目的:探究双氢青蒿素(dihydroartemisinin，DHA)和索拉非尼(sorafenib, SOR)诱导未分化甲状腺癌(anaplastic thyroid cancer, ATC)细胞发生铁死亡的协同作用及分子机制。方法:以细胞计数试剂盒(CCK-8)和流式细胞仪检测DHA和SOR对ATC细胞CAL-62增殖及铁死亡的影响；实时荧光定量PCR和蛋白印迹检测铁死亡相关基因谷胱甘肽过氧化酶4(GPX4)、溶质载体家族7成员11基因(SCL7A11)、脂氧合酶-15(LOX-15)及p53表达水平的变化；对应的检测试剂盒检测铁死亡中间代谢产物乳酸脱氢酶(LDH)、谷胱甘肽(GSH)、丙二醛、亚铁离子(Fe 2+)、一氧化氮(NO)、活性氧簇(ROS)水平；建立裸鼠肿瘤模型分析DHA和SOR对ATC在体内的抑制作用。 结果:与对照组相比，DHA、SOR和DHA+SOR处理均呈剂量依赖性抑制细胞增殖( P<0.001)，LDH、Fe 2+、丙二醛及ROS含量明显增多，GSH活性明显降低( P<0.001)，其作用均被硫酸亚铁(FeSO 4)促进，被铁抑素-1逆转。与对照组及单独用药组比较，DHA+SOR组15-LOX-2及p53表达上调，GPX4和SCL7A11水平降低( P<0.001)，15-LOX-1蛋白含量差异无统计学意义；此外，DHA+SOR组NO的含量显著降低( P<0.001)。DHA和SOR在体抑制ATC肿瘤生长。 结论:DHA与SOR协同作用上调15-LOX-2基因的表达，抑制NO的合成，从而诱导ATC细胞发生铁死亡。

目的:观察人白细胞介素-1受体Ⅱ(IL-1R2)在肠癌肿瘤微环境(TME)中的表达特征，探究IL-1R2在结肠癌中的作用。方法:分析基因表达谱数据库(GEO)中的结肠癌单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据，确定IL-1R2基因在肿瘤组织中的表达分布。采用随机数字表法将小鼠分为对照组和IL-1R2敲基因组(Il1r2 －/－)。利用氧化偶氮甲烷(AOM)和葡聚糖硫酸钠(DSS)制备结肠炎相关肠癌模型。在AOM/DSS诱导后的第70d，收集肿瘤组织，计数肿瘤数量并测量其直径；应用流式细胞术分析Il1r2 －/－小鼠和对照组小鼠TME中各类细胞群体浸润的差异以及免疫检查点分子的表达差异。采用独立样本 t检验比较两组间差异。使用双向方差分析来比较体重曲线。 结果:小鼠结肠癌和人类结肠癌CD45 ＋免疫细胞的scRNA-seq数据的分析结果显示，与正常组织比较，IL-1R2在结肠癌组织中高表达。Il1r2 －/－小鼠与对照组小鼠肿瘤数量之间的差异无统计学意义(4.750±0.977比7.800±1.114， t＝2.005， P>0.05)，但是Il1r2 －/－小鼠肿瘤负荷显著低于对照组(24.170±7.483比96.000±19.990， t＝3.618， P<0.01)。Il1r2 －/－小鼠TME中CD45 ＋免疫细胞(35.140±3.673比7.076±1.929， t＝6.764， P<0.001)和CD8 ＋T细胞(26.820±1.004比15.900±2.665， t＝3.835， P<0.05)的比例显著高于对照组，CD4 ＋T细胞的比例有下降趋势，差异无统计学意义( P>0.05)。IL-1R2缺失导致程序性死亡因子-1(PD-1) ＋CD4 ＋T细胞(14.340±3.401比24.570±2.330， t＝2.482， P<0.05)、T细胞免疫球蛋白黏蛋白-3(Tim-3) ＋CD4 ＋T细胞(20.740±4.001比41.500±4.108， t＝3.620， P<0.01)、PD-1 ＋Tim-3 ＋CD4 ＋T细胞(7.184±2.129比15.140±1.730， t＝2.900， P<0.05)比例显著低于对照组，而CD8 ＋T细胞上PD-1和Tim-3的表达差异无统计学意义( P>0.05)。 结论:IL-1R2在结肠癌中高表达，IL-1R2缺失可以降低小鼠对结肠炎相关肠癌的易感性。

铜是生命体重要的微量元素之一,铜缺乏和铜过载均会对细胞造成损害,因此,细胞内的铜含量维持在一个合理的范围内十分重要.铜死亡是被确立的一种新型独立的程序性细胞死亡方式,主要是线粒体功能受损,细胞中铜过载会导致三羧酸循环中的酯酰化蛋白异常寡聚,铁-硫簇蛋白丢失,造成蛋白毒性应激反应,从而破坏细胞内稳态引发铜死亡.肝细胞癌(HCC)中的铜浓度高于正常是铜死亡发生的条件之一.铜死亡在HCC发生发展中至关重要,对促进血管生成、免疫逃逸、调节经典信号通路以及诱导其他细胞死亡方式等方面发挥了重要作用.铜死亡影响细胞稳态、参与调节多种生物学过程;在HCC免疫微环境中,生物信息学分析揭示了铜死亡与CD8+T细胞、滤泡树突细胞、T辅助细胞等免疫细胞浸润具有相关性,其分子调控机制在克服靶向药物的耐药性中具有潜力,包括抗PD-L1的免疫逃逸、抗索拉非尼耐药性等.铜离子载体双硫仑可激活其他细胞死亡程序,增强了 HCC治疗的敏感性及克服耐药性,铜纳米颗粒联合铜离子载体的抗肿瘤策略具有发展前景.基于铜死亡相关基因建立HCC预后模型存在优势,但仍需要进一步的机制研究和临床验证.综上,笔者就铜死亡在HCC发病机制中的重点进展和关注点进行总结和论述,以期为相关研究提供参考.

目的 建立肺腺癌(LUAD)与双硫死亡(DS)通路相关的基因(DPRGs)预后模型,阐明其潜在的生物学机制.方法 LUAD相关基因测序及临床信息源于公共数据库.使用基因集变异分析(GSVA)结果与癌症基因组图谱(TCGA)数据集中mRNA表达量的相关性筛选DS通路中显著活跃的基因.基于最小绝对收缩和选择算子(LASSO)分析和随机森林(RF)算法筛选出DPRGs,使用多因素Cox回归分析构建风险评分(RS)模型,并通过基因表达综合数据库(GEO)进行验证.根据RS中位数将样本分为高、低风险组并进行分析.建立7个DPRGs的蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络,发现与其他蛋白互作关系最多的蛋白是乳酸脱氢酶A(LDHA),并进一步研究其功能及表达情况.结果 本研究筛选共得到7个DPRGs:SLC2A1、LDHA、SNAI2、ACO2、FGF12、ANP32B和ST13,由以上基因构建的预后模型验证效能较高.Kaplan-Meier生存分析结果显示,4个数据集中,高风险组LUAD患者的总生存时间与低风险组比较,差异有统计学意义(P＜0.05).高、低风险组差异表达基因富集分析发现,差异基因于p53信号通路、细胞周期等通路富集.实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)及免疫组织化学法结果表明,与正常组织相比,LUAD组织中LDHA表达水平升高.结论 基于DPRGs建立的预测模型能有效预测患者预后,可能为LUAD患者的治疗和预后提供思路.

目的 通过生物信息学方法建立基于双硫死亡相关基因表达量预测结直肠癌(colorectal cancer,CRC)预后和药物敏感性的评分模型,并结合CRC患者来源类器官(CRC patient-derived organoids,CRC-PDOs)验证.方法 利用NMF(non-negative Matrix Factorization)算法、Cox和LASSO回归分析明确对CRC预后有预测价值的双硫死亡相关基因,构建双硫死亡相关风险评分公式,结合GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分析不同集群之间的差异基因及富集通路.通过GDSC数据库预测不同分组CRC患者对化疗药物的敏感性,并利用CRC-PDOs进行验证.结果 NMF算法结果显示基于双硫死亡相关基因可建立CRC患者分群,COX回归分析显示LRPPRC和SLC7A11是能够预测CRC患者预后的潜在基因(P=0.047、0.033),CRC患者肿瘤中的SLC7A11低表达或LRPPRC高表达与总生存率(overall survival,OS)显著相关(P=0.004、0.003).基于LASSO回归分析,双硫死亡风险评分公式为:Risk score=LRPPRC×(-0.670 5)+SLC7A11×0.311 2,且能将GSE161158 数据集分群为高风险和低风险组.双硫死亡高低危群集间有 125 个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),结合GO和KEGG结果,高危群集患者的上调基因主要富集于免疫调节,如白细胞趋化性、粒细胞迁移和Toll样受体结合.低风险集群的特征是与硫化物代谢和运输相关的途径,如硫化物跨膜转运蛋白活性.基于GDSC数据库,双硫死亡相关的双基因表达水平可预测化疗药物敏感性,化疗药物(伊立替康)对于CRC-PDOs的生长抑制结果提示患者的结直肠癌组织中SLC7A11和LRPPRC的相对表达量与其类器官映射疗效呈线性相关(P=0.007、0.040).结论 根据生物信息学分析和CRC-PDOs实验结果,双硫死亡相关评分能够预测结直肠癌患者预后和药物敏感性,具有潜在的临床应用前景.

目的 探究智力障碍与双硫死亡之间的联系,为智力障碍的治疗提供新的方向.方法 利用GEO数据库中的智力障碍数据集(GSE64380),结合铁死亡数据库中的双硫死亡相关基因确定与智力障碍相关的双硫死亡基因,采用多因素Logistic分析、LASSO回归模型和随机森林模型(结合SHAP算法)进行机器学习.在中药入血成分数据库DCABM-TCM中以置信度得分 0.90(LR=124)为筛选标准,确定与双硫死亡基因相关的中药入血活性化合物.在TCMSP数据库中检索中药活性化合物的类药性(DL)、口服生物利用度(OB),进行分子对接.结果 经过多因素Logistic分析、LASSO回归模型以及随机森林模型(结合SHAP算法)的综合分析,最终确定ACTC1是与智力障碍相关的双硫死亡的关键基因.分子对接结果显示,ACTC1与环拉酸、D-甘露糖苷、β-乳糖、D-吡喃葡萄糖、β-D-呋喃果糖有良好的结合性.根据中药活性化合物的 DL、OB 值,确定 D-吡喃葡萄糖和 β-D-呋喃果糖是最具潜力的中药活性化合物.扁豆全株被确定为潜在的研究中药.结论 ACTC1被确认为与智力障碍相关的双硫死亡的关键基因,而扁豆中的活性化合物D-吡喃葡萄糖和β-D-呋喃果糖则被视为潜在的治疗药物.

目的 探索双硫死亡相关长链非编码RNA(lncRNA),进一步构建风险预测模型,以期为肝细胞癌的预后评估及个体化治疗提供新的生物标志物.方法 从TCGA数据平台中下载肝细胞癌转录组数据及临床数据,运用皮尔森相关分析筛选出双硫死亡相关lncRNA.通过多种算法构建预测模型.采用单因素和多因素Cox回归、Kaplan-Meier生存曲线、ROC曲线、DCA决策曲线以及列线图对预后模型进行效能评估和验证.计算每例患者的风险评分,根据评分中位数将患者分为低风险组和高风险组,进行免疫逃逸(TIDE)、免疫检查点、m6A修饰基因相关性分析以及药物敏感性分析,通过基因突变、基因集富集分析(GSEA)对其生物学特征进行评价.结果 本研究共鉴定了 5个双硫死亡相关lncRNAs并据此构建风险预测模型.生存分析显示高风险组患者总生存期显著低于低风险组(P＜0.001).该模型的1、3、5年生存预测AUC值分别为0.773、0.725和0.679.单因素、多因素Cox回归证实了该模型的独立预后价值(P＜0.001).列线图内部验证显示模型预测的可信度较好.高低风险组在免疫逃逸潜能评分、关键免疫检查点和m6A修饰基因表达水平、以及对常用HCC治疗药物的耐药性上均表现出显著差异.结论 本研究构建的双硫死亡相关lncRNAs预后模型具有良好的预测准确性,可作为新的生物标志物,评估HCC患者的生存预后和免疫逃逸倾向,为临床决策提供有价值的参考.

"双硫死亡"是近年来报道的一种新的与代谢相关的细胞死亡方式,使用双硫死亡基因及长链非编码RNA(lncRNA)构建预后模型在多种癌症中均展示了较好的预后预测效能,一定程度揭示了双硫死亡与癌症细胞免疫浸润的潜在联系.

目的 分析溶质载体家族7成员11(SLC7A11)在肾透明细胞癌(ccRCC)发生、发展中的作用及其预后价值.方法 采用两样本孟德尔随机化分析以识别与ccRCC风险存在因果关系的基因.使用来自UCSC Xena泛癌队列的RNA测序数据及临床数据分析SLC7A11的表达及预后意义.使用TCGA-KIRC数据(训练集)进行基因集富集分析(GSEA).随后通过逐步Cox回归分析建立了基于SLC7A11的预后模型,并在E-MATB-1980队列(验证集)中进行了外部验证.结果 孟德尔随机化分析显示,SLC7A11水平升高会加重ccRCC的患病风险(HR=1.27,95％CI:1.15～1.40,P＜0.001).SLC7A11在各种肿瘤中过表达,并与高T分期和较差的生存预后相关(P＜0.05).GSEA显示SLC7A11富集在增殖和转移相关通路,包括E2F和上皮-间质转化信号通路.SLC7A11预后模型在训练集(1、3、5年AUC=0.78、0.73、0.71)和验证集(1、3、5年AUC=0.70、0.71、0.72)中均显示出强大的预测性能.结论 SLC7A11作为ccRCC的潜在生物标志物和治疗靶点,为精准医学提供了新视角.

目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库构建肝细胞癌(HCC)的双硫死亡相关长链非编码RNA(DRlncRNA)预后模型.方法 从TCGA中下载377例HCC患者样本转录组数据和临床资料(包括374个HCC组织和50个癌旁组织),通过对双硫死亡相关基因和长链非编码RNA(lncRNA)进行Pearson相关分析确定DRlncRNA.将筛选到的343例样本按1∶1随机分为训练集(172例)和验证集(171例).在训练集中通过单因素Cox回归分析、最小绝对收缩和选择算子回归、多因素Cox回归分析确定DRlncRNA预后模型,计算风险评分,按照风险评分的中位值分为高、低风险组;采用Kaplan-Meier法对两组患者进行生存分析.绘制ROC曲线评估预后模型的效能.在验证集和整个队列中重复验证.分析高、低风险组间免疫特征的差异.结果 Pearson相关性分析共筛选到185个DRlncRNA,多因素Cox回归分析最终筛选出6个DRlncRNA并构建模型.Kaplan-Meier生存分析显示,3个队列中的高风险组患者总生存率均显著低于低风险组(均P＜0.05).ROC曲线显示该模型预测训练集HCC患者1、3和5年生存期的AUC分别为0.806、0.794、0.694,具有良好的预后预测效能;验证集和整个队列中也具有良好的预测效能.免疫细胞及功能在高、低风险组中存在不同程度的差异.结论 基于6个DRlncRNA构建的预后模型可有效预测HCC患者预后,风险评分高是HCC患者死亡的独立危险因素.