜高于正常瓣膜,钙化组平均光密度为(6.57±1.65)%;对照组为(0.91±0.52)%,两组比较差异有统计学意义(P<0.05),蛋白质免疫印迹结果与之一致.结论 细丝蛋白B在钙化瓣膜中表达增高,可能参与了瓣膜钙化的病理进程.
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编辑人员丨2023/8/5
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Filamin B在骨骼系统中的研究进展
编辑人员丨2023/8/5
细丝蛋白B(Filamin B,FLNB)是一种大的二聚体肌动蛋白结合蛋白,是丝蛋白(Filamins)家族中的一员.其可将肌动蛋白细胞骨架细丝交联成动态结构,为细胞运动和信号传递提供了重要的支架.然当FLNB发生突变后,可导致严重的遗传性骨骼相关疾病.基于FLNB在骨骼系统中突变所致疾病的基础和临床研究,本文通过从FLNB基因的生物功能及其突变后影响骨骼系统发育和所致疾病的致病机制入手,对FLNB在骨骼系统中的研究进行综述,提供FLNB在骨骼系统中最新的研究进展.
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编辑人员丨2023/8/5
